新型基因组学工具ECCITEseq扩展多模态单细胞分析
单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域之一。其能够帮助研究人员深入探索单细胞的特性，有效区分不同的细胞类型，并在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。随着对复杂人体组织甚至整个生物体的研究进展，研究人员越来越认识到需要大规模并行技术及数据集才能更加深入地揭示微妙的细胞状态。 近日，一种新型单细胞技术的问世或将再次推动该领域发展。在本周发表于Nature Methods期刊的一篇文章中，来自纽约基因组中心（NYGC）技术创新实验室的科学家开发了一种名为“ECCITE-seq”（Expanded CRISPR-compatible Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing ）的新型技术，使研究人员能够对单个细胞的多维度信息进行高通量表征和鉴定，包括直接检测用于CRISPR筛选的单导向RNA。研究人员表示，ECCITE-seq能够并行分析来自数......阅读全文
2015重大技术进展：单细胞分析、成像
每到年终，The scientist会对本年度的创新产品、年度科学人物和学术界丑闻等进行一系列的盘点。在发表于12月24日的“Top Technical Advances 2015”文章中，该期刊总结了今年CRISPR、光遗传学、单细胞分析和成像技术领域取得的一些重大进展。 上接：2015重大
百花齐放的单细胞分析技术
世界上没有完全相同的两片树叶，世界上也没有两个相同的细胞，单个细胞都是dute的，它们在大小、蛋白质水平和所表达的RNA转录子方面都可能相差甚远。单细胞分析（Single Cell Analysis ，SCA）即是对单个细胞进行研究，研究单个细胞不仅可以很好的认识到细胞异质性，而且可以更好的对疾病进
新技术分析单细胞的染色质构象
分析染色质构象的技术不少，但有的需要大量细胞，有的则分辨率太低。这阻碍了我们对于单细胞中染色质构象的了解。近日，瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员在《Biotechniques》上介绍了一种新方法，能够高分辨率地分析单细胞中染色质的接近程度。 对于理解基因调控、DNA复制和修复来说，研究染色体的
BioMark－HD－平台应用于CTC单细胞分析
按：一种可以从癌症病人全血中分离表面抗原EpCAM阴性或阳性的循环肿瘤细胞（CTC）的装置（CTC-iChip）最近被开发出来，结合Fluidigm Corporation 的BioMarK HD 平台，可以对CTC进行单细胞水平的分析，有力的推进了CTC分析在癌症临床检测及监测中的应用。 人们通常
单细胞测序数据的分析有什么意义
单细胞测序可以分析一个细胞里面的基因组序列这个主要适用于受精卵的试管婴儿
单细胞质谱分析的现状与发展
2015年10月17日，第二届全国质谱分析学术报告会在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕，在5位院士的精彩报告后，多位学者做了高水平的大会报告。 清华大学张新荣教授：单细胞质谱分析的现状与发展 清华大学张新荣教授做题为《单细胞质谱分析的现状与发展》的报告。细胞是生命活动的基本单元，在单细胞
浅谈单细胞RNA测序的技术与分析难点
如今，单细胞生物学是一个热门话题。而在这一领域中，最前沿的则是单细胞RNA测序（scRNA-seq）。传统“批量的”RNA测序方法（RNA-seq）可以一次处理成千上万个细胞，并得到变异的平均水平。但是没有两个细胞是完全相同的，而scRNA-seq则可以揭示出每个细胞独特的微妙变化，甚至可以揭示全新
Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序
2018年11月，Namocell与CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞，并且将其进行单细胞测序，为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序（scRNA-s
实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析，在上一篇中，我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容（具体内容查看链接）。在这里，我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 细胞谱系分析，最简明的理解就是细胞领域的进化树，通常指的是某类祖源细胞，在特定条件下，有多
实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析，在上一篇中，我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容（具体内容查看链接）。在这里，我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 细胞谱系分析，最简明的理解就是细胞领域的进化树，通常指的是某类祖源细胞，在特定条件下，有多
CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法
CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ （ f.sight ）被开发用于满足这些需求， 它可以柔和地接种单个细胞至微孔，同时记录整个细胞接种过程，提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中，我们开展了六组实验，用无血清培养基
芯片实验室让单细胞基因分析更高效
本报讯据美国物理学家组织网近日报道，最近，加拿大英属哥伦比亚大学与英属哥伦比亚癌症研究所、转化与应用基因组学中心合作，开发出一种硅酮材料的芯片实验室技术，能让每个细胞像弹球机里的球一样各就各位，然后进行基因检测。这种“单细胞基因分析”技术使基因检测更加灵敏迅速，有助于肿瘤分析和临床疾病的诊断。本周出
芯片实验室让单细胞基因分析更高效
最近，加拿大英属哥伦比亚大学与英属哥伦比亚癌症研究所、转化与应用基因组学中心合作，开发出一种硅酮材料的芯片实验室技术，能让每个细胞像弹球机里的球一样各就各位，然后进行基因检测。这种“单细胞基因分析”技术使基因检测更加灵敏迅速，有助于肿瘤分析和临床疾病的诊断。本周出版的《美国国家科学院院
专家解析单细胞分析技术：简单的染色成像方法
在这项研究中，Nakauchi教授采用了一种简单的免疫染色技术：单细胞磷酸成像分析（single-cell imaging of phosphorylation assay，SCIPhos）。先将大约50个细胞想排列在载玻片上，然后进行染色，通过共聚焦显微镜进行观察，通过这些染色了的磷酸化修饰蛋白，
单细胞基因表达分析的最新进展
将细胞培养板上的细胞放在显微镜下观察。表面上，它们都一样。实际上，它们一点都不相同。无论是DNA或RNA的水平，还是蛋白质或代谢物的水平，这些细胞相差甚远，而这些差异可能对细胞行为产生深远的影响。 多年来，研究人员一直缺乏工具，来高效拷问这些差异，不过今非昔比。有了新一代DNA测序仪和质谱仪，
单细胞凝胶电泳技术影响因素的分析
单细胞凝胶电泳（SCGE）又称“彗星”法，是一种操作简便、快速、敏感性高的DNA损伤与修复的检测技术。尽管此法无需复杂的实验条件，但在建立过程中可能受诸多因素的影响而难以得到较理想的结果，我们就其主要的影响因素作如下分析。1.琼脂糖凝胶薄板的制备：该实验需要制备两层琼脂糖凝胶薄板，应注意琼脂糖的浓度
单细胞基因表达分析解密血液早期发育调控网络
近日，著名国际期刊nature biotechnology发表了英国科学家的一项最新研究成果，他们应用单细胞基因表达分析与计算方法描述了血液发育的转录调控网络。这项研究为分析器官发育的调控网络提供了一种可行的方法。 研究人员指出，重建调控器官发育的分子途经受限于缺少对胚胎祖细胞进行研究的方法，
被“真”单细胞光环掩盖的高通量分析
01、二代“真”单细胞蛋白质组学质谱：timsTOF Ultra 2023年6月5日，在第71届ASMS会议上，布鲁克公司重磅发布了timsTOF Ultra，“真”单细胞蛋白质组学正式进入第二代。图1：成熟可复制的单细胞蛋白质组学解决方案 布鲁克第二代“真”单细胞蛋白质组学方案，打破单细胞
总裁专访－|－单细胞蛋白质组分析成为现实
多组学发展的两大趋势是大队列高通量分析和单细胞多组学高灵敏度分析。近年来单细胞测序的基因组学成为热点，而蛋白无法如基因般扩增，单细胞蛋白质组学更具挑战。去年Matthias Mann教授团队首次展示了单细胞蛋白质组学的成果，布鲁克今年就为科学家们推出了timsTOF SCP质谱，同时推出在大队列
Namocell单细胞分离仪应用介绍——藻类单细胞分离
Namocell单细胞分离仪最新应用：随着人们对环境研究的不断深入，研究人员逐渐将目光转向藻类的单细胞层面：有些需要对藻类进行单细胞级别的分析（如藻类单细胞测序等），也有需要对单细胞藻类进行培养。这样就面临一个棘手的问题，那就是如何获取藻类的单个细胞。通常实验室里的方式，是在显微镜下用毛细管吸取。这
单细胞凝胶电泳法检测单细胞DNA损伤
单细胞凝胶电泳（single-cell gel eiectrophoresis，SCGE）又称慧星试验（comet assay）是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来，经过不断的改进，已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法，广泛地应用
北京生科院建立单细胞环形RNA分析技术及表达图谱
环形RNA是一类在真核细胞中广泛存在的内源性非编码RNA分子，在生物体发育过程中发挥重要作用。之前研究已在不同物种中鉴定出数百万个环形RNA分子，并产生了大量用于揭示生物体组织表达模式的环形RNA数据资源。然而，由于大多数环形RNA表达量较低，传统的转录组测序方法无法表征单个细胞环形RNA表达谱
PerkinElmer－ICPMS助力癌症早期诊断单细胞分析方法
在癌症发病率逐年上升的今天，如何获得癌症等其他重大疾病的早期诊断正逐渐被科学家所关注，但由于分析方法的限制，过去的细胞研究往往只能以细胞群体为研究对象，探索细胞的生命活动。但是由于细胞之间存在差异，研究细胞群体往往会掩盖这种差异。单细胞分析可以获得细胞在微环境中准确的个体信息，对于研究细胞的信号传导
分析组织消化时,影响单细胞数量和活性的因素
在组织进行消化吸收的时候，但细胞的数量是有所增加的。因为也摄入了一定的养分。分析组织消化组织影响单细胞数量和活性的因素，是组织之间的交错。代谢的强弱是直接受酶的影响，只有酶的活性增强，代谢才会增强。通常酶是蛋白质，蛋白质是受基因直接调控的，生物体内酶的数量是生物体按需求进行调控的，像细胞内的细胞器溶
Science：利用单细胞RNA测序分析黑色素瘤
单细胞分析是一种开创性方法，如今在整个生物领域中正被用来研究一个共同的问题：如何研究异质细胞群体中的细胞多样性。这种多样性能够对细胞存活和增殖、对药物疗法和干预作出的反应以及很多其他的生物过程产生深刻影响。单细胞技术已被用于众多研究---比如，研究自身免疫疾病中的免疫反应异质性，研究传染病中的宿
单细胞分泌分析技术解析神经—免疫细胞互作网络
近日，我所单细胞分析研究组（1820组）陆瑶研究员团队利用单细胞多种类分泌因子检测技术，实现了对神经—免疫细胞互作网络的解析。 随着全球人口逐步进入老龄化阶段，神经退行性疾病正成为威胁人类健康的重大疾病之一。与神经退行性疾病直接相关的是神经细胞，但神经细胞并不是孤立存在的，神经细胞需要通过物理
通过序列杂交和条形码进行单细胞原位分析
现代系统生物学有两种革新技术：基因组学和单细胞生物学，前者具备同时监测生物体中所有基因和蛋白质的能力，后者则可以在自然微环境中跟踪单细胞的一些特定基因。 两种技术都很强大，但具有互补的局限性：基因组学平均了一个细胞群的异质性和空间复杂性，而单细胞技术一次只能探测几个基因。因此，将基因组学与单细
单细胞基因组测序：从实验到分析，步步解析
随着生命科学研究的微观化，基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域（如肿瘤异质性、早期胚胎发育等）。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序，解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题，为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。【应用概览】从20
单细胞凝胶电泳分析（single－cell－gel－eletrophoresis，SCGE）
单细胞凝胶电泳分析（single cell gel eletrophoresis，SCGE）是由Ostling等（1984）首创，后经Singh等（1988）进一步完善并逐渐发展起来的一种快速检测单细胞 DNA损伤的实验方法，适用于多种细胞，能够灵敏地检测DNA断裂，在检测诱变剂、射线等
单细胞分析是研究细胞异质性的有效手段
单细胞分析是研究细胞异质性的有效手段 单细胞分析研究细胞异质性的关键就在于能否实现对单个细胞进行较多参数的分析，这就是“单细胞分析”的概念。事实上，自从“细胞”学说被提出后，人类一直在努力寻求分析单个细胞的技术方法。 但是，单细胞分析有一个巨大的挑战，那就是样品量及其有限，一个典型的人类细