染色质高级结构变化调控细胞凋亡的新机制
真核生物DNA通过缠绕组蛋白八聚体形成以核小体为重复单元的串珠结构，再通过形成远距离的染色质环等高级结构而存储于细胞核中。近年来研究表明染色质高级结构在维持基因表达和细胞命运决定等方面发挥重要作用，且染色质高级结构的形成和维持需要特定转录因子的介导。多功能转录因子CCCTC结合因子（简称：CTCF）是拥有11个高度保守的锌指结构蛋白，除了具有调节基因的转录激活与抑制、基因印记、染色质绝缘、X染色体失活等功能外，还在染色质高级结构调控基因表达方面发挥重要作用，因此CTCF被称为基因组的主编织者。然而CTCF是否存在新的可变剪接体以及该剪切体是否在调控染色质动态变化和细胞命运决定方面有不同于经典CTCF的分子细胞功能仍不清楚。 中国科学院广州生物医药与健康研究院姚红杰研究员课题组在国际学术期刊Nature Communications在线发表了题为“An alternative CTCF isoform antagonizes......阅读全文
染色质高级结构变化调控细胞凋亡的新机制
真核生物DNA通过缠绕组蛋白八聚体形成以核小体为重复单元的串珠结构，再通过形成远距离的染色质环等高级结构而存储于细胞核中。近年来研究表明染色质高级结构在维持基因表达和细胞命运决定等方面发挥重要作用，且染色质高级结构的形成和维持需要特定转录因子的介导。多功能转录因子CCCTC结合因子（简称：CTC
染色质高级结构调控细胞命运机制研究中获进展
真核生物基因组DNA缠绕在组蛋白八聚体上形成染色质，并在染色质架构蛋白的作用下逐级折叠形成远距离的染色质相互作用（或染色质环）、拓扑相关结构域和染色质区室等染色质高级结构。远距离染色质互作可以调控基因表达，在细胞命运决定过程中具有关键作用。CCCTC结合因子（简称CTCF）最早被认为是绝缘子结合蛋白
染色质高级结构调控多能干细胞诱导机制获进展
中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员姚红杰课题组联合美国加州大学圣地亚哥分校教授付向东课题组，运用体细胞重编程到诱导多能干细胞为模型结合多维组学技术并联合生物信息分析，揭示了CCCTC结合因子（以下简称CTCF）介导的染色质绝缘和染色质结构变化协同调控干细胞多能性获得的新机制。相关研究4月5日发
调控基因表达的“染色质环”新因子筛选获进展
中国科学院广州生物医药与健康研究院、生物岛实验室研究员姚红杰课题组通过系统性筛选在基因组上与CTCF共定位的转录因子，鉴定出大量与CTCF存在高共定位率的新转录因子，并选取了转录因子BHLHE40进行后续的功能验证，发现BHLHE40可以调控CTCF在基因组上的结合，进而影响其介导的远距离染色质
中国医学科学院最新文章解析HOX基因表达模式
“核心刊物”迎来了新期刊：科学通报，中国科学C辑:生命科学，这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的，我国学术期刊中的知名品牌，被国内外各主要检索系统收录，如国内的《中国科学论文与引文数据库》（CSTPCD）、《中国科学引文数据库》（CSCD）等；美国的SCI、CA、EI，英
中科院发表Cell－Res文章：三维基因组组装重要新机制
来自上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心，中科院北京生物物理所的研究人员发表了题为“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites”的文章，阐明了染色质架构蛋
好消息！30纳米染色质高级结构成功解析
DNA如何包装成染色体，是科学家们一直努力破解的重要科学问题。近30年来，由于缺乏系统、合适的研究手段，作为染色质包装过程中承上启下的关键部分，30纳米染色质高级结构研究一直是现代分子生物学领域面临的最大挑战之一。李国红（中）在工作 科学家已经发现，染色质包装分4步完成，对应了染色质的四级结构
转座子活动与染色质高级结构进化奥秘
近日，华中农业大学棉花遗传改良团队发表相关研究论文，首次公布了棉属中比四倍体棉花基因组更大的K2基因组，并对A2基因组和D5基因组进行了升级，发现基因组特异的转座子扩增导致了基因组扩张，通过比较三维基因组研究揭示了年轻的转座子扩增伴随着棉属特异的染色质高级结构形成。 棉花（Gossypium）
染色质架构蛋白CTCF结合人类基因组位点的机制研究取得..
近日，国际著名学术期刊《Cell Research》杂志在线发表了上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心吴强课题组和中科院北京生物物理所王艳丽课题组合作研究成果，“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diver
新研究揭示导致神经发育障碍的分子机制
7月1日，《自然-通讯》刊发了广州国家实验室研究员姚红杰团队与合作者最新成果。他们综合运用小鼠模型和人源类器官模型，揭示了染色质架构蛋白CCCTC结合因子（简称CTCF）的精氨酸567突变为色氨酸（R567W）点突变通过调控CTCF在染色质上的结合和局部三维基因组结构，进而导致神经发育障碍的分子机制
中国科学家率先解析30纳米染色质高级结构
你真的了解自己的身体吗?你知道一个细胞中的DNA加起来有2米长吗?这么长的DNA怎样被“塞”进仅有几微米大小的细胞核呢? 其实，这也是科学家想要搞清楚的问题。 4月25日，美国《科学》杂志报道了中科院生物物理所一项关于30纳米染色质高级结构解析的研究成果。这篇研究论文发表后，一个尘封
小鼠卵子竟然具有一种特殊染色质高级结构？
在真核生物中，线性的DNA通过多层级地折叠，以一定的三维结构存在于细胞核中。正确的染色质三维结构在基因表达调控和细胞分裂等细胞生命活动中发挥着至关重要的作用。哺乳动物卵子发生中伴随着剧烈的染色体高级结构的重编程。比如伴随小鼠卵泡发育，初级卵母细胞从相对松散、高度活跃转录的状态逐渐转化成转录沉默，
CTCF的结构特点和生理作用
该基因属于boris+ctcf基因家族，编码一个具有11个高度保守的锌指结构域的转录调节蛋白。这种核蛋白能够利用zf结构域的不同组合来结合不同的dna靶序列和蛋白质。根据所述位点的上下文，所述蛋白质可结合包含组蛋白乙酰转移酶（hat）的复合物并作为转录激活剂发挥作用，或结合包含组蛋白脱乙酰基酶（hd
CTCF基因编码功能及结构描述
该基因属于boris+ctcf基因家族，编码一个具有11个高度保守的锌指结构域的转录调节蛋白。这种核蛋白能够利用zf结构域的不同组合来结合不同的dna靶序列和蛋白质。根据所述位点的上下文，所述蛋白质可结合包含组蛋白乙酰转移酶（hat）的复合物并作为转录激活剂发挥作用，或结合包含组蛋白脱乙酰基酶（hd
上海生科院揭示长非编码RNA对MYC基因转录调控的分子机制
5月5日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组在《细胞研究》(Cell Research)发表当期封面文章Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin
MolecularCell：精子发生过程中染色质高级结构“重编程”模式
在真核生物中，线性DNA通过多层级地折叠以特定的三维结构存在于细胞核中。染色质三维结构对于基因调控、DNA复制和细胞分裂等过程具有重要作用，其异常会导致基因表达失调和发育畸形。哺乳动物中，新的生命由精子和卵子的产生、结合以及随后的早期胚胎发育开启。在形成配子以及全能性胚胎的过程中，染色质需要经历
Science：中美科学家揭示大脑发育机制
上海交通大学系统生物医学研究院吴强教授与美国哥伦比亚大学教授、分子生物学先驱 Tom Maniatis 研究团队合作，发现原钙粘蛋白基因簇表达的一个特定异构体决定5-羟色胺神经环路的组装和轴突空间规则排列（axonal tiling and even spacing），这一研究成果于2017年4
中科院JBC文章揭示转录调控新机制
来自中科院广州生物医药与健康研究院、吉林大学等机构的研究人员证实，凝集蛋白复合体负向调控了基因组调控蛋白CTCF介导的核糖体RNA基因转录。这项工作发表在7月24日的《生物化学杂志》(JBC)上。 中科院广州生物医药与健康研究院的姚红杰(Hongjie Yao)是这篇论文的通讯作者。其主要
细胞凋亡的细胞凋亡检测
细胞凋亡在胚胎发育、造血、免疫系统的成熟以及维护正常组织和器官的细胞恒定与生长平衡，乃至机体衰老方面都起着重要作用。因此，有关凋亡的研究在临床和基础等各个领域已经广泛开展,凋亡细胞的检测方法显得非常重要。流式细胞仪( Flow cytometry ,FCM) 将流体喷射技术、激光光学技术、电子技术和
细胞凋亡的细胞凋亡检测
细胞凋亡在胚胎发育、造血、免疫系统的成熟以及维护正常组织和器官的细胞恒定与生长平衡，乃至机体衰老方面都起着重要作用。因此，有关凋亡的研究在临床和基础等各个领域已经广泛开展,凋亡细胞的检测方法显得非常重要。流式细胞仪( Flow cytometry ,FCM) 将流体喷射技术、激光光学技术、电子技术和
上海生科院首次揭示一条新lncRNA调控MYC转录的新机制
3月25日，国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-ran
热带爪蟾表明染色质重塑对从头－TAD－建立有重要影响
动物间期染色体被组织成拓扑关联域 (TAD)。尚未完全了解 TAD 的形成方式。 2021年6月7日，南方科技大学侯春晖，陈永龙，华中农业大学李立及澳门大学张仲荣共同通讯在Nature Genetics 在线发表题为“Three-dimensional folding dynamics of
细胞凋亡，细胞凋亡通路和细胞凋亡检测的几种检测方法
一、形态学观察方法 1、HE染色、光镜观察：细胞凋亡后呈圆形，胞核深染，胞质浓缩，染色质成团块状，细胞表面有“出芽”现象。 2、丫啶橙(AO)染色，荧光显微镜观察：活细胞核呈黄绿色荧光，胞质呈红色荧光。细胞凋亡|后（细胞凋亡,细胞凋亡通路，细胞凋亡检测）核染色质呈黄绿色浓聚在核膜内侧
我国学者应用液体核磁刻画CTCF多点识别DNA的动态特性
稳态强磁场实验装置（SHMFF）用户中科大生命科学学院施蕴渝院士/吴季辉教授团队的阮科副教授和张志勇教授利用液态核磁共振结合小角度X射线散射等技术，在对人源多功能转录因子CTCF的结构与功能研究中取得重要进展。相关成果在线发表在《物理化学快报杂志》上。CTCT与DNA相互作用示意图 多功能转录
G4高级结构参与细胞脂肪代谢的调控
近日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表了华南师范大学生命科学学院昆虫科学与技术研究所教授冯启理团队的最新研究成果。他们首次把DNA G4高级结构与生物细胞脂肪代谢调控联系起来，证明了G4高级结构参与了细胞脂肪代谢的调控，进而影响生物性状这一新的生物学功能。 D
研究发现影响血液干细胞中特殊基因表达的关键元件
基因转录通常会被启动子和调节元件（比如增强子和沉默子）之间的染色质环来进行调节，不同的转录因子（TFs，transcription factors）能够与这些调节元件结合，并以一种细胞类型特异性的方式来调节启动子-增强子环。尽管其在控制基因表达方面发挥着重要作用，但转录因子如何促进启动子-增强子
液体核磁与小角度X射线散射刻画CTCF多点识别DNA动态特性
中国科学技术大学生命科学学院施蕴渝院士/吴季辉教授团队的阮科副教授和张志勇教授利用液态核磁共振结合小角度X射线散射等技术，在对人源多功能转录因子CTCF的结构与功能研究中取得重要进展。相关成果以“Dynamic Nature of CTCF Tandem 11 Zinc Fingers in M
早期凋亡细胞和.晚期凋亡细胞的区别
细胞凋亡：细胞的编程性死亡，由基因控制的。是由于细胞内部程序激活而发生的自杀性死亡。涉及一系列基因的激活、表达、调控，在非病理的条件下进行。细胞衰老：随着时间的推移，细胞增殖能力和生理功能逐渐下降的变化过程。细胞在形态上发生明显变化，细胞皱缩，质膜透性和脆性提高，线粒体数量减少，染色质固缩、断裂等。
早期凋亡细胞和.晚期凋亡细胞的区别
细胞凋亡：细胞的编程性死亡，由基因控制的。是由于细胞内部程序激活而发生的自杀性死亡。涉及一系列基因的激活、表达、调控，在非病理的条件下进行。细胞衰老：随着时间的推移，细胞增殖能力和生理功能逐渐下降的变化过程。细胞在形态上发生明显变化，细胞皱缩，质膜透性和脆性提高，线粒体数量减少，染色质固缩、断裂等。
早期凋亡细胞和晚期凋亡细胞的区别
细胞凋亡：细胞的编程性死亡，由基因控制的。是由于细胞内部程序激活而发生的自杀性死亡。涉及一系列基因的激活、表达、调控，在非病理的条件下进行。细胞衰老：随着时间的推移，细胞增殖能力和生理功能逐渐下降的变化过程。细胞在形态上发生明显变化，细胞皱缩，质膜透性和脆性提高，线粒体数量减少，染色质固缩、断裂等。