热带爪蟾表明染色质重塑对从头TAD建立有重要影响
动物间期染色体被组织成拓扑关联域 (TAD)。尚未完全了解 TAD 的形成方式。 2021年6月7日，南方科技大学侯春晖，陈永龙，华中农业大学李立及澳门大学张仲荣共同通讯在Nature Genetics 在线发表题为“Three-dimensional folding dynamics of the Xenopus tropicalis genome”的研究论文，该研究结合高通量染色体构象捕获和基因沉默来深入了解热带爪蟾胚胎中的 TAD 动力学。 首先，热带爪蟾中的 TAD 建立与小鼠和果蝇中的相似，并且不依赖于合子基因组转录激活。此过程之后是进一步改进活性和抑制染色质区室以及环和条纹的出现。其次，在 TAD 中，边界一端的较高自相互作用频率与结构蛋白 CTCF 和 Rad21 的较高 DNA 占有率相关。第三，从头形成 TAD 需要染色质重塑因子 ISWI。最后，TAD 结构在不同组织中是可变的。总之，该研究工作表明热......阅读全文
热带爪蟾表明染色质重塑对从头－TAD－建立有重要影响
动物间期染色体被组织成拓扑关联域 (TAD)。尚未完全了解 TAD 的形成方式。 2021年6月7日，南方科技大学侯春晖，陈永龙，华中农业大学李立及澳门大学张仲荣共同通讯在Nature Genetics 在线发表题为“Three-dimensional folding dynamics of
首次揭示人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化
《自然》杂志刊发了中国科学院北京基因组研究所研究员刘江团队与中国科学院院士、山东大学附属生殖医院教授陈子江团队合作研究成果。 该研究首次揭示了人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化，并发现CTCF蛋白对于早期胚胎发育中拓扑相关结构域（TAD结构）有着重要的调控功能，为进一步揭示人类胚胎发育机
Nature：人类早期胚胎发育过程中的染色体结构动态变化
染色体三维结构是重要的表观遗传因素，与基因的表达调控密切相关。研究染色体三维结构在人类精子及早期胚胎中的动态变化和调控分子对于深入理解人类胚胎发育有重要的理论和临床意义。 人类个体发育从精卵结合形成受精卵开始，经历早期胚胎发育过程，由一个细胞逐渐分裂分化形成一个含有上百种细胞类型、多种器官的
非洲爪蟾环状RNA研究成果
作为最新的明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世界第
人体如何发育？首次揭示人类早期胚胎染色体结构动态
人体是如何发育的？个体差异是怎么产生的？疾病又是如何来的？科学家正一步步揭开其神秘面纱。 12月5日，《自然》杂志刊发了中国科学院北京基因组所研究员刘江团队与中国科学院院士、山东大学附属生殖医院教授陈子江团队合作研究成果，该研究首次揭示了人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化，并发现CTC
人为TAD重组对细胞命运转变起到推动作用
真核细胞染色体通常会有序的折叠，在空间上会形成有序的三维结构。这些三维结构由大到小主要分为区室分隔（compartments）、拓扑相关结构域（Topological-Associated Domains, TADs）以及染色质环状结构（loops）等。细胞命运转变过程中往往伴随着染色体三维结构
解析肿瘤HiC多组学研究策略，IF≥10+文章不是梦！
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Se
解析肿瘤HiC多组学研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
简述缺氧诱导因子的分子基础
HIF-1是一种异源二聚体,主要由120kD的HIF-1α和91~94kD的HIF-1β两个亚单位组成。HIF-1β亚基又称芳香烃受体核转运子(aryl hydrocarbon re-eptor nuclear translocator,ARNT),基因定位于人的1号染色体q21区,在细胞内稳定
缺氧诱导因子1－的分子基础
HIF-1是一种异源二聚体,主要由120kD的HIF-1α和91~94kD的HIF-1β两个亚单位组成。HIF-1β亚基又称芳香烃受体核转运子(aryl hydrocarbon re-eptor nuclear translocator,ARNT),基因定位于人的1号染色体q21区,在细胞内稳定表达
华人院士首次发现一种沉默失活X染色体基因的重要蛋白
麻省总医院MGH的研究人员发现了一种结构蛋白在沉默失活X染色体中的重要作用。这一研究成果公布在Cell杂志上。 这项研究由麻省总医院，霍华德休斯医学研究所分子生物学系遗传学及病理学教授李纯慧（Lee, Jeannie T.）领导完成。李教授研究组研究方向为探讨癌症基因和后天环境的关系。图片来源
非洲爪蟾卵母细胞体外翻译系统
实验材料 成年雌性非洲爪蟾 抑肽酶 tRNA 蛋白酶 K 仪器、耗材
非洲爪蟾生发泡内含物的涂布制备实验
实验材料 雌性非洲爪蟾试剂、试剂盒 OR2 培养液“5:1” 分离液分散剂仪器、耗材 培养皿实验步骤 1. 从麻醉了的雌性非洲爪蟾中取一块卵巢，放在盛有温度为 18~22℃ 的 OR2 培养液的培养皿（60 mm x 15 mm ) 中。OR2 培养液：82.5 mmol/L NaCl2.5 mmo
Cell：基因组三维结构存在细胞异质性
美国国家癌症研究所、哈佛大学、马萨诸塞大学和麻省理工学院联合开展的一项研究发现，不同细胞和不同等位基因之间的基因组组织结构存在很大差异。这项研究成果于本周发表在《Cell》杂志上。 研究人员利用高通量的染色质构象捕获（Hi-C）和高通量的荧光原位杂交（hiFISH）光学图谱绘制来分析人包皮成纤
Nature：DNA重复序列是否致病取决于什么？
DNA重复序列在人类基因组中是很常见的。重复序列已经被提出作为一种进化机制，但是它们可能与人类疾病相关。现在，马克斯-普朗克分子遗传学研究所和Charité – Universitätsmedizin Berlin的科学家已经证明，DNA重复序列是否与人类疾病相关，取决于它们在基因组中的位置，序
任兵教授Cell子刊解读染色质结构域
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA，这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体，形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质，使DNA受到良好的保护。 所有控制基因转录的调控蛋白，都要结合在DNA上起作用。而染色质的3D结构会随着细胞生活周期而变化，调节调控因子所能接触到的基因。
非洲爪蟾生发泡内含物的涂布制备实验实验
实验材料 雌性非洲爪蟾 试剂、试剂盒 OR2 培养液 “5:1” 分离液 分散剂
世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表！
作为最新的明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世
世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表！
作为最新的明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世
非洲爪蟾卵母细胞体外翻译系统（二）
(二）外源 mRNA 在非洲爪蟾卵母细胞提取物中的翻译1) 室温融化冻存的提取物，然后即置于冰上。2) 同时，应将用于翻译的 mRNA 分装于 0.5 ml 或 1.5 ml 离心管中，置于冰上3) 每 100ul 提取物应分別加入以下各成分：10ul 网织红细胞裂解液 S-100,1ul120
4.3－非洲爪蟾卵母细胞体外翻译系统
非洲爪蟾卵母细胞体外翻译系统由于具有转移定位、信号肽的切除和糖篇化的能力，因此对于绝大多数的外源性 mRNA 都具冇持续性的修饰加工能力。由于其膜的稳定性高，因此可使用蔗糖密度梯度离心或蛋白酶保护反应等方法分析转录产物的定位。实验材料成年雌性非洲爪蟾抑肽酶tRNA蛋白酶 K仪器、耗材离心机冷室实验步
非洲爪蟾卵母细胞体外翻译系统（一）
实验材料 成年雌性非洲爪蟾抑肽酶tRNA蛋白酶 K仪器、耗材 离心机 冷室实验步骤 一、材料与设备(一) 非洲爪蟾卵母细胞提取物的制备1) 成年雌性非洲爪蟾：数只。2) 高盐的 ModifiededBarth、X(MBS): 每升溶液中补加 1.28 gNaCl, 以使其终浓度达到 llOmmol/
非洲爪蟾生发泡内含物的涂布制备实验实验
实验材料雌性非洲爪蟾试剂、试剂盒OR2 培养液“5:1” 分离液分散剂仪器、耗材培养皿实验步骤1. 从麻醉了的雌性非洲爪蟾中取一块卵巢，放在盛有温度为 18~22℃ 的 OR2 培养液的培养皿（60 mm x 15 mm ) 中。OR2 培养液：82.5 mmol/L NaCl2.5 mmol/L
非洲爪蟾生发泡内含物的涂布制备实验实验
非洲爪蟾涂片的制备实验材料雌性非洲爪蟾 试剂、试剂盒OR2 培养液
Genome－Biology：构建猪体细胞染色质三维结构图谱
猪不仅是重要的经济家畜，在生物医学领域也有重要应用。生猪的育种中广泛应用了辅助生殖技术，包括体外受精技术、孤雌和孤雄生殖技术等。但与体外受精胚胎相比，孤雌和孤雄胚胎的存活率级低。这一存活率差异产生的机制目前还不清楚。深入理解这一机制不仅有助于增加商业化猪育种的产仔数，也将有利于生物医学研究中转基
丝裂原活化蛋白激酶相关信号通路介绍ETV1
这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因，这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域，该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外，在N末端
与肺癌相关的ETV1基因编码功能描述
这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因，这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域，该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外，在N末端
ETV1基因突变与药物因子介绍
这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因，这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域，该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外，在N末端
ETV1基因编码功能及结构描述
这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因，这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域，该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外，在N末端
与食管癌相关的ETV1基因编码功能描述
这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因，这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域，该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外，在N末端