RNA点杂交
RNA点杂交1) 纯化的RNA的点杂交和狭线杂交安装印迹装置1.切一张合适大小的带正电荷尼龙膜。用铅笔标上表示方向的记号。用水把膜简单弄湿,在20×SSC中室温泡1 h。2.在膜浸泡期间,先用0.1 mol/L NaOH小心清洗印迹装置,再用无菌水洗干净。3.把两片厚滤纸用20×SSC浸湿,再放到真空器顶部。4.把样品槽插入装置的上部,把湿尼龙膜放在样品槽加样孔的底部,用吸管在膜的表面滚动以去除膜与装置夹层中的气泡。5.加紧夹板,连接真空管。6.加入10×SSC直至液面没过尼龙膜,关掉真空,再用10×SSC充满。 RNA样品准备1.把每个RNA样品(溶解在10μl水)分别与30μl RNA变性液混合。2.65℃温育5 min,然后在冰上冷却。3.向每个样品中加入等体积20×SSC。4.轻轻向印迹装置中吸入10×SSC,直到淹没尼龙膜。 RNA样品的印迹和RNA在膜上的固定1.把所有样品轻......阅读全文
关于RNA斑点杂交方法的介绍
与上法类似,每个样品至多加10μg总RNA(经酚/氯仿或异硫氰酸胍提取纯化),方法是将RNA溶于5μl 焦碳酸二乙酯(DEPC)水,加5μl 甲醛/SSC缓冲液(10×SSC中含6.15mol/L甲醛),使RNA变性,然后取5-8μl点样于处理好的滤膜上,烘干。
分子杂交技术RNA探针的相关介绍
许多载体如pBluescript, pGEM等均带有来自噬菌体SP6或E.coli噬菌体T7或T3的启动子,它们能特异性地被各自噬菌体编码的依赖于DNA的RNA聚合酶所识别,合成特异性的RNA。在反应体系中若加入经标记的NTP,则可合成RNA探针。RNA探针一般都是单链,它具有单链DNA探针的优
Northern杂交试验指导手册(1)-RNA提取
方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理), 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入250g异硫氰酸胍,加热至60~65℃并持续搅拌使之充分溶解。贮存液室温保存备用(不超过3个
流式荧光杂交法和PCR反向点杂交法优劣对比
流式是检测相对荧光强度的,最后的信号高低取决于检测时机器PMT上所施加的电压。而PCR是核酸体外扩增的一种手段。所以两者是不同的哟。。
Northern杂交试验指导手册(2)-RNA质量检测
二、RNA质量检测提取的RNA需要对其质量和数量进行检测。实验室常用的方法有紫外吸收值检测和电泳检测两种。方法一、紫外吸收检测试剂:TE ( 10mmol/L Tris, 1mmol/LEDTA)。dH2O试验程序1.预热紫外分光光度计10~20min.。2.取两个1ml的狭缝石英杯,一个装入1ml
Northern杂交试验指导手册(5)-RNA探针制备
五、RNA探针制备(根据the DIG system user's guide)A. 地高辛标记的体外转录试剂及其配制(试剂盒提供):10× NTP标记混合物:in Tris-HCl (pH 7.5)10mmol ATP10mmol CTP10mmol GTP6.5mmol UTP3.5mm
大脑RNA编辑位点“辞典”发布
美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目,在这些位点中,RNA在整个人类生命周期中被修饰,这个过程被称为腺苷到肌苷(A-to-I)编辑,其为理解大脑发育的细胞和分子机制以及它们如何影响健康和疾病提供了重要的新途径。在《细胞报告》上发表的论文中,研究团队描述了大脑中RNA编辑的速率如
JACS:“量子点”助力RNA干扰技术
15年前,科学家发现了一种阻碍基因表达路径的方法——RNA干扰(简称RNAi)。这项荣膺2006年诺贝尔奖的发现承载着医学科学的迫切希望,它可以通过沉默基因来阻碍特定蛋白制造,从而达到疾病治疗的效果。不过到目前为止,RNA干扰技术很难在活体细胞中取得应用。 图片说明:由不同尺寸的相同物质构成的
改善RNA提取的4点建议
在分离RNA时,良好的实验室技术很关键。与DNA相比,RNA更加娇贵,也更不稳定。RNA含有高反应性的羟基(C-OH)基团,确保链不断合成、分解和再次利用。分离出的RNA迅速降解,并很容易受到核糖核酸酶(RNase)的污染。RNase似乎随处可见。 加利福尼亚州科学院(Calif
RNA的Nouthern印迹和狭线杂交分析实验
Northern blot 是研究基因表达的最严谨的方法之一,可以定量分析组织中某一特异 mRNA 的表达丰度,根据其迁移位置也可以判断基因表达转录物的大小。该技术应用十分广泛,常用于分析 RNA 样品中特定 mRNA 的大小和丰度,也可用于基因表达调控、基因结构及功能、遗传变异等研究。实验材料RN
分子杂交RNA探针的技术特点及应用介绍
在DNA序列未知而必须首先进行克隆以便绘制酶谱和测序时,也常应用克隆。克隆探针一般较寡核苷酸探针特异性强,复杂度也高,从统计学角度而言,较长的序列随机碰撞互补序列的机会较短序列少,克隆探针的另一优点是,可获得较强的杂交信号,因为克隆探针较寡核苷酸探针掺入的可检测标记基因更多。但是,较长的探针对于靶序
用于检测植物组织RNA的原位杂交法
用于检测植物组织RNA的原位杂交法(一)组织切片制备l 植物组织的甲醛固定和包埋1.将植物组织切成小块,立即放入一个装有10~50ml固定剂溶液的烧杯中,把烧杯放到真空脱水机内。调节真空度以形成一个温和的真空,然后慢慢恢复常压。微量便于固定剂渗入组织,必须反复真空和非真空状态。待固定剂充分
RNA的Nouthern印迹和狭线杂交分析实验
实验材料 RNA试剂、试剂盒 DEPCMOPS甲醛琼脂糖乙酸铵NaOHNaClTris·Cl磷酸钠溴化乙锭SDS仪器、耗材 离心机电泳仪培养箱紫外线透照仪杂交炉实验步骤 1. 用72 ml 水溶解1 g 琼脂糖,在水浴中冷至60℃时,移至通风橱中加入10×MOPS电泳缓冲液和18 ml 12.3
分子杂交RNA探针的技术特点及应用介绍
RNA探针是一类很有前途的核酸探针,由于RNA是单链分子,所以它与靶序列的杂交反应效率极高。早期采用的RNA探针是细胞mRNA探针和病毒RNA探针,这些RNA是在细胞基因转录或病毒复制过程中得到标记的,标记效率往往不高,且受到多种因素的制约。这类RNA探针主要用于研究目的,而不是用于检测。例如,在筛
Northern印迹和总RNA杂交实验——Northern印迹分析
试剂、试剂盒甲醛凝胶溶液RNA 电泳缓冲液仪器、耗材凝胶模梳齿凝胶用具实验步骤1. 用肥皂和水彻底清洗凝胶模,梳齿和凝胶用具。2. 准备甲醛凝胶溶液。甲醛凝胶溶液(300 ml 1% 琼脂糖凝胶):琼脂糖,3.0 g10x RNA 电泳缓冲液,30 ml Milli-Q 或用玻璃器皿蒸馏过的
RNA的Nouthern印迹和狭线杂交分析实验
甲醛-琼脂糖凝胶电泳 实验材料 RNA 试剂、试剂盒
DNA可不可以与RNA杂交
可以。dna中的碱基可以和rna的碱基互补配对:a=u,g≡c。所以只要有互补的序列存在,dna与rna就可以杂交。比如,荧光原位杂交技术(fish)中使用的探针就可以是rna,与组织细胞的dna进行杂交。
关于反义RNA的注意点的介绍
[1]长的反义RNA并不一定比短的反义RNA更为有效; [2]在原核生物中针对SD序列及其附近区域的反义RNA可能更有效; [3]在真核生物中,对应于5'端非编码区的反义RNA可能比针对编码区的反义RNA更有效; [4]尽量避免在反义RNA分子中出现自我互补的二级结构; [5]设
核酶切割-RNA-专一位点
核酶切割 RNA 专一位点 实验材料 合成的核酶分子 切割底物RNA 试剂、试剂盒
核酶切割-RNA-专一位点
实验材料 合成的核酶分子切割底物RNA试剂、试剂盒 Tris-HClMgCl2实验步骤 一、材料与设备1)500 mmol/LTris-HCl(pH7.4)2)100 mmol/LMgCl23) 合成的核酶分子4) 切割底物 RNA二、操作方法1) 制备切割混合构:不超过 l0 pmol 底物 RN
并发转导与基因定位——三点杂交实验
实验方法原理本实验用噬菌体P22对鼠伤寒沙门氏菌进行并发转导(共转导),供体细菌中的两个连锁基因可被导入受体细菌中,与受体细菌中的一个可选择表型的基因进行三点杂交分析,用以确定这三个基因的排列顺序。若有三个基因,其野生型分别用A、B、C表示,相应的突变型基因分别记为a、b、c。若A、B、C三个基因的
细胞系的多位点DNA指纹检测——杂交
实验方法原理用标记的 M13 mp9 DNA 与 Southern 印迹后的细胞 DNA 杂交,严格冲洗后,通过放射自显影技术,观察与 M13 序列结合的 DNA 片段分布图谱 [ Westneat et al.,1988 ] 。试剂、试剂盒严谨冲洗液预杂交 杂交液20×SSC 储存液实验步骤1.
并发转导与基因定位——三点杂交实验
实验方法原理 本实验用噬菌体P22对鼠伤寒沙门氏菌进行并发转导(共转导),供体细菌中的两个连锁基因可被导入受体细菌中,与受体细菌中的一个可选择表型的基因进行三点杂交分析,用以确定这三个基因的排列顺序。若有三个基因,其野生型分别用A、B、C表示,相应的突变型基因分别记为a、b、c。若A、B、C三个基因
脱氧核酶切割-RNA-专一位点
实验材料 脱氧核酶 无RNA酶的DMA酶 切割底物RNA 试剂、试剂盒 5X反应缓冲液
脱氧核酶切割-RNA-专一位点
实验材料 脱氧核酶无RNA酶的DMA酶切割底物RNA试剂、试剂盒 5X反应缓冲液5X乙酸镁或氯化镁无水乙醇水饱和酚实验步骤 一、材料与设备1) 脱氧核酶 (其设计与制格参见脱氧核酶相关章节)2)5X 反应缓冲液:750Tnmol/LNaCl,200 mmol/LTris-HCl (pH8.0)3)5
3.7-核酶切割-RNA-专一位点
核酶是获得长片段 RNA 特定位点切割产物的有用工具,可用于研究 RNA 修饰,修饰位点分析,以及获得具布不间长度末端的 RNA 转录产物。实验材料合成的核酶分子切割底物RNA试剂、试剂盒Tris-HClMgCl2实验步骤一、材料与设备1)500 mmol/LTris-HCl(pH7.4)2)100
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控...
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R
RNA甲基化位点分析新方法
继上次QB期刊给大家推荐了WendyV. Gilbert教授的《关于pre-mRNA存在的修饰形式及其对剪接的影响》综述后,小编看到读者们的热情度特别高。借此机会,再给大家推荐一篇来自德克萨斯大学西南医学中心,QBRC、BICF中心主任谢阳教授实验室在QB期刊上发表的最新关于分析MeRIP-Se
3.8-脱氧核酶切割-RNA-专一位点
脱氧核酶是一类由三十几个脱氧核苷酸构成的寡聚脱氧核糖核苷酸,制备容易,使用方便,是体外在特定位点切割 RNA 的有效方法。常用于体外切割 RNA 底物的脱氧核酶是「10~23」型脱氧核酶。实验材料脱氧核酶无RNA酶的DMA酶切割底物RNA试剂、试剂盒5X反应缓冲液5X乙酸镁或氯化镁无水乙醇水饱和酚实
rna怎么保存可以时间长一点
1、以沉淀的形式保存在无水乙醇中;2、以溶液的形式冻存在-80冰箱,并且尽量少冻融;3、按试剂商提供的说法,保存在裂解液中可达2年;一般这种方法用的比较少,因为每次提RNA都是一气下来,中间没有停顿的,除非一次提很多,上午时间不够用,可进行到加入乙醇未知,然后放到-20度冰箱,下午可继续进行。