Northern杂交试验指导手册(5)-RNA探针制备
五、RNA探针制备(根据the DIG system user's guide)A. 地高辛标记的体外转录试剂及其配制(试剂盒提供):10× NTP标记混合物:in Tris-HCl (pH 7.5)10mmol ATP10mmol CTP10mmol GTP6.5mmol UTP3.5mmol DIG-UTP 10× 转录缓冲液:400mmol Tris-HCl(pH 8.0)60mmol MgCl2100mmol DTE(dithioerythritol)20mmol亚精胺100mmol NaCl1unit/mlRNase抑制剂。10unit/μl DNase I (RNase-free)20unit/μl Rnase抑制剂20unit/μl T7 RNA聚合酶和T3 RNA聚合酶4mol/L LiCl200mmol/L EDTADMPC-H2O 试验程序(带手套操作)1.在一经DMPC处理并高压......阅读全文
Northern杂交试验指导手册(5)-RNA探针制备
五、RNA探针制备(根据the DIG system user's guide)A. 地高辛标记的体外转录试剂及其配制(试剂盒提供):10× NTP标记混合物:in Tris-HCl (pH 7.5)10mmol ATP10mmol CTP10mmol GTP6.5mmol UTP3.5mm
Northern杂交试验指导手册(5)
E.杂交建议杂交条件:探针浓度50~100ng/ml,温度68℃过夜。1.将印迹膜置于装有预杂交液的杂交袋中(每100cm2膜20ml预杂交液),封好杂交袋,在设定的杂交温度下预杂交至少1小时。2.将探针在沸水浴中变性10min.(探针一经变性,立即使用),用预杂交液稀释成设定浓度。3.将杂交袋中
Northern杂交试验指导手册(1)-RNA提取
方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理), 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入250g异硫氰酸胍,加热至60~65℃并持续搅拌使之充分溶解。贮存液室温保存备用(不超过3个
Northern杂交试验指导手册
Northern杂交试验指导手册DIG标记的Northern杂交试验指导一、 RNA提取方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理), 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入25
Northern杂交试验指导手册(2)-RNA质量检测
二、RNA质量检测提取的RNA需要对其质量和数量进行检测。实验室常用的方法有紫外吸收值检测和电泳检测两种。方法一、紫外吸收检测试剂:TE ( 10mmol/L Tris, 1mmol/LEDTA)。dH2O试验程序1.预热紫外分光光度计10~20min.。2.取两个1ml的狭缝石英杯,一个装入1ml
Northern杂交试验指导手册(3)
试验程序1.在纯净工作台上将5ml含AP的LB液体培养基加入到一10~15ml通气良好的试管中,然后将前述经鉴定含有目的 DNA片断的转化细菌接种其中,37℃下振荡培养过夜。2.取1.5ml培养物置于一微量离心管中,在4℃下12000rpm离心2min.,弃去上清液,使细菌沉淀尽可能干燥。3.将细菌
Northern杂交试验指导手册(3)
A. 载体选择为了获得能够在体外转录RNA探针的DNA模板,其克隆载体必须带有可供选择的特异转录启动子,同时,为了获得理想的Northern杂交试验结果,载体选择带有两种不同类型而方向相反启动子的载体,以便在RNA探针制备时同时得到两条链的转录探针。常用的这类载体有:pGEM-3/pGEM-4 (
Northern杂交试验指导手册(2)
RNA样品质量分析:完整的总RNA样品应呈现出三条条带,分别为28S rRNA、18S rRNA、5S rRNA。其中28S rRNA条带的亮度应约为18S rRNA条带亮度的2倍,这表明RNA样品比较完整,基本无降解。如果两条带的亮度反过来,则说明RNA样品已发生降解。如果在点样槽内或槽附近有
Northern杂交试验指导手册(1)
一、RNA提取方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理), 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入250g异硫氰酸胍,加热至60~65℃并持续搅拌使之充分溶解。贮存液室温保存备
Northern杂交试验指导手册(4)
8.将样品测试条和对照测试条按下列顺序在上述准备的溶液中浸渍处理,两步骤直接让多余的溶液滴在吸水纸上。①. 封闭, 2min.→②. 抗体结合, 3min.→①. 封闭, 1min.→③. 洗膜, 1min. →④. 平衡, 1min. →⑤. 显色反应(黑暗),5-30min.9.显色反应30mi
Northern杂交试验指导手册(6)-Northern-印迹杂交
A. 探针准备DIG标记的RNA探针与DNA探针相比,显示较强的杂交信号和较地的非特异性背景,因此,只要可能选用RNA探针可以比DNA探针获得更好的杂交结果。如果必须使用DNA探针,建议使用高SDS杂交缓冲液或DIG Easy Hyb以减少背景。在正式杂交试验之前,优化杂交探针浓度是避免颜色背景所必
Northern杂交试验指导手册(4)-模板DNA的制备
A.质粒DNA的小量提取试剂及其配制含AP的LB液体培养基TE缓冲液:10mmol/L Tris-HCl (pH 8.0)1mmol/L EDTA (pH 8.0)溶液I: 25mmol/L Tris-Cl (pH 8.0)10mmol/L EDTA50mmol/L 葡萄糖高压灭菌15min.后,4
Northern杂交试验指导手册(7)-杂交结果检测
方法一、化学发光检测试剂及其配制:洗膜缓冲液:100mmol Maleic acid150mmol NaCl0.3%(v/v) Tween20pH 7.5Maleic acid缓冲液:100mmol Maleic acid150mmol NaClpH 7.5封闭液:5% (w/v) SDS17mmo
Northern杂交操作步骤和DNA探针的制备与标记(1)
一.原理Northern 杂交是用来测量真核生物RNA的量和大小估计其丰度的实验方法,可以从大量的RNA样本同时获得这些信息。其基本步骤包括:1. 完整mRNA的分离2. 根据RNA的大小通过琼脂糖凝胶电泳对RNA进行分离3. 将RNA 转移到固相支持物上,在转移的过程中,要保持RNA 在凝胶中的相
Northern杂交操作步骤和DNA探针的制备与标记(2)
(4) 将1 ~ 2 μl RNA 上样缓冲液加到乙二醛化的RNA 样品中,然后马上把RNA样品加到凝胶加样孔中,留着两边最外面的两个孔不要加样。将RNA 相对分子质量标准参照物加到最外面的孔中。(5) 以5V/cm 的电压进行电泳,直到溴酚蓝迁移大约8 cm。(6) 将凝胶放在保鲜膜上,在紫外灯下
Northern印迹和总RNA杂交实验——Northern印迹分析
试剂、试剂盒甲醛凝胶溶液RNA 电泳缓冲液仪器、耗材凝胶模梳齿凝胶用具实验步骤1. 用肥皂和水彻底清洗凝胶模,梳齿和凝胶用具。2. 准备甲醛凝胶溶液。甲醛凝胶溶液(300 ml 1% 琼脂糖凝胶):琼脂糖,3.0 g10x RNA 电泳缓冲液,30 ml Milli-Q 或用玻璃器皿蒸馏过的
Northern印迹和总RNA杂交实验
Northern印迹分析杂交和放射自显影试剂、试剂盒甲醛凝胶溶液 RNA 电泳缓冲液
Northern印迹和总RNA杂交实验
试剂、试剂盒 甲醛凝胶溶液RNA 电泳缓冲液仪器、耗材 凝胶模梳齿凝胶用具实验步骤 1. 用肥皂和水彻底清洗凝胶模,梳齿和凝胶用具。2. 准备甲醛凝胶溶液。甲醛凝胶溶液(300 ml 1% 琼脂糖凝胶):琼脂糖,3.0 g10x RNA 电泳缓冲液,30 ml Milli-Q 或用玻璃器皿蒸
Northern印迹和总RNA杂交实验
Northern印迹分析 杂交和放射自显影 试剂、试剂盒 甲醛凝胶溶液 RNA 电泳缓冲液
总RNA提取与Northern杂交(3)
第二天:将上述物品揭开,将胶正面朝下,膜正面朝上,用铅笔作好标记。将胶浸泡在EB中1-2分钟,用DEPC H2O清洗,将膜放在滤纸上面,夹好,4度下保存,或者直接进行预杂交。UV杂交(有助于RNA结合到膜上面)。五、预杂交和杂交预杂交和杂交 buffer: 100ul20×SSC 25ml (5×S
总RNA提取与Northern杂交(1)
一、 总RNA的提取1、 取组织10-50毫克,剪切成大小在0.5厘米以内的碎片,加入×5的RNA later(约2毫升)。样品在37度可保存1天。室温下1周,4度下1个月。2、 匀浆:用Rnase Erase spray(ICN)清理匀浆器头部(7mm),用DEPC水和乙醇清洗,将上述样品用镊
总RNA提取与Northern杂交(2)
4、Loading buffer(10ul每个样) 总体积 100ul 200 ul 500ul 10×MOPS
Northern杂交
Northern杂交1.在10~20 ml 预杂交液中68℃温育膜2h。2.若使用双链探针,在100℃下加热32P标记的双链DNA 5 min,使之变性,然后迅速移至冰水中冷却。3.把变性的或单链放射性标记的探针直接加到预杂交液中,在合适的温度下继续温育12~16h。4.杂交后,将膜从塑料袋中取出,
Northern杂交
实验概要本实验介绍了Northern杂交的基本流程。主要试剂液氮,TRIzol (Invitrogen),DEPC水,氯仿,异丙醇,70%酒精,酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),水饱和酚(PH4.3),无水乙醇,NaOAc,抽提缓冲液(0.02M NaOAc,1 mM EDTA,0.5% SD
Northern杂交
实验方法原理 转移并固定到膜上的 RNA 样品可以与特异的探针杂交,从而用来对所感兴趣的 RNA 进行定位。视实验人员和条件的差异,可以从多种方法中选择任意一种来标记和检测探针。用抑制非特异吸收探针的封闭试剂处理膜之后,在适于探针和固定的
Northern杂交
转移并固定到膜上的 RNA 样品可以与特异的探针杂交,从而用来对所感兴趣的 RNA 进行定位。视实验人员和条件的差异,可以从多种方法中选择任意一种来标记和检测探针。用抑制非特异吸收探针的封闭试剂处理膜之后,在适于探针和固定的靶 RNA 杂交的条件下将膜同探针孵育,而后广泛洗膜以去除非特异结合的探针,
Northern杂交
实验方法原理 转移并固定到膜上的 RNA 样品可以与特异的探针杂交,从而用来对所感兴趣的 RNA 进行定位。视实验人员和条件的差异,可以从多种方法中选择任意一种来标记和检测探针。用抑制非特异吸收探针的封闭试剂处理膜之后,在适于探针和固定的靶 RNA 杂交的条件下将膜同探针孵育,而后广泛洗
Northern-Blotnorthern杂交
Northern BlotPreparation of Formaldehyde Agarose GelThe gel conditions (1% agarose, 1X MOPS, 6.3% formaldehyde) are designed for ~4 hours of electroph
核酸杂交技术(Northern-Blot、Southern-Blot和探针标记)
(一)Southern Blot原理:将待检测的DNA分子用/不用限制性内切酶消化后,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,继而将其变性并按其在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的DNA或RNA探针进行反应。如果待检物中含有与探针互补的序列,则二者通过碱基互补的原理进
Northern印迹和总RNA杂交实验——杂交和放射自显影
实验材料mRNA试剂、试剂盒甲酰胺SSPEDenhardt 试剂SDS仪器、耗材滤膜实验步骤1. 滤膜进行 1~2 小时预杂交。在 42℃:50% 甲酰胺5x SSPE2 x Denhardt 试剂0.1% SDS或者在 68℃:6x SSC2x Denhardt 试剂0.1% SDS2. 把已变性