张锋等人Cell发表空间基因组学最新成果
如果要观察细胞,我们常常需要显微镜。现在,科学家已经开发出一种方法,可通过细胞自身的遗传物质对细胞进行“拍摄”,进而生成独特的可视化图像。虽然当前该方法生成的图像比传统显微镜图像要模糊,但这种方法或许可以帮助科学家们改进癌症治疗,并探索人类神经系统的形成过程等。 在今日发表于Cell杂志的重磅文章中,来自美国Broad研究所的三位科学家:Joshua A. Weinstein、Aviv Regev以及Feng Zhang(张锋),对这种空间基因组学方法进行了描述。研究人员介绍,该方法名为“DNA显微镜”(DNA microscopy)。它无需专门的昂贵光学设备,仅使用样本本身及相应试剂,就能使样本作为化学反应的一部分提供自身的空间信息,帮助阐明细胞和组织内遗传物质的空间组织结构。值得关注的是,该方法化学反应的产物可以直接通过DNA测序仪读出。图:“DNA显微镜”收集数据的可视化图像。来源:Joshua Weinstein/......阅读全文
张锋等人Cell发表空间基因组学最新成果
如果要观察细胞,我们常常需要显微镜。现在,科学家已经开发出一种方法,可通过细胞自身的遗传物质对细胞进行“拍摄”,进而生成独特的可视化图像。虽然当前该方法生成的图像比传统显微镜图像要模糊,但这种方法或许可以帮助科学家们改进癌症治疗,并探索人类神经系统的形成过程等。 在今日发表于Cell杂志的重磅
Cell:人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示新的治疗策略
近日,美国贝勒医学院及太平洋西北国家实验室的科学家们利用基因组蛋白组学相结合的分析技术首次对人类结肠癌的蛋白基因组进行了详尽的分析,全面剖析了结直肠癌相关生物标志物、药物靶点和肿瘤抗原,并在Cell杂志上发表题为“Proteogenomic Analysis of Human Colon Can
Cell-Stem-Cell
|泛素连接酶HECTD1通过协调核糖体大小亚基的组装来调控造血干细胞的再生能力 造血干细胞(Hematopoietic stem cell, HSC)具有自我更新和分化的功能。在正常生理状态下,HSC处于休眠状态,其蛋白合成速度受到严格地调控并维持在较低水平。当机体受到损伤时,HSC 能够迅速
Cell-to-Cell-Adhesion-Signaling
Interactions between cells responsible for cell to cell adhesion also can communicate signals into the cellular interior, often involving interactions
基因组学分析揭示
英国《自然》杂志18日在线公开的一篇基因组学论文显示,来自西伯利亚阿尔泰山脉东部尼安德特人的祖先,和现代人祖先的相遇与交融繁殖可能比原先认为的更早。已有证据显示,尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向现代人贡献了遗传物质。这项新研究还显示,大约在10万年前,现代人和尼安德特人之间
Cell-Thawing/Cell-Freezing-Protocol
Freezing Cells:Cells should be growing well or known to be in log phaseCount, collect and pellet cells in a 15mL test tubeResuspend in freezing media
Cell-Thawing/Cell-Freezing-Protocol
Freezing Cells:Cells should be growing well or known to be in log phaseCount, collect and pellet cells in a 15mL test tubeResuspend in freezing media
美印药物基因组学与癌症基因组学检测商业化
美国Companiondx实验室拟与健康信息技术服务商Enable Healthcare合作,向医生推广药物基因组学检测;印度癌症医学公司HCG宣布建立一个新的肿瘤基因中心,旨在下代测序技术能够帮助定位肿瘤,从而提高化疗和放疗的效率和响应率 美国药物基因组学检测商业化 Companiondx实验
Science专题:癌症基因组学
在2001年完成人类基因组测序后,许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近,越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向,测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异,以
毒理基因组学的定义
毒理基因组学(toxicogenomics)是从多基因、全基因组水平研究毒物作用与基因表达的相互影响。其研究内容主要包括3个方面:促进环境应激原与疾病易感性关系的理解、阐明毒性分子机制、筛选和确认与疾病和毒物暴露相关的生物标志物(biomarkers)。
药物基因组学的定义
药物基因组学(pharmacogenomics),又称基因组药物学或基因组药理学,是药理学的一个分支,定义为在基因组学的基础上,通过将基因表达或单核苷酸的多态性与药物的疗效或毒性联系起来,研究药物如何由于遗传变异而产生不同的作用。
Cell-Stem-Cell-|-连续取得进展!
下丘脑含有惊人的异质性神经元,可调节内分泌,自主神经和行为功能。然而,其分子发育轨迹和神经元多样性的起源仍不清楚。2021年4月21日,中国科学院遗传与发育生物学研究所吴青峰团队在Cell Stem 在线发表题为“Cascade diversification directs generati
表观基因组学研究指南(三)
今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal
-Science:宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
基因组学:-跨越癌症研究国界
1982年11月,在尼日利亚海军医院外足球场上踢球的一名军官,突然摔倒死亡。这名男子被带到急诊室时,当时还是一个新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade医生正在值班。“我们搞不明白为什么他死亡,这让我感到震惊,从那时开始我意识到,我需要做更多的工作来理解和帮助人们。”Ol
表观基因组学研究指南(一)
今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal of Bi
作物基因组学研究进展
摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组
In-Cell-ELISA
实验概要This protocol is a general protocol for ICE analysis and can be used with any of Abcam's ICE-validated antibodies. Antibodies are availabl
Cell-Stem-Cell:皮肤是突变的战场?
正常皮肤含有混杂的突变细胞,但很少有最终形成癌症的,科学家现在发现了原因。剑桥大学桑格研究所和MRC癌症研究所的研究员通过基因工程小鼠,发现皮肤组织中的突变细胞会相互竞争,只有适者才能生存。 9月27日发表在Cell Stem Cell杂志上的研究结果显示,人类正常皮肤对癌症的抵抗力比之前想象
Cell-Stem-Cell综述:干细胞免疫调控
免疫系统是我们机体对抗入侵病原体的第一道防线,也是组织发展,内环境稳态和伤口修复不可或缺的一部分。近年来,科学家们已越来越认识到免疫系统中的细胞和体液成分也有助于损坏组织的再生,比如四肢、骨骼肌肉、心脏和中枢神经系统中出现的损伤,因此在这一方面进行了大量的研究。 7月Cell Stem Ce
Cell-Stem-Cell揭示新癌症干细胞
日前,Lawson健康研究所的研究人员在结肠中鉴定到了与癌症生长有关的新干细胞群体。这项研究发表在Cell Stem Cell杂志上,将给结肠癌研究和治疗带来显著改变。 结肠癌(colon cancer)是一种常见的消化系统恶性肿瘤,发病率占胃肠道恶性肿瘤的第三位。随着饮食习惯的改变和人口老龄
Cell-Stem-Cell:叩开干细胞的家门
人类造血干细胞(HSC)可以通过造血过程生成成熟的血细胞,包括免疫系统的细胞。多年以来,科学家们一直在尝试解析调控造血干细胞功能和分化的具体机制。但这项工作并不简单,因为HSC只存在于骨髓的特殊区域(niche),体外培养很难重现这样的环境。 要对人类造血干细胞进行深入分析,就需要一个能够移植
Cell-stem-cell:纯化人类细胞新技术
多能干细胞研究之所以流行是因为在生物医学研究中,多能干细胞能够分化为任意细胞类型。但一些代表性的分化方法会导致异质性细胞群体的出现,这时候就需要将目的细胞进行纯化分离。 目前对这类细胞进行分离主要根据细胞表面的特征性受体不同,利用抗体进行分离筛选。但在一些情况下,这种分离方法的纯化水平很低,并
Cell-Stem-Cell:揭示细胞炎症记忆机制
当组织经历炎症时,它的细胞会记得。在炎症的高峰期,细胞将蛋白质固定在其遗传物质上,并将它们在最后斗争中所处的位置记下来。下次接触时,炎症记忆就会启动。这些细胞利用以前的经验来更有效地做出反应,即使是对它们以前从未遇到过的威胁也是如此。如果皮肤以前接触过刺激物,如毒素或病原体,它就会更快地愈合伤口
Cell-Stem-Cell:-帕金森发病机制新见解
在帕金森等神经退行性疾病中,特定的神经元的死亡会导致患者出现运动问题和其他症状。长期以来,科学家们致力于发现这些神经元死亡的原因。 最近,来自洛克菲勒大学的研究人员发现,帕金森氏病中受影响的神经元实际上会处于“关闭”而非“完全死亡”的状态。研究小组发现,这些不死的神经元释放出的化学物质也会使他
Cell-Stem-Cell发表重编程重要成果
再生医学旨在通过细胞移植替换人体内受损的细胞、组织和器官,是一个发展迅速的新兴领域。胚胎干细胞(ESC)能够形成胎儿体内所有类型的细胞、组织和器官,被视为细胞治疗的宝贵资源。然而ESC在实际应用中遭遇了两大瓶颈,免疫排斥和伦理问题。 细胞重编程可以绕过人类胚胎干细胞的伦理争议,近年来受到了广泛
Isolation-of-cell-nuclei-for-the-application-in-the-cellfree-system
Characteristics of the procedurePreparation of isolated nuclei - procedurePreparation of radioactive labeled nucleiMaterial Characteristics of the pro
Cosmid-Cloning:-Cell-preparation,-DNA-packaging,-and-Cell-Transfection
Cosmid Cloning: Cell preparation, DNA packaging, and Cell TransfectionProtocol taken from Stratagene's Gigapack packaging extracts instruction man
Method:-Reactivating-Cell-Lines-and-Cell-Growth-for-DNA-Preparation
Purpose:Cell lines are reactivated and grown to a count of 1 x 108 cells. The cells are pelleted and stored frozen at -80 degrees C prior to DNA extra
药物基因组学发展和应用【一】
影响患者对药物反应的因素有很多,包括患者本身的内在因素如年龄、性别、种族/民族、遗传、疾病状态和器官功能,还有其它生理变化,包括怀孕、哺乳以及外源性因素如吸烟和饮食。基因变异可导致疾病表现和药物反应的多样性这一观念目前已得到广泛认可,并经许多的研究证实。对于一些遗传因素影响研究比较明确的药物,在治疗