科学家发布生物进化与多组学综合分析软件
随着二代测序成本的不断降低以及三代、四代测序技术的快速发展,越来越多生物物种的全基因组序列被解读出来,多组学数据呈现爆发性增长的态势。然而,数据的高效挖掘和深度解析却是生物学家面临的又一难题。为了解决这一难题,中国科学院上海营养与健康研究所隶属的中科院计算生物学重点实验室和中科院北京基因组研究所、中科院北京生命科学研究院、中科院生物化学与细胞生物学研究所、上海生物信息技术研究中心、中科院动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心等多家单位组成联合攻关团队,开发了一个针对生物进化和多组学综合分析的免费软件eGPS 1.0 (http://www.egps-software.org),并提供免费云计算服务。 eGPS软件包括单机软件版本eGPS Desktop和云计算eGPS Cloud,能够在不同平台下运行,且利于开发,易于应用。通过eGPS Cloud,将基因组分析、群体数据分析、进化数据分析、网络分析以及图形可视化这五部分的分析......阅读全文
科学家发布生物进化与多组学综合分析软件
随着二代测序成本的不断降低以及三代、四代测序技术的快速发展,越来越多生物物种的全基因组序列被解读出来,多组学数据呈现爆发性增长的态势。然而,数据的高效挖掘和深度解析却是生物学家面临的又一难题。为了解决这一难题,中国科学院上海营养与健康研究所隶属的中科院计算生物学重点实验室和中科院北京基因组研究所
GCMS+多组学软件包高效开展合成生物学代谢途径分析
合成生物学领域是备受关注的新兴领域。通过设计和构建新的生物系统,或者改造现有的生物系统,合成生物技术能够实现生物体的功能改造和新功能的创造。合成生物学在医药领域具有巨大的应用潜力。通过合成基因组和基因编辑技术,设计特定的药物合成途径,并改造微生物,使其能够高效地生产药物及中间体。这对于药物开发和生
LCMS,GCMS数据分析软件:多组学分析软件包
本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理
教育部【设备更新】来了!岛津LCMS,GCMS数据分析软件:多组学分析软件包
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中海油田多组学测序分析检测采办计划公告
中海油田服务股份有限公司多组学测序分析检测采办计划公告,为便于供应商及时了解项目采办信息,现将(多组学测序分析检测)的采办计划公开如下: 本次公开的采办计划是本项目采办工作的初步安排,实际采购应以相关采购公告和采购文件为准,所有提供和反馈的信息只作为项目采办参考。 本次公告有效期是(2023
中药多组学研究取得重大突破
中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研
首个菊科多组学数据平台AMIR发布
10月8日,华中农业大学果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室、药用植物资源可持续利用团队梅之南教授和杨庆勇教授课题组,发布了首个专门面向菊科植物的多组学数据库平台——Asteraceae Multi-omics Information Resource(AMIR)。该平台涵盖了74种菊科植物的多
中药多组学研究取得重大突破
中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研
水稻多器官单细胞多组学图谱问世
记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。 单细胞组学是近年来生命科学
首个免疫衰老多组学数据库设立
记者12月17日从中国科学院基因组所(国家生物信息中心)了解到,该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作,建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory,旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老
解析肿瘤HiC多组学研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
植物多组学比较和进化研究平台发布
近日,西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台,相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础,而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用,在
单细胞多组学高通量测序平台(二)
虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F
CASMS分论坛:多组学整合与大数据
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中,哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验
单细胞多组学高通量测序平台(一)
一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治
Illumina完成收购SomaLogic,强势整合多组学版图
美通社消息,2026年1月30日 ,Illumina公司(纳斯达克股票代码:ILMN)今日宣布,已完成对数据驱动的蛋白质组学技术领导者SomaLogic的收购。此次收购将高度互补的蛋白质组学能力纳入Illumina的多组学产品组合,加强客户大规模获取蛋白质组学洞察的途径,以助力加速药物发现并对医
MassARRAY®-分析软件
MassARRAY® 分析软件是一套模块化应用程序,用于基因分型、甲基化、基因表达、拷贝数变异等多种应用的数据分析。以MassARRAY® Typer4软件为例,该软件用于MassARRAY系统的iPLEX SNP基因分型。用户可利用它进行分析结果的评估和管理,通过表格和图形格式进行数据的可视化,
多组学关联分析鉴定耐多药结核病血清标志物
肺结核(TB)的流行,特别是耐多药结核病(MDR-TB),已成为今天结核病治疗的一个重大挑战。浙江大学细胞生物学研究所李继承教授领衔的课题组采用iTRAQ标记结合2D LC-MS/MS,以及Solexa测序对MDR-TB患者,药物敏感结核病(DS-TB)患者,和健康对照组血清中的蛋白质组和miR
改善蛋白组学研究图像分析的新软件
对双向电泳(2DGE)等蛋白分离实验的图像进行分析不仅耗时,而且经常丢失样本或得出假阳性结果。上周在伦敦举行的AngloNordic Biotech Conference IV会议上 ,瑞典Ludesi公司CEO Ola Forsstrom-Olsson宣布这种现状将有可能得到改善,其公司已经获得了
多组学手段揭示苦荞“不怕冷”的奥秘
苦荞 董玉梅摄低温胁迫是影响植物生化、分子、代谢调控的主要环境因素之一。长期在暴露于低温而引导植物胁迫耐受性的提高,即耐寒性或冷驯化。阐明植物对低温响应的分子机制对育种和基因发掘至关重要。有研究表明苦荞可以通过增加花色苷和原花青素的积累增强其耐寒性。苦荞的每个器官几乎都含有芦丁,包括种子
单细胞多组学整合技术有了新突破
近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。细胞是生物体内发挥功能的基本结构单元。单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术,能够检测单个细
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析(GWAS)是通过推断
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
单细胞多组学整合技术有了新突破
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516674.shtm近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能
空间多组学质谱技术研讨会(2023)
空间多组学技术结合了组学技术(如基因组学、转录组学、蛋白质组学、金属组学等)和组织学技术,有助于更好地理解生物体内各种生物分子与金属元素在空间上的分布、相互作用及其对生理功能和疾病发生发展的影响。 质谱成像技术是近年来快速发展的空间多组学技术之一,可以在组织的空间层面上同时测定多种生物分子(如
P4-China-2016多组学与系统生物学论坛
P4 China 2016国际精准医疗大会将于2016年12月16-18日于北京召开,由中国生物工程学会,上海商图信息咨询有限公司(BMAP)等多家单位联合举办。峰会将会邀请近60位演讲嘉宾,预计近800位精准医疗行业与临床科研资深人士与会。 个体化精准诊疗医学是近年卫生保健领域发展最广泛、最
动物所等建立衰老生物学多组学数据库
随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。 中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研
P4-China-2016多组学与系统生物学论坛
自从精准医学概念提出以来,它一直都是全球最热的研究领域,政府的大力支持也了推动精准医疗行业的蓬勃发展。对于任意一项划时代的大工程而言,基础科研永远是其第一驱动力。P4 China 2016 多组学与系统生物学论坛,从系统生物学出发,对生物信息学与生命组学技术进行了深入探讨,并分享了科研成果应用于
研究人员建立衰老生物学多组学数据库
随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。 中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研究所(