第五届全国生物信息学大会召开
第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会日前在哈尔滨召开,来自海内外的600余位生物信息学专家、学者出席会议。与会专家以“高通量时代的生物信息学与系统生物学”为主题,分别就利用基因组信息学分类细菌的新方法、细菌基因组组织形式、系统生物学在医学发展中的应用和研究策略以及基因组非编码区研究进展与方向等问题进行了深入探讨。 会议由中国细胞生物学学会、清华大学主办,哈尔滨医科大学承办。 中国科学院院士郝柏林、张春霆、陈润生,中国工程院院士刘德培、杨宝峰以及美国得克萨斯大学教授Michael Zhang、哈佛大学教授Shirley Liu等15位著名专家学者作了专题报告。 据与会专家介绍,生物信息学是一门交叉学科,主要是通过计算的方法进行生物医药问题的定量研究,其在基因组、蛋白质组、代谢组等高通量组学研究中居主导地位,在生物进化分析、表观遗传研究、生理和疾病机制探讨、新型药物研发等领域起着举足轻重的作用。 系统......阅读全文
非编码RNA在细胞分裂过程中对于染色体稳定的作用研究
为了确保在所有细胞中遗传密码的一致性,我们的细胞必须精确复制并在每个细胞周期中将其染色体均等地分布到其两个子细胞中。染色体分离的错误导致细胞染色体数目异常,这可能导致自然流产,遗传性疾病或癌症等的发生。为了确保染色体的正常分离,着丝粒具有十分重要的作用。着丝粒是染色体上独特的DNA区域,在细胞分
长非编码RNA调控炎症小体组装激活研究中取得进展
4月3日,中国科学技术大学教授吴缅研究组在国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上在线发表题为The lncRNA Neat1 promotes activation of inflammasomes in macrophages 的研究论文。 在固有免疫反
我科学家发现一类新型长非编码RNA
国际著名学术期刊《分子细胞》近日以封面故事发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文,揭示了一类全新内含子来源的长非编码RNA的产生机制,及其参与剪接调控的重要功能。这将为进一步了解PWS综合征的病理机制提供新的研究思路。 几乎所有哺乳动物细胞的基因
中国科大在动物长链非编码RNA研究中取得进展
中国科学技术大学生命科学学院非编码RNA功能及功能机理研究团队近日在国际期刊《基因组生物学》(Genome Biology)发表了题为Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章,报道了
曹雪涛团队再发Nature——揭示新型非编码RNA调控网络
先天性免疫反应可保护宿主免受病原体感染,并向病原体施加进化压力,以减弱这些反应并确保其存活和复制的策略。这些不断变化的压力导致了跨宿主-病原体相互作用的先天性免疫稳态的复杂机制,但尚未得到全面了解。尤其是,更好地了解控制宿主与病原体相互作用并促进入侵病原体清除或逃逸的调节剂,可以确定传染病和慢性
基因组所发表长非编码RNA分类问题综述文章
近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的“百人计划”研究员章张及其团队,与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology)开展科研合作,对长非编码RNA的分类问题进行了系统综述,相关论文在RN
“非编码RNA调控作用”重大研究计划2015项目指南
国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2015年度项目指南,请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事项申报。 附件:“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2015年度项目指南 国家自然科学基金委员会
研究发现空气污染诱发肺癌关键长链非编码RNA
中科院动物所周光飚研究组通过深入研究,发现了空气污染诱发肺癌的关键长链非编码RNA。相关成果日前发表于肿瘤学杂志Oncotarge。 据了解,肺癌已成为全球发病率最高、致死人数最多的癌症,其中90%的肺癌由吸烟、空气污染等环境因素引起。然而,空气污染诱发肺癌的分子机制目前尚不清楚。 此前研究
中科院Nature子刊发表非编码RNA研究重要发现
来自中科院动物研究所生物膜与膜生物功能国家重点实验室的研究人员在新研究中证实,CARL lncRNA通过破坏miR-539依赖性的PHB2下调,抑制了心肌细胞中缺氧诱导的线粒体分裂和凋亡。 领导这一研究的是中科院动物研究所细胞增殖与信号调控研究组组长李培峰(Pei-Feng Li)
长链非编码RNA对脑生长起重要作用
“长非编码RNA通常被描述为‘基因组的暗物质’。在这里,我们系统地研究了它们对大脑发育、长期记忆储存、衰老和痴呆导致的记忆力下降的分子机制,”Puthanveettil说。 RNA是细胞的主要调节因子,是读取、转录和调节DNA表达以及构建蛋白质的小型核苷酸链,虽然科学家们已经掌握了脑细胞之间如
中山大学RNA团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库
中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。 Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚
百人计划范祖森团队揭示非编码RNA维持细胞静息态的机制
在国家自然科学基金重大研究计划项目(项目编号:91640203)等资助下,中国科学院生物物理研究所范祖森研究员在环状RNA调控造血干细胞稳态机制领域取得突破进展,揭示了一类特殊的环状RNA维持LT-HSCs (Long-term Hematopoietic Stem Cells,长期造血干细胞)
第五届全国生物信息学大会召开
第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会日前在哈尔滨召开,来自海内外的600余位生物信息学专家、学者出席会议。与会专家以“高通量时代的生物信息学与系统生物学”为主题,分别就利用基因组信息学分类细菌的新方法、细菌基因组组织形式、系统生物学在医学发展中的应用和研究策略以及基因组非编码
从心脏病到癌症——长非编码RNA到底发挥了什么作用?
直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA,非编码RNA不能翻译为蛋白质,但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一,她最近获得了欧洲研究委员会(ERC)的ERC高级研究员资助,这使她能够对另一群非编码
上海生科院总结多种基因内部来源的非编码RNA生成机制
10月1日,中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所研究员杨力受邀在WIREs RNA 发表了题为Splicing noncoding RNAs from the inside out 的综述论文,系统总结了多种来自于前体RNA内部序列的非编码RNA分子及其产生机制和潜在功能作用。 真核基
第二军医大学Hepatology解析癌症与非编码RNA
来自第二军医大学的研究人员发现,一种癌胚胎非编码RNA通过稳定NOP2促进了肝癌细胞增殖以及获得干细胞样特性。这项研究已被在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology(最新影响因子12.003)接受并在线发布。 第二军医大学的孙树汉(Shu-Han Sun)教授、李文(Wen Li)副教授以及李
华人学者Cancer-Cell:首张人类癌症非编码RNA综合图谱
随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加,从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因(占总数的不到2%),而70%的基因组被转录为非编码RNA。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发
李培峰教授Cell、Nature子刊非编码RNA研究重要发现
青岛大学转化医学研究院院长李培峰(Pei-Feng Li)教授曾在国际上首先提出“抗氧化酶自身被氧化”的新理论,是国际上少数几个最早将细胞凋亡引入心血管研究的科学家之一。近日李培峰教授领导的研究小组连接在非编码RNA研究领域取得重要研究发现,相关论文发表在《分子细胞》(Molecular Cel
微生物所揭示CMV非编码卫星RNA的起源和发生
烟草植物感染黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)以后,随着连续继代和病毒感染,一个长链非编码RNA(long non-coding RNA)神奇地出现并被称为CMV卫星RNA(satellite RNA,satRNA)。satRNA因能够利用CMV编码的复制酶进行复
Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27
科学家通过多种方法探究长链非编码RNA
直到今天,针对lncRNA的简洁且合理的分类系统仍遥不可及。长链非编码RNA的概念模型 2013年,一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系,并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一,但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是,其中有1
中科大揭示长片段非编码RNA促进肿瘤生长机制
记者从中国科学技术大学获悉,该校生命科学学院吴缅和梅一德教授研究组,揭示了长片段非编码RNA通过调控肿瘤细胞瓦伯格效应促进肿瘤生长的机制。相关研究近日在线发表在国际著名学术期刊《细胞》子刊《分子细胞》。 肿瘤细胞即使在有氧状态下也优先进行糖酵解,而不是通过产能效率更高的氧化磷酸化途径为细胞生长
Cell:神秘的非编码RNA在基因表达中起重要作用
在细胞中,DNA被转录成RNA,提供给细胞制造蛋白质的分子配方。大多数的基因组被转录成RNA,但实际上只有一小部分的RNA是来自于基因组中的蛋白质编码区域。 宾夕法尼亚大学Perelman医学院Penn表观遗传学研究所主任Shelley Berger博士说:“为什么非编码区能转录?它们的功能一
陈润生:人类遗传密码的“暗能量”备受关注
在自然科学中,没有一个领域受到如此强烈的关注。 “物理当中我们尚未解的、最重要的部分是暗能量,它大约占整个物质世界的70%,非编码序列在整个人类遗传密码中实际上也是这个数量级的。”6月23日,在中国第一届分子诊断技术大会上,生物信息学家、中国科学院院士陈润生说。
北京基因组所合作开发完成长非编码RNA数据库
长非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是近年来国际研究的新热点,与人类癌症、神经系统等疾病发生密切相关,在疾病诊疗方面表现出了潜在的重大应用价值。虽然长非编码RNA表达量相对较低,但由于其在转录、基因组印记、翻译、可变剪切、转录后表达调控、蛋白运输与定位等过程的
Cancer-Cell:隐藏在“垃圾DNA”中的癌基因
科学家们一直致力于在基因组中寻找与癌症有关的遗传学改变。在此基础上,人们对癌症的理解以及癌症治疗都取得了巨大的进展。 这类研究大多关注基因组的编码区域,但这一区域只占到人类DNA的2%,应该还有大量癌症相关突变发生在非编码DNA上。非编码DNA曾被称为“垃圾DNA”,虽然人们早已知道它们其实并
长非编码RNA的又一重要功能:调控学习记忆
中国科学技术大学的研究人员发表了题为“Activity dependent LoNA Regulates Translation by Coordinating rRNA Transcription and Methylation”,首次发现并命名了长非编码RNA LoNA,揭示了LoNA通过
研究鉴别出控制前列腺癌进展的特殊非编码RNA—HULLK
日前,一项刊登在国际杂志Molecular Cancer上的研究报告中,来自弗吉尼亚健康系统大学的科学家们通过研究鉴别出了控制前列腺癌生长和进展的关键RNA—HULLK,前列腺癌是男性中第二大常见的癌症类型,每年在美国会引发超过3万名患者死亡;HULLK或许有望帮助研究人员开发阻断前列腺癌进展的
揭秘非编码RNA在卵巢癌发生发展中的作用
四川大学华西医院周圣涛教授擅长肿瘤、子宫肌瘤以及子宫内膜异位等良恶性妇科疾病的诊断和治疗。近期,该课题组应用美国Arraystar LncRNA芯片分析了趋化因子CXCL14介导的卵巢癌细胞中长链非编码RNAs(lncRNAs)的表达情况,筛选到大量异常表达的lncRNAs,并且对其中的LIN
中国科大在长链非编码RNA调控肿瘤形成研究中取得进展
7月1日,中国科学技术大学生命科学学院教授梅一德研究组在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上在线发表题为Long noncoding RNA EMS connects c-Myc to cell cycle control and tumorigenesis的研究论文。 c-Myc作为促癌蛋白