朱健康研究团队发现植物DNA主动去甲基化新机制
7月30日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation in Arabidopsis 的研究论文。该研究发现了植物DNA主动去甲基化的完整调控途径，详细阐述了植物DNA主动去甲基化的最新机制。同时，该研究揭示了拟南芥SWR1复合体通过识别常染色(组蛋白乙酰化)和异染色(DNA甲基化)标记物而被招募到染色质上的靶向机制。 DNA甲基化修饰发生于胞嘧啶的第五位碳原子上，是一种很重要的、保守的表观遗传学标记。DNA甲基化与DNA去甲基化决定了生物体内的甲基化水平和图谱。在植物中，DNA主动去甲基是一个在去甲基酶的作用下甲基基团被移去的过程(Zhu, Annu Rev Genet, 200......阅读全文
植物总DNA提取方法和过程
植物总DNA提取植物总 DNA 的提取有多种方法,转基因食品检测中不同用途的 DNA 提取应该采用各自适宜的方法进行。下面介绍用于新鲜或干燥的植物性食品检测的常见 DNA 提取方法。1、可用于 PCR 的粗提液微量制备1)原理与特点利用搅拌破碎食品组织,碱液破坏细胞壁然后再用缓冲液进行提取。此法主要
DNA去甲基化酶催化作用介绍
DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脱掉甲基化碱基的反应，等同于被损伤的DNA在糖苷酶及无碱基核酸酶酶切偶联催化下的修复反应。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是体内侯选去甲基化酶。此外，甲基化CpG结合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。
研究揭示受精卵DNA去甲基化重要机制
近日，中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现，小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段，均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化，DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生，而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊《细胞—干细胞》。 该研究由中科院上海生
陈柏仰博士Cell揭示DNA去甲基化动态
精子和卵子融合是动物个体发育的起点，不过这一过程并不仅仅是简单的融合。人们发现，在哺乳动物胚胎的早期发育中，全基因组的甲基化模式会发生明显的变化。在小鼠胚胎受精之前，雌雄生殖细胞具有较高的甲基化水平，受精后父源基因组迅速的发生主动去甲基化，而母源基因组发生被动的去甲基化。 为了了解人类生殖细胞
广州生物院发现DNA被动去甲基化的新作用
DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表观遗传学修饰之一，多项生物学过程均涉及DNA甲基化水平的调控。近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院郑辉课题组通过研究细胞增殖过程中DNA甲基化（胞嘧啶的甲基化）的调控，发现DNA被动去甲基化的新作用。相关研究成果在线发表在Journal of Biol
广州生物院发现DNA被动去甲基化的新作用
DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表观遗传学修饰之一，多项生物学过程均涉及DNA甲基化水平的调控。近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院郑辉课题组通过研究细胞增殖过程中DNA甲基化（胞嘧啶的甲基化）的调控，发现DNA被动去甲基化的新作用。相关研究成果在线发表在Journal of Biol
植物组织制备基因组DNA实验
实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部， 从而达到提取的目的。实验材料 植物组织试剂、试剂盒 抽提缓冲液十二烷基肌氨酸钠TE异丙醇溴化乙锭氯化铯仪器、耗材 离心机实验步骤 收取1
植物组织制备基因组DNA实验
氯化铯法 CTAB法 实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则
植物组织中DNA的提取与测定
一、原理 脱氧核糖核酸（deoxyribonucleicacid，DNA）是一切生物细胞的重要组成成分，主要存在于细胞核中，盐溶法是提取DNA的常规技术之一。从细胞中分离得到的DNA是与蛋白质结合的DNA，其中还含有大量RNA，即核糖核蛋白。如何有效地将这两种核蛋白分开是技术的关键。D
SDS法提取植物基因组DNA
本方法由Dellaporta,Wood和Hicks(1983)的方法修改而成。其基本原理是研磨的组织细胞用热的SDS裂解后，加入高浓度的KAc，0℃放置以除去蛋白和多糖类杂质，最后用乙醇或异丙醇沉淀。一 材料、试剂和仪器1 材料 新鲜的组织材料或-80℃冻存的材料2 试剂(1)提取缓冲液Tris-H
DNA甲基化预测
实验概要本实验分别对DNA片段、基因、启动子和外显子进行了甲基化的计算预测，并且随机选择了1000甲基化的和1000未甲基化的个体进行预测。用于甲基化预测的特征有：GC相关特征、四联体频率、转录因子结合位点(TFBSs)。所有预测方法均采用Weka提供的软件进行。实验步骤1. DNA甲基化数据本研究
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
DNA纯化去杂质实验
这周我们来讨论一项常用的技术，即使常用但仍引起部分人核酸分离焦虑症。那就是基因组DNA的纯化去杂质。场景是这样的：你有一份采自南太平洋中部一个偏僻小岛上首次发现的古老兰花品种根际土壤样品。你使用了非PowerSoil Kit法提取其中的微生物DNA。最终DNA含有太多杂质，无法PCR扩增。因此需要去
裴端卿组综述DNA去甲基化的级联调控模型
中国科学院广州生物医药与健康研究院裴端卿课题组综合近期体细胞重编程过程中TET相关DNA去甲基化的研究进展【1】和之前的相关研究，对细胞命运变化过程中的DNA甲基化模式重排过程和级联调控模型进行了调研，提出偶联TET进行DNA去甲基化可能是转录因子打开染色质的一种基本模式，该综述以The Bat
研究首次揭示DNA主动去甲基化可靶向病毒基因
βC1在体外和体内增强DME活性。中国农科院植保所供图 近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队联合清华大学生命科学学院，首次发现植物病毒可以利用植物的DNA主动去甲基化机制来逃逸植物的防御反应，相关研究结果在线发表于《自然—通讯》（Nature Communicati
植物总DNA的快速少量抽提实验
CTAB法 实验方法原理 CTAB法：该方法简便、快速，DNA产量高(纯度稍次，适用于一般分子生物学操作)。 CTAB是一种非离子去污剂，植物材料在CTAB的
植物总DNA抽提方法和优缺点
1、植物DNA的CTAB提取法：经典方法。效果较好，污染少。多用于核基因组提取。2、SDS提取法：较为简易，提取的为全基因组，但有蛋白污染可能。3、简易“一管法”提取方法：4、PCR研究的快速提取法：以上两者方法简单，快速，但污染多，不适合做酶切等操作。5、酚类、多糖类物质较多的植物DNA提取法：多
粗提取植物DNA的实验步骤和原理
提取植物DNA常用的方法是CTAB法。原理：CTAB是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl)，CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物，只是不能沉淀核酸。通过有机溶剂抽提，去除蛋白，多糖，酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分
植物和动物DNA提取方法有何不同
后面的步骤都一样，就是前处理所用的方法和试剂不太一样，植物需用机械或酶去壁，动物需用胰蛋白酶去膜。当然这里的动物DNA提取指的是动物组织DNA的提取，如果用动物血就要简单的多了。所谓前处理，指的就是裂解的过程，让细胞破碎，使DNA跑出来，然后对DNA进行收集。
利用CTAB法提取植物基因组DNA
一、实验原理 CTAB（十六烷基三甲基溴化铵）是一种去污剂，可溶解细胞膜并能与核酸形成复合物，该复合物在高离子强度（0.7mol/L）的溶液里是可溶的，通过离心可将复合物同蛋白质、多糖类物质分开。在酚仿变性的条件下，去除残留的CTAB和蛋白质等杂质，然后利用异戊醇或无水乙醇将DNA分
植物总DNA的快速少量抽提实验
实验方法原理 CTAB法：该方法简便、快速，DNA产量高(纯度稍次，适用于一般分子生物学操作)。 CTAB是一种非离子去污剂，植物材料在CTAB的处理下，结合65 °C水浴使细胞裂解、蛋白质变性、DNA被释放出来。CTAB与核酸形成复合物，此复合物在高盐（>0.7 mM）浓度下可溶，并稳
DNA甲基化技术介绍
DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，是目前新的研究热点之一。介绍DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶（DN
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性
DNA甲基化的原理
DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶（DNA methyltransferase，DNMT）的催化作用下，以S—腺苷甲硫氨酸（S—adenosyl methionine，SAM）作为甲基供体，通过共价键结合的
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性
上海生科院发现植物去甲基化调控的新机制
2月12日，国际权威学术期刊《分子细胞》（Molecular Cell）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组的研究论文The Methyl-CpG-Binding Protein MBD7 Facilitates Active DNA Demethylat
华南植物园鼎湖山植物DNA条形码研究获进展
日前，中科院华南植物园研究人员在鼎湖山木本植物DNA条形码研究方面取得重要进展。相关结果在线发表于《多样性及其分布》上。 DNA条形码技术是一种利用标准的简短基因片段来实现物种快速识别的工具。动物界，线粒体COI基因应用非常成功。但是在植物界，由于进化历史复杂，标准条形码还没有达成共识。 针
上海生科院发现Gadd45a参与DNA去甲基化的机制
4月6日，国际学术期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所徐国良研究组题为Gadd45a promotes DNA demethylation through TDG 的最新研究成果。该研究发现Gadd45a
上海生科院揭示拟南芥DNA主动去甲基化调控新机制
12月9日，《细胞研究》（Cell Research）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase c
上海生科院合作揭示受精卵DNA去甲基化重要机制
9月11日，国际学术期刊《细胞—干细胞》（Cell Stem Cell）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所徐国良研究组、李劲松研究组和北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组的最新研究成果Active and Passive Demethylation