Nature:新研究让mRNA转录本上的m6A标记不再神秘

在一项新的研究中,来自美国康奈尔大学和密歇根大学的研究人员发现在一些mRNA转录本上出现的化学修饰可能在一定程度上有助于细胞在遭受损伤后进行自我修复,并且也可能是了解重要的人类疾病的关键。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“m6A enhances the phase separation potential of mRNA”。 这类称为N6-甲基腺苷(N6–methyladenosine, m6A标记)的化学修饰是在某些条件下由酶作用于一些人体基因的mRNA转录本上产生的,但是这些标记的功能在很大程度上是未知的。在这项新的研究中,这些研究人员发现m6A标记可导致含有m6A的mRNA储存在细胞的特殊液滴状区室(droplet-like compartment)中。在正常情形下,这些mRNA会被细胞中的蛋白制造工厂---核糖体---翻译为蛋白,但是它们在液滴状区室中的隔离有效地阻断了蛋白产生。他们发现的证据......阅读全文

北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6A甲基化修饰调节mRNA选择性剪接规律过程中,发现了读码器YTHDC1通过招募前体mRNA剪接因子SRSF3同时抑制剪接因子SRSF10与RNA的结合,促进外显子被保留的分子机制。该研究结果于2016

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用

  文章导读   表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症治疗

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。这一次,研究重大发现m6A修饰在“人类繁衍”中也发挥着重大意义,该方向的发现将会吸引着更多的科研工作者探究在m6A与“不孕不育”的密切联系。云序生物一

mRNA差异显示技术(mRNA-differetial-display)(2)

6.技术路线 mRNA 差异显示技术 The fluoroDD System •Builds on the HIEROGLYPH™ system –TMR-labeled anchored primers –Increased primer concentrations –I

mRNA工艺技术平台之mRNA制剂

  mRNA疫苗或药物的生产工艺,主要分为质粒DNA原液制备、mRNA原液制备、mRNA制剂制备三个阶段。本文讨论第三阶段的工艺平台,也是当前挑战最大的环节。  关键的制剂技术突破解决了mRNA的成药性问题,使其从60年的科研之路走向临床商业化应用,并在此次新冠疫苗应用中大放异彩。据公开信息, BN

mRNA差异显示技术(mRNA-differetial-display)(1)

1.概 述mRNA差异显示技术(mRNA differetial display)是一种快速有效的克隆差异性表达基因的方法。 方法建立:1992年 Liang P和Pardee首次应用DD技术对比人类乳腺癌细胞与正常细胞所表达的mRNA,以此来克隆癌细胞所特有的基因 目前已应用于个各领域:

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(二)

4.ALKBH5抑 制胰腺ai细胞生长和转移将过表达ALKBH5的ai细胞移植到裸鼠体内,发现过表达ALKBH5的ai细胞生成的肿 瘤体积明显小于对照组,并且细胞生长的指示分子Ki-67的表达也明显降低。染色显示过表达ALKBH5的组织中侵袭和转移的指示分子MMP-2和MMP-9表达降低,敲

植物所揭示莱茵衣藻m6A表观转录组图谱

  m6A是广泛存在于真核生物mRNA中的表观修饰,与RNA命运相关。近年来,m6A修饰在植物胚胎发育、茎尖分生组织的命运决定、表皮毛发生、根部发育、叶形态发生、开花转变、胁迫响应、果实成熟及孢子发生等多个生物学过程中发挥重要功能。然而,m6A在藻类中的功能尚不清楚。藻类包含从单细胞到多细胞的多种细

LncRNA搭上m6A后逆袭为新星

m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell,Cell

SMAD2/3与TGFβ通路协同影响转录因子发生m6A-RNA甲基化调...

SMAD2/3与TGF-β通路协同影响转录因子发生m6A RNA甲基化调控干细胞发育文章导读:胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚

带你解析肿瘤预后模型研究套路

    研究背景  头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是全球人类第六大最常见的恶性肿瘤,超过50%的HNSCC确诊患者处于晚期。免疫系统的失衡在以免疫抑制性疾病为特征的HNSCC的发展中起着至关重要的作用。因此,应进一步探索肿瘤免疫微环境(TIME)的调节机制,以确定可精确预测预后及优化免疫疗法的有效生

动物所等揭示m6A修饰调控哺乳动物造血干细胞发育的机制

  血液,犹如生命的“河流”,静静地在生物体内流淌,哺育着每一个“细胞”。然而,成体血液的再生与再造,一直是临床恶性血液疾病治疗过程中难以攻克的瓶颈。作为脊椎动物血液的源泉,具有自我更新和多系分化潜能的造血干细胞的体外诱导和扩增,一直是组织器官再造的前沿课题,更是众多恶性血液疾病患者的希望。由于对血

中国科学家8月参与发表多篇Nature文章

  8月中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表,其中包括m6A修饰在T细胞介导的病理机制中的体内生物学功能,beta2肾上腺素受体复合物结构,以及SPOP基因突变对药物耐药性发展的影响。  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可

RNA甲基化促进草莓成熟

  果实中富含的营养成分是人类膳食结构的重要组成部分,对人体健康不可或缺。果实品质在成熟过程中逐渐形成,受到精确调控。解析果实成熟调控机制,将为果实品质改良和新品种选育提供理论基础。根据成熟机制的不同,果实可分为两种类型:呼吸跃变型(如番茄、苹果、香蕉)和非呼吸跃变型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素

Nature-Immunology:微小的变化如何帮助T细胞存活

由LMU和Helmholtz Munich免疫学家Vigo Heissmeyer和Taku Ito-Kureha组成的研究小组揭示了T细胞中m6A修饰的基本功能。甲基化是核酸的化学修饰,不仅存在于DNA上,也存在于RNA上。这种甲基化对某些类型的细胞是否重要,以及它对体内细胞的相互作用有什么影响,根

研究人员揭示了T细胞中m6A修饰的基本功能

由LMU和Helmholtz Munich免疫学家Vigo Heissmeyer和Taku Ito-Kureha组成的研究小组揭示了T细胞中m6A修饰的基本功能。甲基化是核酸的化学修饰,不仅存在于DNA上,也存在于RNA上。这种甲基化对某些类型的细胞是否重要,以及它对体内细胞的相互作用有什么影响,根

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(三)

总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法,研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性,改善了体内肿 瘤生长,而ALK

m6A调控肿瘤细胞上皮间质化-促进肿瘤EMT及侵袭转移

  2019年5月6日,中山大学药学院王红胜团队在国际知名杂志Nature Communications期刊上发表题为“RNA m6A methylation regulates the epithelial mesenchymal transition of cancer cells and tr

肿瘤免疫治疗有望:促使T细胞功能失调的新机制被发现

  肿瘤免疫治疗为癌症患者带来新的治疗手段和希望,在多种肿瘤类型中得到了成功应用。一部分病人可以响应免疫治疗并取得理想的治疗效果,但大部分病人对免疫治疗无法产生响应。其中一个重要原因是其肿瘤微环境中T细胞的功能已经处于不可逆的失调状态。研究表明,肿瘤相关巨噬细胞是诱导T细胞功能失调的主力军之一。作为

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症治疗

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。这一次,研究重大发现m6A修饰在“人类繁衍”中也发挥着重大意义,该方向的发现将会吸引着更多的科研工作者探究在m6A与“不孕不育”的密切联系。云序生物一

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用(三)

(5)酶METTL3作用分子机制研究已表明Mettl3是一种甲基化转移酶,可以调控靶分子的甲基化水平,那么是如何调节糖代谢过程呢?现有实验已表明Mettl3敲除或过表达不仅影响HK2和SLC2A1的甲基化水平,还调节HK2和SLC2A1的表达水平,这暗示着靶分子甲基化水平影响其表达,而双荧光素酶实验

三个月内搞定5分m6A甲基化谱文章

关于m6A修饰的研究在生物领域持续火热,近年国自然立项和文章发表数目保持指数增长趋势,2020年pubmed收录文章已经高达652篇。云序生物在m6A修饰测序领域具有丰富的经验,近期云序客户又连发了5篇m6A甲基化测序研究的文章,下面小编就带大家一起来分析下这几篇发表文章的研究思路,给想短时间内发表

m6A文章盘点(二)

是不是甲基化一定发生在mRNA的3’UTR区域才能有重要作用呢?在这篇Nature Communication文章当中的故事则有所不同。上皮间质转换(epithelial-mesenchymal transition)是癌细胞转移的重要步骤,在这一过程当中发现mRNA的m6A水平会有所升高,

SMAD2/3与TGFβ影响转录因子发生m6ARNA甲基化调控干细胞发育

  文章导读:   胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天,分享一

Nature揭示RNA修饰在大脑功能和性别决定中的重要作用

  RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用,兼具信息分子和调控分子双重功能。据估计RNA上有一百多种化学修饰,但绝大多数修饰的功能还鲜为人知。本期Nature发表的一项研究指出,RNA修饰对果蝇神经系统的功能至关重要,也在性别决定起到了重要作用。  N6-methyladenosine(m6A)是真

Nature-Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制

m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最常见的一类化学修饰,其建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶(writer)、结合蛋白(reader)以及去甲基化酶(eraser)的动态可逆调控。研究表明,m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动,参与调控机体的诸多生理或病理进程,包

陈建军/杨建华/何川/黄刚-揭示RNA-m6A由组蛋白修饰决定

  近年来,RNA表观遗传学的研究发现RNA甲基化修饰,特别是m6A甲基化修饰,在哺乳动物的转录组中广泛存在,并且在多种生理和病理过程中发挥着重要的生物学功能,引领了RNA以及表观遗传学领域的又一个热潮。高通量测序揭示在人和小鼠的转录组中有1/3-1/2的mRNA转录本具有m6A修饰【1,2】。理论

m6A文章盘点(一)

19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成

Nature-|-m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成

  目前来说,调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能,今天不会大家一一来讲,而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白,它主要通过与mRNA的m6A位点结合,在脑神经发育[1],多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。   文章导读:   2018年10月31日,美国芝加哥大学何

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...3

总结: 细胞的生长与分化依赖于基因的调控表达方式,越来越多的研究表明m6A 甲基化在更多领域发挥着关键作用,而本文作者正是利用多组学MeRIP, RIP, CoIP, CHIP(云序生物提供此服务)等多种技术联合分析,揭示了m6A修饰通过影响Camkk2转录的稳定性和Ppm1a的翻译效率调节LC