新发现，曹晓风／钱文峰揭示蛋白翻译的调控新机制
多聚腺苷酸化在真核生物中产生成熟mRNA中起关键作用。人们普遍认为，聚（A）结合蛋白（PAB）与聚（A） -尾mRNA均匀结合，调节其稳定性和翻译效率。尽管PAB的重要性及其与mRNA poly（A）尾部的普遍结合，PAB结合的分子功能仍不清楚。 2019年9月3日，中国科学院遗传发育研究所曹晓风及钱文峰共同通讯在Genome Biology 在线发表题为“Impact of poly(A)-tail G-content on Arabidopsis PAB binding and their role in enhancing translational efficiency”的研究论文，该研究发现AtPAB2，AtPAB4和AtPAB8的纯合三重突变体是胚胎致死的。为了理解分子基础，研究人员描述了这些PAB的RNA结合全景。AtPAB结合效率在基因中变化超过一个数量级。为了确定考虑变化的序列，研究人员执行p......阅读全文
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（二）
二、用 于 鉴 定 P T M 的富 集 技 术2.1 磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸残基的可逆磷酸化也许是研究最为深人的 PT M 。蛋白质磷酸化信号网络介导细胞对与不同的应激因子、生长因子、细胞因子以及细胞间相互作用作出响应。憐酸化还影响多种细胞进程，如增殖、凋亡 、迁移 、转录和蛋白
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（一）
一、引言蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T M ) 在 细 胞 生 物 调 节 中 发 挥 着 基 本 作 用 。 P T M 是 m R N A 翻译 后 蛋 白 质 的 酶 促 共 价 化 学 修 饰 。蛋 白 质 化 学 修 饰 非 常 重 要 ，因 为 它 们 会 潜 在 地
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验6
七、P T M 的定量分析当研究 P T M 的生物学意义时，如能了解一个特定修饰或一组P T M 的相对或绝对丰度通常会有帮助。这样可以将不同的生物样品间的目的修饰进行直接比较。例如, 将正常与疾病状态下细胞或组织内某一 P T M 的丰度进行比较。定量分析这些变化能够帮助深人了解 P T M 在
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验3
三、蛋白质的硝化修饰酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的（Yeo et al.，2008)。活性氮和活性氧能够靶向于DNA、脂
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（四）
三、蛋白质的硝化修饰酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的（Yeo et al.，2008)。活性氮和活性氧能够靶向于D
RNA翻译与蛋白质折叠之间的微妙舞蹈
在蛋白质的合成过程中，RNA翻译会影响蛋白质的折叠，而蛋白质折叠也会影响RNA的翻译。 在过去的十年里，我们对细胞内蛋白质合成方式的认知取得了快速的增长，其中包括蛋白质合成的各个基本步骤：转运RNA（transfer RNA， tRNA）是如何高保真、高速率地对信使RNA（messenger
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验2
二、用 于 鉴 定 P T M 的富 集 技 术2.1 磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸残基的可逆磷酸化也许是研究最为深人的 PT M 。蛋白质磷酸化信号网络介导细胞对与不同的应激因子、生长因子、细胞因子以及细胞间相互作用作出响应。憐酸化还影响多种细胞进程，如增殖、凋亡 、迁移 、转录和蛋白质翻译（W
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（三）
2.2 糖基化糖 基 化 是 一 种 常 见 的 P T M , 并 且 已 经 证 明 能 够 影 响 酶 的 活 性 、蛋 白 质 定 位 、稳 定 性 、信 号 转 导 、细 胞 黏 附 和 蛋 白 质 相 互 作 用 (Spiro, 2002k 目 前 已 经 发 现 在 肿 瘤 恶
蛋白质红外特征峰的范围
蛋白质红外特征峰的范围：1250～4000 CM∧-1。蛋白质红外特征峰红外射线（IR）或者单独成为红外线是指那些能量在电磁波频谱范围内，频率比可见光略低的，但是又比无线电波频率高的射线。相应地，红外线的频率高于微波，但是低于可见光。红外光的波长在几个微米（符号μ，1μ=10-6m）或者纳米范围内（
遗传发育所植物组蛋白H3K27me3去甲基化酶研究获进展
PcG介导的组蛋白H3第27位赖氨酸上三甲基化（H3K27me3）在基因沉默和发育调控中起着至关重要的作用。小鼠胚胎干细胞中超过10%的基因受该种修饰调控，拟南芥中超过7,000个基因受该修饰调控。拟南芥中H3K27me3主要由CLF和SWN两个甲基转移酶催化，并招募LHP1结合以有效抑制基因表
新研究揭示水稻组蛋白甲基化调控根系核心菌群
根系微生物组与植物的养分吸收、抗病抗逆等生长发育过程密切相关，其在植物根系的定殖和组装受环境和植物遗传途径等因素的影响。表观遗传调控是调节染色体行为和基因表达的重要机制，探究表观遗传途径与植物根系微生物的关系能够更系统地揭示植物生长发育过程。表观遗传调控与宿主微生物组的关系已在动物模型中得到研究
蛋白水解酶的调控作用
体内很多重要的生理效应与蛋白酶的生物调控有关，如表中所列，当机体受到外界刺激作出相应的生理反应时就动员体内蛋白酶使原来不具有生理活性的某些多肽或蛋白质，迅速成为功能很强的相应产物，从而达到机体的防御、生存与繁殖的目的。有的动员过程较简单，可通过一次催化反应来完成。如胃肠道中无活性的胰蛋白酶原当其
PNAS解析调控心脏收缩的争议蛋白
目前，布兰迪斯大学的研究人员，解开了心脏细胞中负责调控心脏收缩蛋白的一个有争议的结构。相关研究结果发表在2014年3月3日的《PNAS》杂志。 电压门控钾离子通道是分布最广、类型最多的一类离子通道，它存在于所有的真核细胞内，主要参与细胞膜静息电位和动作电位复极化过程的调节，决定着动作电位的
钙调蛋白参与调控靶酶活性
Ca2+-CaM复合体具有结合并调控下游靶酶的功能。现已确定的靶酶有磷酸化酶激酶、鸟苷酸环化酶、磷脂酶A2、肌球蛋白轻链激酶、磷酸二酯酶、钙调蛋白激酶（CaMK）等。Ca2+-CaM复合体形成后，下游的靶酶活力会有不同程度的增加。在动物中，钙调蛋白在肾上腺和脑中 cAMP的合成与降解的过程中扮演
研究发现重要肝脏免疫调控蛋白LSECtin
日前，由军事医学科学院院长、中国科学院院士贺福初领导的蛋白质组学国家重点实验室、北京蛋白质组研究中心发现了一种重要的肝脏免疫调控蛋白LSECtin(肝窦内皮细胞C型凝集素)，相关成果在线发表于国际一流专业杂志《胃肠病学》(Gastroenterology)。 长期以来，肝脏作为机体的代谢、
支架蛋白CRIP1参与蛋白质稳态调控机制被阐明
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516055.shtm
支架蛋白CRIP1参与蛋白质稳态调控机制被阐明
近日，中国医学科学院血液病医院（中国医学科学院血液学研究所）郝牧研究员、邱录贵主任医师团队在eBioMedicine杂志发表论文，在国际上首次阐明了支架蛋白CRIP1参与自噬、蛋白酶体活性等蛋白质稳态调控的分子机制，及其在多发性骨髓瘤（MM）增殖、耐药、疾病复发中的作用及分子机制。 多发性骨髓
神经退行性变与蛋白质翻译相联系
为探究与神经退行性与认知缺陷有关的新突变，研究人员已经发现在同一关键通路中起作用的两个小鼠基因丢失时，就会导致神经退行性变。惊人的是，这两个基因都与蛋白质翻译有关，其中一个编码在大脑特异表达的转运RNA基因—这是首例在脊椎动物中差异表达的基因。在理论上，真核生物需要编码大约42个不同的tRNA基因来
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（一）
每年三月初，都是科研界的“高考”倒计时，因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况，蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明，磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目，总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案解析
细菌类组蛋白HNS翻译后修饰研究取得进展
基因组压缩与动态调控是生命体共通的科学问题。细菌缺乏真核生物核小体结构，依赖H-NS等核结合蛋白实现基因组的压缩与调控功能。H-NS可沉默原噬菌体、毒力岛等外来基因元件，维持基因组稳定性。此前研究发现，细菌能在特定环境下解除H-NS的沉默并激活外源基因表达，这一过程是细菌环境适应的关键过程。但细
水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展
蛋白质的翻译后修饰，如磷酸化、乙酰化等，是调节蛋白质生物学功能的关键步骤，是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础，也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广，其研究极具挑战性。近期，中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（一）
每年三月初，都是科研界的“高考”倒计时，因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况，蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明，磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目，总研究资助金额超过2亿。继上周的肠道微生物研究方案解析后（国自然冲刺：打通菌群
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（二）
由此可见，泛素化相关基金无论是申请项目数还是金额数均在向磷酸化逼近，甚至从重点项目数看，18年泛素化的项目数已然超过了磷酸化。进一步统计表明，泛素化研究资助项目在医学部中一共98项，总资助金额高达4700万元。由此可见，泛素化的相关研究正是科研界的“当红小生”，基金申请的一大热点。图2.国自然基金项
新方法分析临床样本中的组蛋白翻译后修饰
欧洲肿瘤研究所（EIO）等机构的研究人员开发出一种基于质谱的流程，可分析FFPE临床样本中的组蛋白翻译后修饰。他们于上周在《Molecular & Cellular Proteomics》上详细介绍了这种技术。 利用这种技术，研究人员分析了一系列乳腺癌样本，发现Luminal A型乳腺癌和三阴
厦门大学Genome－Res解析水稻基因调控机制
可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)是一种普遍存在于真核生物中的基因调控机制。APA事件的发生能使一个基因产生多种mRNA转录本，从而增加转录本的复杂度。选择不同的多聚腺苷酸化位点可以使不同的转录本具有不同的编码序列，或具有不同长度的3'
用akata纯化蛋白时为什么不出峰
这原因很多主要是看具体的实验条件比如蛋白上柱后发生了变性，一般的洗脱缓冲液无法洗脱，所以就不会出峰或者上样的时候弄错了样品阀，样品未进入AKTA系统的紫外检测池，自然也不会出峰
MALDI打出来的蛋白峰拖尾
出现的拖尾峰可能原因有：1.筛板堵塞，指柱子两头的过滤筛板，如果堵塞，样品就会在筛板部分受阻而形成时间延迟，使得样品在柱后流出时峰型形成拖尾；2.色谱柱塌陷，是指色谱柱由于其它原因引起了柱效率丧失不能对物质形成保留，使得物质不在固定相上保留而随流动相流出，但是又还有一点柱效，因此形成拖尾，即很宽的有
用akata纯化蛋白时为什么不出峰
这原因很多主要是看具体的实验条件比如蛋白上柱后发生了变性，一般的洗脱缓冲液无法洗脱，所以就不会出峰或者上样的时候弄错了样品阀，样品未进入AKTA系统的紫外检测池，自然也不会出峰
用akata纯化蛋白时为什么不出峰
这原因很多主要是看具体的实验条件比如蛋白上柱后发生了变性，一般的洗脱缓冲液无法洗脱，所以就不会出峰或者上样的时候弄错了样品阀，样品未进入AKTA系统的紫外检测池，自然也不会出峰
钱书兵博士Nature－Methods发表新测序技术
细胞有一套精妙的机制，根据环境变化调整蛋白质合成的速率。翻译调控大多发生在起始阶段，通过快速改变蛋白的表达水平，帮助细胞灵活应对外界压力。 尽管人们早就意识到翻译起始的重要性，但直接检测单个mRNA的起始率一直比较困难。对起始密码子进行系统性作图，精确检测相应的起始率，无疑将为翻译调控领域带来