不同核苷酸状态下Snf2核小体复合物的冷冻电镜结构
SWI/SNF家族蛋白利用ATP水解产生的能量移动核小体在基因组DNA的位置,重塑染色质。这对于控制遗传物质的开放性,调节基因转录等方面发挥重要作用。陈柱成实验室近期报道了Snf2与核小体结合的结构。但这个早期的工作并没有明确检测到DNA移位。 染色质重塑蛋白如何利用ATP水解的能量推动核小体滑移依然是一个让人困扰的难题。图1 Snf2-核小体复合物在不同核苷酸状态的整体结构以及核小体滑动模型这个研究基础上,陈柱成继续与李雪明实验室合作,利用冷冻电镜技术,进一步确定了在不同核苷酸(ADP和ADP-BeFx)状态下Snf2-核小体复合物的高分辨结构(图1)。他们发现在一个ATPase循环过程中,Snf2存在打开-闭合的构象变化。在打开状态下,Snf2在核小体结合点(SHL2)引起1bp DNA的凸起,这个形变沿DNA链向入口端传递,使得 1bp DNA被拉入核小体。而且DNA前导链比后随链有更明显的移动,显示DN......阅读全文
科学家揭示相关组蛋白甲基化活性的串扰调控机制
上海交通大学医学院附属第九人民医院上海精准医学研究院黄晶课题组首次揭示了染色质的核小体结构对组蛋白修饰酶MLL(Mixed Lineage Leukemia)复合物的酶活调控及其分子机制,阐明了组蛋白H2B第120位赖氨酸(H2BK120)的单泛素化修饰对MLL甲基化活性的串扰调控机制,并发
冷冻电镜样品冷冻
样品冷冻样品冷冻其实是科学家们很早就想到的思路,但是冷冻之后样品中水分子形成冰晶,不仅产生强烈电子衍射掩盖样品信号,还会改变样品结构。直到1974年,Kenneth A. Taylor和Robert M. Glaeser在-120℃观察含水生物样品时未发现冰晶形成,而且发现冷冻样品能够耐受更大剂量和
冷冻电镜技术总结
冷冻电镜技术从建立到现在在结构测定中取得了快速的发展,这也表明了了对整个细胞和细胞器的分子成分的空间结构的描述可能很快就会成为常规方法。冷冻电镜单粒子法既可以对具有对称结构的大分子进行研究,也适合于研究结构不规则的大分子复合物,对于分子量的上限没有什么限制,理论上>100kD的分子在成像技术能够保证
Science:结构上揭示核小体依赖性的cGAS抑制机制
在一项新的研究中,来自美国北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员首次确定了先天免疫系统中一种名为cGAS的关键DNA感应蛋白与核小体结合在一起时的高分辨率结构,其中核小体是细胞核内最重要的DNA包装单位。相关研究结果于2020年9月10日在线发表在Science期刊上,论文标题为“Structura
研究解析糖皮质激素与GPR97和Go蛋白复合物冷冻电镜结构
中国科学院上海药物研究所研究员徐华强团队与山东大学教授孙金鹏团队、浙江大学教授张岩团队等首次解析了糖皮质激素与其膜受体GPR97和Go蛋白复合物的冷冻电镜结构,这也是国际上首次解析的黏附类GPCR与配体和G蛋白复合物的高分辨率结构。相关研究成果以Structures of glucocortic
上海九院发表Cell,Nature,Science,在结构领域取重大进展
混合谱系白血病(MLL)家族的甲基转移酶 -包括MLL1,MLL2,MLL3,MLL4,SET1A和SET1B-在赖氨酸4(H3K4)上实现组蛋白H3的甲基化,并且在造血,脂肪生成和发育中的转录调节中具有关键和独特的作用。目前关于MLL活性调节的知识仅限于组蛋白H3肽的催化,以及H3K4甲基标
关于核小体的实验研究介绍
早在1956年为双螺旋模型提供X衍射证据的Wilkins和另一位科学家Vittorio Luzzati对染色质进行了X衍射研究,发现染色质中具有间隔为10 nm的重复性结构。蛋白质和DNA本身的结构从来不会表现出这种重复性。推测可能是组蛋白和DNA的结合方式迫使DNA折叠或缠绕成具有10 nm周
核小体的临床意义介绍
抗核小体抗体比抗dsDNA抗体、抗组蛋白抗体更早出现于系统性红斑狼疮的早期,并且特异性较高。阳性率为50-90%,特异性>98%。每个核小体单位包括200bp左右的DNA超螺旋和一个组蛋白八聚体及一个分子H1;组蛋白八聚体构成核小体的盘状核心结构;146bp的DNA分子超螺旋盘绕组蛋白八聚体1.
核小体的重要意义介绍
在80%的MRL/lprDIL小鼠中可产生核小体特异性抗体,该自身抗体产生早,先于其他抗核抗体,与肾小球肾炎有关。SLE患者多克隆核小体特异性自身抗体的抗原反应与鼠类SLE模型表现相似,核小体在SLE中作为主要自身抗原已得到证实。靶器官中免疫复合物的沉积和炎性介质(包括补体)的大量活化是引起SL
核小体的基本原理
人们接着用化学交联、高盐分离组蛋白,以及X衍射等方法进一步研究组蛋白多聚体的结构、排列以及怎样和DNA结合的,从而建立了核小体模型。1984年Klug和Butler进行了修正。核小体的构造可用图表示:每一个核小体结合的DNA总量为200bp左右,一般在150~250变化范围(micrococcal
Nature:解析核小体的重塑机制
在细胞核中,基因组DNA紧紧包裹在核小体上形成染色质,但基因在如此紧密的包装中是无法表达的。现在德国慕尼黑大学LMU的研究团队,揭示了局部释放核小体DNA的分子机制,正是这一机制使染色体DNA得以转录。文章发表在本期的Nature杂志上。 高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环
核小体的基本单位
核小体是染色体的基本单位,是染色质的基本结构亚基。生物学意义揭示了DNA作为遗传物质稳定性的结构特征;确认了碱基互补配对原则。
核小体核心的基本概念
中文名称核小体核心英文名称nucleosome core定 义由4种组蛋白各两分子组成的八聚体结构。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)
免疫复合物包被小体的基本信息
中文名称免疫复合物包被小体英文名称immune complex-coated body;iccosome定 义指长期留存于滤泡树突状细胞伸展的树突部位的抗原-抗体复合物,参与B细胞激活和免疫记忆。应用学科免疫学(一级学科),免疫系统(二级学科),免疫细胞(三级学科)
生物物理所揭示开放核小体导致染色质松散的分子机制
常规核小体的结构包括一个由四种组蛋白H2A、H2B、H3、H4组装而成的蛋白核心,一条在组蛋白核心上缠绕1.6圈、长度为147 bp的双链DNA。核小体具有稳定的结构,对DNA组成和组蛋白修饰的改变均不敏感。组蛋白变体可改变核小体和染色质结构调控基因转录,在迄今测定的所有单核小体结构中,组蛋白H
BRCA1BARD1复合物特异识别泛素化核小体促进同源重组修复
DNA双链断裂(DNA double-strand breaks,DSBs)是真核细胞中最严重的DNA损伤类型之一,单个裸露的DSB即可诱发细胞凋亡。DSB主要通过非同源末端连接(NHEJ,non-homologous end-joining)和同源重组(HR,homologous recomb
什么是核小体核心颗粒?
中文名称核小体核心颗粒英文名称nucleosome core particle定 义由长度为146 bp的DNA区段与各两分子的H3/H4/H2A/H2B组蛋白八聚体组成。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇核小体装配
中文名称:核小体装配英文名称:nucleosome assembly定 义:在核小体装配因子调节下,由DNA链和组蛋白组装成核小体的过程。装配先以两分子H3/H4组蛋白构成的四聚体与DNA结合,再结合上两分子H2A/H2B组蛋白构成的四聚体,形成核小体核心颗粒,再与H1组蛋白连接形成核小体。应用学
中国科学家首次阐明了H2A.Z核小体的优先识别机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506108.shtm8月2日,中国科学院生物物理研究所周政课题组联合本所李国红、朱平课题组等在国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表论文,报道了人源SUV420H1结合H2A.Z核小
冷冻电镜
说起冷冻电镜,小编想不管是研究生还是教授大咖,可能和科研有那么一丁点联系的人对这个名字都不会陌生,因为它实在太出名了!基于冷冻电镜产出的科研成果很多都发表在Nature、Science、Cell等顶刊上(羡慕脸),堪称NSC神器。冷冻电镜技术的发展直接带动了生命科学领域,特别是结构生物学的飞速发展,
施一公等在《科学》发文报道酵母剪接体三维结构
2016年12月16日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公教授研究组于(Science)杂志就剪接体的结构与机理研究再发长文(Research Article),题为《酵母剪接体处于第二步催化激活状态下的结构》(Structure of a Yeast Step II Catal
开年新篇!施一公团队Science再发剪接体新成果
2016年1月8日,清华大学生命学院施一公教授研究组在《科学》(Science)就剪接体的结构与机理研究再发长文(Research Article),题为《U4/U6.U5 三小核核糖核蛋白复合物3.8埃的结构:对剪接体组装及催化的理解》(The 3.8 A Structure of the U
通过扫描电镜成像观察不同的微结构
通过扫描电镜成像观察不同的微结构 通过调整一些蚀刻参数,例如时间(如图3所示的SEM图像)和KOH浓度(如图4所示),可以制作出不同形状的微结构。 在*种情况下,温度影响到微金字塔的高度和墙壁结构。通过改变浓度,微观结构的形状从正方形变为八角形,方角变为了圆形。 图3: 通过 SEM 对在不同时间段
研究揭示Gabija复合物抗噬菌体侵染的分子机理
为了应对噬菌体的入侵,原核生物演化出多种精巧的免疫系统以实现自我保护。对原核生物免疫系统的深入研究催生了多种具有里程碑意义的分子生物学工具,包括在分子克隆实验中广泛应用的限制性核酸内切酶系统,以及在基因编辑领域中大放异彩的CRISPR-Cas系统等。然而,细菌和古菌基因组中还有一大批功能尚不明确的原
关于核小体的检测技术的介绍
许多不同的技术已被用于检测AnuA,除了LE细胞试验以外,还有染色质包被的串珠乳胶凝集试验,以及免疫沉淀(用天然组织蛋白重组酸萃取的组织部分和ELISA法都已被使用。早期的研究用“脱氧核苷蛋白”作抗原研制出一种孵育在1M生理盐水中的染色质中的预备品,但未得到明确鉴定。后期报道已有更好的方法来鉴定
核小体的研究进展的介绍
国内已有少数医院开展了AnuA的检测,也已发表了数篇相关报道。有文献报道,以核小体多肽特异性抗原治疗鼠狼疮模型的研究发现,核小体多肽特异性抗原可以抑制TH细胞和B细胞的激活,从而为研究SLE的发病机制治疗带来了新的曙光[20]。但需要指出的是:AnuA的检测对SLE的诊断有重要意义,不同的核小体
冷冻电镜在结构生物学中的战绩
冷冻电镜在结构生物学中的战绩从NSC等顶刊的发文情况及源源不断的生物大分子结构被解析出来,冷冻电镜在结构生物学领域取得的巨大成功无需赘述。单单以中国大陆为例,基于冷冻电镜技术在结构生物学领域取得的重大进展就十分可观,具体如表1所示[5](2016年)。而随着冷冻电镜技术的大热,国内的许多高校、科研院
冷冻电镜 细胞内分子结构测定
细胞内分子结构测定:从溶液内(in vitro)到细胞内(in situ)当前的高分辨分子结构基本都是在溶液中提纯出来的分子样品,也就是通常所说的in vitro 实验。现在可以利用快速冷冻的方法把细胞固定,再用高能粒子枪对细胞进行高精度切片。在细胞的某些部位,常常有大量同类分子聚集,比如在内质网
冷冻电镜从静态结构到动态分子电影
从静态结构到动态分子电影生物分子在室温下是活跃的,而且大多数的分子功能是通过结构的变化来实现的。基于X射线, 尤其是最近发展的X 射线自由电子激光(XFEL)的结构生物学的研究重点之一便是实现时间分辨的结构生物学研究(time-resolved structure determination)。到目
冷冻电镜技术等解析多巴胺受体DRD1Gs信号复合物
西安交通大学物理学院教授张磊团队与四川大学、山东大学、国家蛋白质中心(上海)、香港中文大学等单位合作,采用冷冻电镜技术在多巴胺受体调节机制方面取得重大进展。近日,该研究相关成果以《DRD1-Gs信号复合物的配体识别和变构调控》为题在线发表在《细胞》上。 作为一种能够给人带来愉悦感受的神经递质