不同核苷酸状态下Snf2核小体复合物的冷冻电镜结构
SWI/SNF家族蛋白利用ATP水解产生的能量移动核小体在基因组DNA的位置，重塑染色质。这对于控制遗传物质的开放性，调节基因转录等方面发挥重要作用。陈柱成实验室近期报道了Snf2与核小体结合的结构。但这个早期的工作并没有明确检测到DNA移位。 染色质重塑蛋白如何利用ATP水解的能量推动核小体滑移依然是一个让人困扰的难题。图1 Snf2-核小体复合物在不同核苷酸状态的整体结构以及核小体滑动模型这个研究基础上，陈柱成继续与李雪明实验室合作，利用冷冻电镜技术，进一步确定了在不同核苷酸（ADP和ADP-BeFx）状态下Snf2-核小体复合物的高分辨结构（图1）。他们发现在一个ATPase循环过程中，Snf2存在打开-闭合的构象变化。在打开状态下，Snf2在核小体结合点(SHL2)引起1bp DNA的凸起，这个形变沿DNA链向入口端传递，使得 1bp DNA被拉入核小体。而且DNA前导链比后随链有更明显的移动，显示DN......阅读全文
核小体模型的建立基础和研究
人们接着用化学交联、高盐分离组蛋白，以及X衍射等方法进一步研究组蛋白多聚体的结构、排列以及怎样和DNA结合的，从而建立了核小体模型。1984年Klug和Butler进行了修正。核小体的构造可用图表示：每一个核小体结合的DNA总量为200bp左右，一般在150~250变化范围（micrococcal
核小体核心颗粒的基本概念
中文名称核小体核心颗粒英文名称nucleosome core particle定 义由长度为146 bp的DNA区段与各两分子的H3/H4/H2A/H2B组蛋白八聚体组成。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
抗核小体抗体检测的原理
将高度纯化的核小体靶抗原固定于微孔板上，患者血清中的抗核小体抗体可与之结合，通过辣根过氧化物酶（HRP）标记的第二抗体（抗人IgG）反应及酶底物／色原显色，即可检测此抗体。
抗核小体抗体的检测及应用
凋亡细胞是核小体的重要来源，当SLE患者的吞噬细胞对凋亡细胞的清除能力受损或降低，导致核小体在患者体内大量存积，多聚核小体与活化的单核细胞结合后被抗原递呈细胞呈递给CD4+Th2细胞，Th2细胞增殖活化，激活B细胞产生抗核小体抗体(AnuA)。 AnuA特异性高，与SLE病情活动性相关，通常采
细胞化学词汇核小体核心颗粒
中文名称：核小体核心颗粒英文名称：nucleosome core particle定 义：由长度为146 bp的DNA区段与各两分子的H3/H4/H2A/H2B组蛋白八聚体组成。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
又1篇Science！施一公组发表冷冻电镜新成果
这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》（Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cerevisiae Spliceosome Before Activation）的论文报道了酿酒酵母剪接体处于被激活前阶段的两个完全组装的关键构象——
施一公：克服提纯问题，发布最新酵母剪接体结构
2018年5月25日，清华大学生命学院施一公教授研究组就剪接体的组装机理与结构研究于《科学》（Science）杂志以长文形式再次发表重大研究成果。这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》（Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cer
冷冻电镜的发展
细胞里面的生命活动井然有序，每一个部分都有其特定的结构，承担不同的功能。生物大分子则是一切生命活动的最终执行者，它们主要是核酸和蛋白。核酸携带了生命体的遗传信息，而蛋白是生命活动的主要执行者。自现代分子生物学诞生以来的半个世纪里，解析和分析生物大分子的结构、进而阐释其功能机制一直都是现代生命科学
冷冻电镜的原理
冷冻电镜是用于扫描电镜的超低温冷冻制样及传输技术，可实现直接观察液体、半液体及对电子束敏感的样品，如生物、高分子材料等。样品经过超低温冷冻、断裂、镀膜制样（喷金/喷碳）等处理后，通过冷冻传输系统放入电镜内的冷台（温度可至-185℃）即可进行观察。冷冻电镜中的冷冻技术可以瞬间冷冻样品，并在冷冻状态下保
冷冻电镜分辨率突破2Å，颜宁等科学家连发新成果！
5月26日，发表在Cell上的一项研究中，美国国家癌症研究所（NCI）的Sriram Subramaniam博士领导的研究小组使用冷冻电镜（cryo-EM）突破了可视化蛋白质的技术壁垒。他们不仅用单颗粒冷冻电镜获得了小于100 kDa的蛋白复合体结构，还让这一技术的分辨率突破了2 Å。 研究人
冷冻蚀刻电镜技术
冻蚀刻(Freezeetching)技术是从50年代开始发展起来的一种将断裂和复型相结合的制备透射电镜样品技术，亦称冷冻断裂(Freezefracture)或冷冻复型(Freezereplica)，用于细胞生物学等领域的显微结构研究。
冷冻电镜成像
冷冻电镜成像冷冻的样品冷冻输送器转移到电镜的样品室，在电镜成像之前，需确认样品中的水处于玻璃态。由于生物样品对高能电子的辐射敏感，成像时必须使用低剂量技术（
冷冻电镜分类
冷冻电镜分类目前我们讨论的冷冻电镜基本上指的都是冷冻透射电子显微镜，但是如果我们以使用冷冻技术的角度定义冷冻电镜的话，冷冻电镜主要可以分为冷冻透射电子显微镜、冷冻扫描电子显微镜、冷冻蚀刻电子显微镜。 冷冻透射电子显微镜冷冻透射电镜（Cryo-TEM）通常是在普通透射电镜上加装样品冷冻设备，将样品冷却
冷冻电镜原理
冷冻电镜原理冷冻电子显微学解析生物大分子及细胞结构的核心是透射电子显微镜成像，其基本过程包括样品制备、透射电子显微镜成像、图像处理及结构解析等几个基本步骤（图3.1）。在透射电子显微镜成像中，电子枪产生的电子在高压电场中被加速至亚光速并在高真空的显微镜内部运动，根据高速运动的电子在磁场中发生偏转的原
冷冻电镜研究
在低温下使用透射电子显微镜观察样品的显微技术，就叫做冷冻电子显微镜技术，简称冷冻电镜(cryo-electron microscopy， cryo-EM)。冷冻电镜是重要的结构生物学研究方法，它与另外两种技术：X射线晶体学(X-ray crystallography)和核磁共振(nuclear ma
冷冻电镜原理
冷冻电镜原理冷冻电子显微学解析生物大分子及细胞结构的核心是透射电子显微镜成像，其基本过程包括样品制备、电子显微镜成像、图像处理及结构解析等几个基本步骤。冷冻电镜解析结构步骤 图片来源：中科院计算所透射电子显微镜成像过程中，电子束穿透样品，将样品的三维电势密度分布函数沿着电子束的传播方向投影至与传播
研究构建核小体结合蛋白在线数据库并揭示染色质调控新机制
染色质是真核细胞中DNA包装和基因表达调控的核心结构。核小体作为染色质的基本单位，与各种蛋白质的相互作用决定了基因表达的精确调控。理解核小体结合蛋白的结构特征和相互作用机制，对揭示表观遗传调控、疾病发生机制以及开发新型治疗策略具有重要意义。然而，传统实验方法在解析这些复杂相互作用时面临成本高、耗
关于核小体的注意事项的介绍
AnuA被定义为与组织蛋白暴露在染色质的部分发生反应的抗体，在染色质内找到的DNA结构，或者一个由天然组织蛋白?DNA复合物构成的表位，特别要排除的是抗体与非组织蛋白的反应和隐藏在染色质内的组织蛋白表位的反应，以及与DNA结构如A、C以及Z构型的反应。这些在染色质中均不存在，因此，并不是所有组织
逆转录元件发生反向剪接插入DNA过程的原理与结构基础
逆转录元件是一种以RNA为媒介，通过“copyand paste”的方式在基因组中不断扩增的基因元件【1,2】。在哺乳动物基因组中有超过45%的遗传成分都是逆转录元件，因此逆转录转座事件如果在不恰当的地方发生就会导致基因紊乱或者基因疾病等严重后果【3】。 II组内含子（Group II int
冷冻电镜技术揭开重要蛋白原子结构
据物理学家组织网10月30日报道，英国科学家利用2017年诺贝尔化学奖重要成果——冷冻电镜技术，攻克了与基因表达有关的一种重要蛋白的结构难题。发表在最新一期《科学》杂志上的相关论文称，蛋白结构显示，流感病毒可与该蛋白中特定位点结合，摧毁细胞的基因表达能力，为深入研究流感、癌症等疾病打开了一扇大门
扫描电镜——细胞内部结构冷冻割断法
该方法简便，结构清晰，已得到广泛应用。其操作方法如下：1) 取材和固定：为了使细胞结构清晰，不被过多的血细胞污染，可在取材前用灌注法冲洗。即先将动物麻醉，经腹主动脉注入生理盐水或低分子量的右,切开下腔静脉放血，至无血色为止。然后迅速取材，将样品修成1mm×1mm×5mm大小，投入1%锇酸溶液
利用冷冻电镜成功解析神经突触超微结构
记者从中国科大获悉，该校合肥微尺度物质科学国家研究中心与生命科学学院毕国强、刘北明与周正洪教授合作课题组的研究成果——利用冷冻电子断层三维重构技术（cryoET）与冷冻光电关联显微成像技术解析神经突触超微结构。图片来源网络 2月7日，美国神经科学学会会刊《神经科学杂志》以封面形式报道了这一成果
果蝇Dicer2结合双链RNA加工生成siRNA的分子机制
RNA干扰（RNAi）是许多真核生物中一种保守的RNA沉默机制， 小干扰RNA是RNA干扰的关键组成部分。在小RNA的加工过程中，Dicer家族蛋白起到了重要的作用，它们发挥作用的过程中常需要双链结合蛋白（dsRBP）作为辅因子来帮助它们发挥功能。在果蝇中，siRNA的产生是由ATP依赖型的Dice
科学家揭示环二核苷酸和叶酸的跨膜转运机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488073.shtm 北京理工大学生命学院教授高昂团队与中国科学院生物物理研究所研究员张立国团队、高璞团队揭示了溶质载体家族蛋白SLC19A1识别环二核苷酸、叶酸和抗叶酸的分子机制。这项研究将有助于
施一公再发Science－克服提纯问题－发布最新酵母剪接体结构
2018年5月25日，清华大学生命学院施一公教授研究组就剪接体的组装机理与结构研究于《科学》（Science）杂志以长文形式再次发表重大研究成果。这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》（Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cer
胸腺小体的结构和功能
胸腺小体或称Hassall小体，是胸腺髓质的特征性结构。由数层扁平的胸腺上皮细胞呈同心圆状排列而成。胸腺小体外周的细胞较幼稚，细胞核清晰，胞质嗜酸性；小体中心的细胞胞核消失，已变性解体。胸腺小体上皮细胞不分泌激素，其功能尚不太明确，但缺乏胸腺小体的胸腺不能培育出T细胞。胸腺小体描述：位于髓质，由数层
关于核小体染色体的基本介绍
染色体是一个独立行动的结构单位，在细胞分裂时传递给子细胞一份染色体拷贝。因此每条染色体必须能复制，所复制的拷贝最后分离并被正确地分配到两个子细胞中。这些基本功能是由真核生物染色体三种特定的DNA序列所控制，即DNA复制起点、着丝粒和端粒。 从DNA到染色体不论是形态还是长度都相差很大。人类最长
上海生科院PI最新Nature子刊发表分子伴侣新机制
生物通报道：中科院上海生科院生化与细胞所的丛尧研究组利用高分辨率冷冻电镜技术，报道了两种状态下的多聚体分子伴侣素TRiC冷冻电镜结构，揭示了TRiC的一个阶段性ATP结合机制，为了解TRiC 核苷酸循环如何与其自身折叠状态准备之间相互协调提出了新的观点。 这一研究成果公布在10月24日的Nat
冷冻电镜单粒子法及其应用
冷冻电镜单粒子法使我们在分子水平对生命过程有了新的认识。核糖体是一个由多种结构相互作用形成的RNA蛋白质复合体，他的结构解析是对这种技术应用的最好说明。从7 0年代Ｆrank开始对核糖体进行单颗粒分析以来 ,二十多年的努力使得大肠杆菌70Ｓ核糖体1.5ｎｍ分辨率的三维结构已经得到揭示。从这个三维结构
Cell|重大进展,清华北大联合中心王宏伟首次揭示人类Dicer
Cell|重大进展,清华-北大联合中心王宏伟首次揭示人类Dicer及其与Pre-miRNA底物复合物的冷冻电镜结构 iNature：2018年4月26日，清华北大联合生命科学研究中心王宏伟课题组等人在Cell 上在线发表了题为“Cryo-EM Structure of Human Dicer a