RNA聚合酶在大肠杆菌细胞内的空间组织及其与转录的关系
2019年9月16日，PNAS杂志在线发表了约翰霍普金斯大学医学院肖杰博士团队的研究成果，题为“Spatial organization of RNApolymerase and its relationship with transcription in Escherichia coli”。该工作揭示了RNA聚合酶（RNAP）簇的特征及其在细胞内空间分配模式不仅依赖于rRNA合成，并且更可能决定于类核的结构组织。 作者主要通过使用定量超分辨率单分子荧光成像来研究大肠杆菌细胞内RNAP的空间组织和转录活性，从而更进一步地检测了RNAP转录工厂的假设。作者使用了可光活化的荧光蛋白融合在活细胞内定位RNAP，使用单分子荧光本为杂交来定位细胞内的新生rRNA，并使用三维结构光超分辨成像SIM探测了细胞内染色体DNA的结构组织。作者观察到RNAP簇大概率位于细胞的中长轴，并在高营养媒介生长条件下和新生rRNA形成的簇高度重合，显示......阅读全文
RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子
实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制，因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的，不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察，也不适于进行文库的筛选。此外，体外制备 siRNA 分子的成本比较高，而且 siRNA
RNA聚合酶的反应需要哪些底物？
该酶需要四种核糖核苷酸三磷酸（NTP：ATP、GTP、CTP、UTP）作为RNA聚合酶的底物，DNA为模板，二价金属离子Mg2+、Mn2+是该酶的必需辅因子。其催化的反应表示为：（NMP）n+NTP→（NMP）n+1+PPi。RNA链的合成方向也是5’→3'，第一个核苷酸带有3个磷酸基。其后
RNA聚合酶链式反应(PCR)步骤
1），准备工作 8， 实验器具与材料: (1)移液枪:200ul、10ul (2)吸头:200ul、20ul (3)吸头台:放置 200ul 和 20ul 的吸头一个 (4)EP 管 1.5ml、100ul2），实验器具的处理与准备 (1) 塑料制品:(包括吸头、EP 管等)
关于RNA聚合酶的基本信息介绍
RNA聚合酶（RNA polymerase）是以一条DNA链或RNA为模板，三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶，因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关，所以也称转录酶。
大肠杆菌DNA聚合酶I－的三种用途
1.利用缺口转移法制备高比活度的DNA探针利用其5′--3′的外切酶活性及其聚合酶活性。2.用于DNA连接前的大缺口填充利用5′--3′的聚合酶活性。3.用于DNA的序列分析利用5′--3′的聚合酶活性。
英国研究构建叶绿体RNA聚合酶原子模型
叶绿体中的RNA聚合酶比较独特，它拥有比蓝藻还多的亚基，转录机制也更复杂。为进一步探究叶绿体RNA聚合酶的结构，英国约翰英纳斯中心科研人员使用冷冻电镜，对从白芥菜提取出来的叶绿体RNA聚合酶样本进行成像，并研究分析了其中的21个亚基等结构的作用，建立了原子水平的数据模型。该模型揭示了超氧化物歧化
从－PEI－沉淀洗脱σ32－和－RNA－聚合酶实验
试剂、试剂盒 缓冲液 A 含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol LNaCl 的缓冲液 A 仪器、耗材
T7RNA聚合酶的基本信息
T7RNA聚合酶具有高度启动子专一性，且只会转录T7噬菌体中位于T7启动子下游的的DNA或DNA复制品。此酶在合成RNA的过程中，需要DNA模板与镁离子（Mg2+）作为辅因子。牛血清蛋白（bovine serum albumin，BSA）及精胺（spermidine）对此酶具促进效果。与细菌的RNA
3类不同的RNA聚合酶的功能介绍
真核细胞含有3类不同的RNA聚合酶,根据其对α-鹅膏蕈碱的敏感性不同,分为RNA聚合酶Ⅰ(A)、RNA聚合酶Ⅱ(B)、RNA聚合酶Ⅲ(C),如下:酶的种类存在功能对抑制物的敏感性RNA聚合酶Ⅰ核仁合成rRNA前体不敏感RNA聚合酶Ⅱ核质合成mRNA前体及大多数snRNA敏感RNA聚合酶Ⅲ核质合成5S
从－PEI－沉淀洗脱σ32－和－RNA－聚合酶实验
试剂、试剂盒缓冲液 A含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol LNaCl 的缓冲液 A仪器、耗材SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶实验步骤材料与设备SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶（10%)试剂缓冲液 A含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol/LNa
从－PEI－沉淀洗脱σ32－和－RNA－聚合酶实验
试剂、试剂盒 缓冲液 A 含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol LNaCl 的缓冲液 A仪器、耗材 SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶实验步骤 材料与设备SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶（10%)试剂缓冲液 A含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol
T7RNA聚合酶系统基因表达实验
实验方法原理 含有 pT7 控制的外源基因（「痘苗病毒系统基因表达实验」中「重组痘苗病毒（VTF7-3）感染后的脂质体转染」）的重组质粒，通过同源重组可整合到痘苗病毒中,并制备重组病毒储液。将此病毒储液与 vTF7-3 共同感染贴壁或悬浮细胞，在培养过程中，外源基因被高效的 T7 RNA
T7RNA聚合酶的基本信息
T7RNA聚合酶具有高度启动子专一性，且只会转录T7噬菌体中位于T7启动子下游的的DNA或DNA复制品。此酶在合成RNA的过程中，需要DNA模板与镁离子（Mg2+）作为辅因子。牛血清蛋白（bovine serum albumin，BSA）及精胺（spermidine）对此酶具促进效果。与细菌的RNA
T7RNA聚合酶系统基因表达实验
两种重组痘苗病毒共感染细胞 单病毒感染OST7-1细胞 利用VOTE系统 实验方法原理 含有 pT7 控制的外源基因（「痘苗病毒系统基
英国研究构建叶绿体RNA聚合酶原子模型
叶绿体中的RNA聚合酶比较独特，它拥有比蓝藻还多的亚基，转录机制也更复杂。为进一步探究叶绿体RNA聚合酶的结构，英国约翰英纳斯中心科研人员使用冷冻电镜，对从白芥菜提取出来的叶绿体RNA聚合酶样本进行成像，并研究分析了其中的21个亚基等结构的作用，建立了原子水平的数据模型。该模型揭示了超氧化物歧化
利用大肠杆菌系统检测RNA与RNA结合蛋白的相互作用实验
实验方法原理 大肠杆菌中异源性的 RNA-BP 与靶 RNA 的结合会抑制靶基因的翻译。此方法已成功地应用于包括 HIV Rcv 蛋白和核仁素（nucleolin）在内的多种 RNA-BP 的研究中。
利用大肠杆菌系统检测RNA与RNA结合蛋白的相互作用实验
实验方法原理大肠杆菌中异源性的 RNA-BP 与靶 RNA 的结合会抑制靶基因的翻译。此方法已成功地应用于包括 HIV Rcv 蛋白和核仁素（nucleolin）在内的多种 RNA-BP 的研究中。实验材料质粒菌株试剂、试剂盒X-Gal 储液IPTG 储存液lacZ 缓冲液ONPG 溶液碳酸钠溶液β
利用大肠杆菌系统检测RNA与RNA结合蛋白的相互作用实验
实验方法原理 大肠杆菌中异源性的 RNA-BP 与靶 RNA 的结合会抑制靶基因的翻译。此方法已成功地应用于包括 HIV Rcv 蛋白和核仁素（nucleolin）在内的多种 RNA-BP 的研究中。实验材料 质粒菌株试剂、试剂盒 X-Gal 储液IPTG 储存液lacZ 缓冲液ONPG 溶液碳酸钠
转录酶的基本分类介绍
通常可根据生物的类别，将RNA聚合酶分为原核生物RNA聚合酶、真核生物RNA聚合酶。 原核生物和真核生物的RNA聚合酶有共同特点，但在结构、组成和性质等方面又不尽相同。 （1）原核生物RNA聚合酶 研究得最清楚的是大肠杆菌RNA聚合酶。该酶是由五种亚基组成的六聚体（α2ββ'ωσ）分
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ－Klenow片段实验——标记DNA的3‘末端
实验方法原理选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量标志物。放射自显影带的强度与片段长度无关，标记DNA可稳定数月之久。 实验材料DNA试剂、试剂盒dNTP仪器、耗材水浴锅实验步骤1. 在20 μl 反应体积中，用可产生5’突出端的限制性内切酶消化0.1~0.4 μg DNA。 2.
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂（Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物，操作时应穿实验服，戴手套，存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯（DEPC) 处理的水
RNA聚合酶复合物晶体结构获解析
中科院武汉病毒所研究员龚鹏带领研究小组解析了RNA病毒基因组复制和转录中重要物质——RdRP转位中间体的晶体结构。这将为相关抗病毒研究提供重要依据。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。 核酸聚合酶是核酸生物合成的分子机器，也是实现核酸遗传信息复制和传递的关键蛋白。在模板序列的指导下，聚合
T7RNA聚合酶系统基因表达实验（二）
单病毒感染OST7-1细胞实验方法原理OST7-1 细胞来源于鼠 L929 细胞，能在细胞质中持续表达噬菌体 T7 RNA 聚合酶，因此，应用此细胞系无需用 vTF7-3 感染细胞。实验材料贴壁培养的单层 OST7-1 细胞含有 pT7 控制的外源基因的重组病毒储液试剂、试剂盒完全 MEM-2.5
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
差异显示聚合酶链反应（PCR) 可促进在诸多物种中与污染暴露相关的新分子标志物的鉴定。至今，已有多种差异显示方法被详细描述。这里，我们描述了一种改良的RNA 随机引物触发的 PCR 方 法（RNAarbitrarily primed PCR， RAP-PCR) , 主要涉及通过 罗 丹 明（rhod
T7－RNA聚合酶/启动子表达实验
基本方案 备选方案 备选方案2 实验材料 载体 试剂、
T7RNA聚合酶系统基因表达实验（三）
实验方法原理VOTE是最近发展的痘苗病毒/T7 RNA聚合酶混合表达系统，将外源基因克隆到质粒 pVOTE. 1或 pVOTE. 2 中，通过同源重组将其整合到痘苗病毒 vT7lacOI 基因组中，制备重组病毒储液。在异丙基-β-D-硫代半乳糖苷（IPTG）存在的条件下，用重组病毒感染细胞，外源基因
T7RNA聚合酶系统基因表达实验（一）
本节介绍依赖于在哺乳动物细胞质合成噬菌体T7 RNA聚合酶的瞬时细胞质表达系统。首先，将感兴趣的基因插入质粒中，使其位于T7 RNA聚合酶启动子（PT7）的控制下。在培养过程中，外源基因被高效的 T7 RNA聚合酶转录。这种转染方案适用于分析的目的，因为不需要构建新的重组病毒，所以比较简单。对于大规
T7－RNA聚合酶/启动子表达实验
实验材料 载体试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材 培养箱分光光度计离心机实验步骤 1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中，转化一种标准大肠杆菌菌株，此菌株不应带有可指导T7 RNA聚合酶合成的质粒。转化物涂布于氨苄青霉素平皿，于37℃温育培养
原核生物和真核生物的RNA聚合酶有共同特点
（1）原核生物RNA聚合酶 研究得最清楚的是大肠杆菌RNA聚合酶。该酶是由五种亚基组成的六聚体（α2ββ'ωσ）分子量约500 000。其中α2ββ'ω称为核心酶（coreenzyme），σ因子与核心酶结合后称为全酶（holoenzyme）。σ因子的主要作用是识别DNA模板上的启动子
用大肠杆菌－DNA－聚合酶－I－Klenow－片段进行双脱氧测序实验
当 Sanger 及其同事建立第一个 DNA 链终止延伸法时，只有一种合适的 DNA 聚合酶可用，即大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段。它具有在模板存在时聚合 dNTP 的活性，但缺乏完整聚合酶 I 的 5'-3'外切酶活性。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，