关于qPCR(RTPCR)数据相对定量的分析方法与经验
qPCR的数据相对定量分析其实很简单。我做了很多的qPCR实验,也看了很多的资料,包括Nature protocol, AB官方的分析教程,MIQE,甚至包括一些商业化软件使用的教程及教程里面记述的原理。我在这里跟大家分享一下自己的经验,最常用,最普遍的相对定量方法就是2^-△△Ct法,该法最最简单的说就是:首先将一次实验的所有基因Ct值整理好,之后用每一组样本自身的目的基因Ct值减去自身内参基因Ct值,得到的数就是△Ct;换成公式就是:△Ct=Ct(目的基因)-Ct(内参基因);然后,将每一组样本每一个目的基因的△Ct都算好,整理进Excel,用本次实验中待研究样本的△Ct减去对照组样本的△Ct,并同时对所有结果取相反数(就是加一个负运算,正数就变成负数,负数就变成正数),该步运算得到的结果就是-△△Ct。最后,对-△△Ct进行2的幂运算,即2^-△△Ct就得出Fold Change。但是,我想说的是2^-△△Ct得出的是Fo......阅读全文
关于qPCR(RTPCR)数据相对定量的分析方法与经验
qPCR的数据相对定量分析其实很简单。我做了很多的qPCR实验,也看了很多的资料,包括Nature protocol, AB官方的分析教程,MIQE,甚至包括一些商业化软件使用的教程及教程里面记述的原理。我在这里跟大家分享一下自己的经验,最常用,最普遍的相对定量方法就是2^-△△Ct法,该法最最简单
qPCR(RTPCR)数据相对定量的分析方法与经验
qPCR的数据相对定量分析其实很简单。我做了很多的qPCR实验,也看了很多的资料,包括Nature protocol, AB官方的分析教程,MIQE,甚至包括一些商业化软件使用的教程及教程里面记述的原理。我在这里跟大家分享一下自己的经验,最常用,最普遍的相对定量方法就是2^-△△Ct法,该法最最简单
qpcr中的相对定量和绝对定量的区别
绝对定量是用已知浓度的标准品绘制标准曲线来推算未知样品的量,绝对定量不同于相对定量,我们是验室用BIOG KIT做PCR实验检测目标RNA,做下来CT值在28左右,S型曲线比较典型
qpcr中的相对定量和绝对定量的区别
荧光绝对定量中标准品:指用含有目的基因的质粒,知道质粒的分子量和浓度计算出拷贝数,然后倍比稀释就作为绝对定量的标准品。获取:把目的基因p出来,然后接到质粒上,转染摇菌扩增,然后再抽质粒,酶切纯化。最后把纯化的目的基因做个鉴定。
相对-RTPCR:-样品定量实验
试剂、试剂盒 双蒸水 RT-PCR 缓冲液 MMLV 逆转录酶 SUPERaseINRNA 酶抑制剂 Taq DNA 聚合酶 总 RNA
相对-RTPCR:-样品定量实验
试剂、试剂盒 双蒸水RT-PCR 缓冲液MMLV 逆转录酶SUPERaseINRNA 酶抑制剂 Taq DNA 聚合酶总 RNA 随机引物dNTP 混合物 基因特异的正向引物基因特异的反向引物[a-32P]dCTP仪器、耗材 Quantu mRNA Universal 18S standards P
相对-RTPCR:-样品定量实验
已知线性范围的循环参数和 18SrRNA 引物与竞争子的比例,就可以用自己的样品去做相对定量 RT-PCR。下面配制的 PCR 反应混合物包含 9 个反应(4 个样品、4 个非反转录对照、1 个不加模板的对照)及 10% 的额外份额。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂
qPCR结果分析经验分享
Real-time qPCR就是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。由于常规的PCR的缺点,real-time qPCR由于其操作简便,灵敏度高,重复性好等优点发展非常迅速。设在
qpcr数据分析及作图方法
荧光定量PCR(qPCR)就是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。由于常规的PCR的缺点,荧光定量PCR( qPCR)由于其操作简便,灵敏度高,重复性好等优点发展非常迅速。设在已经涉
荧光定量PCR“相对定量”与“绝对定量”的区别
相对定量 相对定量,顾名思义,它的结果是一个相对的值,没有单位。与谁相对呢?就是传说中的“内参基因”,又名“持家基因”,即housekeeping gene。 那为什么在相对定量里一定需要它呢? 打个比方:假如你要研究某个基因,提取完样品的RNA然后逆转录再做PCR,发现结果是
相对定量实验的方法介绍
相对定量实验有两种方法:标准曲线法和CT值比较法。如果使用标准曲线法,可以使用绝对标准品,也可以使用相对标准品,而且相对标准品在实验操作上更为简便易行。相对标准品是只知道样品中DNA或RNA的稀释比例而不需要知道其分子数目的标准品,典型的做法是将一个已知pg数的样品做一系列梯度稀释。CT值比较法是
RTPCR经验浅谈
RT-PCR成败的关键首先在于RNA模板的制备以问者的口气应该是做RNA病毒基因的RT-PCR本人三年前做过一个正链RNA病毒全基因组分段扩增设计方案是将全基因组分成7个片段,0.6kb-3.3kb不等分别进行RT-PCR扩增刚开始的三个月我们课题组三个人辛辛苦苦什么招都想过了结果连一个片段都没有拿
RTPCR经验浅谈
做RNA病毒基因的RT-PCR成败的关键首先在于RNA模板的制备。本人三年前做过一个正链RNA病毒全基因组分段扩增,设计方案是将全基因组分成7个片段,0.6kb-3.3kb不等,分别进行RT-PCR扩增,刚开始的三个月,我们课题组三个人辛辛苦苦,什么招都想过了,结果连一个片段都没有拿到。后来有一个周
史上最全的QPCR数据分析
用参照基因 ( 如GAPDH 或 ß-actin)能准确量化初始材料的载量,尤其当初始材料量常常受限时,进行相对基因表达分析实验十分方便。缺点是这个方法要求得到一个或多个在所有测试样本中恒定表达的已知参照基因,而且表达水平不受研究条件下处理方式的影响。确定这样的参照基因十分重要,最近有报道提出在
定量方法知多少之相对定量法详解
在荧光定量PCR检测实验中可以采用多种方法来进行基因的定量。定量的方法也取决于实验的目标。当实验者对待测样品中的核酸的具体拷贝数比较感兴趣时,可以选择绝对定量。如果实验者关注的是实验样本与对照样本之间的倍数变化,无需精确测定拷贝数,则选择相对定量。目前相对定量方法适用于大多数基因表达研究,可分析对照
RtPCR经验总结
Rt-PCR实验步骤一、实验器具与材料:1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl2、吸头:1ml、200μl、20μl3、匀浆管:5ml4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl6、试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,
如何抓住qPCR数据分析的关键
同学们又是做qPCR实验的一天,有没有怀着忐忑又期待的心情去点开“analysis”的呢?点开之后,发现扩增曲线不正常,或者Cq值过大,又或者SD值太高,那这样的实验结果还靠谱吗?现在让小编来告诉你,qPCR实验的成功与否,关键在于各组数据是否达到判定标准以及是否符合实验预期,小小的qPCR实验它可
相对-RTPCR:-引物与竞争子比例的决定实验
试剂、试剂盒 双蒸水RT-PCR 缓冲液TaqDNA 聚合酶cDNAdNTP 混合物基因特异的正向引物基因特异的反向引物dCTP仪器、耗材 PCR 仪 PCR 管Quantum RNA Universal 18S standards实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水1
相对-RTPCR:-引物与竞争子比例的决定实验
这个方案的目的是要选择一个 18SrRNA 引物和竞争子之间的恰当比例,可以模仿目的转录本的表达量。对于大多数转录本来说,一般比例为 3:7。对于模板比较稀少的,采用2:8 或 1:9 可能更恰当。准备的 PCR 反应混合物应比 5 个反应多 10%。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:
相对-RTPCR:-引物与竞争子比例的决定实验
试剂、试剂盒 双蒸水 RT-PCR 缓冲液 TaqDNA 聚合酶 cDNA dNTP 混合物 基因特异的正向引物 基因特异的
LCMS/MS定量分析的经验与体会
1. 准备工作● 查阅文献● 做好样品前处理,萃取浓缩分离纯化● 有条件的可先在HPLC上摸好LC条件,能够基本分离更好,缓冲体系符合MS要求● 溶剂包括水的纯度,最好色谱纯以上● 新的色谱柱可能要先冲洗很长时间才能干净,某些样品非常容易吸附在进样阀和管路中,用溶剂清洗● 质谱仪须校准,预热时间要足
定量RTPCR-(Quantitative-RTPCR)
Application: Quantitative RT-PCR is used to quantify mRNA in both relative and absolute terms. It can be applied for the quantification of mRNA expres
RTPCR、QPCR、Realtime-PCR、realtime-RTPCR你真的区分的开吗?
多少同学能将 RT-PCR、Realtime-PCR、QPCR区分开?有多少同学还在犯晕?今儿这贴,师兄就带你区分区分,拨开那扇 PCR 迷雾。什么是 RT-PCR?RT-PCR就是逆转录 PCR(reverse transcription PCR)或者称反转录PCR(reverse transcr
RTPCR的操做经验分享
在所有RNA实验中,最关键的因素是分离得到全长的RNA。而实验失败的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。由于RNA酶广泛存在而稳定,一般反应不需要辅助因子。因而RNA制剂中只要存在少量的RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解,而所制备的RNA的纯度和完整性又可直接影响RNA分析的结果,所
RTPCR-经验之我谈
看到论坛上有很多朋友询问RT-PCR的重复性问题,说明这里面还是有很多问题的,于是 想跟大家分享一下自己做PCR的经验:1. 总RNA的提取: 材料来源一般为细胞和组织,细胞相对比较单一,蛋白污染较小,TRIZOL法提取结果 A260/A280 结果一般都在1.8-2.1之间;组织的成分较复杂,污染
如何利用GraphPad-Prism软件分析QPCR数据
第一步:在电脑上安装好GraphPad Prism软件,安装此软件在百度上可以下载,一般下载GraphPad Prism5中文版的。第二步:完成第一步后在电脑上打开GraphPad Prism软件,会弹出对话框welcome to GraphPadPrism,点击左边的Column,选择右边的cho
如何利用GraphPad-Prism软件分析QPCR数据
第一步:在电脑上安装好GraphPad Prism软件,安装此软件在百度上可以下载,一般下载GraphPad Prism5中文版的。第二步:完成第一步后在电脑上打开GraphPad Prism软件,会弹出对话框welcome to GraphPadPrism,点击左边的Column,选择右边的cho
荧光定量PCR的相对定量的特点
相对定量特点 从字面上来理解,相对定量就是“相对而言的量的关系”,它并不关注样本中含有的靶标的绝对数量,而更关注实验样本相对于对照样本的靶标的量的变化,通常用倍数关系来表示。常规的基因表达和拷贝数变异CNV实验就属于这个范畴,略有不同的是,CNV实验考量的是样本内靶标基因对内参基因的倍数关
细胞RTPCR的经验(偏向RNA提取)
做RT也做了几次,有成功也有失败,在园子中受益良多,把我自已的一个流程放上来,供大家参考.细胞RT-PCR操作流程实验流程一 、取RNA:1、 处理细胞:(1) 贴壁细胞:先用无菌DEPC水配制的PBS洗细胞两次,弃尽PBS后,直接向培养瓶中加入1ml Trizol,通过溶解细胞,通过移液管分次移出
如何对qPCR数据进行统计分析
如果避免了预扩增,数据可转换成绝对的cDNA数量,否则数据分析可以Cq值来开展,因为每个细胞的转录本水平呈对数正态分布。一开始,可以各种方法对数据作图,此外,基本的统计分析也应开展(如阳性细胞的数量、平均值和偏差)。细胞数量测定通常是以验证过的参考基因来均一化的。这种策略在单细胞分析中应避免,因为单