研究者首次发现孕妇染色体外环状DNA

人血浆中细胞游离的DNA(cfDNA)的片段化模式是引起人们广泛研究的领域。在怀孕期间,观察到胎儿血浆DNA(主要是胎盘来源)是线性DNA片段,比母体来源(主要是造血来源)DNA短。有研究报道了人和鼠血浆中存在染色体外环状DNA(eccDNA)。但是,尚无有关孕妇血浆中eccDNA的公开数据。 2020年1月3日,香港大学卢煜明团队在PNAS 在线发表题为“Identification and characterization of extrachromosomal circular DNA in maternal plasma”的研究论文,该研究通过限制性酶或Tn5转座酶处理后的测序,在孕妇血浆中首次鉴定了eccDNA分子。这些eccDNA分子显示出双峰大小分布,峰值分布在?202和?338 bp,在两个峰的整个大小范围内观察到明显的10 bp周期性,表明它们的核小体起源。此外,胎儿来源的eccDNA比产妇的eccDNA......阅读全文

研究者首次发现孕妇染色体外环状DNA

  人血浆中细胞游离的DNA(cfDNA)的片段化模式是引起人们广泛研究的领域。在怀孕期间,观察到胎儿血浆DNA(主要是胎盘来源)是线性DNA片段,比母体来源(主要是造血来源)DNA短。有研究报道了人和鼠血浆中存在染色体外环状DNA(eccDNA)。但是,尚无有关孕妇血浆中eccDNA的公开数据。 

染色体外环状DNA(eccDNA)

1. eccDNA成环的整体统eccDNA测序结果充分体现了基因组水平成环的多样性。eccDNA来源十分丰富,同一个基因有可能会产生非常多的环状,同样一个环状也不仅仅只会包含一个外显子。TTN基因就是一个非常典型的例子。该基因长度达到了0.3Mb,而这样一个基因竟然能衍生得到130个eccDNA,是

癌基因的关键——染色体外环状DNA(eccDNA)

实验方法:环状DNA-seq, RNA-seq(云序生物提供以上服务)1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构,作者通过环状DNA-seq(云序生物提供以上服务)方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外,并且

细胞化学词汇环状DNA

中文名称:环状DNA分       类:环状单链DNA和环状双链环状DNA也有两种,环状单链DNA和环状双链,一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中, 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定,储存的遗传信息更多(重复序列)。原核生物的拟核是大型环状DNA。定       义:超螺旋,D

环状DNA的结构特点

超螺旋,DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋,超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时,其超螺旋结构为正超螺旋,反之则为负超螺旋,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。

科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能

  早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年,来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出,它们是以染色体外DNA(extrachromosomal DNA,ecDNA)的形式存在的,但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。  201

研究发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构

  近日,纪念斯隆?凯特林癌症中心等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章,发现染色体外环状DNA驱动神

开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA(eccDNA)

  近期,Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA(eccDNA),这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央,云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采(点击链接:颠覆性发现:癌基因竟不在染色体上---环状D

开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA(eccDNA)

  近期,Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA(eccDNA),这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央,云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采(点击链接:颠覆性发现:癌基因竟不在染色体上---环状D

环状染色体的概念和特点

若断裂发生于染色体的二个末端,那么断裂下来的两个断片彼此可以粘合成无着丝粒碎片,而带着丝粒的部分可通过两断端的粘合形成环状染色体。不带着丝粒的碎片往往消失,而带着丝粒的部分能继续进行有丝分裂。如慢性粒细胞白血病患者向急性方向转化时,常可见到环状染色体。(1)真核类生物中的一种异常染色体,为没有末端的

环状DNA的类型和分布

环状DNA也有两种,环状单链DNA和环状双链,一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中, 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定,储存的遗传信息更多(重复序列)。原核生物的拟核是大型环状DNA。

细胞化学词汇带切口环状DNA

中文名称:带切口环状DNA英文名称:nicked circular DNA定  义:双链环状DNA分子中一条单链上带有一个或多个裂口。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

带切口环状DNA的结构特点

中文名称带切口环状DNA英文名称nicked circular DNA定  义双链环状DNA分子中一条单链上带有一个或多个裂口。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

分子遗传学词汇环状DNA

中文名称:环状DNA分    类:环状单链DNA和环状双链定义:超螺旋,DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋,超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时,其超螺旋结构为正超螺旋,反之则为负超螺旋,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。

研究人员绘制出首张儿童癌症环状DNA图谱

  随着时间推移,癌症的发生往往与DNA缺陷的逐渐积累有关,因此,癌症通常会被认为是一种年龄相关的疾病,那么为何儿童也会患癌呢?近日,一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中,来自德国夏洛蒂—洪堡大学和柏林自由大学附属医学中心等机构的科学家们通过研究发现,染色体外环状DNA或

Nature-Nanotechnology:DNA环状分子的自主复制

  生物系统中存在很多的自主复制的例子。然而,人工制造这样的生物系统的自主复制系统却是相当困难,这是因为生物系统很复杂。在其他领域,人类可以创造某些自我复制系统,比如磁场系统以及模块化机器人等等。我们很少将这些人造的自我复制系统和生物系统中的自我复制系统进行比较。因而,如果能从理论上将人工的自主复制

研究者首次发现“驯化”的水稻“外来DNA”

  转座子是一种可以改变自身基因组位置的DNA序列,其通过转座事件改变细胞遗传特性和基因组大小。转座子通常被认为是外来DNA,“寄生”于宿主基因组中,但它们也可以在基因组中被“驯化”,并进化出有益于宿主的新功能。迄今为止,大多数驯化转座子都在哺乳动物中发现,只有少数转座子驯化在植物中被报道。在农作物

细胞化学词汇共价闭和环状DNA

中文名称:共价闭和环状DNA英文名称:covalently closed circular DNA;cccDNA定  义:两条多核苷酸链是完全连续的环状双链DNA分子。由于链上没有裂隙可以释放内部张力,所以可以形成超螺旋结构。天然状态下某些病毒、细菌的染色体DNA,质粒、线粒体和叶绿体的DNA具有这

共价闭和环状DNA的结构特点

中文名称共价闭和环状DNA英文名称covalently closed circular DNA;cccDNA定  义两条多核苷酸链是完全连续的环状双链DNA分子。由于链上没有裂隙可以释放内部张力,所以可以形成超螺旋结构。天然状态下某些病毒、细菌的染色体DNA,质粒、线粒体和叶绿体的DNA具有这种结构

染色体外DNA的定义

中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定  义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

染色体外DNA的定义

中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定  义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

染色体DNA的提取

一、实验目的与原理DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象。DNA的提取是分子生物学实验技术中的最重要、最基本的操作。本实验通过植物样品在液氮下研磨以粉碎组织,通过裂解液裂解细胞,有机溶剂反复抽提,使DNA进入水相与蛋白质成分分开,在RNase作用下,降解RNA以纯

孕妇吸烟可能会改变孩子的DNA

  根据一项最新研究表明,孕妇吸烟不仅会危害胎儿的健康,而且还会损害孩子的DNA。这一研究或许可以解释为什么吸烟孕妇的孩子在以后的生活中会继续面临健康并发症。  吸烟母亲产出的婴儿往往较小,肺功能受损,并有较高的出生缺陷发生率。即使成年之后,这些人也表现出健康和行为问题,吸烟母亲生的孩子长大后更容易

分子遗传学词汇共价闭合环状DNA

中文名称:共价闭合环状DNA外文名称:cccDNA定义:共价闭合环状DNA(cccDNA)是乙型肝炎病毒的原始复制模板,对乙型肝炎病毒的复制具有重要的意义,药物难以清除。

Nature发表山中伸弥新成果,iPS校正环状染色体

  科学家们通过细胞重编程技术(iPS),使正常染色体成功替代环状染色体,校正了大规模的染色体缺陷。这样的新技术有望用来治疗,因染色体异常引起的先天畸形、智力障碍和生长迟缓。   这项研究于一月十二日发表在Nature杂志的网站上,文章的通讯作者包括iPS技术的创始人山中伸弥(Shinya Y

细胞化学词汇染色体外DNA

中文名称:染色体外DNA英文名称:extrachromosomal DNA定  义:存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

染色体DNA的片段化

实验概要琼脂糖(agarose)或聚丙烯酰胺(PAGE)电泳是分离、鉴定和纯化DNA的标准方法。琼脂糖凝胶的分辨率比聚丙烯酰胺电泳低,但分离范围广,可以分离200 bp一50 kb的DNA。细胞凋亡时染色体从核小体间断裂形成大小为180-200bp整数倍的片段,在琼脂糖凝胶中电泳后可呈现出规

细胞化学词汇染色体外DNA

中文名称:线粒体DNA外文名称:Mitochondrial DNA,mtDNA定       义:线粒体DNA是线粒体中的遗传物质,线粒体能为细胞产生能量(ATP),是在细胞线粒体内发现的脱氧核糖核酸特殊形态。线粒体是为细胞提供能量(ATP)的细胞器。一个线粒体中一般有多个DNA分子。

孕妇的染色体缺失可能造成假阳性的NIPT结果

  如今,无创产前检测(NIPT)正受到更多孕妇的青睐。不过,荷兰的一个研究团队最近通过这项检测发现了母体10号染色体的缺失及相关的脆性位点扩增,这可能导致NIPT的检测结果为假阳性。图片来源于网络  研究人员筛选了数千名孕妇的NIPT结果,发现了10号染色体缺失的异常结果。这项检测利用单端测序,旨

“捕获技术”帮助研究者分析-49000-年前的古老DNA

  “捕获技术”帮助研究者分析 49000 年前的古老DNA进而了解现代人与尼安德特人的异同点  2010 年 5 月 6 日,加利福尼亚州圣克拉拉市,德国莱比锡城,纽约冷泉港—来自马普研究所(MPI)、冷泉港实验室(CSHL)、安捷伦科技公司(纽约证交所:A)以及其它国际著名机构的研究表明,D