研究发现N6甲基腺苷调节人体细胞RNA:DNA杂交的稳定性
近日,英国诺丁汉大学等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“N6-methyladenosine regulates the stability of RNA:DNA hybrids in human cells”的文章,发现N6-甲基腺苷可以调节人体细胞RNA:DNA杂交的稳定性。图片来源于网络 R环结构(R-loop)是生物体中发现的一种三链RNA:DNA杂合结构,包括两条RNA:DNA杂合链和一条以单链状态存在的DNA链。通常是新生RNA插入DNA双链中并与DNA模板链形成稳定的RNA:DNA杂合链,从而形成转录伴随的R环结构。R环的存在可能会阻碍基因的转录过程,或者诱发DNA双链断裂,从而影响基因组的稳定性。科研人员发现在人多能干细胞中的大多数RNA:DNA杂合体上都可以检测到N6-甲基腺苷(m6A)修饰对信使RNA代谢不同方面的促进作用,并证明含有m6A的R环在细胞周期中的G2/M期累积......阅读全文
揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用
近日,《EMBO报告》在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文,该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。 准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重要的,DNA损伤修复功能的障碍会引起严重疾病,包括多种癌症、免疫缺陷、代谢紊乱、
线粒体胁迫适应性跨代遗传研究获突破
北京大学刘颖课题组在线粒体胁迫适应性的跨代遗传及其表观遗传调控机制研究方面取得了重要进展,相关研究成果于12月4日在线发表于《自然-细胞生物学》。 刘颖告诉《中国科学报》,这是国际上第一项证明动物存在线粒体胁迫适应性跨代遗传现象的研究,也加深了对跨代遗传调控机制的理解。该研究为人类线粒体疾病的
何川教授Nature,Cell子刊解析表观遗传学
早年毕业于中国科技大学的何川教授现任芝加哥大学生物物理动态研究所主任,以及北京大学合成与功能生物分子中心主任。何川教授研究组主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究,近期在Nature Biotechnology,Molecular Cell杂志上发表新研究成果,解析基因组及
甲基乙二醛:一种新型的DNA甲基化上游调节因子
甲基乙二酮(MG)是一种高反应性的二羰基分子。在糖酵解癌症细胞中,MG主要由磷酸二羟丙酮和3-磷酸甘油醛沿糖酵化途径的自发转化形成。细胞MG浓度显著受乙二醛酶系统的解毒活性调节,乙二醛蛋白酶1(GLO1)是限速酶。代谢重编程和DNA超甲基化异常相互独立地在癌症中进行了广泛的研究。然而,迄今为止,
单分子测序助力细菌甲基化组的分析
New England Biolabs联合Pacific Biosciences的研究人员利用PacBio RS系统对6种细菌基因组进行了重测序,不仅鉴定出细菌基因组中新的胞嘧啶和腺嘌呤甲基化位点,还鉴定出介导这些表观遗传学标志的甲基转移酶。该研究成果近日发表在《Nucleic Acid
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
科技日报北京3月18日电 英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果,欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序,通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。 正确诊断肿瘤,对于癌症的治疗至关重要。但是,在已知的约100种肿瘤中,中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。
DNA甲基化研究方法的回顾与评价
摘要: DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲
Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测
加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。 研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN
DNA甲基化酶的作用和种类
DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与CG序列甲基化的维持。CMTs类酶仅发现在植物中,主要特征
DNA甲基化:诊断癌症的强大工具
最近,来自香港中文大学的研究人员,通过分析血浆DNA中的甲基化序列,能够检测到癌症患者的肝肿瘤和淋巴瘤,以及孕妇胎盘中的遗传异常。他们使用已知的组织甲基化图谱,能够识别循环DNA的组织起源,从而使其成为一种强大的工具,用于筛选、癌症检测和治疗监测。这项研究是由几个机构的研究人员合作,由香港中文大
DNA去甲基化的两种方式
本公司提供专业的DNA甲基化修饰服务,有需要的客户请与本公司的工作人员。 作为发现较早的一种修饰途径,DNA甲基化能够引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。DNA甲基化修饰过程会使甲基添加到DNA分子上,例如在胞嘧啶环的5'碳上:这种
DNA甲基化酶的基本信息
大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶,即DNA甲基化酶,它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统(R-M系统)Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化,形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中,常用的甲基化酶属于Ⅱ型,它与相应的
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果,欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序,通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。正确诊断肿瘤,对于癌症的治疗至关重要。但是,在已知的约100种肿瘤中,中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。为了解决这个问题,德国癌症研究中心科学
我科学家改写DNA甲基化经典
近日,吉林大学人兽共患病研究所和华大基因研究院通过合作,首次在旋毛虫基因组中发现了甲基转移酶,并证实了DNA甲基化的存在,改写了长期以来认为线虫中没有该种表观遗传修饰的历史。相关成果发表于《基因组生物学》。业内专家认为,该研究为以DNA甲基化为靶标的抗旋毛虫及类似病原药物与预防制剂
DNA甲基化与拟南芥的免疫力
DNA甲基化有助于拟南芥的免疫力,它动态调控了某些基因的表达,让植物能够抵御细菌感染。近日,一篇在线发表于《PNAS》上的文章阐述了以上研究成果。 美国加州索尔克生物学研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人员利用MethylC测序鉴
在基因组范围定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。 尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技
科学研究揭示DNA甲基化的秘密
甲基化指 DNA 的化学修饰,这种修饰发生在 DNA 序列的数百万个位置上。直到现在,科学家们相信这种表观遗传学的现象减少了一些基因的表达。 近日,来自UNIGE大学的研究团队们,发现 DNA 甲基化在基因调节中扮演着积极和消极的角色。 DNA 序列的变异性与基因表达之间的关系也
DNA甲基化:在衰老细胞中的作用
近日,科学家们在45万个基因组位点中发现了8%的与衰老有关的DNA甲基化的改变。这项研究成果题为“Age-related variations in the methylome associated with gene expression in human monocytes and T c
Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测
加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。 研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN
简述DNA甲基化检测的临床意义
在肿瘤的发生发展过程中,由于CpG岛的局部高度甲基化要早于细胞恶性增生,故其甲基化的检测可用于肿瘤的预测,而全基因组水平的低水平甲基化状态,则随着肿瘤恶性程度的增加而进一步降低,使其可用于肿瘤的诊断以及分级。此外,除了在肿瘤组织中检测甲基化以外,大量研究通过对肿瘤患者血清及其他体液中的肿瘤细胞的
揭示DNA甲基化与基因沉默的关系
DNA 甲基化与真核基因和转座子的转录抑制有关,但基因沉默的下游机制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日,加州大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen团队在Science 在线发表题为“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果,欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序,通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。 正确诊断肿瘤,对于癌症的治疗至关重要。但是,在已知的约100种肿瘤中,中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。 为了解决这个问题,德
DNA甲基化酶的基本信息
大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶,即DNA甲基化酶,它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统(R-M系统)Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化,形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中,常用的甲基化酶属于Ⅱ型,它与相应的
DNA甲基化酶的主要类型介绍
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
植物DNA去甲基化的机理和功能
10月19日,Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为The mechanism and function of active DNA demethylation i
关于DNA甲基化的酶分类的介绍
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参
DNA甲基化与癌症之NGS检测篇
摘要 DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中,DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化,大量实验研究表明,在多种类型癌症中,DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外,甲基化还与非
DNA甲基化酶的主要类型介绍
DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与CG序列甲基化的维持。CMTs类酶仅发现在植物中,主要特征
我国学者发现ALKBH1识别与催化DNA-6mA去甲基化结构
DNA 6mA(N6-甲基腺苷)作为DNA的第二种修饰形式,是哺乳动物基因组表观遗传调控的重要组成。基因组6mA的水平在生物体内具有调节组织发育、性别比例、基因表达、X染色体失活等多种作用,阐明其调控机制是解码这一新型修饰碱基生物学功能的关键。2016年,耶鲁大学Andrew Xiao首次报道A
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化
亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较