《分子生物学与进化》—何静等—脊椎动物荷尔蒙基因研究

昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室(筹)何静等研究了脊椎动物motilin/ghrelin荷尔蒙及其受体基因家族的进化历史,揭示了ghrelin/GHSR信号通路系统的保守性,以及新的motilin/MLNR信号通路系统的演化形成机制。由此他们提出了分子相互作用网络系统进化形成的一种模式:新功能关系形成之前,通常存在基因共享,即一种分子参与到多个过程、多种分子间相互作用。基因重复产生了新的组分,其中一个被征募与已经存在的分子形成新的分子间相互作用,从而分化形成新的网络关系;另一个则维持原有的网络关系,并产生了功能的专化。 这项工作对于理解复杂的分子相互作用网络系统的形成机制提供了新的线索。该成果是在973项目和国家自然科学基金资助下取得的,于近期发表在国际著名刊物Molecular Biology and Evolution网络上(doi:10.1093/molbev/msm161)。......阅读全文

昆明动物所等破译山羊和绵羊基因组

  在“973”项目的支持下,中国科学院昆明动物研究所研究员王文领导的团队继2013年解析山羊基因组揭示羊绒生长的基因基础之后,近日再次携手华大基因研究院、澳大利亚联邦科学与工业研究组织等国内外机构“破译”了绵羊基因组。至此,所有重要家畜动物的基因组密码全部告破。  山羊和绵羊是反刍动物的典型代表动

基因“时钟”或能预测脊椎动物寿命

  近日,一个澳大利亚研究团队报告了一种采用基因标记准确估算不同脊椎动物物种寿命的模型。这个“寿命时钟”筛选了CpG(核苷酸对)位点的42个特定基因,以预测某脊椎动物物种成员可能拥有多长的寿命。CpG位点是DNA上的短片段,其密度与寿命相关。相关论文刊登于《科学报告》。  一个物种的最大寿命难以定义

中科院昆明动物所成功揭示实验大鼠起源驯化遗传机制

  近日,中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组与吴东东课题组合作,通过比较野生褐家鼠和实验大鼠的基因组和转录组数据,解析了实验大鼠的起源和驯化遗传机制。相关研究成果发表在Molecular Biology and Evolution上。   实验大鼠作为一种广泛使用的模式动物,由野生褐家鼠驯化而来

昆明动物所蝙蝠和海豚新运动能力的进化机制研究获进展

  哺乳动物大多数都是陆地上运动(奔跑或者行走),但蝙蝠和海豚是例外,它们分别进化出了新的运动方式:蝙蝠进化出飞行能力,海豚进化出游泳能力。   由于运动方式的变化涉及到骨骼、肌肉、能量代谢等一系列非常复杂的变化,为了找出海豚和蝙蝠进化出新的运动方式的分子机制,中科院昆明动物研究所张

昆明动物所揭示人群进化历史差异对复杂病遗传分析的影响

  目前,复杂疾病(如双向情感障碍、抑郁症等)的遗传学分析已在世界范围人群中广泛开展。然而,即使是大样本量和高密度SNP的分析,在不同样本尤其是遗传背景差异很大的人群中往往不能重复出疾病易感基因的相关性。人群生活的环境因素,如气候、饮食和生活方式等可能是造成这种差异的原因,但更重要的原因可能是由于易

昆明动物所重构蚂蚁等级分化祖先基因调控网络

  近日,中国科学院昆明动物研究所生物多样性基因组学团队在调控蚂蚁等级分化演化机制研究中取得进展,研究人员通过对三个亚科五个蚂蚁物种的大脑转录组演化分析,揭示了蚂蚁这类超个体组织物种(superorganism)存在的生殖等级分化的核心基因调控网络。研究成果以Towards reconstructi

昆明动物所等在疯牛病调控基因研究中取得进展

  朊病毒疾病是一类致死性神经退行性疾病,已在包括人在内的十多种动物中发现,例如牛的疯牛病、羊的搔痒症、人的克雅氏症等。其中,疯牛病因具有高度传染性和致死性,且可通过食物链传染给人类而受到高度关注。25年来对朊病毒疾病的研究表明,朊病毒基因是致病的基质,但是仅此一个基因还是无法彻底澄清朊病毒疾病的致

昆明动物所人类从头起源新基因研究取得重要进展

  基因的起源在生物界是一个普遍而又不断延续的过程,是生物由简单到复杂演化的基础。新基因产生的机制主要有基因重复、外显子重排、逆转录、基因水平转移、可移动元件、基因断裂融合和从头起源等。其中,从头起源的基因(指基因起源于没有功能的非编码区域DNA)研究甚少,主要是因为人们一直认为此机

昆明动物所家犬嗅觉受体基因研究取得新进展

  家犬作为人类最亲密的朋友,在人类历史上一直扮演者重要的作用。更重要的是,家犬是人类最早驯化的家养动物,由于其经过了驯化和品种培育两个重要的群体历史阶段,并且在家养哺乳动物中形成了最具多样性的品种,因此家犬一直是研究人工选择和自然选择的重要模式生物。中国最为家犬的驯化地,不仅遗传多样

蜥蜴类冷血脊椎动物雌性攻击行为进化机制研究

  攻击行为是一种高风险的竞争行为,常伴随着受伤甚至死亡,这种行为多见于雄性动物之间。如:雄性个体可以通过竞争来确立自己的优势地位,从而在配偶和资源竞争方面获得“益处”。经典性选择理论认为雌性动物一般不会发生竞争行为,尤其是攻击行为。近年来,雌性攻击行为逐步受到重视,并围绕雌性攻击行为提出了一些新的

昆明动物所揭示家养动物高原适应遗传机制

  青藏高原低氧低压、寒冷、强紫外线等极端环境塑造了其独特的生物多样性资源。家养动物高原适应性状遗传机制的解析,不仅能够研究环境与遗传发育的相互作用机制,也有助于青藏高原动物遗传资源的保护和长远开发利用,为高原家畜育种、提高家畜的生产性能和品种改良提供重要信息和理论指导,进一步促进青藏高原地区生态文

中科院昆明动物所-提出大尺度生物多样性监测方法

  近日,中科院昆明动物研究所Douglas Yu课题组提出了大尺度生物多样性监测方法,为环境保护政策的制定提供了全面的科学依据。相关成果已发表于《自然—生态学与进化》,并被选为封面文章。  大尺度实时生物多样性管理监测,对精细研究生物多样性格局动态和物种适应策略、预测生物兴衰和分布格局态势有重要意

昆明动物所等家养动物线粒体DNA基因组学研究取得进展

  近年来,家养动物线粒体DNA(mtDNA)基因组学得到了迅速发展,积累了大量的mtDNA序列数据。与此同时,一些问题随之浮现出来。除了数据质量存在缺陷(Shi, et al. 2014. Mol Ecol)之外,mtDNA世系划分标准不一,世系命名混乱的问题也已开始干扰家养动物mtDNA的研究工

07年新筹建重点实验室发表文章解析演化形成新机制

来自昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室的研究人员揭示了ghrelin/GHSR信号通路系统的保守性,以及新的motilin/MLNR信号通路系统的演化形成机制。这一研究成果公布在《Molecular Biology and Evolution》杂志上。 这一研究受到了973项目和国家自然

昆明动物所在果蝇基因组进化合作研究中取得新进展

银额果蝇基因组进化研究  性染色体和B染色体(相对于正常染色体而言不遵循孟德尔遗传分裂规律的染色体)的演化一直是经典遗传学长期未曾研究透彻的重要问题。有意思的是,在一种叫做银额果蝇(Drosophila albomicans)的果蝇物种(如图),新近演化出了非常年轻的性染色

昆明植物所等研究揭示水平基因转移促进陆生植物进化

  转基因食品的安全风险是当前的热议话题之一,然而在自然界里,物种间的基因转移可能频繁发生,并对不同物种的遗传进化有深刻的影响。近期的一项科学研究表明,在陆生植物起源演化的早期阶段,物种间的水平基因转移可能促进植物由水生环境向陆生环境转变。  水平基因转移(horizontal ge

昆明植物所枯草杆菌蛋白酶类基因家族进化研究获进展

  枯草杆菌蛋白酶(subtilase)是一类丝氨酸蛋白酶,广泛存在于古细菌、细菌与真核生物中。这类蛋白酶在结构上具有典型的 Asp/Ser/His 催化结构域,具有广泛的生理学功能,包括从非特异性的降解蛋白功能,(比如降解地衣芽孢杆菌中的丝氨酸蛋白),到特异性的参与多肽类激素的形成,(比如特异性降

昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式

  挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而,肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题,而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感,容易产生假阴性结果。针对此,中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法

昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式

  挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而,肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题,而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感,容易产生假阴性结果。针对此,中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法

昆明动物所等在蝴蝶基因组研究中取得进展

  蝴蝶因其在自然界中多姿多彩的变异,自达尔文时期以来就是进化研究的好材料。然而,长期以来其高杂合的基因组难以解析,对其也缺乏有效的遗传操作技术体系,极大地限制了蝴蝶在进化学研究的深入广泛应用。  为了使蝴蝶成为研究宏观形态进化遗传基础的新模式生物,中国科学院昆明动物研究所的基因起源课题组与深圳华大

深圳华大基因研究院石琼教授访问昆明动物所

  7月17日下午,受遗传资源与进化国家重点实验室系统进化与生物地理学组杨君兴研究员的邀请,深圳华大基因研究院海洋平台负责人石琼教授访问中国科学院昆明动物研究所,并作了题为“海洋基因科技及其产业化应用”的学术报告。  石琼首先介绍了海洋生物资源在全球的重要作用和对国家的战略意义,通过生物科技在海洋资

昆明动物所揭示新的肿瘤靶标

  肿瘤目前是世界人口死亡的第一原因。中国每年因肿瘤死亡的人数超过200万。除了传统的放化疗等方法外,靶向治疗是肿瘤临床的研究热点及发展趋势。该治疗方法是通过药物选择性抑制肿瘤细胞特异的分子靶标的功能,来抑制肿瘤生长,而不杀伤或较少损伤正常细胞。相比传统放化疗方法,靶向治疗具有耐受性好、毒副作用轻微

昆明动物所完成“一三五”国际评估工作

  11月18日至20日,秋意浓浓,阳光暖人。  中国科学院组织国际专家对中科院昆明动物研究所进行了“一三五”现场诊断评估。评估专家组由来自英国、加拿大、法国、澳大利亚、美国的9位专家组成,王小凡教授任专家组组长。  中国科学院发展规划局副局长张凤代表中科院向远道而来的专家致辞;中国科学院副院长张亚

昆明动物研究所通过实验动物饲料生产认证

  11月29日,昆明市科学技术局为昆明动物研究所颁发实验动物饲料生产许可证,许可生产的七种饲料包括:实验猴繁殖、维持饲料,树鼩繁殖、维持饲料,大小鼠繁殖、维持饲料,实验兔维持饲料。   根据实验动物饲料生产许可证的认证程序,首先七种饲料要通过实验动物饲料检测部门的抽样检测,且各项营

最古老的脊椎动物,原来长这样!

中国古生物学者运用先进的实验技术证实,5.18亿年前的云南虫是地球上最古老的脊椎动物。这是中国化石宝库澄江动物群中诞生的又一位“超级明星”。该发现对了解我们自身所在的脊椎动物谱系起源具有重要意义,相关成果8日刊发在国际权威期刊《科学》上。  云南虫生态复原图。(中科院南京地质古生物研究所研究员赵方臣

昆明动物所揭示两个重要光合作用酶的起源及其进化机制

  光合作用是地球上最重要的生物化学反应。通过光合作用,光合生物吸收太阳光能,将CO2固定,转变成化学能,成为地球上几乎所有有机物和能量的源头。其中CO2固定任务是由卡尔文循环途径来完成的。果糖-1,6-二磷酸酶(FBPase)和景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶(SBPase)是真核光合生

周忠和任中科院古脊椎动物与古人类研究所所长

  据中科院人教局网站通知,中科院经研究,决定:  任古脊椎动物与古人类研究所所长(任期5年);董军社、邓涛任古脊椎动物与古人类研究所副所长(任期5年);免去高星的古脊椎动物与古人类研究所副所长职务(保留副局级待遇)。                 

昆明动物所马普小组为新基因起源绘制全基因组蓝图

新基因的不断出现是生物进化的重要基础。昆明动物所马普青年科学家小组在王文研究员的领导下与国际一些研究小组合作,已陆续报道了包括 “sphinx”、“猴王”、“Hun”、BSC4等等一系列新近产生的新基因。这些研究成果表明新基因的起源是一个重要的生物学现象。但在全基因组水平,具体有哪些重要的新基因起源

全部脊椎动物基因组测序再上路

  为了获得更多的关注和支持,研究人员迫切希望对所有脊椎动物的基因组进行测序。近日,科学家正式启动了脊椎动物基因组计划(VGP),发布了14个物种的15个高质量基因组。但该计划仍远未筹集到所需资金,以记录地球上约6.6万种脊椎动物的基因组。  这个项目已经进行了3年,其前身是2009年启动的基因组1

昆明动物所等发布最新版树鼩基因组注释

  树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物,是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短(约6周),饲养成本低,单胎产仔数较高(每胎2-5只)等特点,在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前,树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建,是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究