《分子生物学与进化》—何静等—脊椎动物荷尔蒙基因研究
昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室(筹)何静等研究了脊椎动物motilin/ghrelin荷尔蒙及其受体基因家族的进化历史,揭示了ghrelin/GHSR信号通路系统的保守性,以及新的motilin/MLNR信号通路系统的演化形成机制。由此他们提出了分子相互作用网络系统进化形成的一种模式:新功能关系形成之前,通常存在基因共享,即一种分子参与到多个过程、多种分子间相互作用。基因重复产生了新的组分,其中一个被征募与已经存在的分子形成新的分子间相互作用,从而分化形成新的网络关系;另一个则维持原有的网络关系,并产生了功能的专化。 这项工作对于理解复杂的分子相互作用网络系统的形成机制提供了新的线索。该成果是在973项目和国家自然科学基金资助下取得的,于近期发表在国际著名刊物Molecular Biology and Evolution网络上(doi:10.1093/molbev/msm161)。......阅读全文
《分子生物学与进化》—何静等—脊椎动物荷尔蒙基因研究
昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室(筹)何静等研究了脊椎动物motilin/ghrelin荷尔蒙及其受体基因家族的进化历史,揭示了ghrelin/GHSR信号通路系统的保守性,以及新的motilin/MLNR信号通路系统的演化形成机制。由此他们提出了分子相互作用网络系统进化形成的一种模式:新
-姥鲨基因揭示早期脊椎动物进化
在过去的4.2亿年里,姥鲨(Callorhinchus milii)几乎没有什么变化,这就使其DNA序列在与其他脊椎动物物种进行比较时更有价值。 这种有着大吻状突起、外形古怪的鱼类是最原始的颌类脊椎动物,研究人员已经对其基因组进行了测序。姥鲨的DNA序列有助于解释为什么鲨鱼具有一副软骨
昆明动物所蝙蝠视觉基因通路进化研究获新进展
蝙蝠是夜行性动物。食虫蝙蝠主要用回声定位来确定方位、捕捉昆虫,其眼睛退化;旧大陆果蝠没有回声定位能力,它们主要依赖视觉和嗅觉来寻找食物,其眼睛很发达。 在之前的研究里,中国科学院昆明动物研究所沈永义副研究员在张亚平院士的指导下,克隆了视网膜上视杆细胞视紫红质的RHO基因 (Rhodop
昆明动物所新基因的功能起源和进化研究取得进展
基因复制是新基因和新功能产生的最主要的方式之一。然而,在分子水平,新产生的复制基因如何通过通路整合而获得生物学功能以及产生适应性性状却并不清楚。 为了回答以上问题,中科院昆明动物研究所中德马普进化基因组学青年科学家小组的博士生丁昀等在导师王文研究员的指导下,对黑腹果蝇亚群(Drosophi
中科院昆明动物所等发布新款基因测序软件
中科院昆明动物研究所研究员马占山与美国马里兰大学叶承曦博士在基因测序领域的合作再次取得重要突破。合作团队近日正式发布了一款代号为 Sparc 的软件。 针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%~40%的问题,该团队研发出了一套“线性复杂度”(复杂性最低)的算法,Sparc软件即基于该新算法完成
昆明动物所揭示rRNA加工机器的进化机制
核糖体是蛋白质合成的分子机器。核糖体RNA的加工成熟及其与核糖体蛋白的结合是核糖体亚基装配的基本过程。真核生物的该过程是在核仁中进行的。在酵母上已有报道核糖体小亚基rRNA(SSU rRNA)的加工成熟,是由一个被称为SSU Processome(小亚基rRNA加工体)的核酸蛋白复合体所
昆明动物所基因家族相关性进化研究取得新进展
食物的寻找、选择和消化之间存在一定的关系,虽然宏观上的主观判断存在合理性,但缺乏遗传学上的直接证据。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、吴东东博士和David Irwin教授等研究人员分析了12种果蝇中六个和食物有关的基因家族:类胰蛋白丝氨酸蛋白酶(Tryp_SPc)(主要
PNAS:miRNA揭示脊椎动物进化起源
美英科学家的一项最新研究表明,脊椎动物这种复杂生命形式的出现源于miRNA。调控基因表达的miRNA的不断进化是早期脊椎动物出现的背后原因。相关论文近日在线发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)上。 论文高级作者、美国达特茅斯学院的Kevin Peterson表示,“新的研究不仅为认识人类自身的进
昆明动物所RNASEL基因进化与功能的相关性研究取得进展
核糖核酸酶L(RNASEL)是免疫2-5A系统中的核酸酶,在免疫抗病毒过程中起到重要作用。另外,RNASEL也是非常重要的前列腺癌基因,在人群中RNASEL基因的多个多态性位点与前列腺癌有显著相关性。 为研究RNASEL在抗病毒以及癌症相关性之间的关联,中国科学院昆明动物研究所张亚
昆明动物所研究团队在蝴蝶基因组大小进化方面获进展
蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
昆明动物所人类大脑转录组进化研究获进展
人类在进化过程中,脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力,比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰,如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA,进而翻译成不同的蛋白质构体,是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展,转录后
中科院昆明动物所摸清云南鱼类“家底”
记者8月15日从中科院昆明动物研究所获悉,该所副研究员陈小勇在《动物学研究》杂志 2013年第4期上发表了云南鱼类名录,种数达620种。该研究进一步印证了云南是中国淡水鱼类多样性最丰富的地区,并刷新了《云南鱼类志》的纪录,为全面摸清云南鱼类的“家底”、厘清相互关系奠定了基础。 陈小勇介
昆明动物所研究发现选择性剪切在果蝇新基因中的进化
选择性剪切(alternative splicing)是一个基因编码出不同转录本和蛋白质的重要途径,对满足生物体所需蛋白多样性具有重要意义。此前的研究显示,新基因通常在序列、基因结构和表达模式上与其祖先基因发生快速的分化。基因结构的改变可能伴随着选择性剪切的改变,但关于新基因选择性
昆明动物所贾第虫原始进化地位研究取得进展
作为单细胞原生动物的贾第虫(Giardia)因发现其存在一系列的原始特征而一度被认为是目前已知的最原始真核细胞,对研究真核细胞如何从原核细胞进化而来具有极为重要的意义。但也有不少学者坚持认为,这些所谓的“原始特征”应该是由于贾第虫高度适应寄生生活方式而次生性退化所致。这种“原始性”
昆明动物所在人类骨骼基因进化研究上取得进展
现代人类的表型多样性很大部分是由骨骼系统塑造而成的,例如不同人群在体型、骨密度、脸型等等方面都表现出巨大差异。实际上,伴随着农业的出现,人类骨骼系统发生快速进化。BMP3 (Bone morphogenetic protein 3)是其它骨形成蛋白的拮抗剂,在骨骼系统发育中起重要作
昆明动物所转基因动物研究取得新成果
由中国科学院昆明动物研究所季维智研究员领导的研究小组关于非人灵长类转基因动物的研究论文Transgenic rhesus monkeys produced by gene transfer into early-cleavage–stage embryos using a simi
昆明动物所等揭示动物适应性进化的第二套基因组学机制
动物适应青藏高原极端环境的过程中,逐渐形成了耐低氧、耐高寒、耐粗饲料等复杂性状的适应性。以往针对高原适应遗传机制的研究大多数局限在动物自身遗传物质的变异,很少了解与动物宿主共进化的第二套基因组(即肠道微生物组)的重要贡献,特别是能量代谢方面。 中国科学院昆明动物研究所研究员施鹏领导的团队和中国
昆明动物所在脊椎动物早期神经发育研究中取得进展
脊椎动物神经系统的发育包括神经诱导、图式形成以及神经分化三个主要过程。经神经诱导形成的神经板由多种神经前体细胞构成,这些神经前体细胞特异性表达转录因子Sox2,以便维持其细胞多能性。在神经分化阶段,神经前体细胞中的Sox2表达下调,激活Ngnr1---NeuroD1---N-tubulin通路,
基因组所与昆明动物所在家犬起源进化研究中取得新进展
5月14日,中科院北京基因组研究所与中科院昆明动物研究所在家犬起源进化合作研究中取得重要进展,相关论文在最新一期《自然·通讯》在线发表。该研究成果从全基因组层面上阐述了狗的起源进化,并首次将其进化历史和人类的近期演化联系了起来。 在昆明动物所张亚平教授和基因组所吴仲义教授的带领下,昆明动物
基因组研究显示七鳃鳗独立于其他脊椎动物进化
一个国际研究团队在新一期《自然·遗传学》杂志上说,他们成功破译了原始鱼类七鳃鳗的基因组,发现这种动物拥有诸多不同于其他脊椎动物和更原始的无脊椎动物的基因特征,这表明七鳃鳗是独立进化而来的。 七鳃鳗又称八目鳗,属于无腭纲,它们的嘴呈圆筒形,没有上下腭。从进化角度看,七鳃鳗处于接近脊椎动物祖先
中科院昆明动物所揭示新型肺癌肿瘤靶标
记者3月25日从中科院昆明动物研究所获悉,在国家自然科学基金委和科技部项目的支持下,该所李功华博士在黄京飞研究员的指导下,建立了新的系统生物学模型,并发现可能是新型的针对肺癌的肿瘤靶标。该研究成果已发表在《生物信息学》上。 据悉,肿瘤已是世界人口死亡的首要原因,我国每年因肿瘤死亡的人数超过
中科院昆明动物所-系统挖掘中草药抗癌潜力
中科院昆明动物所黄京飞课题组在从传统中草药中发掘抗癌植物和化合物研究中取得进展。相关成果日前在线发表于《科学报告》杂志。 我国传统中药数据库记录了2000多种药用植物。但在传统中草药中,只有小部分药用植物被充分系统地研究过。 针对这一现状,黄京飞课题组首先建立了一个抗肿瘤药物预测平台。基于该
中科院昆明动物所:系统挖掘中草药抗癌潜力
中科院昆明动物所黄京飞课题组在从传统中草药中发掘抗癌植物和化合物研究中取得进展。相关成果日前在线发表于《科学报告》杂志。 我国传统中药数据库记录了2000多种药用植物。但在传统中草药中,只有小部分药用植物被充分系统地研究过。 针对这一现状,黄京飞课题组首先建立了一个抗肿瘤药物预测平台。基于该
中科院昆明动物所“十二五”硕果累累
在云南昆明,有一家历史悠久的科研单位,它是我国最早开展灵长类动物驯养繁殖和研究的单位之一,曾为我国原子弹的辐射生物学研究作出过贡献。它就是中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆明动物所)。 新时期,昆明动物所立足于我国及东南亚丰富的生物多样性资源,瞄准“遗传、发育和进化交叉统一”的重大科学前沿
昆明动物所等在人类大脑进化遗传机制研究中取得进展
表观遗传修饰的重要性越来越被人所认识,但是表观遗传的变化如何对表型的进化产生影响,特别是表观遗传调控在人类大脑进化中的作用仍然不是很清楚。美国乔治亚理工大学教授Soojin V.Yi 曾经对人和黑猩猩大脑进行了全基因组甲基化测序,发现了很多物种间甲基化差异区域,但这些甲基化差异区域是否属于人类特
德国马普进化人类学研究所李明锟博士访问昆明动物所
6月20日,“中国科学院第二届人才发展主题活动日”在北京拉开序幕。作为系列活动之一的“海外人才走进科学院活动周”当天同时启动。该活动旨在通过邀请海外优秀青年科技人才集中访问中科院有关研究所并进行学术交流,与海外人才建立起交流密切的联络机制,向海外人才宣传国家和中科院人才政策与举措,搭建
中科院昆明动物所家鸡矮小化研究获得系列进展
中科院昆明动物所在家鸡矮小化研究中获得系列进展,相关研究成果发表在《分子生物学与进化》杂志上。 人类的驯化和选育使得家鸡成为表型多样性最为丰富的动物之一。在体型大小方面,大型肉鸡或斗鸡(>5 kg)和小型观赏鸡(约0.5 kg)可达到10倍以上的悬殊差异。其中,家鸡的矮小化在蛋鸡和观赏鸡选育
昆明动物所举办GLP培训
4月13日上午,中科院昆明动物研究所举办GLP培训会,研究所生物产业化中心及实验动物中心相关工作人员参加了培训。 生物产业化中心副主任杨启成博士就GLP的理念、管理准则及目标等进行了深入浅出的讲解。对在GLP运行中可能出现的问题、数据可追溯的重要性作了详细解释。同时,生物产业
昆明动物所等发现人类大脑进化幼态持续现象的分子机制
幼态持续(neoteny)是人类进化中发生的独特现象。与我们的近亲非人灵长类相比,人类的发育速度变慢,发育过程延缓。人类的幼态持续在进化上的重要性在于为大脑发育和神经网络的可塑性提供了更长的时间窗口,是人类智力形成的关键因素。然而,人们对人类幼态持续的遗传基础尚不清楚。 中国科学院昆明动物研究
昆明动物所等发布超大规模进化树构建软件
近日,中国科学院昆明动物研究所马占山团队与天津大学教授邹权、厦门大学科研人员联合发布了为千兆(GB)级基因序列数据构建进化树的软件HPTree。该软件使用谷歌Hadoop并行技术和美国加利福尼亚大学伯克利分校Spark集群大数据技术作为并行处理平台,利用计算机集群对基因序列大数据进行分割处理和整