武汉大学开发纳米孔测序法，较qPCR阳性率检测率提升43.8％
2019年底爆发新型冠状病毒性肺炎COVID-19疫情，全球已有许多感染和死亡病例，截止2020年3月1日，累计确诊超8万人，死亡近三千例，但仍存在许多临床疑似病例无法确诊。既往COVID-19诊断依赖于qPCR核酸检测，但是该方法显示出较高的假阴性率和低敏感性（阳性检出率仅为30％至50％），从而导致临床高度疑似新冠感染患者或低病毒潜伏的“假痊愈患者”检测“假阴性”现象频发，此外，qPCR核酸检测无法同时检测其他秋冬季高发、症状与新冠相似的其他呼吸道病毒，给疫情防控和患者分流管理带来极大挑战。 身处疫区一线的武汉大学刘天罡教授、武汉大学人民医院李艳教授、余锂镭教授、武汉臻熙医学检验实验室有限公司总负责人付爱思博士等组建的联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序（Nanopore Targeted Sequencing， NTS）检测方法，2020年1月20日便在一线医院开展工作， NTS结合了病毒靶向扩增和纳米孔测序长读长、实......阅读全文
纳米孔测序技术
测序长度和准确率的快速提升使得纳米孔测序有望颠覆DNA测序市场。纽约威尔康奈尔医学院的计算生物学家Christopher Mason喜欢在会议上表演一个“绝活”：他和同事先从志愿者手机上收集DNA样本，然后就能在一个小时内现场进行谱系分析，甚至叙述志愿者一天的生活细节。“我们能从留在手机上的DNA信
详解牛津纳米孔测序仪
牛津纳米孔测序仪在美国人类遗传学学会年会上公布技术参数 2014年的ASHG年会于10月18日开始在圣地亚哥举行，有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinIon的现场演示，技术之创新，令人震惊!21日下午，牛津纳米孔公司特地在旁边的Hardrockho举行了一个小型的封闭式的技术说明会，讲解了纳米孔的
详解牛津纳米孔测序仪
2014年的ASHG年会于10月18日开始在圣地亚哥举行，有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinIon的现场演示，技术之创新，令人震惊!21日下午，牛津纳米孔公司特地在旁边的Hardrockho举行了一个小型的封闭式的技术说明会，讲解了纳米孔的测试结果。 尺寸 MinION的尺寸之小，大大出乎我的
纳米孔测序技术有望颠覆DNA测序市场？
Scott Tighe（左）等研究人员利用MinION设备在南极泰勒谷测序微生物DNA。 “我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示。你们相信吗？Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机
纳米孔测序技术发展简介
随着对DNA结构和序列的研究，DNA测序技术不断发展，成为生命科学研究的核心领域，对生物、化学、电学、生命科学、医学等领域的技术发展起到巨大的推动作用。利用纳米孔研究出新型的快速、准确、低成本、高精度及高通量的DNA测序技术是后人类基因组计划的热点之一。 纳米孔测序技术发展简介 纳米孔检测技
－Oxford－Nanopore：纳米孔测序仪开放试用
在上个月的美国人类遗传学协会年会上，英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次，它果然没有食言。MinION试用计划于11月25日启动，将延续到2014年初，具体截止日期未定。 根据这项试用计划，参与者须支付1,000美
纳米孔测序仪真机现身ASHG
英国Oxford Nanopore Technologies公司在年初的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上发布了一款便携式的基因组测序仪MinION，性能强劲，价格给力，引发市场轰动。然而，大半年过去了，纳米孔测序仪却迟迟不见踪影，连更早发布的GridION也未上市。于是，生物界开始议论
纳米孔技术有望颠覆DNA测序市场
Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机上收集的化验样本获取DNA，他和同事能在1个小时内现场进行谱系分析，甚至详细描述出捐赠者一天的生活细节。“我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示
Nature－Methods：纳米孔测序仪潜力无限
来自英国Oxford Nanopore公司的MinION是第一台商业化的纳米孔测序仪。它在带来无限希望的同时，也承受着高错误率的质疑。英国伯明翰大学的Nicholas J. Loman和爱丁堡大学的Mick Watson在最新一期的《Nature Methods》上撰文，称新开发的工具让纳米孔测
纳米孔测序的过去、现在和将来
纵观测序技术的发展历程，没有哪一个技术像纳米孔测序那样慢热，但也没有哪一个技术像纳米孔测序这么接近普罗大众。将单链DNA拉过蛋白孔，检测碱基穿过时电导的微小改变，纳米孔测序的这一基础理念已经有十几年历史了。 1996年哈佛大学的DanielBranton、加州大学的DavidDeamer及其同
纳米孔测序仪首次于失重环境下完成测序实验
科学家们在失重环境下进行实验，首次证实掌上测序仪MinION可以在太空中使用。 Johns Hopkins大学的遗传学家Andrew Feinberg和Lindsay Rizzardi登上了NASA的低重力飞机，在模拟的失重环境下完成了遗传学实验。“我非常享受这种体验，感觉就像置身天堂，”Fe
小小纳米孔破解蛋白质测序难题
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503589.shtm
纳米孔测序发现DNA损伤的新策略
最近，美国犹他大学的化学家们，设计了一种新的方法来检测DNA化学损伤，DNA损伤有时会导致基因突变，引发许多疾病，包括各种癌症和神经系统疾病。相关研究结果发表在十一月六日的《NatureCommunications》。 本文通讯作者、化学教授CynthiaBurrows说：“我们更进一步了解了
iPhone供电的纳米孔测序仪有望上市
Oxford Nanopore的用户组会议于上周四在伦敦召开。媒体并没有被邀请，不过一些用户和博主已经在Twitter上透露了最新消息。Oxford Nanopore正在开发一款智能手机供电的纳米孔测序仪以及一款低成本的文库制备系统。 Oxford Nanopore的用户组会议于上周四在伦敦召
纳米孔测序的最低DNA量是多少
第三代测序技术则是基于纳米孔的单分子读取技术，全基因组的测序以及RNA-seq测序有DNA测序和RNA测序，之前比较早的测序是以芯片为基础,这种方法读取数据更快，现在常用的是二代测序。随之而来的是第三代测序技术、有望大大降低测序成本。望满意，目前比较高级的还有单细胞测序
纳米孔测序发现DNA损伤的新策略
最近，美国犹他大学的化学家们，设计了一种新的方法来检测DNA化学损伤，DNA损伤有时会导至基因突变，引发许多疾病，包括各种癌症和神经系统疾病。相关研究结果发表在十一月六日的《Nature Communications》。延伸阅读：科学家解开DNA修复的谜团。本文通讯作者、化学教授Cynthia
纳米孔测序搞定超级难搞的基因
Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定，通量也不高，但Graveley和他的同事决定立刻就试试。 对于MinION，众多讨论
纳米孔测序搞定超级难搞的基因
Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定，通量也不高，但Graveley和他的同事决定立刻就试试。 对于MinION，众多讨论
武汉大学研发纳米孔靶向测序检测方法
记者从武汉大学获悉：该校组建的联合团队创新性开发的纳米孔靶向测序检测方法，能够大幅提升病毒阳性检出率，并能实现当天同时检测新冠病毒和其他10类40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变，有助于破解临床疑似病例难以确诊的问题。 据介绍，既往新冠病毒诊断依赖于qPCR核酸检测，但是该方法显示出较高的假阴性
2013值得关注的技术：纳米孔测序仪
《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时，杂志还介绍了2013年值得关注的技术，包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func
纳米孔测序仪为何迟迟不见踪影？
今年2月，英国Oxford Nanopore Technologies公司(以下简称Oxford)宣布推出一款便携式的基因组测序仪MinION，约摸只有U盘大小，价格低于900美元，立即引发市场轰动。同时，该公司另一测序平台GridION有望在15分钟内完成人类基因组测序，费用约为1,500
PCR假阴性的原因
假阴性是指不出现特异扩增带。可能原因：引物设计不合理，酶失活或酶量不足，模板量太少，退火温度不合适，循环次数过少，产物未及时电泳检测等。解决方法有：重新设计引物，增加酶量或调换酶，增加模板量，调整退火温度，增加循环次数，及时检测扩增产物，一般在 48h 以内进行。
什么是PCR假阴性？
假阴性是指不出现特异扩增带。可能原因：引物设计不合理，酶失活或酶量不足，模板量太少，退火温度不合适，循环次数过少，产物未及时电泳检测等。解决方法有：重新设计引物，增加酶量或调换酶，增加模板量，调整退火温度，增加循环次数，及时检测扩增产物，一般在 48h 以内进行。
PCR假阴性的原因
造成PCR假阴性的原因是复杂的，也是多样的。主要有： 1.PCR仪本身的质量问题。PCR仪设计原理上的差异和经常出现的质量问题（如：温控不准等）给临床带来了诸如非特异性扩增（假阳性）、扩增效率下降(假阴性）等问题. 2.离心机问题。离心机的质量或使用不正确，造成离心标本模板没有分离出来造成假阴性，窃
ELISA假阳性结果和细胞假阴性结果
假阳性结果和假阴性结果1、标本的采集与保存ELISA试剂盒当标本采集保存不当产生溶血时，红细胞中的血红蛋白释放到血清中，血红蛋白具有过氧化物酶的性质，其通过吸附或“PP效应"（蛋白质间相互吸附的现象）结合后，可催化A、B液显色而造成假阳性标本采集保存不当致细菌污染，菌体中可能含有内源性HRP，会产生
利用纳米孔测序在100天内测序100种番茄
约翰霍普金斯大学的研究人员Michael Schatz概括了目前所做的工作和进展情况，而贝勒医学院的研究人员Fritz Sedlazeck介绍了样本选择和结构变异检测的详细信息。 番茄是最有价值的经济作物之一，在世界各地广泛栽培。根据联合国粮农组织的统计，2016年番茄产量达到1.77亿吨，价
武汉大学开发纳米孔测序法，较qPCR阳性率检测率提升43.8％
2019年底爆发新型冠状病毒性肺炎COVID-19疫情，全球已有许多感染和死亡病例，截止2020年3月1日，累计确诊超8万人，死亡近三千例，但仍存在许多临床疑似病例无法确诊。既往COVID-19诊断依赖于qPCR核酸检测，但是该方法显示出较高的假阴性率和低敏感性（阳性检出率仅为30％至50％），
PNAS：新技术实现纳米孔内快速测序DNA
据《每日科学》近日报道，由美国华盛顿大学物理学家领导的研究小组设计了一种新技术，可在纳米孔内对DNA进行快速测序，而且价格比较便宜。新方法可为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图，提供更加高效的个体医疗。相关论文发表于美国《国家科学院院刊》（PNAS）。 论文主要作者
牛津纳米孔测序将全面升级，回避IlluminaZL之战
一直以来，牛津纳米孔公司对其核心产品的微通道都持有保密态度，然而自测序巨头Illumina公司对其进行ZL诉讼之后，牛津纳米孔透露了其最新设备的驱动因子——细菌孔隙，似乎有意回避Illumina的ZL之战。 纳米孔测序被誉为是一个比传统测序更便携和实惠的技术，根据单核苷酸通过孔隙产生的电流变化
纳米孔测序首次实现1－Mb的读长
高通量测序的产量让人惊叹不已，但读长却屡屡遭人诟病。不过，从100 bp到1 kb，读长始终在进步。近日，测序界传来了一个激动人心的消息，澳大利亚Garvan研究所的研究人员利用Oxford Nanopore测序技术实现了> 1 Mb的读长，这堪称测序历史上的一个里程碑。 Kinghorn临床