一文读懂|西湖大学郭天南：多组学对新冠的研究与挑战

西湖大学郭天南团队发现新冠患者生物标志物

　　北京时间5月28日12时左右，Cell杂志在线发表了西湖大学生命科学学院蛋白质组大数据实验室同合作团队的新冠肺炎研究论文，揭示了重症患者的血清中存在多种独特的分子变化，并找出了重症患者一系列特征性的重要生物标志物，将有望为预测轻症患者向重症发展提供导向。　　这是继周强实验室之后，西湖大学在新冠病

西湖大学郭天南团队发现新冠重症生物标志物

　　 继周强实验室之后，西湖大学生命科学学院PI郭天南带领的蛋白质组大数据实验室，近日在新冠病毒研究方面又有重要发现。　　 他们和合作团队一起对新冠肺炎患者血液中的蛋白质和代谢物分子进行系统检测，发现重症患者的血清中存在多种独特的分子变化，并找到了一系列生物标志物，有望为预测轻症患者向重症发展提供导

郭天南：全景式组学研究为新冠重症早诊断提供决策依据

　　分析测试百科网讯 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之际，PCR技术在快速筛查中已大显神威，但进入临床后如何更早地区分轻症和重症患者，从而更准确地治疗和用药？5月27日中国研究人员在《Cell》发表文章，利用蛋白质组学和代谢组学的全景式分析，发现了重症患者体内应对病毒进攻特征性的分子改变，并

一文读懂|西湖大学郭天南：多组学对新冠的研究与挑战

　　编译 | 陆恬，钱丽琴　　作者 | 陆恬，王瑛睿 ，郭天南　　COVID-19 仍在全球肆虐，且似乎不会从地球消失。近日，西湖大学郭天南团队在 Cell Reports Medicine 发表评述，在这篇评述中，郭天南等人讨论了多组学技术在揭示 COVID-19 发病、进展和传播背后的分子机制中

西湖大学郭天南：蛋白质组大数据和人工智能的临床应用

　　高通量蛋白质组技术的进步驱动了大队列级别的临床蛋白质组研究的深度不断拓展。2020年1月10日上午，SCIEX特邀西湖大学特聘研究员郭天南进行网络讲座，为大家介绍《蛋白质组大数据和人工智能的临床应用》，将具体探讨蛋白质组大数据的方法学进展，以及其结合人工智能在医学中的应用。敬请期待！　　→点击此

和疫情赛跑，质谱战“疫”在行动

2020年突如其来的新冠疫情不仅给公共卫生造成了极大负担，更直接影响和重塑了传染病的研究模式。新冠肺炎疫情持续期间，相关科研论文产出呈现井喷之势。在Pubmed搜索“Covid-19 or SARS CoV-2”，结果显示相关论文数量为145112篇。组学技术在传染病的表征、致病机制、临床检测、疫苗

如何通过代谢组学发现新的生物标志物

　　重症肌无力(Myasthenia gravis，MG)是一种慢性的、让人逐渐疲乏无力的自体免疫疾病，临床上表现为随意肌的受累。如果不加以治疗，重症肌无力的症状会加重甚至导致死亡。目前，对于重症肌无力还没有发现较稳定的生物标志物。因此，迫切需要一种新的诊断方法和生物标志物来提高重症肌无力的诊断和治

新冠肺炎患者器官损伤背后分子层面的“面纱”逐步揭开

  科学家针对新冠病毒及致病机理的研究在持续深入，关于新冠肺炎患者器官损伤背后分子层面的“面纱”也在逐渐揭开。 北京时间1月9日，顶级学术期刊《细胞》（Cell）在线发表了由西湖大学生命科学学院和华中科技大学同济医学院附属协和医院的研究人员共同完成的一项研究，题为“Multi-organ Pro

高分辨质谱Orbitrap直击靶标代谢组学新热点

在生命科学奇妙世界里，基因、核酸、蛋白和小分子代谢产物构成了细胞生命活动的基本要素，以这些物质为基础的诸多组学技术的发展，推动着生命科学研究不断向前。 基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命科学研究中研究的范式⁽¹⁾，研究成果可谓精妙纷呈、大放异彩。 图1：基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命

质谱组学，引领精准

　　8月，上海。炎炎夏日，骄阳似火，正值生机盎然的季节，一场造福行业发展的合作协议今日于上海签订。赛默飞世尔科技（中国）有限公司和上海中科新生命生物科技有限公司在多组学及精准医疗领域，建立战略合作伙伴关系。出席本次签订协议的嘉宾有赛默飞世尔科技（中国）有限公司商务运营副总裁冯时瀚先生、上海中科新生命

质谱和蛋白质组学：击中目标

Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)   作者：Nathan Blow   分析测试百科  译     近年来，质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度，使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面，更从容地面对挑战。     在2008年6月的美国质谱大会（ASMS）

Cell提出一个新“组学”：蛋白质代谢小分子互动组学

　　科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学（protein-metabolite interactomics）。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学，现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。　　基因组学针对的是生物体基因的系统分析，而蛋

第二届西湖临床质谱研讨会－探讨临床蛋白质组学

　　Progresses and Perspectives of Mass Spectrometry-based Clinical Proteomics　　基于质谱的临床蛋白质组学的研究进展与展望联合主席：Steve Pennington 贺福初 郭天南主办单位：西湖大学 CNHUPO HUPO会议

欢迎加入【中药代谢组学与脂质组学】网络讲座

精准分析－量化释能——6位专家齐聚2019－SCIEX技术交流会

　　分析测试百科网讯 2019年4月18日，在第一届中国生物物理学会代谢组学分会年会暨2019代谢组学国际研讨会召开前夕，2019 SCIEX技术交流会如期召开，此次交流会的主题为“精准分析、量化释能”，旨在推动精准医学的发展。中国科学院大连化学物理研究所许国旺研究员、北京大学郑乐民教授、中国科学院

质谱与临床的邂逅——2021年质谱沙龙线上学术交流年会召开

　　2021年12月25日，2021年度“质谱沙龙”线上学术交流年会在线上顺利召开。本次第十五届沙龙年会首次以国家级继续教育项目形式举办，邀请了国内临床质谱领域专家进行交流，主要围绕质谱前沿技术与临床中的应用进行展开，为质谱的临床转化、合理应用拓展思路。分析测试百科网作为本次活动的支持媒体，为您带来

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

　　靶向代谢组学中，通常需要同时检测多个目标组分，这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 　　岛津超快速质谱（UFMS）拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例，其驻留时间（Dwell time≥0.8 ms）、切换时间（Pause time≥1 ms）、扫描速度（Scan s

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

靶向代谢组学中，通常需要同时检测多个目标组分，这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。  岛津超快速质谱（UFMS）拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例，其驻留时间（Dwell time≥0.8 ms）、切换时间（Pause time≥1 ms）、扫描速度（Scan speed≤3

西湖实验室郭天南团队利用膨胀水凝胶助力组学分析

　　蛋白质作为疾病生物标志物和药物靶点在现代生物医学中具有举足轻重的作用，蛋白质组学是分析生物体内所有蛋白质的组成与定量的有效手段。传统的蛋白质组检测的是整块组织或分离后的细胞中的蛋白表达水平，失去了空间位置信息。然而，由于组织异质性，组织中不同细胞表达的蛋白种类和数量可能存在显著性差异，获得组织空

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

　　什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 　　代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

　　什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 　　代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

　　什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 　　代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？       代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

AI赋能甲状腺结节良恶性诊断－大幅提升准确率

术后检测？穿刺活检？在手术前，甲状腺结节的良性恶性难分辨。西湖大学教授郭天南团队将高通量蛋白质组学与Al技术结合，诊断准确率提高到85%以上。 9月6日，西湖大学郭天南研究员团队、李子青教授团队及临床合作者在学术期刊《细胞发现》（Cell Discovery）杂志上发表论文“Artificial

郭天南：藏在尿液中的新冠肺炎病情“密码”

　　团队从尿液中筛选出20个蛋白质标志物并建立模型，成功实现了对轻、重型新冠肺炎患者进行分类预测。该研究表明，从新冠肺炎患者尿液中获取的蛋白分子可以灵敏地反映机体的病理状态。　　近日，西湖大学生命科学学院郭天南实验室与合作团队在《细胞》子刊《细胞报告》发表最新研究成果：联合团队从尿液中筛选出20个蛋

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（一）

在疫情逐步可控的情形下，一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学，脂质组学，以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示，新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样，

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（二）

案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章，采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒（Cricket paralysis virus, CrPV）感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现，CrPV

当蛋白质组遇上AI，加速的是什么

临床质谱局部图  西湖欧米供图使用压力循环技术处理微量组织样品。  西湖欧米供图西湖欧米愿景图  西湖欧米供图一个普通人做一次血液全蛋白质组的质谱检测，能获得哪些有意义或有趣的信息？谁会成为蛋白组领域的23andMe（DNA鉴定公司）？去年7月人类蛋白质组98.5%的蛋白质结构被AlphaFold破

杭州质谱学术大会系列：Astral突破质谱组学新极限

　　——2020-2023杭州质谱学术大会系列报导　　6月11日，中国质谱学术大会 “新方法与新技术”专场报告中，来自北京生命科学研究所董梦秋研究员、中科院大连化物所张丽华研究员、南京大学鞠幌先教授、赛默飞应用主管范自全等专家、学者和企业代表带来了关于蛋白质相互作用、结构分析的最新质谱检测方法与应用

综述：基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展

　　 糖是组成生命体的四大类重要分子之一，糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内，在很多生命过程中起着重要作用，如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时，糖基化修饰在疾病中，特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用，许多疾