强强联合(脂质组+DIA),IF>10(二)

5.聚类分析为了进一步识别人群队列中潜在的相似代谢,基于KODAMA值进行partition around medoids clustering分析,鉴定到4个cluster(A,B,C,D)。比较有意思的是,不同cluster的PEs的发生具有显著差异,分别是Cluster A:71%,Cluster B:42%,Cluster C:29%,Cluster D:19%,其中cluster D发生PE的可能性最高。 结论 通过脂质组和蛋白组实验,研究发现12种PCs,4种LPCs以及凝血途径的PLG在对照组和PEs组具有显著变化,且大多数脂质分子与PLG具有很强的相关性。无监督的聚类分析发现cluster D发生PE的可能性最高。这篇文章揭示了代谢失调可能会引起PEs的早期易感性,并提示这些PCs、LPCs、凝血和补体蛋白之间的相互作用。小编心得1.DIA定量准确性接近PRM,可用于靶向检测相比传统的DD......阅读全文

强强联合(脂质组+DIA),IF>10(二)

5.聚类分析为了进一步识别人群队列中潜在的相似代谢,基于KODAMA值进行partition around medoids clustering分析,鉴定到4个cluster(A,B,C,D)。比较有意思的是,不同cluster的PEs的发生具有显著差异,分别是Cluster A:71%,Clust

强强联合(脂质组+DIA),IF>10(一)

脂质组学技术 相比其他组学技术,脂质组学技术发展较晚,新颖性高,仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。DIA技术 新一代、革命性的蛋白质组技术DIA,相比传统的蛋白质组技术(shotgun,Label fr

最新高分文章套路-|-强强联合(脂质组+DIA),IF>10

   脂质组学技术   相比其他组学技术,脂质组学技术发展较晚,新颖性高,仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。   【纯组学数据分析发文】   PNAS | 脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及

最新高分文章套路-|-强强联合(脂质组+DIA),IF>10

   脂质组学技术   相比其他组学技术,脂质组学技术发展较晚,新颖性高,仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。   【纯组学数据分析发文】   PNAS | 脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(二)

案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现,CrPV

脂质组-LC/MS自动化鉴定及相对定量(二)

第 1 步 数据分析模块 — 峰提取 • 原始数据文件读取• 智能峰提取 整合于 LipidSearch 软件中的峰提取引擎能够处理不同 MS 实验和仪器平台采集的数据。综合独特的峰提取算法、区分不同实验和仪器类型、整合先进的谱图处理功能,最终确保精确的谱峰提取。 第 2 步 鉴定模块 — 脂质鉴定

高分辨质谱脂质轮廓谱表征用于食品组学研究中...(二)

3.2 分类与多元统计结果实验挑选 6 种最为常见的食用植物油进行深度的多元统计分析。图 5 为对 SIEVE 软件获得的脂质轮廓谱数据矩阵进行聚类分析的结果,可见, 6 种食用植物油样品按照各自的植物基源,分类明确。随后,为进一步明晰不同脂质分子在脂质整体轮廓分类中的贡献,实验又对这 6 种植物油

全新角度探索生命奥秘:脂质组学

  血浆中约70%的代谢物是脂类,脂类代谢是动植物的第一大类代谢。加上质谱法的广泛应用,大大加速了脂质组学的发展,脂质组学已成为代谢组学中最为活跃的研究领域之一。  万事万物都存在着辩证,尽管我们对高血脂深恶痛绝,心痛它对我们身体的摧残。但脂质却又是人体无法舍弃的重要组成,少了它,生命将一团乱麻以至

脂质组学:全新角度探索生命奥秘

  血浆中约70%的代谢物是脂类,脂类代谢是动植物的第一大类代谢。加上质谱法的广泛应用,大大加速了脂质组学的发展,脂质组学已成为代谢组学中最为活跃的研究领域之一。  万事万物都存在着辩证,尽管我们对高血脂深恶痛绝,心痛它对我们身体的摧残。但脂质却又是人体无法舍弃的重要组成,少了它,生命将一团乱麻以至

LCMS在脂质组学中的应用

  脂质组学(lipidomics)已经作为一门独立的学科与非靶代谢组学、靶向代谢组成为代谢组学中“三大主要研究领域”。为什么脂质组学会成为研究热点中的新宠?请听我一一道来。  还记得上面这张18年初风靡全生物圈的“小鼠拔罐”图吗?今年2月,陆军军医大学新桥医院李咏生团队发表在【Cellular P

Proteome-and-Phosphoproteome-Quantification-by-DIA-on-Orbitrap-(二)

FIGURE 2. Comparison of DDA and DIA raw data. (A) Comparison of MS1 base peak chromatograms. (B) Comparison of zoomedin chromatograms. (C) Composi

二醇脂质的概念和定义

中文名称二醇脂质英文名称diol lipid定  义学名:2-顺-十六烯(9)酰-3-反-十八烯(11)酰-2,3-丁二醇。由二羟基醇与脂肪酸形成酯的中性脂肪。但不是甘油酯,少量存在种子油中。如见于薏苡仁的薏苡仁酯。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),脂质(二级学科)

二醇脂质的基本概念

中文名称二醇脂质英文名称diol lipid定  义学名:2-顺-十六烯(9)酰-3-反-十八烯(11)酰-2,3-丁二醇。由二羟基醇与脂肪酸形成酯的中性脂肪。但不是甘油酯,少量存在种子油中。如见于薏苡仁的薏苡仁酯。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),脂质(二级学科)

代谢及脂质组学液质应用培训班通知

  基于质谱的代谢组学已成为疾病机理研究、临床生物标志物发现、新药靶点开发、环境暴露、食品真伪或溯源、农业和林业科学等方面的重要科研手段而被广泛应用。为了助力代谢组学领域的质谱学者更好地运用LC-MS/MS系统进行研究,SCIEX将在天津举办“代谢及脂质组学液质应用培训班”,内容主要涉及:  1)代

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(一)

在疫情逐步可控的情形下,一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示,新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,

脂质第二信使的定义

中文名称脂质第二信使英文名称lipid second messenger定  义细胞内化学性质是脂质的第二信使。包括二酰甘油、肌醇-1,4,5-三磷酸、花生四烯酸、磷脂酸和神经酰胺等。通过受体与细胞外配体结合后其浓度的变化而介导信号转导。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

PB反应结缘小型质谱,脂质组学研究再添利器

  近日,Nature Methods杂志(IF25.06)报道了清华大学欧阳证教授和瑕瑜教授在质谱小型化及脂质同分异构体研究领域取得的研究进展。图片来源于Nature Methods  PB反应解锁脂类C=C双键位置  哺乳动物细胞脂质组中含有较多的同分异构体,这对于脂质的定量和分析是一个挑战。近

单细胞脂质组学技术的机制及意义

  5月17日,清华大学精密仪器系质谱研究团队发文报道基于质谱的单细胞脂质组精细结构表征技术,实现了哺乳动物单细胞内脂质的大规模精细结构分析,解决了单细胞质谱领域长期面临的关键技术挑战。基于单细胞内多种类型脂质异构体的鉴定与相对定量,该团队实现了野生型非小细胞肺癌(HCC827)细胞群体中耐药细胞的

税光厚:为什么要做脂质组学研究?

“精准分析”我们的成功故事系列  ——写在前面的话  “精准分析•量化释能”——我们的成功故事系列栏目,是SCIEX帮助科学家们分享有意义的科学发现和研究成果的科普平台。我们期待让更多的人感受到科学和“质谱”的力量,”让质谱改变每个人的生活”始终是SCIEX最美好的愿景。SCIEX非常荣幸能够参与到

【JOAT刘虎威编者按】专题:代谢组学和脂质组学

  刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编。     近日,刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编进行了约稿审稿工作,并撰写了题为“专题:代谢组学和脂质组学”的编者按。  代谢

常见的质谱扫描模式丨DDA--DIA

  Data Dependent Acquisition  DDA  1 之前已经提到,DDA可以同时获得被测代谢物的一级质谱和碎片信息,母离子的筛选主要依靠研究者预先设定的条件,如信噪比,同位素分布,离子强度,选择top-n等等。该方法由于采用了较窄的m/z(通常为~1Da)窗口进行筛选目标离子减

质谱立大功!首张人体肺部的脂质组图谱出炉

  美国太平洋西北国家实验室和罗切斯特大学领导的研究团队近日利用质谱分析技术,绘制出第一张人体器官特异的脂质组图谱–肺部。  近年来,不同类型细胞的转录组和蛋白质组已经陆续发布,包括大脑、心脏和肝脏中的主要细胞类型,这些有助于我们更好地了解人体每个器官的功能。不过到目前为止,还没有类似的脂质组(li

脂质第二信使的功能特点

中文名称脂质第二信使英文名称lipid second messenger定  义细胞内化学性质是脂质的第二信使。包括二酰甘油、肌醇-1,4,5-三磷酸、花生四烯酸、磷脂酸和神经酰胺等。通过受体与细胞外配体结合后其浓度的变化而介导信号转导。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

PNAS脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常潜在治疗靶

  关键词:埃博拉病毒,脂质组学,治疗靶点,脂质代谢   2014年,非洲爆发了有史以来最凶猛的一次埃博拉病毒疫情,震动全球。直到年底,疫情才终于得到控制。根据世卫组织的统计数字,截至2014年12月14日,全球范围内已有超过1.8万例感染者,近7000人死亡。因为疫情影响农业生产和贸易,西非疫区

脂质组学技术揭示拔罐疗法科学原理

  中医拔罐治疗有什么科学依据和作用原理?22日,科技日报记者从陆军军医大学第二附属医院(重庆新桥医院)获悉,该院全军肿瘤研究所李咏生团队率先使用小鼠拔罐模型,运用超高效液相-质谱联用仪建立的脂质代谢组学平台,揭示了拔罐疗法导致体内抗炎/促炎脂质代谢谱的变化规律,为拔罐疗法的潜在机制提供了科学支撑。

【网络研讨会】蛋白质组学/脂质组学研究进展

  自从精准医学概念提出以来,组学研究一直都是全球最热的研究领域,其技术在临床医学、生物医药和食品安全等领域都占据十分重要的作用。2016年初,中国发起了精准医学研究专项课题,目标在2017年至2019年构建重大疾病的预防诊断和治疗大数据平台,推动一批精准治疗药物和分子检测产品进入国家医保目录。同时

清华教授Nat-Commun发表论文:质谱的单细胞脂质组学分析

  单细胞分析是研究细胞异质性的关键技术,对生物学过程研究及新药研发有着重要意义。目前,单细胞基因组学技术较为成熟,单细胞转录组学和蛋白组学分析技术近年来获得较多关注和投入。与其他组学相比,单细胞脂质组学分析刚刚起步,面临诸多技术难点。由于脂质数量庞大,结构复杂,其在单细胞层面的结构表征和定量分析颇

脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及潜在治疗靶点

  关键词:埃博拉病毒,脂质组学,治疗靶点,脂质代谢   2014年,非洲爆发了有史以来最凶猛的一次埃博拉病毒疫情,震动全球。直到年底,疫情才终于得到控制。根据世卫组织的统计数字,截至2014年12月14日,全球范围内已有超过1.8万例感染者,近7000人死亡。因为疫情影响农业生产和贸易,西非疫区