lncRNA功能机制研究(二)
实验路线(1)LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果:转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合,并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子KLF5、MYC、LINC00346基因表达;c. GSE51705数据库的分析显示,KATO-III GC细胞中KLF5与LINC00346基因启动子结合;d. UCSC基因组生物信息学网站显示, MYC高度富集在LINC00346的启动子上;e. GSE51575数据库显示LINC00346的表达与KLF5或MYC正相关;f. qPCR显示LINC00346的表达与KLF5或MYC 正相关;g. ChIP实验显示,内源性MYC和KLF5与LINC00346基因启动子区结合。h. WB显示干扰或过表达LINC00......阅读全文
lncRNA功能机制研究(二)
实验路线(1)LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果:转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合,并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子
lncRNA功能机制研究(一)
文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能
lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(二)
2. GC细胞中FOXD2-AS1富集高的患者预后较差在芯片数据GSE51575基础上,以正常组织作为对照,来评估FOXD2-AS1的诊断效果。ROC曲线下面积为0.919(95%置信区间[CI] 0.809-0.976; P < 0.0001);特异性和敏感性分别为0.885和0.885。
lncRNA在农业领域的研究成果(二)
【思路及相应结果】内容与图片源:(王立方,2015)【结论】通过全转录组测序、lncRNA测序和实时荧光定量的方法发现和鉴定了与家蚕产丝相关的lncRNA和其在不同产丝阶段的表达量变化,挑出了与家蚕产丝调控紧密相关的非编码RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互补链的lncR2034,与P25
外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘(二)
(5)外泌体LNMAT2上调PROX1的表达有研究报道,PROX1通过调节内皮细胞的分化和转移,对淋巴管系统发育至关重要。因此作者通过qPCR和WB实验发现,HLECs中上调LNMAT2能够促进PROX1的表达;为了探究LNMAT2调控PROX1表达的分子机制,作者进行核质分离PCR,发现LNMAT
lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析
近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 through
lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析
Nature子刊|联合南京医科大发表重要研究成果:揭示lncRNA促进胃癌进展的新机制 近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinoge
Nature-子刊:研究lncRNA功能的新方法
长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA位于细胞核,它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠,有的位于基因间或者内含子中。
云序客户8.0分成果揭秘还愁lncRNA功能机制如何研究吗?
LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能的了
云序客户8.0分成果揭秘:还愁lncRNA功能机制如何研究吗?
文章导读 LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱
lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(一)
近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 throu
lncRNA研究策略与技术
研究背景:长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子,长度在200 bp以上,起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控
circRNA机制研究汇总(二)
结合蛋白:(2)CircNfix与Ybx1结合并促进其降解:circNfix和对照组的蛋白质谱分析(A)。采用Ybx1、Nedd4l或阴性IgG抗体进行RIP实验(云序生物提供该服务)(B)。P0 CMs中过表达circNfix后Ybx1蛋白表达水平(C-D)。qRT-PCR检测P0 CMs中Y
新机制:lncRNA可调控小麦开花
冬小麦开花需要长时间低温环境的诱导,该过程称之为春化作用。这一过程受到外部环境因子和植物内在发育状态的双重复杂精准的调控。冬小麦不同品种的春化特性与其产量直接相关。在六倍体小麦中,TaVRN1是受低温诱导、可加速开花转换的关键调控因子。然而,目前对于在春化过程中TaVRN1逐步激活的分子机制尚不
lncRNA助力叶酸研究新成果
LncRNA研究发表的成果五花八门,然而借助于lncRNA芯片,挖掘其中的高通量数据,发表5分影响因子的文章,还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础,让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》(IF=5.104)上发表。研究背
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作为最新的国自然热点受到
LncRNA芯片应用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确
LncRNA芯片应用于胃癌研究
上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥
教你如何玩转tRNA机制研究(二)
4.AET1而不是RACK1A以及eIF3h直接和OsARF mRNA结合AET1与RACK1A以及eIF3h的结合是否和mRNA相关?RIP测序(云序生物提供)帮助研究者快速的明确哪些mRNA能够和蛋白AET1结合,分析结果显示高温条件下545个mRNA分子只在野生型水稻株当中和AET1结合,而仅
华裔学者Cell发表lncRNA研究的利器
长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本,绝大多数位于细胞核内。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生物学功能依然
上海交大LncRNA研究刊登国际期刊
长非编码RNA(lncRNA)不编码蛋白质,最初被认为是基因组“暗物质”的一部分。最近,有研究表明,lncRNAs在染色质修饰复合物的招募过程中发挥作用,并能影响基因的表达。然而,是否lncRNAs以类似的方式在癌症中发挥作用,尚不明确。延伸阅读:中美学者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。
lncRNA在农业领域的研究成果
miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错!不是标题党。说到miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar,想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题
长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略
长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作
第二军医大学Hepatology聚焦lncRNA
来自第二军医大学的研究人员在新研究中证实,在肝再生过程中一种称之为lncRNA-LALR1(Long noncoding RNAs associated with liver regeneration 1)的长链非编码RNA通过激活Wnt/β-Catenin信号促进了肝细胞增殖。相关论文
外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘
外泌体是指包含多种RNA(环状RNA、miRNA、LncRNA和mRNA等)和蛋白质的盘状囊泡(30-200nm)。几乎所有类型的细胞均可分泌外泌体,且外泌体天然存在于各种体液中,包括血液、唾液、尿液、脑脊液和乳汁等。外泌体被视为特异性分泌的膜泡,能够参与细胞间通讯。目前,有关外泌体分泌、摄取、
外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘
外泌体是指包含多种RNA(环状RNA、miRNA、LncRNA和mRNA等)和蛋白质的盘状囊泡(30-200nm)。几乎所有类型的细胞均可分泌外泌体,且外泌体天然存在于各种体液中,包括血液、唾液、尿液、脑脊液和乳汁等。外泌体被视为特异性分泌的膜泡,能够参与细胞间通讯。目前,有关外泌体分泌、摄取、
Cell子刊:超保守lncRNA的重要功能
谈到遗传物质,我们往往指的是从父母那儿继承到的DNA(脱氧核糖核酸)。这些DNA会转录成为RNA,进而指导各种蛋白质的合成,例如血红蛋白或胰岛素。除了这些RNA之外,细胞中还存在着大量神秘的非编码RNA。 MicroRNA是最广为人知的一种非编码RNA,这种微小的分子控制着众多基因的启动和关闭
共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能
lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点,但是,目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计,目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此,怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢?针对lncRNA和mRNA的共表达研究,为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提
共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能
lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点,但是,目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计,目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此,怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢?针对lncRNA和mRNA的共表达研究,为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提供了
共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能
lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点,但是,目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计,目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此,怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢?针对lncRNA和mRNA的共表达研究,为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提