lncRNA研究策略与技术

研究背景:长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子,长度在200 bp以上,起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控,尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色,如染色质修饰、转录激活和抑制、转录后调解以及作为miRNA的诱导分子干扰基因的表达等。随着高通量测序技术的发展,越来越多的lncRNA被注释,但是绝大多数的lncRNA的功能仍然不清楚,因此lncRNA的研究是一片非常广阔的未知领域,具有极大的研究价值和意义。案例解读:案例(一)RNA seq发现lincRNA1. 2011年,Rinn研究小组对24种组织样本进行RNA测序发现了8000多个人的lincRNA2. lincRNA的表达具有组织特异性案例(二)lncRNA可以成为各种肿瘤的生物标志物......阅读全文

lncRNA研究策略与技术

研究背景:长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子,长度在200 bp以上,起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控

长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略

长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作

烟气脱硫脱硝除尘技术与环保策略研究

  1、烟气脱硫技术  常见的烟气脱硫技术有几十种,常见的有湿法脱硫技术、干法脱硫技术、海水烟气脱硫和电子束烟气脱硫,湿法脱硫技术是较为成熟,使用最为广泛的一种脱硫技术,具有使用效率高、操作简单等特点。下面对每种脱硫技术做简单介绍:  1.1、湿法烟气脱硫  湿法脱硫技术的脱硫效果较好,但是存在设备

lncRNA功能机制研究(二)

实验路线(1)LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果:转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合,并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子

lncRNA功能机制研究(一)

文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能

lncRNA表达与RNA的延伸

LncRNA的火热研究已经有几年的时间了,关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后,今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。  长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN

lncRNA甲基化如何研究?

lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作为最新的国自然热点受到

lncRNA助力叶酸研究新成果

LncRNA研究发表的成果五花八门,然而借助于lncRNA芯片,挖掘其中的高通量数据,发表5分影响因子的文章,还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础,让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》(IF=5.104)上发表。研究背

LncRNA芯片应用于胃癌研究

     研究背景      在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确

LncRNA芯片应用于胃癌研究

上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥

甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合

2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。研究背景肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,由于环境的污染,肺癌

甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合

  2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。   研究背景   肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,

上海交大LncRNA研究刊登国际期刊

  长非编码RNA(lncRNA)不编码蛋白质,最初被认为是基因组“暗物质”的一部分。最近,有研究表明,lncRNAs在染色质修饰复合物的招募过程中发挥作用,并能影响基因的表达。然而,是否lncRNAs以类似的方式在癌症中发挥作用,尚不明确。延伸阅读:中美学者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。

lncRNA在农业领域的研究成果

  miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦   你没看错!不是标题党。说到miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar,想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题

华裔学者Cell发表lncRNA研究的利器

  长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本,绝大多数位于细胞核内。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生物学功能依然

军工产业研究策略

  一、回顾与展望:景气度提升被验证,产业即将步入新阶段  1.4.2 当前军工板块面临的五大疑问及我们的研究体系  军工板块经历了自 15 年以来持续超过 4 年的低迷,同时也积累了不少亟待解决的疑问。这些疑问也逐渐成 为了制约板块摆脱颓势的主要矛盾,我们总结为以下五大疑问:  (1)国防预算是否

血管生成研究策略

(1)内皮细胞迁移试验内皮细胞迁移是血管生成的标志之一,也是血管生成级联反应的早期步骤之一。伤口愈合试验:细胞培养、伤口愈合试验是表征细胞迁移活性的基本读数之一。血管内皮细胞在培养皿中培养至融合,用刀片/移液管尖端在孔的中间形成一个直的间隙。洗涤并去除漂浮的细胞。将细胞培养一段时间后,在显微镜下观察

打通菌群多样性与功能的研究策略

近几年,肠道微生物可以说是最热的研究热点,频繁登上在CNS期刊的封面,不仅相关主题的学术论文表现强势,而且国自然资助的肠道微生物项目数也呈显著增长的趋势,其中2018年一共资助了近180项研究,资助金额高达7600万。由此可见肠道微生物一直是科研领域的研究热点,相信2019年肠道微生物仍是国自然申请

RNA疗法新策略:lncRNA功能元件制剂有苯丙酮尿症治疗潜力

  对人类遗传病的研究往往主要围绕着识别编码基因的突变和功能障碍来进行,然而,约98%的人类基因组突变发生在非编码区域内,而人们对非编码RNA在人类遗传疾病中的功能作用仍缺乏了解。例如,苯丙酮尿症 (Phenylketonuria, PKU) 在长期以来一直被认为是一种由 L-苯丙氨酸 (Phe)

Diabetes:新研究发现调节leptin表达的lncRNA

  长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA,其在转录沉默、转录激活、染色体修饰等方面有重要的功能。许多研究已经发现肥胖会诱导脂肪细胞发生剧烈的转录组变化,最近一些证据表明长非编码RNA在该过程中发挥关键作用。来自新加坡的研究人员对棕色脂肪细胞和白色脂肪细胞中与肥胖相关

lncRNA在农业领域的研究成果(一)

miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错!不是标题党。说到miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar,想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题,大阅哥呕心沥

lncRNA在农业领域的研究成果(二)

【思路及相应结果】内容与图片源:(王立方,2015)【结论】通过全转录组测序、lncRNA测序和实时荧光定量的方法发现和鉴定了与家蚕产丝相关的lncRNA和其在不同产丝阶段的表达量变化,挑出了与家蚕产丝调控紧密相关的非编码RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互补链的lncR2034,与P25

lncRNA在农业领域的研究成果(三)

【结论】①通过lncRNA测序,在上万条白菜中候选的lncRNA中挑出了1,300余条与花粉授粉相关的lncRNAs。分析结果显示一部分lncRNA在花蕾到授粉受精整个发育过程中持续表达,其余的部分为阶段、部位特异性表达。lncRNA在白菜不同发育阶段花蕾种的表达呈现出较明显的差异,在V级花蕾中特异

lncRNA反向遗传学研究的典型案例

研究背景长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被认为是一类不能编码蛋白的长链RNA。由于其序列较长,所以可以有较大的潜力形成多种复杂构象,从而通过不同生物学途径发挥其作用。此外,由于其不具备蛋白编码能力,因此此类RNA也主要由其碱基序列形成的高级结构来执行生物

曹雪涛研究组4月最新Cell文章:lncRNA与免疫的新关联

  来自中国医学科学院/北京协会医学院等处的研究人员发表了题为“Self-Recognition of an Inducible Host lncRNA by RIG-I Feedback Restricts Innate Immune Response”的文章,受中国传统哲理启发,发现了多个新的长

PRC2与lncRNA相互作用的序列特异性研究获进展

  国际学术期刊《科学报告》(Scientific Reports)近期在线发表了中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所邵振研究组关于PRC2与长非编码RNA(lncRNA)之间相互作用的序列特异性研究成果,题为The PRC2-binding long non-coding RNAs in hu

细胞自噬研究策略

医学科研实验基础知识笔记(四):细胞自噬研究策略细胞自噬是指细胞在外界环境因素的影响下, 细胞利用溶酶体降解自身受损、 变性或衰老的大分子物质以及细胞器的自我消化过程。自噬是细胞的一种自我保护机制, 广泛存在于真核细胞内, 在调节细胞生存和死亡的过程中, 起着重要的作用。当细胞发生自噬后, 在自噬相

基因功能研究策略

随着人类基因组计划的顺利进行,越来越多的新基因被发现,基因功能研究成为生命科学领域中的重大课题,目前基因功能研究方法主要有基因转导、反义技术、转基因和基因剔除、染色体转导、RNA 干涉等。一、 正常情况:DNA→mRNA→蛋白质→功能(遗传效应以及表型)二、 基因功能研究策略:1、 基因功能的获得(

应用Arraystar-LncRNA芯片研究宿主抗病毒反应

中科院微生物研究所/福建农林大学的陈吉龙研究员长期从事流感病毒致病机理、抗病毒免疫学、病毒感染诱导肿瘤发生机理、肿瘤免疫学等领域的研究。近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究发现了一种新的调控宿主抗病毒反应的长链非编码RNA——NRAV,通过抑制干扰素刺激基

Nature-子刊:研究lncRNA功能的新方法

  长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA位于细胞核,它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠,有的位于基因间或者内含子中。