共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能
lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点，但是，目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计，目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此，怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢？针对lncRNA和mRNA的共表达研究，为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提供了一种简单有效的方法。 研究背景 烟雾病（MMD）是一种原因不明、慢性进行性的脑血管闭塞性疾病，主要表现为单侧或双侧颈内动脉远端大脑中动脉和大脑前动脉近端狭窄或闭塞伴脑底部和软脑膜烟雾状、细小血管形成。临床表现主要有脑缺血、脑出血及癫痫等。目前对于MMD的发病机理还不清楚，因此，挖掘与MMD发病相关的功能基因有助于MMD的诊断与治疗。本研究从lncRNA和mRNA出发，运用共表达分析方法，挖掘了与MMD相关的lncRNA，为理解lncRNA在MMD中的作用提供了基础。 研究结果 1 MMD特异性差异基因筛选......阅读全文
共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能
lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点，但是，目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计，目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此，怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢？针对lncRNA和mRNA的共表达研究，为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提供了
共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能
lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点，但是，目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计，目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此，怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢？针对lncRNA和mRNA的共表达研究，为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提
共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能
lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点，但是，目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计，目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此，怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢？针对lncRNA和mRNA的共表达研究，为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提
lncRNA助力叶酸研究新成果
LncRNA研究发表的成果五花八门，然而借助于lncRNA芯片，挖掘其中的高通量数据，发表5分影响因子的文章，还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础，让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》（IF=5.104）上发表。研究背
lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程
自然杀伤（NK）细胞是一类先天性免疫淋巴细胞，与体外病毒感染和免疫调节有关。但是，lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术，分析了NK细胞中lncRNA表达模式，发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中，lnc-CD
lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程
自然杀伤（NK）细胞是一类先天性免疫淋巴细胞，与体外病毒感染和免疫调节有关。但是，lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术，分析了NK细胞中lncRNA表达模式，发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中，lnc-CD56，
lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程
自然杀伤（NK）细胞是一类先天性免疫淋巴细胞，与体外病毒感染和免疫调节有关。但是，lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术，分析了NK细胞中lncRNA表达模式，发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中，lnc-CD
lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程
自然杀伤（NK）细胞是一类先天性免疫淋巴细胞，与体外病毒感染和免疫调节有关。但是，lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术，分析了NK细胞中lncRNA表达模式，发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中，lnc-CD
lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程
自然杀伤（NK）细胞是一类先天性免疫淋巴细胞，与体外病毒感染和免疫调节有关。但是，lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术，分析了NK细胞中lncRNA表达模式，发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中，lnc-CD
我国科学家发现裸鼹鼠的LncRNA抗癌特性
近日，中国科学院昆明动物研究所孔庆鹏课题组研究发现裸鼹鼠的抗癌特性与长链非编码RNA密切相关，相关成果发表在《表观遗传学与染色质》期刊上。 据了解，裸鼹鼠是啮齿类动物中名副其实的长寿之星，其寿命可长达30年，而一般小鼠及大鼠的寿命仅有2~3年。此外，裸鼹鼠还具有天然的抗癌特性，因此裸鼹鼠在长
原发性干燥综合征（pSS）相关的lncRNA表达模式研究
研究背景原发性干燥综合征（pSS）是一种由于外分泌腺紊乱引起的自身免疫性疾病，最典型的临床表现为口眼由于唾液腺和泪腺原因而导致的异常干燥。LncRNA是目前转录组学研究的热点，但是，lncRNA是否与pSS的发病有关，目前还没有相关报道，来自上海第九人民医院的研究人员，通过唾液腺中lncRNA的表达
lncRNA研究策略与技术
研究背景：长链非编码RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子，长度在200 bp以上，起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能；近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构，可以与蛋白、DNA和RNA相互作用，参与多种生物学过程的调控
原发性干燥综合征（pSS）相关的lncRNA表达模式研究
研究背景 原发性干燥综合征（pSS）是一种由于外分泌腺紊乱引起的自身免疫性疾病，最典型的临床表现为口眼由于唾液腺和泪腺原因而导致的异常干燥。LncRNA是目前转录组学研究的热点，但是，lncRNA是否与pSS的发病有关，目前还没有相关报道，来自上海第九人民医院的研究人员，通过唾液腺中lnc
南京医科大学最新文章：癌细胞中的RNA表达模式
系统生物学认为, 生命体是一个复杂的动态变化网络, 对于生命的研究需要从整体出发, 研究生命网络中的这些复杂的相互作用和调控关系, 而不是仅孤立地研究各个网络中的节点。近期针对非编码RNA，来自南京医科大学的研究人员进行了深入探索，旨在构建全基因组水平编码-非编码 RNA调控网络, 探讨 ncR
基因共表达的定义
共表达质粒就是指那些可以同核DNA一起表达的质粒DNA。
共表达质粒的定义
共表达质粒就是指那些可以同核DNA一起表达的质粒DNA。
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2
（二）云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱，一次测序两篇文章疾病：胃癌样品：胃癌组织vs癌旁组织（6 vs 6）研究方法：m6A-MeRIP-Seq，RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志：Frontiers in Genetics影响因子：3.258
lncRNA功能机制研究（一）
文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA，在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合，并在转录或转录后水平调控基因表达，而且lncRNA也可以作为诱饵，吸附miRNA，调节miRNA调控的靶基因表达。但是，目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能
lncRNA功能机制研究（二）
实验路线（1）LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果：转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合，并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析；b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子
山西医科大学徐勇教授发表多篇文章解析精神分裂症
精神分裂症是常见的、危害极大的重性精神疾病，其发病机理迄今未明，既往研究提示精神分裂症是基因变异和/或调控障碍的结果。转录因子、微小RNA（miRNA）和长非编码RNA（lncRNA）是重要的基因调控因子。随着芯片技术的发展和基于系统生物学角度的共表达网络分析方法的不断完善，从多组学角度出发，联
暨南大学报道－造血干细胞发育单细胞lncRNA动态表达图谱
来自暨南大学基础医学院兰雨课题组、中国医学科学院基础医学研究所余佳课题组、军事医学科学院附属医院（现为解放军总医院第五医学中心）刘兵课题组合作发表研究论文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Re
最研究揭示了胰腺癌中一组解除调控的基因
在2003年完成的人类基因组计划(Human Genome Project)的诸多发现中，有一项发现是我们的很大一部分基因不会产生编码蛋白质的rna。事实上，只有5%的人有这个功能。非编码基因曾被轻蔑地称为“垃圾DNA”。例如，在20年的时间里，它们在癌症研究中被忽视，科学家们把注意力集中在信使rn
生物信息分析数据挖掘
DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达，检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化，显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据，仅仅进行差异表达分析还远远不够，如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现
重庆医科大学利用lncRNA芯片和circRNA芯片来研究膀胱癌
重庆医科大学基础医学院的陈俊霞教授主要从事肿瘤转移及信号传导方面的基础研究。近期，该课题组和西南医科大学田强教授课题组合作应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片和circRNA芯片分析了膀胱癌组织的非编码RNAs表达情况，同时筛选到一批可预测膀胱癌发生和复发的分子标志物，并阐明了lnc
转录组测序和全转录组测序的区别
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术，可以全面获取样本中转录产物信息，结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制， 进行联合分析，深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集群进
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集
Cell子刊：重编程过程中的lncRNA动态
利用体细胞重编程生成诱导多能干细胞的技术称为iPS，该技术生成的诱导多能干细胞（iPSC）理论上可以生成任何类型的细胞。现在这一技术已经渗透到了生命科学的各个领域，帮助研究者们寻找致病基因、进行药物研发和开发细胞疗法。 全面挖掘iPS技术的临床潜力，需要详细了解重编程各个阶段发生的细胞事件。为
首次揭示Y染色体上LncRNA－TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖...
首次揭示Y染色体上LncRNA TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移文章导读前列腺癌（Prostate cancer，PCa）作为男性发病率第二的癌症，严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控，且目前缺乏相关机制方面的深入研究，治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展，