ctDNA（羟）甲基化测序案例分享（一）
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主流方向。最新的报道表明：ctDNA（羟）甲基化不仅可以作为肿瘤分子标志物，还可用于追溯肿瘤细胞的组织来源。在精准医疗大趋势下，ctDNA（羟）甲基化检测既具有极高的科研价值，又具备推进精准医疗临床实践的巨大潜能，为实现肿瘤临床治疗的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA（羟）甲基化测序，仅凭一管液体就可以进行肿瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等，是里程碑式的新型液体活检技术。图1. ctDNA（羟）甲基化来源最具临床应用前景的分子标志物---ctDNA（羟）甲基化图2. ctDNA（羟）甲基化研究应用范围1.癌症早筛利器：ct......阅读全文
曹雪涛院士团队发现免疫炎症平衡调控新机制
医学免疫学国家重点实验室主任曹雪涛院士团队发现，DNA修饰酶Tet2分子可以通过调控RNA修饰的新方式，促进机体增加天然免疫细胞的数量和功能，以应对病原体感染及其炎症反应。该发现不仅从免疫学角度为机体抵抗病原体感染的天然免疫机制提出了新观点，也在表观机制层面揭示了Tet2参与基因表达转录后调控的
PCR测序方法你知道几种？（一）
自从 Sanger等(1975)引人双脱氧核苷三磷酸( ddNTP)作为链终止剂,DNA序列测定技术得到迅速发展。 ddNTP在DNA聚合酶作用下,通过其5三磷酸基团可以掺入到正在延伸的DNA链中,但由于其脱氧核糖3位置缺少一个羟基,因此不能同后续的dNTP形成磷酸二酯键,使得DNA链的延伸
Helicos测序仪的再研发（一）
Helicos公司的比尔•埃福卡威奇有信心，生产一种可以在10天内以1000美元的价格，对一个基因组进行测序的机器。但这条路走得并不容易。 在比尔•埃福卡威奇的带领下，我们参观了设在麻省坎布里奇市的Helicos生物科技公司的实验室。埃福卡威奇在一台电冰箱大小的3700DNA测序仪前停了下来。该测序
一代测序仪系统概述
一代测序仪系统是一种用于基础医学领域的分析仪器，于2018年7月20日启用。 3.1仪器具有SFDA注册证和CE，IVD认证，可用于临床诊断。 3.2仪器分析原理：基于经典SANGER法测序原理 3.3采用固态长寿命激光光源激发装置，无需散热 3.4检测系统采用高灵敏度的低温CCD装置，保证能
第二代测序技术（NGS）推动个性化肿瘤学发展
目前，肿瘤学已经上升到基因组分析的前沿，它可以被用于识别驱动突变和其他标记， 临床医生也可以借此设计疗法，监测病人的反应，而突变和标记可以通过NGS技术（第二代测序技术，一个生成gigabases数据的大规模平行测序技术）显现出来。 何为NGS？它面临着哪些问题？ NGS已经成为一个研究平台
《自然》带来液体活检技术新突破
在顶尖学术期刊《自然》26日上线的一批论文中，斯坦福大学的科学家携人工智能为液体活检领域带来一项重要进展。他们开发出一种机器学习模型，通过分析血液中的DNA突变，可以鉴别出早期肺癌患者。 肺癌是全球发病率最高，造成死亡人数最多的癌症。每年，它会带走将近200万条生命。尽管肺癌的诊治技术在不断提
科学家尝试用血液DNA循环指导癌症治疗
我们正在黑暗中摸索。但如果有个工具能让你看到发生了什么，那你为什么不这样做？ 2012年，Charles Swanton被迫面对一种癌症的“肮脏”把戏。当时，他与同事在英国癌症研究中心伦敦研究所测序从少量肾脏肿瘤中提取的DNA，以期找到一些不同的变异，但是单一肿瘤的遗传多样性的宽度让他们十分震
提高分光光度法测定硝酸银溶液浓度精密度的案例分享
提高分光光度法测定硝酸银溶液浓度精密度的案例分享：实验背景某实验室需要准确测定一批硝酸银溶液的浓度，以用于后续的实验研究。最初使用分光光度法测定时，精密度不够理想，相对标准偏差（RSD）较高。问题分析通过对实验过程的仔细观察和分析，发现以下可能影响精密度的问题：显色剂用量不准确：每次加入显色剂的量存
一代测序技术，二代测序技术具有哪些优点
相比一代测序技术，二代测序技术优点如下：1、Illumina 原理：桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像优势：Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题，它的主要测序错误来源是碱基的替换。而读长短（200bp-500bp）也让其应用有所局
全外显子测序和高通量测序一样吗
能否简述下全外显子测序和普通的基因测试、全基因组测序有什么不同...全外显子组测序，是指利用序列捕获技术将只占基因组1%的外显子进行高通量测序，从而检测出约85%的致病突变，测序深度更高，数据更有效，变异检测更准确。全基因组测序，是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序，可以同时
－Science：一幅脑内的甲基化图谱
我们基因的表达可能会受到我们DNA上的特定标记的影响，例如那些通过对特定核苷酸碱基对的甲基化而被赋予的标记——这一过程被称为表观遗传学过程。科学家们现在提出了一个详细的图谱用以阐释在发育中的哺乳动物大脑中的甲基化如何随着时间的推移而变化。在我们很小的时候及在我们的神经环路正在成形时，DNA甲基化
精准医疗准不准，精准检测是关键
在精准医疗火热发展的当下，基因检测对于精准医疗的概念具有纲举目张的意义。而在肿瘤分子诊断领域里，循环肿瘤DNA（ctDNA）检测可以说是最具有发展潜力的技术。在癌症的临床诊治中，如果能够得知肿瘤的基因突变位点，医生便可针对性地使用抗癌药物，大大提高肿瘤患者的存活率。然而由于ctDNA的低含量、随
因美纳扩展全景变异分析应用，赋能NovaSeq－X用户
通过在旗舰型测序仪上提供标志性肿瘤学产品应用，因美纳致力于为客户提供覆盖更大规模、总成本更低的全景变异分析 美国加利福尼亚州圣迭戈——近日，全球基因测序和芯片技术的领导者因美纳（纳斯达克股票代码：ILMN）宣布，已在 NovaSeq™ X 系列测序仪上扩展了肿瘤学产品应用。近几个月以来，因美纳
新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人员不久前
新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。 如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人
新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。 如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人
液体活检专题
近十年来，液体活检研究热度不断攀升，多个国家以及地区的研究纷纷投入其中。 一、传统肿瘤检查之“痛”如果某人不幸确诊患上恶性肿瘤，似乎将面临无尽的“痛苦”和“危险”。除了各种治疗方法要“折磨”他的身体，各种定期检查、药物疗效评估方法也给病人带来了巨大的“痛苦”。整个肿瘤诊疗过程，从筛选到初步诊断，到手
一例插件孔管脚导通不良的失效分析案例（一）
0 背景印制电路板（PCB）由绝缘板、金属导线、连通不同层导线的金属化孔，以及连接元器件的连接盘组成，其主要作用是支撑电子元器件之间的信号连通。PCB是为电子组件中各元器件之间提供电气互联的载体，如果其本身存在导通不良的情况，会直接导致互联的元器件之间功能失效。形成PCB各层互联导通的主要是孔和线路
ctDNA检测在CRC患者术后复发预测的应用
近日，2019年欧洲肿瘤医学学会年会（ESMO）在西班牙巴塞罗那召开。会上，来自法国的研究团队报告称，液体活检在结直肠癌（CRC）患者术后复发预测方面有重要作用，ctDNA或可作为CRC的独立预后指标，并在指导患者个性化治疗方面具有应用潜力。 液体活检作为一种非侵入性手段在恶性肿瘤中进行早期筛
新一代测序十年记：第一台测序仪的诞生
从454生命科学推出第一台新一代测序仪以来，一晃十年过去了。这十年，正是基因组学高速发展的十年。我们看到了新仪器接踵而至，也看到了新技术不断问世，让人脑洞大开。从当初耗资30亿美元的人类基因组计划，到如今1000美元的人类基因组，测序技术经历了怎样的发展？我们在此作一回顾。 454生命科学（4
Science子刊公布癌症液体活检成果：评估肿瘤DNA片段大小
液体活检已经成为了癌症检测的一大热门词汇，许多液体活检都是通过循环肿瘤DNA（ctDNA）进行检测，ctDNA就是肿瘤细胞遗传物质脱落后进入血液的碎片。 来自剑桥大学的科学家们建立了一种新方法，通过分析ctDNA的大小，在血液中检测难以追踪的肿瘤DNA（又称ctDNA），这种方法可提高对罹患脑
循环DNA与实体瘤患者生存
采用分子分析来指导预后和预测治疗效果会因为患者组织的获取而受到限制。对患者外周血中的全部循环游离DNA（cfDNA）或者循环肿瘤DNA（ctDNA）进行检测可以更容易的获得肿瘤样本，并有助于预测临床效果。11月24日发表在Cancer Epidemiol Biomarkers Prev上的一篇
ctDNA较常规循环DNA更短，助力液体活检技术
理解循环肿瘤DNA和正常游离DNA在其长度上的区别或许会促进能从患者血液中检测出肿瘤DNA的液体活检技术。 能够从血液中发现和诊断癌症，并且可以监测癌症复发性或是评估治疗效果的反馈——液体活检，这项技术一直以来因受监测灵敏性而被制约它的发展。7月18日，来自犹他大学和华盛顿大学的研究人员在《P
ctDNA液体活检可提高癌症患者入组效率
随着精准肿瘤学的进步，对新型靶向药物、药物使用以及临床试验等研究的加速，使得我们对癌症及其治疗的了解越来越深入，这有助于提高诊治效益，改善预后。但目前只有少数癌症患者能够从基因组匹配的靶向治疗中受益，许多靶基因仅存在于一小部分患者中，这意味着每项临床研究必须筛选成百上千的患者。传统的患者入组方式存在
研究首次提出外周血ctDNA对儿童AML作用
近日，中国医学科学院血液病医院（中国医学科学院血液学研究所）竺晓凡主任医师和阮敏副主任医师团队在Clinical Cancer Research在线发布研究论文，在国际上首次提出外周血ctDNA是儿童AML患者MRD水平监测的重要标志。 白血病是儿童及青少年时期发病率最高的恶性肿瘤性疾病，其中
全基因组甲基化测序技术可用于肺结节良恶性无创诊断
近期，中国科学院合肥物质科学研究院健康与医学技术研究所研究员聂金福、副研究员洪波生物信息学研究团队、研究员王宏志课题组和安徽医科大学二附院赵大海团队合作，在肿瘤早筛领域取得进展，开发出基于血液cfDNA甲基化的肺结节良恶性无创诊断模型。相关研究成果在线发表在Cancer Science上。
循环肿瘤DNA为难治性前列腺癌提供线索
前列腺癌是西方国家老年男性常见的癌症。许多患有前列腺癌的男性死于其他原因，而不知道自己身患癌症。多数前列腺癌生长非常缓慢，不会引起症状，但有些癌症是侵袭性的，生长和扩散的速度很快。然而，医生往往无法判断哪种前列腺癌是侵袭性的。近日，加拿大英属哥伦比亚大学领导的研究团队表明，血浆中循环肿瘤DNA的“年
SMAD2/3与TGFβ影响转录因子发生m6ARNA甲基化调控干细胞发育
文章导读： 胚胎干细胞作为一种全能性细胞，通过增殖和分化，产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明，胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化，大多与细胞增殖[1-2]，免疫应答[4]关系密切。然而，对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天，分享一
一例鼻用软膏引发的不寻常案例
1名既往体健的意大利护士在与1名肺结核患者密切接触后进行职业性筛查。没有明显的其他医疗史（包括糖尿病或胃食管反流）。患者记不清是否接种过BCG疫苗。结核菌素皮肤测试为阳性（约10 mm）。胸片显示左肺下叶两处病变：结节充满气体伴壁轻微增厚，直径约2 cm，另一个结节直径约1 cm。胸部高分辨CT
实验操作经验和案例，每个细节都很重要（一）
实验安全1.进入实验室要穿好工作服，不要存侥幸心里，如果一不小心碰到酸，心爱的衣服烧个洞是小事，烧伤皮肤就麻烦了。不要嫌麻烦，一定要戴手套才做对身体有危害的实验，要对自己的身体负责。 2.实验前后清洁洗手，如果，实验中途去休息喝水的时候，也要洗手，不要以为刚才的实验药品没什么毒性，生命很重要，小心为