ctDNA（羟）甲基化测序案例分享（一）
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主流方向。最新的报道表明：ctDNA（羟）甲基化不仅可以作为肿瘤分子标志物，还可用于追溯肿瘤细胞的组织来源。在精准医疗大趋势下，ctDNA（羟）甲基化检测既具有极高的科研价值，又具备推进精准医疗临床实践的巨大潜能，为实现肿瘤临床治疗的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA（羟）甲基化测序，仅凭一管液体就可以进行肿瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等，是里程碑式的新型液体活检技术。图1. ctDNA（羟）甲基化来源最具临床应用前景的分子标志物---ctDNA（羟）甲基化图2. ctDNA（羟）甲基化研究应用范围1.癌症早筛利器：ct......阅读全文
DNA测序技术的现状和发展（一）
一、我们将如何应对海量的基因信息新一代测序技术带给人们大量遗传信息的同时，却成为限制其广泛应用的一个障碍。1980年，英国生物化学家Frederick Sanger与美国生物化学家Walter Gilbert建立了DNA测序技术并获得诺贝尔化学奖，至今已有近三十年了。在这三十年，DNA测序技
llumina高通量测序平台的应用（一）
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了
第一代DNA测序技术
第一代DNA测序技术用的是1975年由桑格（Sanger）和考尔森（Coulson）开创的链终止法或者是1976-1977年由马克西姆（Maxam）和吉尔伯特（Gilbert）发明的化学法（链降解）. 并在1977年，桑格测定了第一个基因组序列，是噬菌体X174的，全长5375个碱基[1]。自此，人
测序仪：一台也许并不够
如今，基因组测序的新闻已变得司空见惯，不像几年前，基因组草图甚至能登上杂志的封面。随着测序仪的价格不断下探，你也考虑购入一台。挑来选去，不知哪一台更好。在这一期的《BioTechniques》上，Jeffrey Perkel告诉你，一台也许并不够。 新一代测序仪在上市之初，价格高昂，仅限“土豪
用循环DNA进行早期癌症的非创伤性检测
一种新型的基于DNA测序的方法对以非创伤性方式来发现早期癌症有帮助，它是通过分析血液循环中的源自肿瘤的遗传物质碎片来实现这一目的的。这些发现或为创建对癌症病患更有用的筛检及管理工具做好了准备。全球每年有超过1400万人被诊断罹患癌症，他们中的大多数都是在癌症发展到晚期的时候才被发现的，这时可供选
循环肿瘤DNA比循环正常DNA矮半截
如今，人们开始利用液体活检技术来诊断癌症，以及监测治疗效果，不过灵敏度是个问题。美国犹他州大学和华盛顿大学的研究人员近日在《PLOS Genetics》上发表文章，称来源于肿瘤的DNA片段比来源于正常细胞的片段要短，这个特征可用于改善液体活检。 犹他州大学的Hunter Underhill及其
疫苗应用案例
一、背景描述： 主要以白油乳化后形成有效的药物载体，注射后使人或动物产生对某种疾病的抗体，减少疾病的发生率。 主要成份：白油，药粉，注射用水。 传统工艺：通过齿盘式搅拌，做油水乳化。 存在问题：由于搅拌所提供的剪切概率不均匀， 形成以下问题： 不同批次的物料，质量不均一
TOC应用案例
TOC分析仪监测降低生产停产风险Hanmi 是韩国的一家制药公司，其采用的离线总有机碳 (TOC) 分析仪无法始终在 TOC 时常很高的注射用水储罐中进行有效诊断。在安装TOC分析仪 电极之后，该公司能够迅速找到问题的根源，成功地避免了损失巨大的停产事件发生。在制药等级用水中进行的 TOC 分析用于
Roche罗氏：新一代测序AVENIO肿瘤组织分析试剂盒正式上市
近日，罗氏宣布在全球推出三种新一代测序（NGS）AVENIO肿瘤组织分析试剂盒——AVENIO肿瘤组织靶向试剂盒、扩展试剂盒以及监测试剂盒。这些试剂盒可检测实体瘤中的全部四种突变类型，是对罗氏用于肿瘤学研究的新一代测序（NGS）ctDNA试剂盒的补充。AVENIO仅限研究用的即用型试剂盒所组成的
泛生子生物芯片阅读仪GENETRON－3D获批上市
该仪器目前已被国内多家医院、科研机构采购，配套应用于肿瘤基因检测试剂的开发和科学研究。泛生子生物芯片阅读仪GENETRON 3D 数字PCR技术平台优势显著 GENETRON 3D生物芯片阅读仪，明确对已经完成PCR扩增反应的专用数字PCR芯片进行处理和数据分析，无配套试剂盒的限定。 泛生
生物谷液态活检大会：优迅医学与业界专家共话热点
2016年5月20日，由生物谷举办的“2016液态活检与临床应用研讨会”在上海召开，会议紧扣主题，各方专家学者及业内企业代表分享了液态活检各技术平台的研发进展、临床应用现状。在大会特设的讨论环节，特邀嘉宾和场内听众积极互动，表达了对液态活检及期临床应用的独到看法。现场座无虚席，足见液态活检这一领
云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用2
3) m6A修饰与基因表达联合分析通过m6A-MeRIP-seq和RNA-seq联合分析，文章展示了m6A修饰水平与基因表达水平间的关系，统计发现表达高的基因分组中，受m6A修饰的基因比例也更高。4）甲基化相关酶的表达通过qPCR检测了两组样品中6个甲基化相关酶的表达，发现在高度近视白内障患者中甲基
云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用1
m6A甲基化是近年来一大热门研究方向，种种研究表明m6A修饰在各种真核生物、各类组织细胞中普遍存在，并对多种生物学功能、疾病肿瘤的发生发展具有极大影响。m6A甲基化位点的检测依赖于MeRIP-seq，其中的抗体免疫共沉淀（IP）环节要求样品RNA起始量相较普通转录组测序要高，曾经令许多难以大量获取的
dna甲基化与rna甲基化的区别
DNA甲基化和组蛋白修饰的相同点：都有包含甲基化修饰；不同点：修饰对象不同，一个是对DNA修饰，一个是对蛋白：组蛋白修饰。而RNA干扰是对RNA的降解，与前两者差异较大。
P4－China－2016多组学与系统生物学论坛
自从精准医学概念提出以来，它一直都是全球最热的研究领域，政府的大力支持也了推动精准医疗行业的蓬勃发展。对于任意一项划时代的大工程而言，基础科研永远是其第一驱动力。P4 China 2016 多组学与系统生物学论坛，从系统生物学出发，对生物信息学与生命组学技术进行了深入探讨，并分享了科研成果应用于
必备技能！云序生物教你巧用IGV轻松实现基因组的可视化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，借助于此工具，从事生物信息的科研工作者就可以轻松的分析查看多种基因组数据。除了直观的查看序列信息及遗传密码中的序列变化或突变外，还可以查看拷贝数变化、染色质
多元化检测技术助力液体活检（ctDNA）临床应用
传统的组织活检，因其局限性，如肿瘤的异质性、肿瘤患者无法进行手术、某些肿瘤解剖位置不便进行穿刺及穿刺自身的临床风险等，可能导致患者无法获得针对性治疗；液体活检(Liquid biopsy)作为组织活检的补充，通过非侵入性取样降低活检危害，在动态监测肿瘤进展和治疗反应等领域获得临床认可，已成为肿瘤
一管血液－可检测肿瘤
“在癌症的治疗上，ctDNA无创癌症基因检测将被广泛应用，传统的肿瘤标志物很可能被取代。”昨日，在2015生物/生命健康产业展览会一号论坛上，深圳市海普洛斯生物科技有限公司CEO许炎明在演讲中如此表示。 许炎明表示，ctDNA（循环肿瘤DNA）是一种新型的肿瘤检测技术。2013年有研究证明在乳
Nature－Medicine：－液体活检新技术让肿瘤耐药性基因显形！
肿瘤异质性是恶性肿瘤的特征之一,可使肿瘤的生长速度、侵袭与转移、药物敏感性等多方面产生差异。之前的研究表明，液体活检(特别是cfDNA (无细胞DNA))可以很好地检测获得性耐药的肿瘤异质性。但该方法尚缺少大规模队列验证。近日，由包括麻省总医院、麻省理工学院布罗德研究所、哈佛大学及IBM Re
GRAIL癌症早筛：利用cfDNA甲基化分析方法可溯源20余种癌症
2019年9月27日，欧洲肿瘤内科学会（ESMO）年会在西班牙巴塞罗那拉开帷幕。ESMO是欧洲最负盛名和最具影响力的肿瘤学会议，众多临床机构及领先企业在本届年会上公布了肿瘤领域的最新转化研究及临床实践数据。 9月28日，美国癌症早筛公司GRAIL在ESMO年会上重磅发布了该公司基于cfDNA的
基因测序助力“液体活检”大放异彩
2015年CSCO大会刚刚落下帷幕，精准医疗当仁不让的成为吸引近2万名与会者讨论的热门话题，而热门中的热门又当属“液体活检”。通过几天的大会观察发现，临床专家几乎是一边倒的看好液体活检在临床中的应用，其在肿瘤早筛、肿瘤用药、疗效评估和复发监测方面的研究进展无不让大家拍手叫好。本月24日，Cell
看表观新修饰6mA甲基化如何助力IF飙升!
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一，我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine, 5mC），却不知道随着测序技术的快速发展，科研者们已经在真核生物中（果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等）发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化，且DNA-6m
闪存技术有望带来太赫兹频率光子芯片应用案例一
闪存技术有望带来太赫兹频率光子芯片根据科技日报消息，据美国《每日科学》网站报道，以色列科学家利用金属氧化氮氧化硅（MONOS）结构设计出一种新型集成光子回路制备技术。该技术在微芯片上使用闪存技术，有望使体型更小、运行速度更快的光子芯片成为现实，运算频率达太赫兹量级，从而将目前标准的8—16千兆赫计算
案例解析－|－抗病毒生物大分子制药治疗（一）
近期爆发的新型冠状病毒肺炎（COVID-19，对应的病毒为SARS-CoV-2）突出了开发有效治疗方法的重要性。在近期的公众号中，我们向大家介绍了“人民的希望”瑞德西韦的工作机制[1]，在此，我们结合疫苗、血清、多肽和单抗的研究案例，向大家继续介绍靶向病毒的大分子治疗和我们的解决方案是如何推动下一代
针织物酶抛光染色一浴生产实践案例
常规棉和涤棉针织物的抛光采用酸性抛光酶在酸性条件下进行，以提高织物表面光洁度，减少起毛起球。其需在氧漂前或氧漂后单独进行，不能与染色同浴，且考虑到酶的活性对织物强力的影响，抛光后还需加碱或在高温条件下使酶失活，因此需多耗用水、电、蒸汽和工艺时间。诺维信公司推出的中性抛光酶8000L，可使抛光与染色一
蛋白质组学几种定量方法的案例解读（一）
一、Label-free定量Label-free定量，顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化，通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free技术又可分为基于谱图数（Spectra Co
推荐一些－Cell－Ranger－开源代码的使用案例
以下是一些可能的 Cell Ranger 开源代码的使用案例：研究特定疾病中的细胞异质性例如在癌症研究中，使用 Cell Ranger 分析肿瘤组织的单细胞测序数据，以揭示不同癌细胞亚型以及肿瘤微环境中的免疫细胞组成和状态。发育生物学研究分析胚胎发育过程中的单细胞数据，了解不同发育阶段细胞的分化轨迹
原代细胞培养经典案例和细胞药筛介绍（一）
威斯腾生物经过10多年的发展，获得了上百种细胞株和四十余钟原代细胞培养经验，并建立了庞大的细胞库及原代培养资料库；细胞平台有资深实验员、规范的SOP操作文件，万级净化细胞房，这些条件为保质保量完成每个客户的实验提供了保障。 同时，威斯腾生物结合多年原代及传代细胞培养经验，结合平台已有的技术优势，建立
介绍一些研发新型絮凝剂的成功案例
以下为您介绍一些研发新型絮凝剂的成功案例：案例一：纳米复合絮凝剂研发团队通过将纳米材料与传统絮凝剂复合，开发出一种新型纳米复合絮凝剂。这种絮凝剂利用纳米材料的高比表面积和特殊表面性质，显著提高了对微小颗粒和难沉降污染物的去除能力。在实际应用于某工业园区废水处理中，该新型絮凝剂能够将化学需氧量（COD
最高法发布环境公益诉讼典型案例－统一裁判尺度
环境公益诉讼是人民法院环境资源审判工作的重要组成部分，也是国家环境治理体系的重要环节, 对于提升生态文明治理的法治化水平，保障和促进绿色发展发挥着不可或缺的作用。最高人民法院今天发布人民法院环境公益诉讼典型案例。 最高人民法院环资庭副庭长魏文超介绍，2015年1月1日新《环境保护法》施行以来，