ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(二)
案例解析案例1:ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文:Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊:Nature Materials 影响因子:39本篇文章由美国加州大学圣地亚哥分校教授张康与广州中山大学附属肿瘤医院院长徐瑞华团队一同合作完成,通过对比肝癌患者血浆、组织及健康人白细胞中ctDNA甲基化分布情况,发现肝癌患者体内血浆和组织一致性很高。通过1,098位肝癌患者和835位健康者的ctDNA甲基化情况及病理信息为资源库,建立了疾病预测分析模型,结果显示该模型基因的特异性、敏感性与肿瘤状态、诊断反应和时期显著相关(P<0.001)。与此同时,作者还构建了诊断结果预测模型,该模型的基因可用于预测疾病诊断和生存时期的分子标志物(P<0.001)。......阅读全文
手机壳气密性检测设备使用案例分享
随着防水手机的流行,手机做气密性检测成为手机包装出厂前的必备流程。为保证手机的防水性能能达到很好的标准,手机厂家必须要对手机的各个部件先进行气密性检测。手机壳作为手机内部电子元件的保护壳,对手机壳的使用手机壳气密性检测设备进行防水检测成为检测的重点过程。传统的手机壳气密防水性检测是通过水压密
羊驼VHH-SingleB®纳米抗体快速发现案例分享
纳米抗体(nanobody, Nb),即重链抗体VHH(variable domain of heavy chain of heavy-chain antibody)——骆驼体内存在着天然缺失轻链的重链抗体(heavy-chain antibody, HCAb),克隆其可变区而得到的只由一个重链可变
DNA甲基化与癌症之NGS检测篇
摘要 DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中,DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化,大量实验研究表明,在多种类型癌症中,DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外,甲基化还与非
甲基化测序要躲哪些坑?甲基化检测的局限性剖析
表观组学研究滞后于基因组学是可以理解的。一方面,在分析碱基修饰或染色体活性之前,我们需要知道基因组的确切序列,即得到基因组的参考序列,在这个基础之上基因组的表观调控研究才能得以进行;另一方面,造成表观组学研究发展相对缓慢的一个重要原因,是目前支撑表观组学研究的技术手段都或多或少存在一定的局限性,限制
创新ctDNA高通量测序技术让临床不再“盲人摸象”
安可济(AccuraGen)公司联合创始人兼科研总监赵奇志(Grace Zhao)博士 在3月6日-11日举行的旧金山分子医学三方会议(The Molecular Medicine Tri-Conference)上,安可济(AccuraGen)公司的联合创始人兼科研总监赵奇志(Grace Zh
长链非编码-RNA-测序案例分析
背景:人类寿命的延长伴随着神经退行性疾病的发病几率的增加,因而价格不贵的血液诊断的发展迫在眉睫。通过 RNA-seq 分析血液细胞的转录本是发现新的生物标志物的非常高效的途径。 目的:利用 Illumina 测序平台对帕金森病人白血球中 lncRNAs 进行分析,探讨其对 mRNA 选择性剪接的
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2
(二)云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱,一次测序两篇文章疾病:胃癌样品:胃癌组织vs癌旁组织(6 vs 6)研究方法:m6A-MeRIP-Seq,RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志:Frontiers in Genetics影响因子:3.258
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1
一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac
我是“神药”——二甲双胍抑癌机制研究
上海交通大学附属第一人民医院张箴波团队以题为“Metformin sensitizes endometrial cancer cells to chemotherapy through IDH1-induced Nrf2 expression via an epigenetic mechanis
高钙血症疑难案例分析(二)
思考二:讨论可能诊断?治疗方案? 本次疑难病例讨论目的: 高钙血症可能原因?需要再进行哪些检查明确?可能诊断?治疗方案? 曹××副主任医师分析: 中年女性患者,入院检查高钙血症突出,既往无长期服用维生素D及慢性肾病史,不符合因肠道吸收钙增加,故考虑骨钙吸收过多。分为PTH参与和非P
甲基化测序能否突破肿瘤难关?WGBS、杂交捕获了解一下?
DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中,DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化,大量实验研究表明,在多种类型癌症中,DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外,甲基化还与非编码RN
血液ctDNA检测
日前,美国约翰霍普金斯癌症中心及墨尔本大学的科学家在《Science Translational Medicine》杂志上表明,通过检测癌症相关的血液循环DNA可准确预测部分早期结肠癌患者的癌症复发。 血液中存在ctDNA,癌症复发的可能性更大 在该研究中,科学家对澳大利亚13家医院的
ctDNA是什么
ctDNA是肿瘤患者血液中游离的来自肿瘤的DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)在非小细胞肺癌中的应用在过去十年中,对非小细胞肺癌(NSCLC)的理解发生了重要的变化。现在证实,NSCLC具有不同的分子亚型。现在医生认为,针对NSCLC的个性化治疗,应该是利用这些分子亚型匹
生态环境智慧监测创新应用市级典型案例分享
2023年3月30日,生态环境智慧监测创新应用技术指导委员会在深圳组织召开生态环境智慧监测技术专题研讨会(以下简称研讨会)。在研讨会上,部分试点单位分别结合各自工作实际,介绍了智慧监测优秀案例,分享了先进经验。今天我们一起了解雄安新区、常州市、杭州市、济南市、长沙市的试点建设经验。雄安新区雄安新区为
案例分享:-Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用
1.新鲜组织样本 新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机
案例分享:-Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用
1.新鲜组织样本 新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机
小麦面包粉中呕吐毒素超标真实案例分享(一)
你知道最新颁布的GB2762-2017《食品安全国家标准食品中真菌霉素限量》中有关小麦面粉中呕吐毒素(脱氧雪腐镰刀菌烯醇)最高限量吗? 话不多说,先来分享一组案例: 一、抽检基本情况2016 年 2 月 1 日,总局委托某检验中心,在上海某电子商务有限公司抽取的某食品股份有限公司生产的小麦面包粉(规
PCB设计宝典分享(二)
PAD and VIA : ≥ 0.3mm(12mil) PAD and PAD : ≥ 0.3mm(12mil) PAD and TRACK : ≥ 0.3mm(12mil) TRACK and TRACK : ≥ 0.3mm(12mil) 密度较高时: PAD and VIA :
抽管血,揪出癌症“指纹”
该技术仅需抽取人体外周血,通过捕获这些微量ctDNA中的甲基化位点改变,即可精确检测到肝癌、乳腺癌、结直肠癌、肺癌等高发癌症的早期信号。 肿瘤在人体内如同器官一样,不断地有细胞生长和死亡。而在肿瘤细胞坏死或凋亡过程中会释放自身DNA并进入血液循环。这些在人体内不断流动的肿瘤DNA碎片,就是循环
最新DNA甲基化测序技术比较研究
在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。 对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合
使用血液进行基因检测如何减少假阴性
基因检测-入门攻略什么是基因检测?肿瘤基因检测是通过特定检测设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测,分析它所含有的各种基因突变情况,从而能针对性地为每位患者“量身定制”一套最合适的治疗方案。它是肿瘤精准医疗的基础。选择什么样本最合适?做基因检测,是检测肿瘤细胞的突变,因此需要获取肿瘤细胞。临床上
测序简史(二)
(3)原因不明的复杂结构,测序结果出现突然信号减弱或消失从序列上看,DNA碱基排列并无特别异常。估计是DNA整体出现复杂结构,从某一位置开始聚合酶的聚合反应便无法进行。图4 复杂结构引起的信号中断 2.出现套峰是什么原因?在测序反应中,模板或引物的原因都可能造成套峰的形成,归结其形成原因有以下几点
TOPEM技术应用案例集锦(二)
图4. 80℃下DGEBA-DDM 体系等温固化中测试的比热曲线(上边)和总热流曲线(下边)。 硝酸钠的固-固转变 硝酸钠显示在约275℃有一个二级转变。在硝酸钠的这个相转变中,比热先随着温度增加而增加,然后于临界温度点在100mK内突然下降。要得到这种转变的物理性质的信
免疫细胞杀伤经典案例(二)
除了传统T细胞杀伤外,DELFIA细胞毒法还可以被用于检测靶向T细胞的新型免疫治疗分子,如双特异抗体(BiTE)等的细胞杀伤功能[6]。四,NK细胞杀伤 鉴于NK细胞在天然免疫系统的重要性,其活力检测也是免疫检查点抑制剂研发过程中的核心项目。此外,NK细胞活力检测还可以用于衡量用于免疫疗法开发的新型
DLTMA技术应用案例解析(二)
如图4的DLTMA测试曲线所示,上下包络线(虚线)表示对于0.5N和1.0N应力的弯曲曲线。包络线之差是对样品弯曲模量弹性的量度。钢刀片的弹性模量可假定不变,因而变化仅由环氧树脂试样产生。玻璃化转变温度Tg可计算为平均曲线(红色)的起始点(101.49℃)或中点(104.66℃)。 图4中
反应釜在环氧树脂乳化中的应用案例分享
LR1000反应釜应用案例分享用户国内知名特种纤维复合材料研发生产企业环氧树脂环氧树脂是泛指分子中含有两个或两个以上活泼的环氧基团的高分子化合物,可与多种类型的固化剂发生交联反应而形成不溶的具有三向网状结构的高聚物。固化后的环氧树脂具有良好的物理、化学性能,它对金属和非金属材料的表面具有优异的粘接强
透气率测试仪VACVBS的检测案例分享
Labthink兰光VAC-VBS透气率测试仪基于压差法的测试原理,是一款专业用于薄膜试样的气体透过率测试仪,适用于薄膜、片材、高阻隔材料、金属箔片等材料气体透过率的测定。透气率测试仪的别名:压差法气体渗透仪、透气性测试仪、压差法透气仪、气体透过率测试仪、气体透过性能测试仪、透气性能检测仪等。
BioTechniques:从外周血中分离cfDNA的高通量方法
传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从全血中分离出血浆,这一步妨碍了自动化的实施。为此,加拿大迈克•史密斯基因组科学中心的研究人员开发出一种方法,能够高通量地分离ctDNA。 在液体活检中,人们通常需要对游离的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行分析。传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从
磷酸二羟丙酮的概念
磷酸二羟丙酮,生物学术语,是一种存在于生物中的糖酵解的中间产物。中文名磷酸二羟丙酮外文名DHAP,dihydroxyacetone phosphate概 念糖酵解以及糖异生的中间产物作 用甘油-3-磷酸经NAD+氧化成为DHAP学 科生物学
全基因组及转录组测序案例分析
案例:应用全基因组测序和 RNA 测序来描绘常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)的基因图谱 背景:常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)是机体免疫应答反应中不能产生抗体的最主要原因。CVIDs 变异度很高,大概 5% 的病人是由基因改变引起的。 目的:利用 Illumina HiSeq25