蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（一）
每年三月初，都是科研界的“高考”倒计时，因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况，蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明，磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目，总研究资助金额超过2亿。继上周的肠道微生物研究方案解析后（国自然冲刺：打通菌群多样性与功能的研究策略），本周我们再抓紧时间为各位老师分享一下国自然中各类修饰的趋势分析及组学研究的注意事项，以期为各位老师提供帮助。下面我们主要关注三种最常规研究的修饰类型——磷酸化修饰、泛素化修饰和乙酰化修饰。表现稳定：磷酸化——全能调控之王磷酸化是修饰中的全能调控之王，其研究最早，且分布广，修饰量最多。在真核细胞中，约1/3的蛋白随时都可以被磷酸化，几乎参与所有的生理、病理过程。因此，磷酸化修饰是所有修饰中最被广泛认知和重点研究的。▲ 磷酸化修饰在历年国自然基金中的申请情况综上这些特点，在国自然基金申请中，与磷酸化、激酶相关的研......阅读全文
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（五）
六、CID、ECD和 ETD的对比基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列，再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离（collision induced dissociation，C I D ) ( S w
RNA翻译与蛋白质折叠之间的微妙舞蹈
在蛋白质的合成过程中，RNA翻译会影响蛋白质的折叠，而蛋白质折叠也会影响RNA的翻译。 在过去的十年里，我们对细胞内蛋白质合成方式的认知取得了快速的增长，其中包括蛋白质合成的各个基本步骤：转运RNA（transfer RNA， tRNA）是如何高保真、高速率地对信使RNA（messenger
Molecular－Cell：蛋白质翻译后修饰调控植物胁迫反应
甲基化修饰与一氧化氮(nitric oxide； NO)依赖的亚硝基化修饰是高度保守的蛋白质翻译后修饰，这两类修饰参与调控众多生物学过程，包括调控非生物胁迫反应。但二者调控非生物胁迫的分子机制不甚清楚。 中国科学院遗传与发育生物学研究所左建儒研究组在亚硝基化蛋白质组学研究中发现拟南芥蛋白质
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（四）
三、蛋白质的硝化修饰酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的（Yeo et al.，2008)。活性氮和活性氧能够靶向于D
关于蛋白质合成真核生物翻译起始的特点
一、真核生物翻译起始的特点： 1.真核起始甲硫氨酸不需甲酰化。 2.真核mRNA没有S-D序列，但5'端帽子结构与其在核蛋白体就位相关。帽结合蛋白（CBP）可与mRNA帽子结合，促进mRNA与小亚基结合。 3.肽链的延长 ：延长阶段为不断循环进行的过程，也称核蛋白体循环。分为进位、
基因翻译的延伸
此过程在真核细胞和原核细胞中高度类似，下面只以原核细胞为例进行讨论。涉及到的因子主要有EF·Tu和EF·G，在真核细胞中对应的名称分别是是eEF1和eEF2。A. tRNA的转运和入位（1）非起始AA·tRNA结合EF·Tu·GTP形成一个三元复合物；（2）该三元复合物结合至核糖体P位点，tRNA反
A翻译成中文
一、事由 今天2012年5月9日《北京青年报》C1版《天天副刊》，刊登了晋平先生的文章，其中有如下一段文字： 一次我的一个外国朋友问我“知道ABCD的A翻译成中文是什么吗？”在我满头雾水之后告诉我“A翻译过来就是假的意思。”因为他在这里买的假货都叫A货。在丰富了知识的同时，我被他的幽默感吓着
基因翻译的终止
本过程细胞主要需完成以下目标：（1）使翻译停止，不再有新的氨基酸掺入；（2）释放合成的多肽链；（3）释放结合在mRNA上的各组分；（4）确保核糖体大小亚基以及重要因子的重复利用。原核细胞和真核细胞在此过程的处理上有明显不同，下面将分开介绍。 （一）原核细胞A.肽链的释放（1）释放因子RF1/2 （t
什么是翻译调控？
在mRNA翻译成蛋白质的水平上进行控制，包括控制蛋白质合成的速度、mRNA稳定性的控制、翻译起始的控制等。
翻译的生化基础
翻译的化学本质是单个氨基酸脱水缩合形成肽链，这一过程需要多种酶的参与。而在体内，多种酶参与的多种化学反应组成了翻译的生物化学途径。就化学层面来看，翻译主要涉及到三个化学步骤：氨基酸的腺苷化（Amino Acid Adenylation）、tRNA装载（tRNA charging）、肽键的形成。腺苷化
翻译的过程简述
翻译过程需要的原料：mRNA、tRNA、21种氨基酸、能量、酶、核糖体。翻译的过程大致可分作三个阶段：起始、延长、终止。翻译主要在细胞质内的核糖体中进行，氨基酸分子在氨基酰-tRNA合成酶的催化作用下与特定的转运RNA结合并被带到核糖体上。生成的多肽链（即氨基酸链）需要通过正确折叠形成蛋白质，许多蛋
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（一）
每年三月初，都是科研界的“高考”倒计时，因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况，蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明，磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目，总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案解析
神经退行性变与蛋白质翻译相联系
为探究与神经退行性与认知缺陷有关的新突变，研究人员已经发现在同一关键通路中起作用的两个小鼠基因丢失时，就会导致神经退行性变。惊人的是，这两个基因都与蛋白质翻译有关，其中一个编码在大脑特异表达的转运RNA基因—这是首例在脊椎动物中差异表达的基因。在理论上，真核生物需要编码大约42个不同的tRNA基因来
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（一）
每年三月初，都是科研界的“高考”倒计时，因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况，蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明，磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目，总研究资助金额超过2亿。继上周的肠道微生物研究方案解析后（国自然冲刺：打通菌群
水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展
蛋白质的翻译后修饰，如磷酸化、乙酰化等，是调节蛋白质生物学功能的关键步骤，是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础，也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广，其研究极具挑战性。近期，中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方
研究发现HYL1蛋白调控miRNA介导的翻译抑制过程
中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在The Plant Cell上，发表了题为Cytoplasmic HYL1 modulates miRNA-mediated translational repression的研究论文。该研究组发现，HYL1蛋白除了介导m
新方法分析临床样本中的组蛋白翻译后修饰
欧洲肿瘤研究所（EIO）等机构的研究人员开发出一种基于质谱的流程，可分析FFPE临床样本中的组蛋白翻译后修饰。他们于上周在《Molecular & Cellular Proteomics》上详细介绍了这种技术。 利用这种技术，研究人员分析了一系列乳腺癌样本，发现Luminal A型乳腺癌和三阴
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（二）
由此可见，泛素化相关基金无论是申请项目数还是金额数均在向磷酸化逼近，甚至从重点项目数看，18年泛素化的项目数已然超过了磷酸化。进一步统计表明，泛素化研究资助项目在医学部中一共98项，总资助金额高达4700万元。由此可见，泛素化的相关研究正是科研界的“当红小生”，基金申请的一大热点。图2.国自然基金项
ImmuneChem产品在蛋白质翻译后生物修饰最新动向
最新Nature刊登的科技文献指出： 通过比较Sigma,SantaCruz的同类产品， 只有ImmuneChem的抗生物素抗体Agarose填料达到PTM蛋白质组学质谱分析应用的质量。蛋白质翻译后生物修饰是新的PTM研究领域。 抗生物素抗体Agarose填料也是非破坏性（Non-inv
科学家探讨蛋白质翻译后修饰对肉品质影响
我国生鲜肉加工、贮藏、流通过程存在品质劣变快、损耗高的突出问题。从分子水平揭示生鲜肉品质形成与劣变的代谢通路，精准控制生鲜肉劣变和靶向调控肉品质，是我国肉类产业亟待攻克的重大难题。 中国农科院肉品加工与品质调控创新团队近十年来聚焦宰后早期能量代谢与蛋白质翻译后修饰关联调控肉品质的分子机制，取得系
用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰
在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面，电子转移裂解（ ETD ）线性离子阱质谱是很有优势的工具。传统的诱导活化裂解（CAD）常用来鉴定蛋白，并试图确定和找到他们修饰的位点，但这种技术有其本身固有的缺点，下面将详细叙述。与线性离子阱的结合使用的ETD是蛋白质组学研究的一个可靠的技术，可以很容
环状RNAs帽独立的翻译蛋白及其在癌中的作用
环状RNA是一种共价封闭RNA，在真核生物中广泛表达。circRNA参与多种生理和病理过程，但其调控机制尚不完全清楚。随着RNA深度测序技术的发展和算法的改进，发现了一些circRNA通过cap-independent机制编码蛋白质，参与肿瘤发生发展的重要过程。本文在概述CircRNAs的基础上
用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰
By Andreas Huhmer, Director of Proteomics Marketing, Thermo Fisher Scientific 在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面，电子转移裂解（ ETD ）线性离子阱质谱是很有优势的工具。传统的诱导活化裂解（CAD）常用
用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰
在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面，电子转移裂解（ ETD ）线性离子阱质谱是很有优势的工具。传统的诱导活化裂解（CAD）常用来鉴定蛋白，并试图确定和找到他们修饰的位点，但这种技术有其本身固有的缺点，下面将详细叙述。与线性离子阱的结合使用的ETD是蛋白质组学研究的一个可靠的技术，可以很容易
为什么同样的DNA会翻译出不同的蛋白质
相同的DNA模板只能保证合成蛋白质的氨基酸序列是相同的，即一级结构相同，不能保证蛋白质的空间结构相同。蛋白质的特异性不仅与其氨基酸序列有关，更与其空间结构，即二、三、四级结构有关。空间结构不同，蛋白质必然不同。另外，有可能发生了基因突变或转录、翻译错误等意外情况，也会导致蛋白质不同。还有一个更重要的
机器能否扛起翻译大旗
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454879.shtm 将英语逐出中学必修课的话题余音未了，谷歌翻译就“翻车”了。 近日，谷歌翻译对一份英文药物说明译出：“您可以根据疼痛程度使用尽可能多的反坦克导弹”的句子。有研究者发布了谷歌翻译
基因的翻译表达2
方法 1：重组载体构建同前面实验 2：诱导表达：提取带重组片断的质粒DNA转化BL21（DE3）受体菌37℃活化过夜，转入新鲜培养基摇菌至对数生长期（约2－3小时），加入IPTG至终浓度0.4mM，继续培养6小时 3：表达产物提取及鉴定见实验十九
共翻译运输的概念
中文名称共翻译运输英文名称cotranslational transport定 义分泌蛋白合成过程中肽链边合成边转移至内质网腔中的运输方式。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞生理（二级学科）
简述翻译的终止目标
本过程细胞主要需完成以下目标： （1）使翻译停止，不再有新的氨基酸掺入； （2）释放合成的多肽链； （3）释放结合在mRNA上的各组分； （4）确保核糖体大小亚基以及重要因子的重复利用。
概述翻译的生化基础
翻译的化学本质是单个氨基酸脱水缩合形成肽链，这一过程需要多种酶的参与。而在体内，多种酶参与的多种化学反应组成了翻译的生物化学途径。就化学层面来看，翻译主要涉及到三个化学步骤：氨基酸的腺苷化（Amino Acid Adenylation）、tRNA装载（tRNA charging）、肽键的形成。