广州生物院开发出一种单核苷酸多态性检测生物传感器
近日,中科院广州生物医药与健康研究院曾令文研究组成功开发出一种基于核酸等温链置换反应技术、T4连接酶反应与胶体金技术的单核苷酸多态性检测的生物传感器。 该生物传感具有以下三个特点:1.简单,无需复杂的检测仪器,仅需室温反应;2.高灵敏度,单次反应可检测约6个核酸分子;3.高特异性,可区分单碱基突变。该生物传感器克服了传统检测方法的操作技术复杂、耗时长、需要特殊仪器等缺陷。 该生物传感器可用于检测/诊断由单核苷酸多态性引起的遗传病、耐药性病原微生物、肿瘤等疾病易感基因。相关成果于7月6日发表在国际著名学术期刊Chemical Communications,2012,48(68): 8547-8549。 该项目由国家重大专项(2008ZX10004-004)、(2009ZX1004-109)经费资助。 单核苷酸多态性检测生物传感器 ......阅读全文
SNP(single-nucleotide-polymorphism,单核苷酸多态性)概念
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计
分子生态学单链构象多态性
单链构象多态性,在一定条件下, 单链DNA可形成特有的二级结构。不同 DNA链上单个碱基的改变可引起其二级结 构的改变,从而改变DNA链在非变性胶中 的电泳迁移率形成的多态性称作单链构象多 态性。单链DNA片段呈复杂的空间折叠构 象。这种立体结构主要是由其内部碱基配对 等分子内相互作用力来维持的,当
关于单链构象多态性的原理介绍
单链构象多态性(Single-strand conformation polymorphism,SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下,单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象,它影响了DNA在非变性凝胶中
单链构象多态性的原理及应用
单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism, SSCP)是一种分离核酸的技术,可以分离相同长度但序列不同的核酸(性质类似于DGGE和TGGE,但方法不同)。原理单链构象多态性(Single-strand conformation polymorph
关于单链构象多态性的基本介绍
单链构象多态性,在一定条件下, 单链DNA可形成特有的二级结构。不同 DNA链上单个碱基的改变可引起其二级结 构的改变,从而改变DNA链在非变性胶中 的电泳迁移率形成的多态性称作单链构象多 态性。单链DNA片段呈复杂的空间折叠构 象。这种立体结构主要是由其内部碱基配对 等分子内相互作用力来维持的
单链构象多态性的结构及应用
单链构象多态性,在一定条件下, 单链DNA可形成特有的二级结构。不同 DNA链上单个碱基的改变可引起其二级结 构的改变,从而改变DNA链在非变性胶中 的电泳迁移率形成的多态性称作单链构象多 态性。单链DNA片段呈复杂的空间折叠构 象。这种立体结构主要是由其内部碱基配对 等分子内相互作用力来维持的,当
单核苷酸多态性易于基因分型的介绍
SNPs 的二态性,也有利于对其进行基因分型。对SNP进行基因分型包括三方面的内容: (1)鉴别基因型所采用的化学反应,常用的技术手段包括:DNA分子杂交、引物延伸、等位基因特异的寡核苷酸连接反应、侧翼探针切割反应以及基于这些方法的变通技术; (2)完成这些化学反应所采用的模式,包括液相反应
日本开发出识别单核苷酸多态性新技术
据日本媒体8月21日报道,日本松下电器公司日前宣布,该公司开发出依靠计测电流识别单核苷酸多态性的新技术,这项技术可帮助准确识别个人DNA碱基排序的微小差异。 据报道,携带人体遗传信息的DNA由4个不同的碱基组合而成。不同人基因组的碱基排列顺序大部分相同,但也存在极小差异。这种差异仅占人体基因的1%多
单核苷酸多态性检测的液相芯片技术
单核苷酸多态性(SNP)是人类基因组中单个碱基的变异,属于二等位基因的标记,在人类30亿个碱基中每千个碱基出现一次,是近来被受关注的第三代多态性标记。由于SNP的研究将会极大地推动群体遗传学、药物开发、法医学、癌症、糖尿病、精神病等复杂疾病研究,故近年来不断有新的技术及方法出现并应用于SNP的检测。
单链构象多态性的结构特点和作用
单链构象多态性,在一定条件下, 单链DNA可形成特有的二级结构。不同 DNA链上单个碱基的改变可引起其二级结 构的改变,从而改变DNA链在非变性胶中 的电泳迁移率形成的多态性称作单链构象多 态性。单链DNA片段呈复杂的空间折叠构 象。这种立体结构主要是由其内部碱基配对 等分子内相互作用力来维持的,当
单链构象多态性诊断法相关介绍
单链构象多态性(signlestrand conformation polymorphism,SSCP)是指单链DNA由于碱基序列的不同可引起构象差异,这种差异将造成相同或相近长度的单链DNA电泳迁移率不同,从而可用于DNA中单个碱基的替代、微小的缺失或手稿的检测。用SSCP法检查基因突变时,通
单核苷酸多态性在基因组内的形式
一是遍布于基因组的大量单碱基变异;二是分布在基因编码区(coding region) , 称其为cSNP,属功能性突变。SNP在单个基因或整个基因组的分布是不均匀的:(1)非转录序列要多于转录序列(2)在转录区非同义突变的频率, 比其他方式突变的频率低得多。
单核苷酸多态性在基因组内的形式
一是遍布于基因组的大量单碱基变异;二是分布在基因编码区(coding region) , 称其为cSNP,属功能性突变。SNP在单个基因或整个基因组的分布是不均匀的:(1)非转录序列要多于转录序列(2)在转录区非同义突变的频率, 比其他方式突变的频率低得多。
单核苷酸多态性的数量分布和筛查介绍
一、数量分布 据估计,人类基因组中每1000个核苷酸就有一个SNP,人类30亿碱基中共有300万以上的SNPs。SNP 遍布于整个人类基因组中,可位于基因编码区、基因的非编码区以及基因间区(基因和基因之间)。 二、适于筛查 组成DNA的碱基虽然有4种,但SNP一般只有两种碱基组成,所以它是
单核苷酸多态性在基因组内的形式介绍
一是遍布于基因组的大量单碱基变异; 二是分布在基因编码区(coding region) , 称其为cSNP,属功能性突变。 SNP在单个基因或整个基因组的分布是不均匀的: (1)非转录序列要多于转录序列 (2)在转录区非同义突变的频率, 比其他方式突变的频率低得多。
单核苷酸多态性或可帮助预测双极性情感障碍患者
近日,刊登在国际著名杂志New England Journal of Medicine上的一篇研究报告中,来自台北生物医学科学研究所的研究人员通过研究表示,对于第一型双极性情感障碍 (bipolar I disorder)患者来讲,谷氨酸脱羧酶样蛋白1(GADL1)中两个单一的单核苷酸多
通过单链构象多态性分析检测基因突变实验
实验材料人类基因组 DNA试剂、试剂盒矿物油PCR引物A和B多核苷酸激酶和10 X 缓冲液4dNTP 混合液Tag DNA 聚合酶10 X PCR 扩增缓冲液低胶凝 溶点琼脂糖二甲基二氯硅烷丙烯酰胺原溶液10 X TBE 缓冲液过硫酸铵EDTA2 X 甲酰胺加载缓冲液仪器、耗材水浴锅循环变温加热器D
寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验
实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌试剂、试剂盒 ATPPE1缓冲液PE2 缓冲液噬菌体 T4 DNA 连接酶噬菌体 T4 多核苷酸激酶大肠杆菌 DNA 聚合酶ⅠKlenow 片段M13 噬菌体通用测序引物含 4 种 dNTP 的 dNTP 溶液诱变的 M
寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验
本文介绍了由 Zoller 和 Smith 的双引物技术(1984,1987) 结合 Kunkel 的诱变体产量富集方法(1985) 构成的经典方案。本方案中使用的单链 DNA 模板含有较高的尿嘧啶残基,因为它们是从生长于 dut 和 ung 基因突变大肠菌中的 M13 噬菌体中制备的(见方案 1)
寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验
实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌 试剂、试剂盒 ATP
湖南地方猪60K单核苷酸多态性芯片开发成功
11月30日,中国工程院院士、湖南农业大学教授印遇龙主持的湖南省创新型省份建设专项“优质湘猪全基因组育种技术研发及新品种(配套系)培育”项目中期检查会在长沙召开。该项目旨在针对目前我国地方猪品种遗传基础和基因资源研究不足问题,系统挖掘地方猪优异特色性状功能基因,开发和优化以基因组选择和杂种优势预测为
成都生物所发现一种单核苷酸多态性新型检测方法
单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上,由于单个核苷酸的转换、颠换、插入或缺失等引起DNA序列的多态性,它与许多疾病直接相关。因此,快速、准确、廉价的SNP检测技术的开发,对药物研究、个体化医疗、临床试验和分子诊断等至关重要,而目前大多数的SNP检测方法均需要复杂的探针标记,并依靠高成本的检
毛细管电泳法分析单链构象多态性实验
基本方案1 毛细管电泳的样品准备 基本方案2 应用 ABI 310基因分析仪的自动化毛细管电泳 基本方案3 应用ABI PRISM 3100基因分析仪的自动化毛细管芯片电泳
毛细管电泳法分析单链构象多态性实验
单链构象多态性(SSCP) 是最常用的突变检测方法之一。应用毛细管电泳法,通过 DNA 在非变性聚合物中被分离,可以区分野生型和突变型 DNA 片段。通过给每条链贴上不同的标签可以区分两条链。构象是蕰度决定的,因此,凝胶电泳时要在不同的温度下以实现一个高敏感性。毛细管电泳的样品准备实验材料5'
基因芯片技术的主要应用
1998 年底美国科学促进会将基因芯片技术列为 1998 年度自然科学领域十大进展之一,足见其在科学史上的意义。现在,基因芯片这一时代的宠儿已被应用到生物科学众多的领域之中。它以其可同时、快速、准确地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的威力。这些应用主要包括基因表达检测、突变检测、基因组
毛细管电泳法分析单链构象多态性实验(三)
应用ABI PRISM 3100基因分析仪的自动化毛细管芯片电泳实验材料PCR 产物5% 非变性引物试剂、试剂盒10 X 基因分析仪缓冲剂Milli-Q 级别的超纯水仪器、耗材ABI PRISM 3100 基因分析仪基因扫描毛细管芯片实验步骤1.安装一个 16 通道的芯片(50 cmi.d.) 使之
毛细管电泳法分析单链构象多态性实验(二)
应用 ABI 310基因分析仪的自动化毛细管电泳实验材料PCR 产物5% 非变性引物试剂、试剂盒10 X 基因分析仪缓冲剂Milli-Q 级别的超纯水仪器、耗材ABI PRISM 310 基因分析仪基因分析仪毛细管基因扫描分析软件实验步骤1.将 PCR 管放在样品槽上。参照制造商的说明书将 ABIP
成都生物所发明一种检测单核苷酸多态性的方法-简便实用
中国科学院成都生物研究所“一种检测单核苷酸多态性的方法”获国家知识产权局发明ZL(ZL号:ZL 201310045649.0)。 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,
聚合酶链反应一单链构象多态性分析-(PCRSSCP)
聚合酶链反应-单链构象多态性分析(Single Strand Conformation Polymorphism Analysis of Polymerase Chain Reaction Products, PCR-SSCP)是近年来发展起来的一种基因分析方法。 PCR-SSCP分析的基本
单链构象多态性和异源双链分析方法检测突变实验
试剂、试剂盒 扩增缓冲液dNTP 混合溶液甲酰胺上样缓冲液蔗糖凝胶缓冲液TBE 电泳缓冲液限制性内切酶热稳定 DNA 聚合酶人类基因组 DNA正向引物和反向引物[a-32P]dCTP丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸胺甘油TEMED仪器、耗材 带屏障装置的自动移液器吸头 沸水浴电泳板、破璃和 0.4 mm 隔