基于QOTqIT质谱系统的蛋白质组学快速鉴定（二）
表1 有效梯度内的采集数据分析 表2 HeLa和酵母样本全蛋白鉴定结果 2.2 HeLa和酵母蛋白质组快速鉴定结果 数据经SEQUEST HT搜库和Percolator卡值, 从1 μg和50 ng HeLa样本中分别鉴定到20860和14100条肽段(q值0.01), 分别对应3865和2877个非冗余蛋白(表2), 而同样的鉴定数量, 目前的报道至少需要2~3h[9]. 另外, 酵母样本共鉴定到15083条肽段(q值0.01), 对应2697个非冗余蛋白(表2). HeLa数据进一步使用Preview软件分析谱图质量精度(图2). 结果显示, 母离子(m/z)质量精度平均为0 ppm, 子离子质量精度(m/z)平均为0.075 Da. 轨道肼质量偏差基本保持在5 ppm以内, 具有高质量精度和长期稳定的质量轴; 离子阱质量偏差基本保持在±0.2 Da以内, 质量精度良好,......阅读全文
“组学国标”项目结硕果：最精准的mRNA测序与蛋白质组质谱
二代测序、蛋白质组质谱，这些“高大上”的组学手段早已不是稀罕事，使人们对生命和疾病的理解进入了一个崭新的时代。这些组学技术大量用于科研的同时，在应用领域却陷入了巨大的困境。 蛋白质组质谱技术和RNA测序目前几乎没有任何值得一提的临床应用，即便是在临床应用得相对较多的DNA测序，也饱受重复性差、
基于高分辨质谱的组学分析方法在白酒香型鉴别...（二）
4.3 统计学分析采用 SIEVE 软件对组分进行提取、过滤（P-Value ＜ 0.05）及统计学分析。不同品牌组和不同等级组分别得到 486 个和1246 个化合物。通过 SIMCA 软件对上述化合物的 PCA 分析表明，在这两个分析组中 3 种香型的白酒均能较好的分开，聚类趋势明显
台式高分辨率质谱系统快速鉴定药物杂质（二）
图2. 奥美拉唑的高分辨率准确质量数全扫描和MS/MS 谱图 图3. Mass Frontier 的FISh 功能鉴定杂质 表1. 已识别杂质的准确质量数和元素组成 II. Mass Frontier 用于未知物的结构鉴定采用Mass Frontier 的“ 碎片离子搜索”（FISh） 功能
三合一质谱仪的技术特点
技术特点：Orbitrap Fusion Lumos作为第二代“三合一”质谱(同时拥有四极杆质量过滤器、线性离子阱及Oritrap质量分析器三种检测器)，对Q-OT-qIT系统进行深度优化，同时配合智能平行运行技术(ADAPTTM)将质谱所有部件充分调动，相互配合同时工作，极大的提升了性能。而2
质谱技术帮助科学家发现蛋白质组学重要成果
最近，来自瑞士和荷兰的科学家，对在22种不同生长条件下大肠杆菌表达的蛋白质，进行了定量和定性分析。确定了超过2300个蛋白质，其中一些处于每个细胞一个副本的平均水平。由此产生的数据集描述了细胞中大多数(> 90%)的蛋白质量，对细胞生物学家来说这将是一个宝藏。相关研究结果发表在十二月出版的《Na
二维液质杂质鉴定系统
制药企业QA/QC 部门的液相检测方法中会经常使用非挥发性缓冲盐流动相(如磷酸盐缓冲溶液)，但当进行液质联用分析时，流动相必须转换为适合于ESI(APCI)的挥发性流动相。而改变流动相很多时候会使得杂质峰的保留时间发生变化，甚至湮没在主峰中，因此，需要耗时耗力摸索新的分析方法。 为解决
基于质谱分析技术的蛋白质组学检测法能更有效识别肝癌
随着丙型肝炎病毒感染的不断发生，肝癌病例不断增加，这就急需一种针对肝癌的早期诊断方法。 一项发表在1月15日《临床癌症研究》(Clinical Cancer Research)杂志上的研究性文章称，一种基于质谱分析技术的蛋白质组检测比传统的生物标志物检测更为准确，可以更好地区分肝癌患者和丙型肝炎肝硬
岛津携手质谱专家，北京共话组学发展 ——2023北京质谱专家沙龙组学专题会议
2023年8月17日，岛津企业管理（中国）有限公司举办的“2023质谱专家沙龙-组学专题会议”在北京成功召开。会议旨在促进质谱及组学行业专业人士交流、学习与合作。来自于国内各大高校及科研院所的四十余位专家学者参加了本次会议。 会议现场 主持人 岛津企业管理（中国）有限公司，分析计测事业部营业部，北京
杭州质谱学术大会系列：Astral突破质谱组学新极限
——2020-2023杭州质谱学术大会系列报导 6月11日，中国质谱学术大会 “新方法与新技术”专场报告中，来自北京生命科学研究所董梦秋研究员、中科院大连化物所张丽华研究员、南京大学鞠幌先教授、赛默飞应用主管范自全等专家、学者和企业代表带来了关于蛋白质相互作用、结构分析的最新质谱检测方法与应用
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（二）
案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章，采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒（Cricket paralysis virus, CrPV）感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现，CrPV
高分辨质谱脂质轮廓谱表征用于食品组学研究中...（二）
3.2 分类与多元统计结果实验挑选 6 种最为常见的食用植物油进行深度的多元统计分析。图 5 为对 SIEVE 软件获得的脂质轮廓谱数据矩阵进行聚类分析的结果，可见， 6 种食用植物油样品按照各自的植物基源，分类明确。随后，为进一步明晰不同脂质分子在脂质整体轮廓分类中的贡献，实验又对这 6 种植物油
谭敏佳：色谱质谱双翼护航－助力蛋白质组学新突破
分析测试百科网讯 2021年9月23日，赛默飞双重新品线上直播发布会召开，重磅推出了Thermo Scientific™ TSQ™ Plus 三重四极杆质谱仪和Vanquish Neo UHPLC 系统，为蛋白质组学、精准医学、制药和生物制药、临床研究、转化研究等领域提供了从色谱到质谱的高效、高
李海洋课题组研制出便携离子阱质谱－快速鉴定混合毒品
打击毒品滥用长期以来一直是全球重点关注问题。近年来，制毒者为了提升毒品的“快感”，同时降低毒品的成本，经常将多种毒品进行混合，配置成混合药效新型毒品，这类不同毒品相互掺杂促进药效的混合毒品危害性很大。2017年，北美地区因吸食毒品过量造成的死亡人数超过5000人，其中大部分是因为吸食海洛因中掺入
如何判定蛋白质的质谱鉴定结果的差异
1 单个蛋白鉴定1. 用于鉴定纯化的单个蛋白的溶液或粉末，或经过SDS-PAGE（Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis）的单个条带或二维电泳的单个点。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分离多肽，离子化的多肽进入质谱，母离子检
如何判定蛋白质的质谱鉴定结果的差异
1 单个蛋白鉴定1. 用于鉴定纯化的单个蛋白的溶液或粉末，或经过SDS-PAGE（Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis）的单个条带或二维电泳的单个点。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分离多肽，离子化的多肽进入质谱，母离子检
质谱在蛋白质组学中的应用实验
实验材料 冷冻干燥样品试剂、试剂盒 校准标准品基质溶液甲醇仪器、耗材 MALDI 质谱仪MALDI 板实验步骤 1.吸取 0.5ul 的基质溶液，加到 MALDI-MS 分析所用的金属样品板上的样品孔中（为了准确起见，请使用2ul 的移液器）。2.在基质干燥之前，迅速加入 0.5ul 的标准品或样品
质谱在蛋白质组学中的应用实验
方案1 蛋白质和多肽 MALDI-MS 分析的一般方法 方案2 反相微型层析柱的制备实验 方案3 固定化酶微型层析柱的制备 方案4 用于蛋白质组分析的微毛细管 HPLC 色谱及 ESI —体化装置的制备和使用 方案5 利用 Nano-LC
蛋白质质谱鉴定技术概述及常见问题
蛋白质（Protein）是生物体中含量最高，功能最重要的生物大分子，存在于所有生物细胞，作为生命的物质基础之一，蛋白质在催化生命体内各种反应进行、调节代谢、抵御外来物质入侵及控制遗传信息等方面都起着至关重要的作用，因此蛋白质也是生命科学中极为重要的研究对象。现代研究结果发现越来越多的多肽同蛋白质一样
【网络研讨会】蛋白质组学/脂质组学研究进展
自从精准医学概念提出以来，组学研究一直都是全球最热的研究领域，其技术在临床医学、生物医药和食品安全等领域都占据十分重要的作用。2016年初，中国发起了精准医学研究专项课题，目标在2017年至2019年构建重大疾病的预防诊断和治疗大数据平台，推动一批精准治疗药物和分子检测产品进入国家医保目录。同时
奥美拉唑药物杂质高分辨质谱快速鉴定（一）
前言杂质分析对于药物的研发至关重要 1。在研究过程中，杂质谱信息能帮助药物化学家优化合成路线和避免潜在的有毒杂质。在开发过程中，当大量母体化合物存在时，鉴定和表征痕量杂质至关重要，从而促进了高分辨率、高灵敏度和高扫描速度的 HR-MS 仪器和智能化结构鉴定软件的发展。为了展示 HR-MS
基于－Orbitrap－GCMS－的非靶向代谢组学（二）
图 2. 大鼠肌肉组织样品代谢 0–3 天后的 GC-MS 色谱图（自上而下天数增加），X 轴为保留时间，Y 轴为强度（固定为1E9 计数）。例如，记下高亮区域中峰强度随时间的变化。 化合物发现阶段Q Exactive GC 系统获取了每个样品的全扫描色谱图（图 2）。该系统在较宽的动态范
ASMS－2023丨布鲁克质谱新品继续引领单细胞蛋白质组学
MS/MS扫描速度提升至300Hz的timsTOF Ultra，进一步推进空间蛋白质组学和单细胞多组学；新型离子源和微升流喷雾针、采集方法和软件带来更稳定、更灵敏、更快速的4D-蛋白质组学 01.timsTOF Ultra 质谱仪 timsTOF Ultra PASEF扫描速度提高至300
岛津携手质谱专家，北京共话组学发展
——2023北京质谱专家沙龙-组学专题会议2023年8月17日，岛津企业管理（中国）有限公司举办的“2023质谱专家沙龙-组学专题会议”在北京成功召开。会议旨在促进质谱及组学行业专业人士交流、学习与合作。来自于国内各大高校及科研院所的四十余位专家学者参加了本次会议。分析测试百科网为您报道精彩内容
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗力，不
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗
蛋白质组的鉴定方法
如蛋白质鉴定结果、蛋白质的亚细胞定位、蛋白质在不同条件下的表达水平等信息。目前应用最普遍的数据库是NRDB和dbEST 数据库。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等几个数据库组成，dbEST是由美国国家生物技术信息中心（NCBI）和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑的核酸数据库；
蛋白质组的鉴定方法
如蛋白质鉴定结果、蛋白质的亚细胞定位、蛋白质在不同条件下的表达水平等信息。目前应用最普遍的数据库是NRDB和dbEST 数据库。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等几个数据库组成，dbEST是由美国国家生物技术信息中心（NCBI）和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑的核酸数据库；
Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行
【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节，第一个是样品的处理阶段，这是最简单，也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分，使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分，这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的