QExactive中TMT定量工作流程的参数优化和ProteomeDi...（三）
4. 工作流程设置和定量比值的定义首先在 workflows tab 下打开 Processing Workflow。模板里已经包含了质量数容许偏差、报告离子定量分析说明和常见修饰，只需要再细化以下几个参数。1. 在 Processing Workflow 的 SequestHT 节点下，选择 Protein Database。可同时选择多个蛋白质数据库。2. 在 Processing Workflow 的 SequestHT 节点下，指定 TMT 为肽段氮端和赖氨酸残基上的 static modification。（请注意：TMTsixplex 和 TMT10plex 都对应 229.163 Da 质量增加）。3. 在报告离子定量节点下，确认 MS 级别是 MS2。4. 打开 consensus Workflow ，选择 Protein Marker 节点。选定需要在结果中标示的蛋白质。因为样品是 E. coli 和人......阅读全文
Q－Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome－Di...（三）
4. 工作流程设置和定量比值的定义首先在 workflows tab 下打开 Processing Workflow。模板里已经包含了质量数容许偏差、报告离子定量分析说明和常见修饰，只需要再细化以下几个参数。1. 在 Processing Workflow 的 SequestHT 节点下，选择 Pr
Q－Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome－Di...（五）
MS1 参数 TMT 标记对于母离子来说是真正的同量异序标签，因此 MS1分辨能力的设置是与未标记样品完全相同的: 对于 Q Exactive Plus MS 和 Q Exactive HF MS 来说，其分辨率分别为 70,000 和 120,000。这样的设置足以在不显著影响数据依赖扫描
Q－Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome－Di...（一）
Q Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome Discoverer2.1数据处理方法Xiaoyue Jiang1, Tabiwang Arrey2, Eugen Damoc2, Michaela Scigelova2, David Horn1, Rosa Viner1, an
Q－Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome－Di...（四）
图 10. 运用本研究中每个研究因素筛选蛋白质组（上图）和肽段组（下图）鉴定结果的滤筛。 图 11. 筛滤后肽段组的定量分析结果总览。 图 12. 结果中的 Abundance Ratios 栏。比值分别按 Isolation Windows 和 Quan Channel 排序。比例上调或下调的蛋
Q－Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome－Di...（六）
图 17. TMT-标记的纯 E. coli 中的比值。预期比例用虚线表示。请注意对于 128/126 和 129/126 比例，方法 4 的定量分析准确度最高。 MS2 自动增益目标值（AGC）自动增益目标值是需要设置的另一个关键参数，其大小决定了 C trap 能积累并进入 Orbitra
Q－Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome－Di...（二）
数据处理采用 Proteome Discoverer 软件 2.1 版本（PD 2.1）进行数据处理。该软件的特色是提供了全新改进版的 TMT 定量分析工作流程，其新功能包括：1）可用于添加报告离子同位素分布的全新用户界面；2）解析 TMT10plex 试剂中报告离子同位素杂质的能力；3
Q－Exactive－Focus－不同高分辨定量方式在药物分析中的应用－三
3.3 平行反应监测（PRM）平行反应检测（PRM）高分辨定量通过四极杆对目标化合物进行选择性通过，离子在通过后立即进入碰撞池并发生高能碰撞碎裂，所产生的碎片将被同时送入 Orbitrap 进行高分辨扫描，然后选择高分辨的二级子离子进行定量。该定量方法的特点为，在四极杆过滤掉大量干扰离子提高了灵敏度
“Q－Exactive－蛋白质组学研究的综合平台”网络讲座
9月27日，赛默飞世尔科技借分析测试百科网这一平台成功举办了“Q Exactive 蛋白质组学研究的综合平台”网络讲座。赛默飞世尔科技李静工程师为大家介绍了Q Exactive高性能台式四极杆—轨道阱系统的基本组成及特点，着重讲解了Q Exactive 在蛋白质组学应用的优势。 赛默飞世尔科技
Orbitrap－Exploris™－480的鉴定性能、软件特性和蛋白质组学应用2
3.前所未有的TMT定量体验 困扰：对于10标以及11标的TMT定量来说我们一直受到两个问题的困扰。 1第一个问题 10标TMT的相邻报告离子基团仅存在质量亏损级的质量差异，因此我们需要采用50,000的分辨率进行采集，从而使得扫描速度变慢，降低了对样品的测序深度。 2第二个问题 共流出肽段的干扰，
药物代谢研究新流程Quanformation网络讲座
2011年10月25日，赛默飞世尔科技“药物代谢研究新流程Quanformation”网络讲座在分析测试百科网举行。此前，赛默飞世尔科技举行已经在分析测试百科网举行了三次Q-Exactive系列讲座，分别是“四极杆-轨道阱质谱仪的特性和功能”、“Q-Exactive -蛋白组
“QExactive－蛋白质组学研究综合平台”视频讲座进行中......
本次讲座主要介绍Q-Exactive高性能台式四极杆—轨道阱系统的基本组成以及其特点，着重讲解了Q-Exactive在蛋白质组学应用的优势。 点击参加：http://www.antpedia.com/ant_video/thermo/thermo9-10/page2.h
赛默飞世尔科技精彩亮相第六届AOHUPO大会
2012年5月5~7日，第六届亚太人类蛋白质组组织(AOHUPO)大会在国家会议中心卡隆重召开，这是亚太地区规模最大、影响最广、学术水平最高的蛋白质组学学术峰会。赛默飞世尔科技作为此次大会的金牌赞助商，展示了其蛋白质组学领域的最新产品技术及解决方案。赛默飞世尔科技展台大会入口处摆设了赛
Q－Exactive－Focus－不同高分辨定量方式在药物分析中的应用－二
2.3 样品制备取盐酸美金刚片杂质 N-（二甲基金刚烷）甘氨酸对照品储备液，逐级稀释后制成含 N-（二甲基金刚烷）甘氨酸 0.12、 0.6、1.2、 6.0、 12.0、 60、 120、 600、 1200、 6000、 12000 ng/ml（ppb）的溶液，分别按上述不同扫描模式进样
Q－Exactive－Focus－不同高分辨定量方式在药物分析中的应用－一
1. 引言质谱技术因其出色的灵敏度和专属性已经被广泛的应用于药物分析，传统质谱定量采用单位分辨选择离子检测 SIM 或选择反应监测 SRM 的定量方式，高分辨质谱具有获得化合物离子精确质量数和分离相邻质量峰的能力，被越来越多的应用于定量分析中。基于 Orbitrap 静电场轨道阱技术的 Q Exac
定量蛋白质组表达谱分析技术iTRAQ/TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签，通过特异性 标记多肽的
赛默飞在ASMS－2017上推出Q－Exactive－HFX－Orbitrap质谱仪
分析测试百科网讯 在2017年6月4日-8日举行的ASMS 2017上，赛默飞推出了Q Exactive HF-X Hybrid Quadrupole Orbitrap质谱仪，为深度分析、定量准确性和重现性设定了新的标准，为生命科学研究和生物制药应用的挑战性工作提供卓越的数据质量，供研究复杂蛋白
定量蛋白质组表达谱分析技术——iTRAQ/TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签，通过特异性 标
什么是Orbitrap－？－Q－Exactive－？
Orbitrap（静电场轨道阱）是一种拥有超高分辨率的质量分析器，是赛默飞ZL独有的高分辨质谱技术，如图 6 所示。Orbitrap是继磁质谱质量分析器、飞行时间质量分析器（ToF）、傅立叶变换离子回旋共振质量分析器（FT-ICR）这些高分辨质谱技术之后，发明原理完全创新的高分辨质谱技术，克
利用高分辨质谱Q－Exactive－Focus定量分析小麦和饲料中的...
利用高分辨质谱Q Exactive Focus定量分析小麦和饲料中的真菌毒素引言真菌毒素是真菌在食品或饲料里生长所产生的代谢产物，对人和动物都具有极大的健康隐患。据联合国粮农组织（FAO）统计，全球每年约有 25% 的农产品受到真菌毒素污染。为了保证食品和饲料的安全，全世界多个国家通过法规或
一小时－DDA－鉴定－DIA－定量－4000－个－Hela－蛋白（一）
引言数据非依赖性的扫描模式（data-independent acquisition, DIA）是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式[1]。它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量。DIA 扫描模式中，超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，并快
用QExactive筛查未知非法添加剂－三聚氰胺事件不再重演
Sensitivity：提高灵敏度，高分辨下可以保持高灵敏度 灵敏度也是食品安全及其它应用关心的问题，针对记者提出的“Orbitrap为什么在高分辨时还具有高灵敏度？”的问题，James博士回答说，“Orbitrap的体积很小，仅有2寸大小；真
赛默飞在ASMS－2017推出一系列创新质谱产品
分析测试百科网讯 第65届美国质谱年会 (ASMS 2017) 上，赛默飞世尔科技有限公司（NYSE：TMO）推出了一系列新技术，推动尖端研究，改进应用市场。 分析仪器高级副总裁兼总裁Dan Shine表示：“在ASMS期间，客户将了解我们的新型质谱技术将如何推动生物研究、转化医学、食品和
一小时DDA鉴定DIA定量4000个Hela蛋白（一）
引言数据非依赖性的扫描模式（data-independent acquisition, DIA）是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式[1]。它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量。 DIA 扫描模式中，超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，并
赛默飞世尔科技：为蛋白质组学提供深层次解决方案
定量蛋白试剂盒 在蛋白分析相关的试剂消耗品方面，Thermo Fisher Scientific都是直接在仪器上开发的。由于试剂和仪器时配套的，从而能够提高分析效率。例如细胞培养氨基酸稳定同位素标记技术（SILAC）和串联质谱标签（tandem mass tag）试剂盒。 细胞培养氨基酸稳定
Thermo－Fisher－Scientific和Biognosys推出非相关数据采集（DIA）
分析测试百科网讯 在2017年6月4日-8日举行的ASMS 2017上，世界科学服务领先供应商赛默飞世尔科技公司宣布与下一代蛋白质组学领导者Biognosys AG达成共同营销协议，为数据库的创建和数据处理研究，通过组合使用Orbitrap质谱仪和Spectronaut Pulsar软件，为非相
使蛋白质检测更容易
图1. Q Exactive质谱仪器内部结构。 Q Exactive是赛默飞世尔科技在2011年ASMS上推出的新型四极杆和轨道阱杂交高分辨质谱仪，将高选择性四极杆的离子过滤与Orbitrap高分辨准确质量数（HR/AM）测量技术相结合，在分辨率、扫描速度和灵敏度性能上进一步提
在食品农产品检测中Q－Exactive的作用
Q Exactive 作为高分辨质谱仪，广泛应用于食品农产品中未知物、危险物的筛查，比如农药残留、兽药残留、生物毒素残留等多种有机污染物的定性筛查，保证食品农产品的安全。此外，Q Exactive 还拥有媲美高端三重四极杆的定量能力，对于复杂基质样品中目标分析物进行高分辨定量，更是高分辨质谱
Q－Exactive－Focus在多农残快速筛查和确证分析中的应用
引言近年来，对于农药残留的分析不断地朝快速化、大规模化发展。而目前，在食品安全中的多农残筛查分析多采用三重四极杆质谱仪，但该质谱系统需要用标准品来优化仪器参数，且能同时分析的化合物数目有限，对于大规模农残筛查具有一定的局限性。在对复杂基质样品分析时，也存在一定的假阳性概率。本文采用具有高分辨率、精确
三合一质谱仪的技术特点
技术特点：Orbitrap Fusion Lumos作为第二代“三合一”质谱(同时拥有四极杆质量过滤器、线性离子阱及Oritrap质量分析器三种检测器)，对Q-OT-qIT系统进行深度优化，同时配合智能平行运行技术(ADAPTTM)将质谱所有部件充分调动，相互配合同时工作，极大的提升了性能。而2