鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定
PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*,研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。PIWI 基因最早在果蝇的生殖干细胞(Germline Stem Cells,GSCs)中被发现,因其编码的蛋白质能调节GSCs的数量与分化率而得到研究者的进一步研究。在果蝇中,PIWI亚家族包含三个成员:PIWI, AUB, AGOs。对于PIWI突变个体,雄性与雌性均表现不育。而在人类中,PIWI蛋白除了参与精子发生外,同时也与肿瘤的形成和发展相关。在本研究中,研究者首先克隆得到PIWI基因,随后利用二代测序技术对鹌鹑的小RNA表达谱进行分析(由联川生物承担完成),并利用生物信息学方法预测了与其绑定的小RNA,再经过免疫共沉淀与West......阅读全文
鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定
PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*,研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。PIWI 基因
PLoSONE:鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定
PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*,研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。 P
PLoS-ONE:鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定
PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*,研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。
Nature子刊:RNA测序鉴定小胶质细胞独特表达基因
马萨诸塞州综合医院(MGH)的研究者采用一种新的测序方法,鉴定了一组被脑免疫细胞——称为小胶质细胞—— 用来感知需要其做出反应的致病组织、毒素或损伤细胞的基因。这些基因的鉴定,能使我们更好地理解小胶质细胞在正常大脑和神经退行性疾病中的作用,为保护诸如阿尔茨海默氏病和帕金森氏综合症引起的损伤带
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验
实验方法原理 实验材料 含有多个串联拷贝识别位点的、缺乏识别位点的(或含识别位点突变的)pUC重组质粒DNA试剂、试剂盒 限制性内切核酸酶EcoRI及HhdIII1 mol L Tris • Cl pH 7. 55 mmol L dCTPdGTPdTTPdATP5000 Ci mmol [α32P]
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验
用盐酸胍进行干燥膜的变性/复性循环试剂、试剂盒HEPES结合缓冲液实验步骤1) 按基本方案步骤1〜15进行。2) 将平皿在4℃冷却10 min。用针扎孔标记各膜的位置。小心地揭起膜,室温下在空气中瞭干15 min。3) 将膜浸于HEPES结合缓冲液/6 mol/L盐酸狐中,4℃轻轻摇动温育10 mi
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验
从重组溶源菌中制备粗提物鉴定DNA结合蛋白的活性实验材料大肠杆菌 Y1089试剂、试剂盒含有或不含10 mmol L MgCl2的LB培养液1010pfu mLλgtU重组噬菌体液1 mol L IPTG抽提缓冲液5 mg mL溶于抽提缓冲液中的溶菌酶(保存于-20℃)仪器、耗材4 mol L Na
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验
用位点识别DNA筛选λgtll表达文库 用盐酸胍进行干燥膜的变性/复性循环 从重组溶源菌中制备粗提物鉴定DNA结合蛋白的活性 实验方法原理
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验1
一个DNA位点识别探针被用来从表达文库中检测合适的重组克隆,并对 之进行纯化,证明其中编码了具有一定序列特异性的DNA结合域。这种策略排除了为 分离其基因而对序列特异性DNA结合蛋白进行纯化的过程;只需要一个合适的构建于 λgtll载体中的cDNA文库和一个DNA识别位点的探针。用位点识别DNA筛选
小干扰RNA转录后基因沉默的介绍
siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物(RISC)的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程,两条siRNA链中的一条(引导链)将被装载到RISC中,而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后,siR
小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切
最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工作是
小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切
最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工
小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切
最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工作是
新发现!精子发育过程中蛋白质翻译激活重要机制
据不完全统计,近20年我国不孕不育率从6.9% 升至17.1%,其中近50%是男性因素导致,目前有一半以上不育男性无法明确其病因。在精子细胞演变为精子的过程中,细胞核内的基因转录活动将完全停止,为后期精子细胞发育所需的基因提前转录为信使核糖核酸(mRNA),然后以抑制状态储存在精子细胞中,直到特
诱骗RNA结合蛋白不与癌细胞中的天然RNA分子结合
科学家也开始变得“狡猾”,开始用欺骗来对抗癌症。希伯莱大学的研究人员发明了一种诱饵,可以阻止癌症用于转移的RNA结合蛋白。 近年来,RNA结合蛋白在肿瘤生长中起着重要作用已经成为不争的事实。这些蛋白在所有细胞中都很活跃,尤其是在癌细胞中,它们与RNA分子结合,加速癌细胞的生长。不幸的是,目前还
可爱龙教授Cell评述重要结构生物学进展
在所有的非编码RNA中, piRNA 数量最多, 主要存在于生殖系统,这种RNA在动物生殖组织中可以引导PIWI蛋白质沉默有害的转座子。其关键作用复合物:piRNA诱导沉默复合体piRISC的生物合成涉及多个步骤,至今科学家尚未清楚了解这个步骤的分子机制。 近期一组研究人员报道了PIWI-cl
核仁小RNA的功能及其在癌症研究中的作用(二)
snoRNAs在癌症中的作用snoRNAs参与的癌症的分子病理学研究snoRNAs在癌症中的作用起始于一项研究:在脑膜瘤中,与正常脑组织相比snoRNAs的表达大幅下调[20]。最近研究发现,在非小细胞肺癌中多种snoRNAs呈现出不同的表达状态[21]。其它的研究证明snoRNAs U50
核仁小RNA的功能及其在癌症研究中的作用(一)
为什么研究snoRNAs?引言核仁小RNA(snoRNAs)是一类中等长度的非编码小RNA,它们的长度在60-300nt不等,能与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs 复合物[1]。在脊椎动物中编码核仁小RNA的基因主要存在于蛋白编码基因或非蛋白编码基因的内含子区域,并且经过进一步的转录后加
转化克隆的筛选和鉴定
实验概要本实验介绍了转化克隆的筛选和鉴定方法,有助于学会用酶切法或PCR法筛选重组质粒转化成功的克隆菌。实验原理利用转化后宿主菌所获得的抗菌素抗性性状筛选出获得质粒的菌落克隆。再从这些菌落中鉴定出质粒上带有外源基因插入片段的克隆菌落。主要试剂1. LB培养基(加抗菌素)2. PCR用试剂3. 引物4
转化克隆的筛选和鉴定
1.目的学会用酶切法或PCR法筛选重组质粒转化成功的克隆菌。2.原理利用转化后宿主菌所获得的抗菌素抗性性状筛选出获得质粒的菌落克隆。再从这些菌落中鉴定出质粒上带有外源基因插入片段的克隆菌落。3.器材旋涡混合器,小镊子,微量移液取样器,移液器吸头,1.5ml 微量离心管,双面微量离心管架,干式恒温气浴
转化克隆的筛选和鉴定
1.目的学会用酶切法或PCR法筛选重组质粒转化成功的克隆菌。 2.原理利用转化后宿主菌所获得的抗菌素抗性性状筛选出获得质粒的菌落克隆。再从这些菌落中鉴定出质粒上带有外源基因插入片断的克隆菌落。 3.器材旋涡混合器,小镊子,微量移液取样器,移液器吸头,1.5ml 微量离心管,双面微量离心管架,干式恒温
克隆的筛选和快速鉴定
实验概要掌握快速细胞破碎法测定大小不等的众多的质粒DNA;和菌落PCR快速鉴定克隆。实验原理在这个实验方法中,只需配制一种细胞缓冲液(它可以在室温下保存,长期使用)。利用破碎细胞缓冲液中的阴离子去污剂---SDS在37℃溶解膜蛋白,使细胞破裂,并解聚核蛋白,SDS还能与蛋白质结合形成复合物,使得蛋白
生化与细胞所等研究发现小鼠PIWI/piRNA代谢调控机制
国际知名学术期刊Developmental Cell于1月13日发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所刘默芳组、王恩多组关于piRNA在精子发生后期触发小鼠PIWI(MIWI)蛋白经 APC/C-泛素途径降解的最新研究成果。该工作与李劲松研究员、上海计划生育研究所施惠娟研究员、美国路
关于小干扰RNA的RNA激活介绍
已经发现dsRNA还可以激活基因表达,这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa,称为“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。
核小RNA的用途
核小RNA是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。
小分子RNA的简介
MicroRNA (miRNA) 是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA,其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某
时序小RNA的定义
中文名称时序小RNA英文名称small temporal RNA;stRNA定 义一类长度约为22核苷酸的非编码RNA,是微RNA大家族的成员。与生物发育时间顺序调控有关,如早期报道的线虫lin-4和let-7时序小RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
核小RNA的特点
①稳定,半寿期常与核糖体相近;②含量丰富,如U1分子在每个核中的含量可有10^6个;③普遍性,在动、植物细胞中均含有snRNA;④高度保守,如人和爪蟾的U1snRNA有90%的序列相同。
核小RNA的特点
①稳定,半寿期常与核糖体相近;②含量丰富,如U1分子在每个核中的含量可有10^6个;③普遍性,在动、植物细胞中均含有snRNA;④高度保守,如人和爪蟾的U1snRNA有90%的序列相同。通常snRNA不是游离存在,而是与蛋白质结合成复合物,成为小核核糖核蛋白颗粒(small nuclear ribo
核仁小RNA(snoRNAs)的功能及其在癌症研究中的作用介绍
核仁小RNA(snoRNAs)是一类中等长度的非编码小RNA,它们的长度在60-300nt不等,能与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs 复合物[1]。在脊椎动物中编码核仁小RNA的基因主要存在于蛋白编码基因或非蛋白编码基因的内含子区域,并且经过进一步的转录后加工处理形成成熟的核仁小RNA[2]