高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用（一）
在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群，它们的种类繁多，可达上千种，数量也很惊人，是人体细胞总量的10倍以上，迄今为止，仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系，对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡，能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收营养、维持肠道免疫系统功能、抵挡有害微生物的侵害，但是当这种平衡因某些因素被打破致使肠道菌群发生紊乱时，人体就可能患上诸如肥胖症、糖尿病、肠炎甚至癌症等疾病。为了加深对人类疾病发生原因、药物作用机理的理解，继人类基因组计划之后，科学家们又启动了人类元基因组计划，这使肠道菌群的研究迎来了一个新的浪潮。 在以往的肠道微生物群落多样性研究中，人们主要采用DGGE等分子生物学方法及生物芯片对肠道菌群进行研究，但是这些方法都存在一定的缺陷。如DGGE只能检测到环境样品中十几种优势菌，但是对痕量微生物却束手无策；电泳条带中包含不只一种16......阅读全文
肠道研究专家Cell发现泻药对肠道菌群的影响
来自斯坦福大学的研究人员发表了题为“Transient osmotic perturbation causes long-term alteration to the gut microbiota”的文章，发现在小鼠出现腹泻时，保护肠内膜免受它的内含物损害的粘液层变薄，但在泻药移除两周后完全恢复
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例
以下是一些单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例： **案例一：乳腺癌** 研究人员利用单细胞测序技术对乳腺癌肿瘤组织进行分析，发现了不同亚型乳腺癌细胞之间的基因表达差异和肿瘤细胞的异质性。他们鉴定出了具有干细胞特性的肿瘤细胞亚群，这些细胞可能与肿瘤的复发和耐药性有关。这为开发更有针对性的治疗
肠道菌群的基本介绍
肠道菌群,人体肠道的正常微生物,如双歧杆菌,乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育必须的维生素,如B族维生素（维生素B1、B2、B6、B12）,维生素K,烟酸、泛酸等,还能利用蛋白质残渣合成必需氨基酸,如天门冬氨酸、苯丙氨酸、缬氨酸和苏氨酸等,并参与糖类和蛋白质的代谢,同时还能促进铁、镁、锌等矿物元素
肠道菌群的分类介绍
根据可培养细菌的数量分类在肠道菌群中,可以培养到的细菌有400余种,依据其数量多少可以分为主要(优势)菌群(predominant microflora)和次要菌群(sub—dominant microflora)。 ①主要(优势)菌群：指肠道菌群中数量大或种群密集度大的细菌,一般在10～10
肠道菌群的影响因素
影响肠道菌群的主要因素有4个方面：人体自身的因素（肠道的酸碱性,胆汁及消化酶的分泌,肠道的蠕动,肠道黏液的分泌,肠道表皮的脱离等）以及人所处的环境因素（压力,出差等）；人体摄入的饮食（可消化的食物与不可消化的纤维、药物等）；细菌自身因素（细菌的黏附能力,繁殖能力,营养需求量,抗消化酶能力等）；细
昆明动物所等在人体菌群多样性与疾病关系研究中获进展
近日，中国科学院昆明动物研究所马占山课题组在The ISME Journal上发表文章，揭示肠道菌群多样性与疾病间不一定存在相关关系。严格统计分析表明只有在大约1/3情形，菌群多样性才与“菌群相关疾病”之间具有显著关系。 人体菌群主要分布在肠道、口腔、皮肤、呼吸道和生殖道五大部位，但远不止如此
高通量测序技术技术的应用及前景
高通量测序技术技术的应用及前景 （作者：生物芯片上海国家工程研究中心 滕晓坤, 肖华胜） 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划
高通量测序技术技术的应用及前景
高通量测序技术技术的应用及前景 （作者：生物芯片上海国家工程研究中心 滕晓坤, 肖华胜） 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划
高通量测序技术技术的应用及前景
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能, 所以又被称
高通量测序的技术应用的介绍
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展，科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序（de novosequencing），获得该物种的参考序列，为后续研究和分子育种奠定基础；对有参考序列的物种，进行全基因组重测
Science新研究：肠道菌群互相竞争－保证肠道生态稳定
最近一项研究发现人类肠道中的菌群生态系统复杂多样，不同菌群之间的竞争关系帮助维持了肠道生态系统的稳定，这对于保持人类机体健康是必不可少的。来自英国牛津大学的科学家们在国际学术期刊Science上发表了相关研究结果，他们建立了数学模型用于研究人类肠道中成百上千种细菌如何能够成功共存。 在他们的研
llumina高通量测序平台的应用（一）
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了
关于高通量测序的技术应用介绍
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展，科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序（de novo sequencing），获得该物种的参考序列，为后续研究和分子育种奠定基础；对有参考序列的物种，进行全基因组重
打通菌群多样性与功能的研究策略
近几年，肠道微生物可以说是最热的研究热点，频繁登上在CNS期刊的封面，不仅相关主题的学术论文表现强势，而且国自然资助的肠道微生物项目数也呈显著增长的趋势，其中2018年一共资助了近180项研究，资助金额高达7600万。由此可见肠道微生物一直是科研领域的研究热点，相信2019年肠道微生物仍是国自然申请
男女肠道菌群在7方面有差异
最近，中国科学院昆明动物研究所马占山学科组在《先进科学》上发表了研究论文，揭示了男女菌群在15个位点（包括肠道、呼吸道、口腔、皮肤等）7个方面所存在的重要差异及其机制，为研究男女在对菌群相关疾病的易感性差异等领域提出了参考标准，在“菌群性别组学”这一崭新研究领域取得基础性突破。 据了解，“菌群
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下应用：肿瘤发生的早期检测能够追踪肿瘤起始细胞在早期阶段的变化，发现潜在的肿瘤发生标志，从而实现更早期的诊断。肿瘤异质性解析明确肿瘤内部不同细胞在空间位置上的基因表达差异，深入了解肿瘤异质性的形成机制和演化过程。肿瘤微环境研究分析肿瘤微环境中各种细胞（如免疫细胞
单细胞测序技术在癌症研究中的应用案例分享
以下是一些单细胞测序技术在癌症研究中的应用案例： 1. 胶质母细胞瘤：通过单细胞 RNA 测序，发现了肿瘤细胞中的不同亚型，以及肿瘤微环境中免疫细胞的特征。这有助于理解肿瘤的异质性和免疫细胞的功能状态，为开发更有效的治疗策略提供了依据。 2. 乳腺癌：研究人员利用单细胞测序揭示了肿瘤细胞在转移过
单细胞测序技术在细胞呼吸研究中的应用前景
单细胞测序技术在细胞呼吸研究中的应用前景非常广阔。未来，它有望帮助我们更深入地理解细胞呼吸的精细调控机制。通过对大量单个细胞的分析，可以揭示不同细胞类型和状态下细胞呼吸的特异性变化，发现新的与细胞呼吸相关的基因和调控网络。在疾病研究方面，单细胞测序能够精确解析病变组织中细胞呼吸异常的细胞亚群，为疾病
二代测序技术在临床诊疗中的应用（一）
Sanger测序在过去的二十年间是基因组研究的主流方法，取得了包括人类基因组计划(human genome project, HGP)等一系列重大成就，这使得单基因遗传病的鉴定和靶向治疗成为可能1,2。随着基因组大数据时代的到来，尽管Sanger测序是基因检测的金标准，但是NGS）技术应运而
Gut：运动和饮食对肠道菌群多样性产生影响
肠道共生菌群、宿主免疫状态和代谢形成了平衡的信号网络，而饮食习惯对三者都有影响。除了饮食，现代化生活的很多方面会影响肠道菌群，但运动对它的影响程度尚不清楚。爱尔兰科克大学的Fergus Shanahan教授及其团队进行研究，旨在探索运动和饮食对肠道菌群的影响，研究结果发表在《Gut》。 考虑到
人肠道菌群多样性降低与结直肠癌有关
结直肠癌(CRC)是发生在人体下消化道结肠或直肠部位的恶性肿瘤。在世界范围内,其发病率和死亡率均位居各种癌症的前三位，对人类健康构成巨大的威胁。近几十年来，流行病学调查和分子、细胞生物学研究都表明，饮食是影响结直肠癌发病率的最重要因素。而饮食成分对癌症的影响，则很大程度上通过人体肠道细菌的代谢活
多样性增加281％，人类肠道菌群基因组图谱公布！
近两年来，以免疫检查点为药物靶点的免疫检查点抑制剂治疗癌症受到越来越多科研工作者的青睐。但是临床研究结果表明，许多癌症患者因接受免疫药物治疗而出现不同程度的免疫相关不良反应，最终出现不得不提前终止治疗的情况。 而寄居在人体内的肠道菌群可以影响免疫检查点抑制剂治疗癌症，能够极大地改善患者对该疗法
解读近期科学家在机体肠道菌群研究新进展
如今大量研究证据表明，机体肠道菌群对于人类健康非常重要，且与多种疾病的发生直接相关，本文中，小编整理了科学家们近期在肠道菌群研究领域取得的新进展，分享给大家！【1】Nat Med：肠道微生物组在CAR-T细胞癌症免疫治疗中发挥关键作用doi：10.1038/s41591-023-02234-6近日，
高通量测序平台发展及在临床分子诊断中的应用
自2000年人类基因组计划完成，测序技术得到了快速的发展。在美国ABI公司基于末端终止法的第一代测序基础上，各大公司相继推出了不同的NGS测序平台。核酸（DNA和RNA）测序技术的发展推动了医学对遗传病分子特征的认识。以揭示疾病分子特征为目的的高通量测序，即下一代测序（next generati
肠道菌群随季节改变
对现存为数不多的其中一个狩猎—采集者群体开展的研究表明，生活在人类肠道中的微生物随着季节发生变化。相关成果日前发表于《科学》杂志。 来自“人类食物工程”的Jeff Leach及其团队用一年多时间收集了生活在坦桑尼亚的350名哈扎人的粪便样本。“人类食物工程”是一个非营利性机构，旨在研究微生物组
肠道菌群“大有作为”
最近肠道菌群研究大热，肠道菌群并不安分在消化系统中，人们发现其在越来越多的领域发挥作用，今天，小鱼就跟大家盘点一下近期大牛杂志里关于肠道菌群的研究，看看肠道菌群都干了些啥？ 1.Cell：小小肠道菌“调教”大大免疫细胞 最新一期Cell杂志，刊登了两篇文章，皆是讲述肠道细菌对免疫
肠道菌群诱发机体衰老
多年以来，科学家们一直在研究栖息于人类机体肠道中的不同细菌群落是如何对机体功能产生显著影响的，包括机体免疫系统等；肠道菌群有时被称为“共生菌”，其存在于所有生活在一定功能平衡下的动物机体中，当这种平衡被打破后就会诱发宿主机体出现共生失调（commensal dysbiosis）的表现，比如疾病或
高通量测序技术－中的“高通量”－是什么意思
高通量是相对于第一代测序的，第一代测序只能一次测1个样品的1段序列，产生的数据量相对来说很小，而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G，可以一次测很多的样本。在2000年的时候，3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序，是相对手工测序或者跑平板胶来说的。不过到2005年以后，高通
利用三代测序解析肠道菌群结构变异和功能
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481751.shtm 中科院微生物研究所王军课题组和动物研究所宋默识课题组合作，建立了ONT三代测序和Illumina二代测序数据混合组装和后续分析流程。在mock community上的验证表明，三
新研究或揭示肠道菌群紊乱致病奥秘
4月17日，海南大学生命健康学院刘柱教授团队发现，维氏气单胞菌C4（A.veronii C4）可通过细菌Ⅵ型分泌系统（T6SS）重塑宿主肠道菌群并致其紊乱，进而导致宿主患病。该发现揭示了细菌T6SS致病机理，可帮助挖掘新治疗靶点，为细菌性病害防控提供理论依据。相关研究成果已经发表于《国际微生物生态学