专家点评Cell肺腺癌的帽子戏法多组学整合精准医学来临
肺癌是我国也是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤【1】，五年存活率不足20%【2】。肺腺癌（Lung Adenocarcinoma, LUAD）是非小细胞肺癌中最普遍存在的分型，大约占所有恶性肺肿瘤的一半【3】。LUAD最普遍的风险因素是吸烟，其他的风险还包括暴露在致癌物以及户外空气污染等等【4,5】。近年来，诊断出肺腺癌的非吸烟病人人数逐渐增加，这说明找出LUAD发展过程中的非吸烟风险因素是非常关键的【6】。 在过去的十几年中，西方国家的一些研究中为了揭示出LUAD的驱动基因进行了大规模的基因组研究，发现LUAD中最常见的体细胞突变是TP53、KRAS、KEAP1、STK11、EGFR等【7-9】。在中国和其他的亚洲国家，女性非吸烟者罹患肺腺癌的人中约有40-50%是由EGFR突变引起的【10】。 目前关于肺腺癌治疗方面可供选择的治疗方式包括外科手术、放疗、化疗、靶向治疗、免疫疗法或者是这些治疗方式的组合。尽管肺腺癌治......阅读全文
人类蛋白质组计划2.0和蛋白质组学驱动的精准医学
“如果说抗生素的发明引发了第一代医学治疗技术革命，影像学和分子医学的发展引发了第二代医学诊断技术革命，那么，由蛋白质组学驱动的精准医学，势必带来精确诊断与精准治疗统一的第三代医学革命。人类蛋白质组计划2.0将在国际范围部署建立蛋白质组学驱动的精准医学技术体系和行业标准，进一步提升对重大、疑难疾病
专家点评Cell肺腺癌的帽子戏法－多组学整合精准医学来临
肺癌是我国也是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤【1】，五年存活率不足20%【2】。肺腺癌（Lung Adenocarcinoma, LUAD）是非小细胞肺癌中最普遍存在的分型，大约占所有恶性肺肿瘤的一半【3】。LUAD最普遍的风险因素是吸烟，其他的风险还包括暴露在致癌物以及户外空气污染等等【4
Cell:中国团队发布首个肺腺癌分子全景图谱助力精准医学
肺癌是发病率和死亡率增长最快，对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。非小细胞肺癌约占所有肺癌的80%，其中肺腺癌（Lung Adenocarcinoma, LUAD）是非小细胞肺癌中最普遍的分型，大约占所有恶性肺肿瘤的一半。已有研究发现，LUAD中最常见的体细胞突变是TP53、KRAS、KEAP1
景杰生物：蛋白质组学驱动精准医学技术先锋
分析测试百科网讯，中国细胞生物学学会2021年全国学术大会于4月14日在重庆盛大开幕，作为国内蛋白质组学技术开发和应用引领者的景杰生物特装参会，备受行业关注。分析测试百科网采访了景杰生物市场经理邹文安先生和学术经理王涛博士，他们进一步为我们介绍了公司的特色、本届带来的产品，并描绘了公司未来的发展
磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研究获突破
近日，广东省农业科学院农业生物基因研究中心晏石娟团队联合加拿大约克大学、德国马普分子植物生理研究所等研究人员在磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研发方面取得重大突破，首次搭建全自动在线磷酸化蛋白质组学分析技术平台，解决了磷酸化蛋白质组学研究的一大瓶颈。相关研究以农业生物基因研究中心为第一完成单位在线发
Cell子刊：精准医学的光明未来
2015年1月20日，美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医学计划”，希望精准医学可以引领一个医学新时代。精确医学是利用来自基因组序列到健康档案的大量临床数据，来确定药物如何以不同的方式影响人们。通过让医生们针对性地向将真正受益的患者提供药物，这样的知识可以减少浪费，利用现有的治疗方法改善患者的
上药所揭示KRAS突变肿瘤的分子分型和精准治疗新策略
8月9日，中国科学院上海药物研究所研究员谭敏佳和研究员黄敏团队合作，在Molecular Cell上在线发表了题为A proteomic and phosphoproteomic landscape of KRAS mutant cancers identifies combination th
第11届CNHUPO开幕－蛋白质组学驱动的精准医学
分析测试百科网讯 2021年10月13日，为促进蛋白质组学的研究和学科发展，增进国际间合作交流，由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会（CNHUPO）主办，军事科学院军事医学研究院生命组学研究所、湖北大学生命科学学院、国家蛋白质科学中心∙北京、蛋白质组学国家重点实验室、北京蛋白质组研究
让精准医学更精准——组学大数据与医学的完美结合
奥巴马的精准医学计划意在大规模测定癌症病人的全基因组，挖掘癌症驱动基因，实现个性化精准用药，解决癌症对人类的威胁。然而，科学家呼吁：生命活动的实际承担者、大部分的疾病标志物、绝大多数的药物治疗靶标都是蛋白质，因此，精准医学离不开蛋白质组。以蛋白质组、代谢组为重点的多组学为基因组提供了更接近表型的
Cancer－Cell新文章指明肺癌精准治疗未来方向
美国犹他大学的一项新研究发现小细胞肺癌可以再细分为不同的肿瘤亚型，他们还发现一个靶向药物组合对其中一种肿瘤亚型有很好的治疗效果。相关研究结果发表在国际学术期刊Cancer Cell上。这些结果表明不能将不同的小细胞肺癌当作同一种疾病进行治疗。 犹他大学的Trudy G. Oliver教授领导了
MRM－Proteomics同Biodesix合作开发蛋白质组肺癌精准诊断法
蛋白质组学领头公司MRM Proteomics和分子诊断公司Biodesix于近期签署了一项合作协议。根据协议条款，MRM Proteomics将授予Biodesix使用其专有iMALDI技术的权利，以进一步推进其基于血液的肺癌诊断。在此之前，Biodesix的测试菜单包括GeneStrat®基因组
【两会科技热点】蛋白质组学驱动精准医学热潮
胃癌在全球肿瘤死亡原因中排名第三，其中我国的患病人数就占到一半。在很多人的印象中，胃癌就是一种病，但细分的话，它包括弥漫型胃癌等很多种，这些不同类型的胃癌甚至还可以进一步细分。那么，弥漫型胃癌究竟分几种？患者手术后化疗是否有效？预后如何呢？
贺福初院士：蛋白质组学驱动精准医学开启新时代
6月10日在广州举行的第十四届中国生物产业大会高层论坛上，中国科学院院士、发展中国家科学院院士、国家蛋白质科学中心（北京）理事长贺福初发表题为“大科学计划与国家使命”主旨演讲。他指出，人类基因组计划开启了全球生物技术时代，而作为一个新的推动力和新生学科，蛋白质组学进一步推动了精准医学的发展。贺福初H
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析3
结果显示，从 DIA 数据中提取、定量到 6401 条可信的磷酸化肽，占谱图库磷酸化肽总数（6505 条）的 98.4%（图 5）。磷酸化肽的丰度和离子化效率普遍较低，本实验如此高的解析成功率表明，基于 Orbitrap 的 DIA 数据具有极高的谱图质量和出色的灵敏度。 图5. DIA可
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析2
2. 磷酸化样本的 DDA 鉴定、可信度筛选和谱图库建立磷酸化样本信息和色谱质谱参数见实验条件部分。3 针 DDA 数据按磷酸化检索流程使用 Proteome Discoverer 2.0 软件搜库鉴定（S/T/Y+79.966 Da），并使用 ptmRS 模块对位点打分（图 2-1）。搜库完成
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析1
引言 数据非依赖采集（Data-Independent Acquisition, DIA）是当前最热门的质谱采集技术之一，它以非目标的方式将质量范围分为若干窗口，依次并循环采集窗口内所有母离子的二级碎片[1,2]。DIA 与 SRM 类似，也是基于子离子（transition）定量，相比
Cell：转移性前列腺癌的磷酸化蛋白质组学研究
癌症基因组学有望通过揭示驱动个体患者肿瘤细胞的遗传突变来实现个体化癌症治疗。但解读这一基因组数据仍然是个挑战。一些突变和其他遗传改变对癌细胞的影响，呈现在与细胞生长、增殖和其他癌症生物学标志相关的复杂分子互作（信号通路）网络中。通过绘制在前列腺癌细胞中活化的一些关键信号通路，研究人员能够确定可以
4D组学新时代！更精确的磷酸化修饰组学
离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D蛋白质组学是在3D分离即保留时间（retention time）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度的基础之上增加了第四个维度，离子淌度（mobility）的分离（图1），进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度，带来蛋白
黄超兰Cell发文－绝对定量质谱揭示CD3ε的多重信号转导功能
2020年7月29日，北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰团队，中科院上海生化与细胞所许琛琦团队、美国加州大学圣地亚哥分校惠恩夫团队，联手在Cell上发表了题为“Multiple signaling roles of CD3ε and its application in CAR-T cell
谭敏佳：色谱质谱双翼护航－助力蛋白质组学新突破
分析测试百科网讯 2021年9月23日，赛默飞双重新品线上直播发布会召开，重磅推出了Thermo Scientific™ TSQ™ Plus 三重四极杆质谱仪和Vanquish Neo UHPLC 系统，为蛋白质组学、精准医学、制药和生物制药、临床研究、转化研究等领域提供了从色谱到质谱的高效、高
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并...（二）
Figure 2. Quantification and Gene Ontology analysis ofdifferentially phosphorylated peptides and proteins in (5/6Nx + NS)/(Sham + NS)and (5/6Nx +
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并...（一）
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压的病理机制慢性肾病病人一般会出现很多的并发症，其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一，但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术，对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面
磷酸化蛋白质组学研究获进展
中科院大连化物所生物技术部1809组封顺、叶明亮、邹汉法等人关于新型金属离子固定化亲和色谱固定相应用于磷酸化蛋白质组学的研究成果(Immobilized Zirconium Ion Affinity Chromatography for Specific Enrichment of Phosphop
肺癌的精准治疗
肺癌主要分为小细胞肺癌和非小细胞肺癌，其中非小细胞肺癌占80-90％。肺腺癌是非小细胞肺癌最常见的组织类型，占70%-80%。包括手术、化疗、放疗、靶向治疗及免疫治疗的综合治疗已成为肺癌的治疗共识。目前肺癌已经进入精准化治疗时代，患者的生存得到大幅度提高。最近收治的一位晚期肺癌患者，得益于精准化治疗
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰，20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰，20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰，20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压
慢性肾病病人一般会出现很多的并发症，其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一，但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术，对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面系统性的分析。 Proteomic and p
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压
慢性肾病病人一般会出现很多的并发症，其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一，但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术，对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面系统性的分析。 Proteomic and p
Molecular－Cell：蛋白质翻译后修饰调控植物胁迫反应
甲基化修饰与一氧化氮(nitric oxide； NO)依赖的亚硝基化修饰是高度保守的蛋白质翻译后修饰，这两类修饰参与调控众多生物学过程，包括调控非生物胁迫反应。但二者调控非生物胁迫的分子机制不甚清楚。 中国科学院遗传与发育生物学研究所左建儒研究组在亚硝基化蛋白质组学研究中发现拟南芥蛋白质