miRNA的特征、功能及识别方法等详解(二)
miRNA的作用方式最早被发现的两个miRNAs——lin-4 and let-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA 3’非编码区端,以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制,进而抑制蛋白质合成,阻断mRNA的翻译。多个果蝇miRNAs也被发现和他们的目标靶mRNAs的3’非编码区有部分同源。由于miRNAs和其潜在的目标靶之间并非完全互补,这使得通过信息学的方法鉴定miRNA的目标靶位点变得困难。因而也无法确定miRNAs的作用方式是什么,以何种机制影响mRNA的翻译,以何种方式调控基因表达。miRNAs的作用目标靶和活性机制一直是各地的研究人员的关注热点。 在植物中目前有一个miRNA和3个潜在的目标靶基因完全互补(这些scarecrow 基因编码潜在的转录因子),尽管目前还不清楚这些基因是否就是miRNA的目标靶,这仍是第一次发现miRNA 和其潜在的目标靶完全互补,也提示miRNA可能包含和siRNA类......阅读全文
miRNA和siRNA简介及区别
1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室
马丽《自然》文章发现miRNA的原罪
来自麻省9月26日的消息,麻省理工Whitehead生物医学研究所(Whitehead Institute for Biomedical Research),纪念斯隆-凯特琳癌症中心(Memorial Sloan - Kettering Cancer Center)的研究人员发现microRNA能引
《cell》:miRNA是逆境的捍卫者?
现有许多数据说明microRNAs (miRNAs) 除了在发育方面的重要作用以外,在许多逆境应答(stress responses)中也扮演了重要角色。让人惊讶的是miRNAs这一通常抑制靶基因转录表达的小分子,也许在逆境中成为了表达的激活因子,其中的机制也许就是通过逆境中,miRNA/Argon
miRNA调控乳脂合成新机制
乳汁是年幼哺乳动物包括人类的主要营养来源。乳汁的营养价值主要来自脂肪和蛋白质组分。相比于牛奶,山羊奶含有更多的总脂肪,包括更高丰度的有益不饱和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一类含有约22个核苷酸的小RNA,参与各种代谢过程。然而,目前有关miRNA在调控山羊奶成分中的作用知之甚少。西北
首个miRNA药物进入临床试验
生物通编译:丹麦制药公司Santaris Pharma近日宣布SPC3649(LNA-antimiRTM-122)开始进入人体第一阶段的临床试验,这是世界上首个在人体中试验的microRNA药物。这项研究由哥本哈根Phase One Trials A/S组织管理,最多包含48名健康男性志愿者。公司同
高通量快速验证miRNA靶基因
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译
癌症miRNA研究获新进展
来自美芝加哥大学医学院,麻省总医院,Dana-Farber癌症研究所(Dana-Farber Cancer Institute),浙江大学附属第一医院等处的研究人员通过一项大规模的全基因组microRNA表达谱分析,识别出了能分辩AML和ALL(两种急性白血病)的miRNAs,为这种恶性肿瘤疾病的诊
miRNA,siRNA,shRNA有什么区别
siRNA是小干扰rna;shRNA是小发卡rna,一段rna单链,形成茎环结构部分双链的小rna siRNA可以是天然产生也可以是人工导入的,shRNA一般都是指人工的 shRNA多是用dna载体构建,在宿主内自行转录成shRNA,再加工成像siRNA一样的小RNA,目的为了模仿。
康乐院士PLOS发表miRNA重要成果
近期,来自山西大学、中科院动物研究所和中科院北京生命科学研究院的研究人员,在国际著名遗传学期刊《PLOS Genetics》在线刊登了题为“miR-71 and miR-263 Jointly Regulate Target Genes Chitin synthase and Chitinase
Nature-Medicine:掌控细胞生死的miRNA
瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH)的研究人员在β细胞中对microRNA开展研究时,发现了一种对压力下细胞死亡起关键作用的microRNA。研究结果发布在5月18日的《自然医学》(Nature Medicine)杂志上。 糖尿病是现代社会的重要祸患之一,糖尿病病例每年都在上升。全球已有超过3.8
测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNA
Science:miRNA控制蛋白表达的噪音
众所周知,一些microRNA能使特定基因的表达下调,然而,对于这些小的非编码RNA的更广泛用途,人们还不是太清楚。一项新的研究表明,miRNA可作为基因组噪音的阻尼器,控制蛋白表达的变化。这项成果发表于4月3日的《Science》杂志上。 miRNA的普遍和保守,再加上它们微弱抑制绝大多数目
检测血液中miRNA的简便技术
癌变肿瘤会脱落一些微小的指示遗传分子,称为microRNAs。最近,密歇根大学的研究人员开发出一种有效的方法,能在血液中检测到它们。相关研究结果发表在六月二十二日的《Nature Biotechnology》。 研究人员称,他们这种方法可通过一种廉价的血液测试,同时对多种类型的癌症进行筛选——
引发牛奶过敏的关键miRNA分子
根据最近发表在《Allergy》杂志上的一篇文章,miR-193a-5p是一个调节白介素-4(interleukin-4 ,IL-4)的关键转录后调控分子,这一调控机制进一步影响了儿童产生牛奶过敏的症状。 该研究的作者是来自意大利Naples Federico 第二大学的Valeria D
Cell新文章:miRNA,癌症的推手
就在25年前,人们还只是将非编码RNAs视作是整个基因组景观中的“背景噪音”。而现在越来越多的证据已经表明,它们广泛地参与了生命现象的各个环节,如生长、分化、发育、免疫,甚至在肿瘤的形成中也具有重要的调控作用。两项最新的研究发现揭示了,其中一种微小的非编码分子——miR-22在两种类型的癌症中发
Cell揭示miRNA调控新机制
来自波士顿大学儿童医院及哈佛医学院的研究人员发现,微处理器上游的一个生物合成步骤控制了miR-17∼92表达。这一重要的研究发现发布在8月6日的《细胞》(Cell)杂志上。 MicroRNAs (miRNAs)是一个调控RNA大家族,其主要通过与靶mRNA 3′端非翻译区(3′ UTR)互补配
做miRNA的PCR的方法介绍
加尾法和茎环法加尾法,是指把miRNA再人工加一个polyA的尾巴,这样它的结构就变长,有点象是典型的mRNA结构。很多公司提供有现成的miRNA加尾法逆转录试剂盒。按常规方法提取总RNA,用于逆转录。做完逆转录后,可参考的方法去做PCR。注意,这时的PCR需要的上下游引物,一般是上游引物就直接用m
Nature-Medicine:掌控细胞生死的miRNA
瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH)的研究人员在β细胞中对microRNA开展研究时,发现了一种对压力下细胞死亡起关键作用的microRNA。研究结果发布在5月18日的《自然医学》(Nature Medicine)杂志上。 糖尿病是现代社会的重要祸患之一,糖尿病病例每年都在上升。全球已有超过3.8
中国农大:玉米miRNA参与应答氮缺乏
虽然最近研究表明,miRNA能调节植物对于营养缺乏的适应性应答,但对于miRNA在氮缺乏适应性应答的功能仍需进一步探索。为了阐明玉米中氮传感与信号传导的分子生物学机制,中国农业大学李文学副教授领衔团队联合应用miRNA测序和降解组测序对玉米miRNA在氮缺乏条件下的调控作用展开了系统
miRNA调控植物对镉的应激反应
土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题,主要是由于一些人为活动,如采矿,工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉(Cd)可以很容易地被植物吸收,从而导致各种中毒症状,如降低生物量,叶片失绿,抑制根系生长,发生形态学改变,甚至植株死亡。大量研究表明,在植物中,microRNA(miRNA)参与
快速灵敏-让-miRNA-无处可逃
miRNA 是一种既可爱又可恨的小东西,它们深居简出,它们飘忽不定,它们似乎总是在和我们捉迷藏,当我们费尽力气以为即将要将它们掌控的时候,它却又顽皮的从我们的指缝中溜走,而我们却又毫无办法。同学莫怕,TIANGEN 即将上市的最新产品 miRcute 增强型 miRNA cDNA 第一链合成试
miRNA和siRNA的基本介绍及区别
1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是
miRNA研究之RNA提取试剂的选择
RNA提取试剂的选择RNA提取对于科研人员来说并不陌生,但是要得到好的结果却不是一件很容易的事情。事实上,现在市面上的丰富的RNA提取试剂基本上可以满足科研人员的需要,为什么往往提取的RNA却容易失败呢?RNA提取失败的主要现象有三个:提取的RNA降解、提取的RNA量偏低以及提取的RNA纯度低。究竟
Nature重要论文:抗癌miRNA的抑制因子
近日来自德克萨斯大学MD安德森癌症和肿瘤中心的研究人员发现,癌症促生长因子受体EGFR即便是在被拖入到细胞内快要遭到破坏的情况下,在溶解之前它也能得到激活,转而阻止肿瘤抑制microRNAs (miRNAs)生成。这一重要的研究发现发布在著名期刊《自然》(Nature)杂志上。 肿瘤常
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然,确定miRNA与mRNA之间的互作,我们还有更直接的方法,那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物(RISC)中的Argonaut(AGO)蛋白的抗体进行免疫共沉淀(co-IP)。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物,然后开展深度测序以鉴定发现的RNA,
miRNA荧光定量PCR结果怎么看
荧光定量我用罗氏的反应速度算是相当快的,在样本处理(提出核酸)后,放在荧光定量PCR仪器上一般需要30分钟~1小时左右.但是如果你的样本比如支原体的含量非常高,可能在没有运行结束已经可以看出结果了,但是如果说5分钟就出结果了,确实太快了点.如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个
RMVD患者左右心耳miRNA表达谱比较
心房颤动(Atrial fibrillation ,AF)是临床上最常见的持续性心律失常,其发病率和死亡率十分高。目前, AF相关的microRNA(miRNA)已在患粉丝性二尖瓣病(RMVD)患者的右心房(RA)和左心房(LA)中发现。然而,大多数的研究只关注RA;与LA相关的miRNA在
PNAS:首次发现miRNA家族共同的功能
生物通报道:德州大学西南医学中心的研究人员发现一组小RNA分子家族会影响进入胎盘的细胞发育,胎盘是氧气和营养物质给到胎儿的重要器官,研究人员指出 miRNA-515-5p 未来也许能作为血液检测,筛选先兆子痫患病风险。 这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上,文章通讯作者为
Nature子刊:调控代谢的miRNA开关
长久以来,科学家们一直梦想着能将讨厌的白色脂肪细胞转变为棕色脂肪细胞,由此轻易消除多余的体重。来自波恩大学的研究人员现在朝着这一目标又走近了一步:他们破译了小鼠体内的一个“切换开关”,其可以显著促进脂肪燃烧。研究结果现在发表在科学期刊《自然通讯》(Nature Communications)
南京医科大PLOS肺癌相关miRNA
8月19日,国际著名遗传学期刊《PLOS Genetics》在线刊登了南京医科大学、上海交通大学、河北北方学院等处的一项研究成果,题为“Reprogramming of Normal Fibroblasts into Cancer-Associated Fibroblasts by miRNAs