测序解析miRNA调控害虫发育机制

小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNAs,但仍缺乏对小菜蛾完整miRNA的鉴定。为此,来自中国农业大学和美国肯塔基大学的研究人员携手系统完整地鉴定了小菜蛾全部发育阶段的保守和新的 miRNAs2,该研究成果发表在11月刊的PLoS One上。 研究人员首先采用高通量测序技术对小菜蛾的miRNA组进行了全面鉴定(小RNA测序由联川生物承担完成)。实验中构建了小菜蛾(从卵到成虫)的整个发育阶段的混合小RNA文库。通过比对家蚕基因组和miRBase上已报道的miRNAs ,共鉴定出234个miRNAs。当使用小菜蛾的基因组数据作为参考时,可鉴定出34......阅读全文

测序解析miRNA调控害虫发育机制

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测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制

海参(Apostichopus japonicus),是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物,以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临,上层海水由于太阳光强烈照射,温度上升。此时,海底的小生物都浮到海面,进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参,迫于夏季食物中断,进入夏眠,此时,其基础代谢率明

中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制

  小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼

中海大:测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制

  海参(Apostichopus japonicus),是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物,以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临,上层海水由于太阳光强烈照射,温度上升。此时,海底的小生物都浮到海面,进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参,迫于夏季食物中断,进入夏眠,此时,其基础代谢

miRNA-mimics-miRNA-inhibitor

miRNA mimics 是模拟生物体 内源的miRNAs,运用化学合成的方法合成,能增强内源性miRNA的功能。miRNA inhibitor 是化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。近年来人工合成的miRNA(artificial miRNA,amiRNA)已经成功应用于沉默预期靶

南师大研究测序揭示小龙虾免疫相关miRNA

  克氏原螯虾(Procambarus clarkii),俗称“小龙虾”,是存活于淡水中一种像龙虾的甲壳类动物,也叫红螯虾或者淡水小龙虾。小龙虾是甲壳类中分布最广的外来入侵物种,因其杂食性、生长速度快、适应能力强而在当地生态环境中形成绝对的竞争优势,近年来,小龙虾在中国已经成为重要的经济养殖品种

miRNA海绵—长效抑制miRNA

随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么

miRNA海绵—长效抑制miRNA

miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困

miRNA研究

一、miRNA研究的基本问题和研究方法二、miRNA研究的综合解决方案1. miRNA微阵列芯片服务Agilent miRNA 芯片(21.0) Affymetrix miRNA 4.0 芯片2. miRNA测序服务  miRNA-seq文库构建流程  miRNA测序数据分析流程3. miRNA R

二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因

  野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代

二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因

野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测

BMC-Plant-Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因

  野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通

miRNA测序应用于阿尔茨海默氏症新机制的研究

阿尔茨海默氏症(Alzheimer's disease,AD)是一种神经性疾病。有研究表明,miRNA-Seq和全基因组测序鉴定到了一些非编码RNA可能参与了其中的疾病形成。竞争性内源RNA(ceRNA)是非编码RNA执行生物学功能的一种重要方式。然而,相对于其重要的生物学功能,只有部分

miRNA--克隆实验

实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达,还有一部分则起着调控基因表达的作用。实验材料 寡核

miRNA克隆实验

在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达,还有一部分则起着调控基因表达的作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主

miRNA克隆实验

            实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 维持着基因

Nature发布miRNA重要发现:脂肪细胞的miRNA信号

  脂肪细胞并不简单,Joslin糖尿病中心的科学家发现这种细胞并不只是静静的待在我们身体中,而且能释放出激素和其它信号蛋白,影响多种组织,其中一种竟然是miRNA。利用脂肪细胞研发基因治疗方法,也许能用于治疗肝脏或其它器官的代谢疾病,还有癌症等。  这一研究成果公布在2月15日的Nature杂志上

mirna-pcr电泳多久

一般是根据PCR产物大小和所用电压来决定时间的吧一般溴酚蓝跑到胶的1/3处就可以了。电压大,就时间短,第一次跑,还是在边上观察着点吧,分子小,时间不长的。

MicroRNA(miRNA)的概念

MicroRNA(miRNA):是含有茎环结构的miRNA前体,经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子(~21-23个核苷酸)。MiRNA,以及miRISCs(RNA-蛋白质复合物)在动物和植物中广泛表达。因之具有破坏目标特异性基因的转录产物或者诱导翻译抑制的功能,miRNA被认为在调控发

如何设计miRNA-mimics

miRNA mimic能模拟细胞中内源性成熟miRNA的高水平表达,以增强内源性miRNA的调控作用,是miRNA功能研究的一大利器。miRNA mimic是一种简单高效的miRNA研究工具,只需用转染试剂包裹即可转染进入细胞,无需构建载体的繁琐操作,无需病毒防护方面的担忧,用转染对照即可观察其转染

miRNA的qPCR检测

测序技术的引入促使miRNA研究领域进入快速发展阶段,然而qPCR仍是验证测序数据的重要标准。本文将为您介绍使用qPCR进行miRNA分析的基本要点,希望能帮助新人快速入门。什么是miRNA?miRNA是一类小的非编码RNA,能够与RNA诱导沉默复合物(RISC)结合,通过作用于mRNA,进而介导转

miRNA-qPCR-Detection-Primer-Set(miRNA检测试剂盒)实验说明

  一、概述   1、介绍   microRNA(miRNA)是一类有大约22 个核苷酸组成的非编码小分子RNA,其广泛存在于真核生物中。miRNA 在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式,都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此,对miRNA 的检测方法主要有Northe

miRNA-qPCR-Detection-Primer-Set(miRNA检测试剂盒)实验说明

一、概述1、介绍microRNA(miRNA)是一类有大约22 个核苷酸组成的非编码小分子RNA,其广泛存在于真核生物中。miRNA 在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式,都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此,对miRNA 的检测方法主要有Northern B

南师大:联合分析鱼类缺氧适应机制

  瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)是亚洲知名的经济鱼类。然而,突然缺氧会导致其死亡。研究鱼类缺氧适应的分子机制,不仅有助于理解鱼类物种和缺氧信号通路的演变,也将指导缺氧耐受鱼种的培育。尽管如此,对于鱼类miRNA与mRNA的基因调控网络,以及缺氧应答相关的信号通路仍然知之甚

micro-RNA(miRNA)综述3

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted- disruption缺失miR

Isolation-of-microRNA-(miRNA)

实验概要        This protocol utilizes the powerful guanidine isothiocyanate–phenol:chloroform extraction method which allows the rapid isolation of t

miRNA研究之RNA标记

RNA标记RNA标记是将标记物(如放射性同位素、荧光素或酶)共价地连接到RNA,通过检测标记物,进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛,在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求:1.  操作简单,灵敏度高2.  不影响碱基配对的特异性3.  不影响R

micro-RNA(miRNA)综述2

miRNA的作用方式最早被发现的两个miRNAs――lin-4 and let-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA3'非编码区端,以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制,进而抑制蛋白质合成,阻断mRNA的翻译。多个果蝇miRNAs也被发现和他们的目标靶mRNAs的3'非编码区

miRNA引物设计流程介绍

  MiRNA的命名原则可以大致归纳如下:   一个系统命名包含三部分内容,即物种,microRNA类别,序号。三者间用短线连接。物种一般用三个小写字母表示,如hsa,mmu和rno分别代表人,小鼠和大鼠。MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miR

micro-RNA(miRNA)综述1

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比RNA我们早前设想的更为重要。RNA干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化替代基因敲除而成为研究基因功能的