粘粒及质粒文库的铺平板和转移实验
实验材料 质粒试剂、试剂盒 LBNaOH氯霉素Tris·ClNaCl仪器、耗材 硝酸纤维素滤膜离心机布氏漏斗培养箱实验步骤 1. 在含抗生素的平板上,通过系列等比稀释确定质粒和粘粒文库的滴度,计算出最佳的铺平板用的细菌悬液量并稀释到5~10 ml LB培奍基中。 2. 准备一层无菌的10 cm 或15 cm的Whatman 3 MM 滤纸,故在玻璃布氏漏斗或瓷质过滤漏斗中,加入10~20 ml LB培养基。3. 将标记好方向的硝酸纤维素滤膜放入含抗生素的LB平板中,并移至过滤装置,再将细菌悬液用吸管加到滤膜上,注意不要往滤膜边缘4~5 mm 处加液体。 4. 慢慢抽吸液体,待菌悬液被吸干之后,揭下滤膜并移至含抗生素的平板中,置于37℃培养,直至长出直径达1~2 mm 的菌落。5. 标记并浸湿另一张硝酸纤维素滤膜。6. 先将长有克隆的滤膜(......阅读全文
相互作用蛋白的捕获实验
相互作用蛋白的捕获试验要经过两次连续大量的酵母菌平板筛选过程。酵母菌含有lexA 融合合探针,报道基因和插入pJG4-5的GAL启动子控制下的cDNA表达文库。实验材料酵母菌试剂、试剂盒CM培养基乙酸锂PEGTEDMSO甘油氨苄青霉素仪器、耗材离心机分光光度计摇床培养箱实验步骤1. 为了转化文库,
相互作用蛋白的捕获实验
基本实验 实验材料 酵母菌 试剂、试剂盒
相互作用蛋白的捕获实验
实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 CM培养基乙酸锂PEGTEDMSO甘油氨苄青霉素仪器、耗材 离心机分光光度计摇床培养箱实验步骤 1. 为了转化文库,将约20 ml 含pSH18-34和pBait 的酵母菌EGY48培养液接种到Glc/CM-Ura-His 省却成分液体培养基中,于30℃培养过夜。2.
通过杂交筛选未扩增的黏粒文库(滤膜影印)
经黏粒转化的稠密细菌菌落可通过杂交的方法筛选,该方法源于质粒转化菌落的大规模筛选(Hanahan and Meselon 1980)。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理经黏粒转化的稠密细菌菌落可通过杂交的方法筛选,该方法源于质粒转化菌落的大规模筛选(Hanahan and
双杂交和其他双成分系统实验(二)
第二阶段 筛选一个相互作用子材料缓冲液和溶液将贮存液稀释至适当的浓度二甲基亚砜(DMSO)乙醇可选择,请参见步骤 9。冻存转化体用的无菌甘油溶液65% 无菌甘油0.1mol/LMgS0425 mmol/L Tris-Cl(pH8.0)TE(pH7.5)(无菌)TE(pH7.5),含 0.1mol/
YAC实验——YAC文库构建
YAC带有天然染色体所有的功能元件,包括一个着丝粒,一个DNA复制起点,两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA,这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色体步移中每次允许更大的步移距离,同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。实验步骤1. 尽管当插入片段大于10
电转化连接物及构建抗体文库
实验概要本实验通过电转化连接物,构建了抗体文库。主要试剂1. SOC培养基(将20g细菌培养用胰蛋白胨、5g酵母提取物及0.5g NaCl溶于950ml水中。加入10m1 250mmol/L KCl,5mol/L NaOH调整pH至7.0并加入去离子水至IL。高压灭菌。手感变凉后,再加入5m
YAC克隆的分析实验——基本方案
YAC带有天然染色体所有的功能元件,包括一个着丝粒,一个DNA复制起点,两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA,这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色体步移中每次允许更大的步移距离,同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。实验材料酵母菌试剂、试剂盒AHCYPD
用噬菌粒载体制备单链DNA
噬菌粒巧妙地组合了质粒和丝状噬菌体的特征。除了基本特征外,这些质粒通常是高拷贝数的,并带有一个修饰后的丝状噬菌体的主要基因间区。这个区域 ( 野生型为 508 bp)不表达蛋白,但含有全部的顺式作用序列,该作用是病毒 DNA 合成起始和结束及噬菌体颗粒的形态发生必不可少的。本实验来源「分子克隆实验指
噬菌体文库的扩增实验
实验材料 噬菌体试剂、试剂盒 MgSO4麦芽糖琼脂糖氯仿DMSOSM仪器、耗材 离心机分光光度计水浴锅实验步骤 1. 制备铺平板菌(1)2.5 ml 新鲜过夜培养的宿主菌液接种于250 ml 含0.2%麦芽糖和10 mmol/l MgSO4的LB培养液中。(2)在37℃恒温摇床剧烈摇荡2~4 h,
噬菌体文库的扩增实验
基本方案 实验材料 噬菌体 试剂、试剂盒
真核表达文库的构建与筛选实验
实验材料 宿主细胞 质粒或λ噬菌体表达载体 包装提取物 电转化感受态大肠杆菌 试剂、试剂盒
真核表达文库的构建与筛选实验
实验材料 宿主细胞质粒或λ噬菌体表达载体包装提取物电转化感受态大肠杆菌试剂、试剂盒 限制性内切核酸酶缓冲液限制性内切核酸酶通过 poly(A)+富集的 mRNAcDNA 文库含适当抗生素的 Terrific 球脂平板含适当抗生素的 Terrific 肉汤培养基仪器、耗材 cDNA 合成试剂盒实验步骤
真核表达文库的构建与筛选实验
类似方案 1、方案 2 描述了在真核表达载体上进行 cDNA 文库构建与筛选的方法, 流程分为以下两个阶段:1. 在真核表达载体上构建 cDNA 文库;2. 在真核表达载体上构建的 cDNA 文库的筛选。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。实验材料宿主细胞质粒或λ噬菌体表达载体
通过杂交筛选未扩增的黏粒文库(滤膜影印)
实验方法原理 经黏粒转化的稠密细菌菌落可通过杂交的方法筛选,该方法源于质粒转化菌落的大规模筛选(Hanahan and Meselon 1980)。实验步骤 一、材料1. 培养基含 25 μg/ml 卡那霉素的 TB 琼脂平板(150 mm )TB 培养基2. 专用设备厚玻璃板皮下注射针头(17号)
通过杂交筛选未扩增的黏粒文库(滤膜影印)
实验方法原理 经黏粒转化的稠密细菌菌落可通过杂交的方法筛选,该方法源于质粒转化菌落的大规模筛选(Hanahan and Meselon 1980)。 实验步骤
应用黏粒载体构建基因组DNA文库
在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中,真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接,形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体形式贮存和增殖。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理
应用黏粒载体构建基因组DNA文库
实验方法原理 在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中,真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接,形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体
应用黏粒载体构建基因组DNA文库
实验方法原理 在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中,真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接,形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体形式贮存和增殖。实验材料 T4 噬菌体 DNA 连接酶牛小肠碱
分子克隆常用载体(质粒、单链丝状噬菌体和噬粒)
DNA 片段的克隆需要合适的载体,载体或是质粒,或是噬菌体,或是病毒,通常大多经过人工改造[地的。作为载体必须具备两条件:一是该载体在细胞内必须能自主复制,即必须具备复制原点;二是该载体必须具备适合的酶切位点,且这些酶切位点不在复制原点区域内。以上两条,保证了载体的可繁殖性和可利用性。为了便于获
质粒的酵母直接转化
实验方法原理将待测基因与Gal4或LexA或其他合适蛋白的DNA结合域融合构建诱饵质粒;将诱饵质粒转化缺乏报告基因启动子的酵母细胞株中,选择被转化的酵母;再将文库质粒转化到酵母中实验材料单菌落试剂、试剂盒PLATE溶液载体DNA转化质粒DNA仪器、耗材离心管离心机实验步骤1、 用牙签从平板中挑取单菌
质粒DNA的大量提取和纯化实验
碱法 实验材料 细菌 试剂、试剂盒 ST
质粒DNA的大量提取和纯化实验
实验材料 细菌试剂、试剂盒 STE酚 氯仿NaClPEG乙醇仪器、耗材 离心管离心机抽干机实验步骤 1、取培养至对数生长后期的含pBS质粒的细菌培养液250 ml,4 ℃下5000 g离心15分钟,弃上清,将离心管倒置使上清液全部流尽。2、将细菌沉淀重新悬浮于50 ml用冰预冷的STE中(此步可省略
筛选构建于λ噬菌体载体的表达文库实验(一)
试剂、试剂盒 封闭缓冲液氯仿IPTG抗原-抗体复合物检测试剂SMTNT 缓冲液洗涤缓冲液放射性碘标记第二抗体第一抗体LB 琼脂板LB 顶层琼脂板硝酸纤维素滤膜λ噬菌体表达文库E.coli仪器、耗材 预设 42°C 的空气培养箱培养管平头镊子装有防水黑墨水(印度墨水)并带有 18 号针头的注射器实验步
用噬菌粒载体制备单链DNA
实验方法原理 噬菌粒巧妙地组合了质粒和丝状噬菌体的特征。除了基本特征外,这些质粒通常是高拷贝数的,并带有一个修饰后的丝状噬菌体的主要基因间区。这个区域 ( 野生型为 508 bp)不表达蛋白,但含有全部的顺式作用序列,该作用是病毒 DNA 合成起始和结束及噬菌体颗粒的形态发生必不可少的。实验材料
用噬菌粒载体制备单链DNA
实验方法原理 噬菌粒巧妙地组合了质粒和丝状噬菌体的特征。除了基本特征外,这些质粒通常是高拷贝数的,并带有一个修饰后的丝状噬菌体的主要基因间区。这个区域 ( 野生型为 508 bp)不表达蛋白,但含有全部的顺式作用序列,该作用是病毒 DNA
酵母双杂交系统的实验步骤
酵母双杂交系统的实验步骤 1. 将报告基因p8op-LacZ转化酵母EGY48菌株,用培养基SD/-Ura筛选。2. 同时构建DNA文库,并纯化足够的质粒以转化酵母细胞。3. 构建DNA-BD/靶蛋白质粒pLexA-X,作为钓饵(bait)。4. 将上述钓饵质粒pLexA-X转化EGY48(p8op
双杂交和其他双成分系统实验(三)
方法转化文库1. 挑选一个在第一阶段的原始对照试验中状态最好的表达诱饵蛋白和 lexAop-lacZ 报道子的酵母菌落,接种于 20 ml CM(Glu)-Ura-His 液体培养基中,30°C 摇动过夜培养。重要:应该在用文库重新转化之前 7~10d 内,将诱饵蛋白和 lexAop-lacZ 报道
质粒的转化及转化子的鉴定实验
实验方法原理 热激法:大肠杆菌在0 ℃ CaCl2低渗溶液中,菌细胞膨胀成球形,转化混合物中的DNA形成抗DNase的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面,经42 ℃短时间热冲击处理,促进细胞吸收DNA复合物,在丰富培养基上生长数小时后,球状细胞复原并分裂增殖。在被转化的细胞中,重组子基因得到表
酵母菌基因组转座子的诱变实验
基本方案 小载体聚合酶链反应 mTn诱变基因产物的表位标记 实验方法原理 实验材料