脉冲场凝胶电泳制备DNA(酵母完整DNA的分离)
实验方法原理 制备用于电泳的酵母 DNA,先用酶破坏酵母细胞胞壁,然后在熔化的低熔点琼脂糖中混悬,制成栓。将栓浸入含蛋白酶的裂解缓冲液,以加速细胞裂解和除去蛋白质。此方法在 Schwartz 和 Cantor (1984) 最初介绍的方法上略有改进,它可用于制备作为 高分子质量标准的酵母染色体和酵母人工染色体(YAC)。实验材料 酵母混悬培养物试剂、试剂盒 细胞清洗缓冲液EDTAL 缓冲液TE酵母裂解缓冲液酵母细胞壁消化酶酶解酶仪器、耗材 低熔点琼脂糖Sorvall GSA 转头或相当型号的转头预成型的 Plexiglas 模具实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液细胞清洗缓冲液(0.01 mol/L Tris-Cl ( pH 7.6),0.05 mol/L EDTA ( pH 8.0),室温存放。)EDTA ( 0.05 mol/L, pH 8.0)L 缓冲液(0.1 mol/L EDTA ( pH 8.0),0.0......阅读全文
横向交变场的脉冲场凝胶电泳
实验方法原理 Gardiner 等(1986; Gardiner and Patterson 1989) 使用置于垂直凝胶两侧的两组铂线电极的凝胶电泳装置以分离大的 DNA 片段。在这种横向交变场电泳(transverse alternating field electrophoresis,
横向交变场的脉冲场凝胶电泳
实验方法原理 Gardiner 等(1986; Gardiner and Patterson 1989) 使用置于垂直凝胶两侧的两组铂线电极的凝胶电泳装置以分离大的 DNA 片段。在这种横向交变场电泳(transverse alterna
向交变场的脉冲场凝胶电泳
Gardiner 等(1986; Gardiner and Patterson 1989) 使用置于垂直凝胶两侧的两组铂线电极的凝胶电泳装置以分离大的 DNA 片段。在这种横向交变场电泳(transverse alternating field electrophoresis, TAFE) 中 ,当
酵母遗传学方法1:DNA分离
酵母DNA分离1)酵母DNA微量制备(40ml)1.在125ml三角瓶中用40ml YPD培养液在30℃条件下培养细胞达最大生长量(过夜)。2.将上述培养物移入螺盖离心管,用医用离心机或Sorvall SS-34转头以5000r/min离心5分钟,弃去上清液。3.将细胞悬浮在3ml的0.9mol/L
脉冲场凝胶电泳(PFGE)概述
脉冲场凝胶电泳(PFGE)的原理大致为:细菌包埋于琼脂块中,用适当的内切酶在原位对整个细菌染色体进行酶切,酶切片段在特定的电泳系统中通过电场方向不断交替变换及合适的脉冲时间等条件下而得到良好的分离。PFGE中内切酶的选用至关重要,所采用的内切酶常为寡切点酶(lowfrequencycleavager
脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验
实验概要本实验利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分离了大分子DNA。实验原理大分子DNA(一般长度超过20kb,在某些情况下,超过40kb)在电场作用下通过孔径小于分子大小的凝胶时,将会改变无规卷曲的构象,沿电场方向伸直,与电场平行从而才能通过凝胶。此时,大分子通过凝胶的方式相同,迁移率无差别(也称“极
脉冲场凝胶电泳(PFGE)概述
脉冲场凝胶电泳(PFGE)的原理大致为:细菌包埋于琼脂块中,用适当的内切酶在原位对整个细菌染色体进行酶切,酶切片段在特定的电泳系统中通过电场方向不断交替变换及合适的脉冲时间等条件下而得到良好的分离。PFGE中内切酶的选用至关重要,所采用的内切酶常为寡切点酶(low frequency cle
酵母基因组DNA的玻珠制备法
实验概要本实验利用玻珠制备法制备了酵母基因组DNA。主要试剂无菌水,裂解缓冲液,5mol/L NaCl,苯酚,氯仿:已戊醇(24:1),乙醇,TE缓冲液,EDTA-Sark,蛋白酶K,5mol/L醋酸铵主要设备摇床,玻璃离心管,台式离心机,玻珠,振荡器,P-1000移液器,1.5ml离心管实验步骤1
脉冲场凝胶电泳实验——倒转电场
脉冲场凝胶电泳是在两个不同方向的电场周期性交替进行的,可分离长至5Mb的DNA分子,其工作原理是DNA分子在交替变换方向的电场中作出反应所需的时间取决于它的大小。较小的分子重新定向较快,因而在凝胶中移动也较快,于是不同大小的分子被成功分离。实验材料DNA试剂、试剂盒GTBETBE琼脂糖仪器、耗材电泳
脉冲场凝胶电泳的应用领域
脉冲场凝胶电泳在生物基因分型、分子流行病学研究、细胞凋亡、追踪传染源、兽医流行病诊断辅助、食品和公共健康及染色体DNA分离等研究中有广泛应用。追踪传染源脉冲场凝胶电泳用于评估同一事件中不同来源菌株可能存在的关系,是溯源的有用技术之一。当疫情爆发时, 为了采取有针对性的措施,对该疫情进行合理有效地防控
脉冲场凝胶电泳的分子质量标准
实验方法原理 PFGE 用于分离很大的 DNA 分子,因而需要很高分子质量的标准。这种标准可以按照 Lauer 等(1977 ) 介绍的方法从噬菌体,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取获得。但是一个更好的覆盖范围更广的系列标准是 λ 噬菌体 DNA
脉冲场凝胶电泳的分子质量标准
PFGE 用于分离很大的 DNA 分子,因而需要很高分子质量的标准。这种标准可以按照 Lauer 等(1977 ) 介绍的方法从噬菌体,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取获得。但是一个更好的覆盖范围更广的系列标准是 λ 噬菌体 DNA 的系列串联体。后面介绍的具
脉冲场凝胶电泳的分子质量标准
实验方法原理 PFGE 用于分离很大的 DNA 分子,因而需要很高分子质量的标准。这种标准可以按照 Lauer 等(1977 ) 介绍的方法从噬菌体,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取获得。但是一个更
箝位匀强电场的脉冲场凝胶电泳
箝位匀强电场(contour-clamped homogeneous electric field, CHEF) 凝胶电泳中, 电场是由多个电极产生的。这些电极围绕水平凝胶呈四边形或六边形,其电位被箝制在顶先设定的水平(Chuetal. 1986; Vollrath and Davis 1987;
箝位匀强电场的脉冲场凝胶电泳
实验方法原理 箝位匀强电场(contour-clamped homogeneous electric field, CHEF) 凝胶电泳中, 电场是由多个电极产生的。这些电极围绕水平凝胶呈四边形或六边形,其电位被箝制在顶先设定的水平(Ch
箝位匀强电场的脉冲场凝胶电泳
实验方法原理 箝位匀强电场(contour-clamped homogeneous electric field, CHEF) 凝胶电泳中, 电场是由多个电极产生的。这些电极围绕水平凝胶呈四边形或六边形,其电位被箝制在顶先设定的水平(Chuetal. 1986; Vollrath and
DNA凝胶电泳(DNA-agarose-gel-electrophoresis)
实验原理琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA分子混合物的方法,这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分
将DNA导入酵母细胞实验_单链高分子质量载体DNA的制备
实验材料待转化的酵母菌株试剂、试剂盒 DNA (从鲑鱼精巢制备的DNA III型钠盐 Sigma #D1626)l×TE缓冲液 pH 8.0 缓冲液平衡酚1: 1 (W)酚 氯仿氯仿3 mol L 乙酸钠 pH 5.2100%乙醇 冰冷仪器、耗材超声波发生器实验步骤1) 将DNA溶于pH 8.0的1
采用Agilent-Femto-Pulse系统对不同基因组DNA提取进...(一)
采用Agilent Femto Pulse系统对不同基因组DNA提取进行质量评估作者Chava Pocernich,Jolita Uthe,Steve Siembieda 安捷伦科技有限公司摘要Agilent Femto Pulse 系统采用革命性设计,是唯一一款能够自动进行高分子量 (HMW)
叶绿体DNA分离
设备:Hitachi CS-150GXL或CS-120GXL微量超速离心机,S100AT6 转头,5PA 密封管(如果用4PC管,可接比例减少各层液量)溶液配制:A液:0.35Msorbitol(山梨醇),50mM Tris—Hcl (PH8.0) 25mM EDTA—Na2B液:5%(w/w)So
酵母人工染色体的应用
直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理直到 20 世纪 80 年代
胸腺DNA的制备
实验概要本实验介绍了浓盐法小牛胸腺DNA制备的原理及操作步骤。实验原理DNA在生物体内是以与蛋白质形成复合物的形式存在的,因此提取出脱氧核糖核酸蛋白复合物(DNP)后,必须将其中的蛋白质除去。小牛胸腺,鱼类精子和植物种子的胚等含有丰富的DNA,可作为提取DNA的良好材料。动物和植物组织的脱氧核糖核蛋
酵母人工染色体的应用
实验方法原理 直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。实验材料 酿酒酵母试剂、试剂盒 甘油仪器、耗材 脉冲场凝胶电泳仪选择性培养
酵母人工染色体的应用
实验方法原理 直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。
琼脂糖凝胶电泳仪分离DNA片段的范围
琼脂糖凝胶电泳仪是以琼脂糖凝胶作为载体的电泳,广泛用于核酸的研究,为DNA分子及其片段的分子量测定和DNA分子构象分析提供了重要手段。不同浓度的琼脂糖凝胶分离DNA段的范围如下:一、凝胶总浓度:0.3%dsDNA段的分离范围:5~60kb二、凝胶总浓度:0.6%dsDNA段的分离范围:1~20kb三
克隆化酵母DNA的操作实验
实验材料 酵母实验步骤 将待研究的基因亚克隆到YIP质粒。2. 用限制性内切酶在克隆化基因内部切开,使质粒线性化。3. 用1~10 μg DNA加上担体DNA转化适合的菌株,通过质粒上带的标记进行选择,在选择培养基上纯化几个转化子,制备DNA,应用Southern 杂交确证整合是否发生在所期
DNA的凝胶电泳(gel-electrophoresis)
一、原理琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶是分离和纯化DNA片段的标准方法。聚丙烯酰胺凝胶电泳适用于分离小分子的核酸;琼脂糖凝胶孔径较大,被应用于大分子核酸的分离和纯化。在一定浓度的琼脂糖凝胶介质中,DNA分子的电泳迁移率与其分子量的常用对数成反比。当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶(EB)染色,在紫外光下至少可
制备互补DNA的方法
制备互补DNA,往往需要先分离从目的基因转录来的mRNA.如果该基因编码的蛋白质是细胞中的主要蛋白质,则此基因的产物是总mRNA的主要组成部分。就胰岛B细胞而论,此细胞含有高水平胰岛素前体mRNA,后者有时可以沉淀正在翻译的mRNA的核糖核蛋白体,如果用特异抗体结合所表达的蛋白质(抗原),则可从沉淀
质粒DNA的大量制备
实验概要本方法用于从细菌中提纯大量质粒DNA。主要试剂1. STE 0.1mol/L NaCl 10mmol/L Tris.Cl(pH8.0) 1mmol/L EDTA(pH8.0) 2. 溶液I 50mmol/L葡萄糖 25mmol/L Tris.Cl(pH8.0) 10mmol/L EDTA(
DNA片段的制备方法
常用以下方法获得DNA片段:①用限制性核酸内切酶将高分子量DNA切成一定大小的DNA片段;②用物理方法(如超声波)取得DNA随机片段;③在已知蛋白质的氨基酸顺序情况下,用人工方法合成对应的基因片段;④从mRNA反转录产生cDNA。