cDNA5’末端的快速扩增(5’RACE)
实验方法原理 在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条链往往 5' 末端不完整。实验材料 反转录酶末端脱氧核苷酸转移酶末端转移酶缓冲液热稳定 DNA 聚合酶试剂、试剂盒 扩增缓冲液氯仿dATPdNTP 贮存液胎盘 RNase 抑制剂TE反转录酶缓冲液仪器、耗材 琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶制备型离心机SorvallSS - 34 转头实验步骤 一、材料1. 缓冲液与溶液10X 扩增缓冲液氯仿dATP ( 1 mmol/L,二钠盐)4 种 dNTP 贮存液(20 mmol/L, pH 8.0)胎盘 RNase 抑制剂(20 单位/μl)TE ( pH 7.6)2. 酶与缓冲液5X 反转录酶缓冲液反转录酶(......阅读全文
RACE-PCR简介
近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA
RACEPCR克隆基因的几点建议
摘 要: RACE是一种快速克隆cDNA末端的方法,目前, 该方法被广泛应用于未知碱基序列基因的克隆,尤其是SMART RACE技术更为人们所青睐。本文总结了我们实验室用SMART RACE技术克隆基因的一些心得体会,希望对用RACE方法克隆基因的同行有些帮助。关键词: RACE; RNA提取;
RACE技术的原理和操作
近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA
RACE技术在基因工程抗体中的应用
前言20世纪80年代后期,随着分子生物学的迅速发展,使得人们可以通过基因工程技术对天然的分子进行人为的改造,这为抗体药物带来了新的突破点和希望。了解和阐明抗体分子的结构及功能,为人类疾病诊断及治疗提供了新的推动力。基因工程抗体 为了解决传统的鼠源性单抗存在的弊端,对鼠源性单抗进行改进以及人源化单抗的
RACE(rapidamplification-of-cDNA-ends)技术2
具体的实验步骤cDNA第一条链的合成:我们建议进行cDNA合成的对照反应,这样可以对样品的 cDNA的合成进行鉴定。加入各种试剂之后,在气浴中42度保温一个小时。注意: 在水浴或酒精浴中保温回减少反应体积,从而降低第一链的合成效率。将管放于冰上,以终止第一链的合成反应。直接进行第二链的合成。cDNA
RACE(rapidamplification-of-cDNA-ends)技术1
RACE技术的简介cDNA完整序列的获得对基因结构、蛋白质表达、基因功能的研究至关重要。完整的cDNA 序列可以通过文库的筛选和末端克隆技术获得。末端克隆技术是20世纪80年代发展起来的。RACE(rapid-amplification of cDNA ends)是通过PCR进行cDNA末端快速克隆
cDNA文库组标准流程5
4EcoRIadaptor加接:1.往双链 cDNA沉淀中加入9ulEcoRI adaptor(400ng/ul),4℃至少放置30分钟以充分溶解cDNA沉淀;2.溶解完成后,顺序加入下列试剂:1.2ul 10×Ligase Buffer1ul 10mMrATP1ul T4DNA Ligase(4U
RACE的原理、应用和优缺点(二)
三、RACE 的应用 RACE技术主要是应用于对全长cDNA序列的获得,但对该技术进行一定的修改后,也可在其它方面显示出极高的应用价值。 首先,RACE技术可用于cDNA文库的构建及筛选。Belyavaasky等(1989)用10个骨髓瘤细胞分离的总RNA,通过TdT加同聚尾、(dT)
PCR仪得不到全长的5’RACE-PCR产物
*CIP反应后的RNA降解产生了新的带有5’磷酸的断裂模板,可以同GeneRacer RNA Oligo连接。一定要小心操作,保证RNA无降解。 *CIP脱磷酸不完全,可以增加反应中CIP的量或减少RNA的量。 *PCR产生了杂带,并不是真正的连接产物,可以使用上述建议优化PCR。
全长cDNA文库的构建—SMART技术
真核细胞的mRNA在加工过程中有一个比喻为“穿鞋戴帽”的过程,因此mRNA的3'末端都带有一段Poly A,这是利用逆转录酶制备cDNA文库的基础。但是由于cDNA的5'端的序列各不相同,如何获得全长的cDNA,如何扩增由微量的mRNA逆转录得到的cDNA文库、如何利
SMART技术
真核细胞的mRNA在加工过程中有一个比喻为“穿鞋戴帽”的过程,因此mRNA的3’末端都带有一段Poly A,这是利用逆转录酶制备cDNA文库的基础。但是由于cDNA的5’端的序列各不相同,如何获得全长的cDNA,如何扩增由微量的mRNA逆转录得到的cDNA文库、如何利用已知片断序列得到全长的cD
SMART技术简介
真核细胞的mRNA在加工过程中有一个比喻为“穿鞋戴帽”的过程,因此mRNA的3’末端都带有一段Poly A,这是利用逆转录酶制备cDNA文库的基础。但是由于cDNA的5’端的序列各不相同,如何获得全长的cDNA,如何扩增由微量的mRNA逆转录得到的cDNA文库、如何利用已知片断序列得到全长的cDNA
RLMRACE法合成双链cDNA
实验概要掌握合成双链cDNA的RLM-RACE技术,可构建高质量的cDNA文库。主要试剂1. 酶类及分子量标准 1) 高保真酶Easy-A high fidelity cloning enzyme,Merck公司Stratagene系列; 2) Taq DNA Polymerase,上海申
功能基因-cDNA-3’末端的克隆
一.原理 (1) 以目的mRNA 为模板,使用Oligo dT-3sites Adaptor Primer 进行反转录反应,合成1st Strand cDNA。 (2) 使用含有KpnI、XbaI、BamH I 酶切位点的上游特异性引物和3sites Adaptor Primer进行PCR反应。 (
帽子转换-RACE-实验
试剂、试剂盒 寡核苷酸引物cDNA 文库HerculesHot-Start 聚合酶HerculesHot-Start 聚合酶缓冲液dNTP 溶液TE反转录缓冲液RNasinSuperscript II 逆转录酶生物素标记的引物 Ptotal帽子发现接头引物poly(A)+RNA仪器、耗材 热
帽子转换-RACE-实验
试剂、试剂盒 寡核苷酸引物 cDNA 文库 HerculesHot-Start 聚合酶 HerculesHot-Start 聚合酶缓冲液 dNTP 溶液
线形质粒DNA-5粘性末端去磷酸实验
实验材料 质粒试剂、试剂盒 CIAPEDTABUFFER酚-氯仿乙醇TE仪器、耗材 水浴锅抽干机实验步骤 1、质粒DNA和CIAP以及BUFFER 37 ℃水浴30min 2、补充CIAP 再37 ℃水浴30min 3、加入50 mM EDTA至终浓度5 mM 75 ℃加热10min 失活CIAP
寡核苷酸5末端磷酸化实验
试剂、试剂盒 T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液Tris-ClT4噬菌体多核苷酸激酶寡核苷酸[γ-32P]ATP仪器、耗材 微量离心管水浴箱实验步骤 材料缓冲液与溶液稀释贮存液至适当浓度10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液Tris-Cl(1mol/L,pH8.0)酶和缓冲液T4噬菌体多核苷酸激酶野生型T4噬
寡核苷酸5末端磷酸化实验
以下介绍的是标记 10pmol 高比活度的寡核苷酸的反应,标记不同量的寡核苷酸可以通过增加或减少反应体积而保持各组分的相应浓度来实现。也可用类似的反应条件,将非放射性的磷酸加到用于定点突变的合成寡核苷酸 5'末端。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒T4噬菌
寡核苷酸5末端磷酸化实验
试剂、试剂盒 T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液 Tris-Cl T4噬菌体多核苷酸激酶 寡核苷酸 [γ-32P]ATP
帽子转换-RACE-实验
这里介绍的方法,是用一个生物素化的引物来帮助纯化第一链产物。这些纯化技术是可以互换的。与之类似,使用这里所介绍的基于寡核苷酸-(dT) 的引物,在反转录的起始阶段使用的基因特异性引物(如上所述)也是可以互换的。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒寡核苷酸引物cD
cDNA-扩增和影印实验
实验材料保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列试剂、试剂盒LB 培养基超级肉汤培养基乙醇裂解液RNA 酶溶液缓冲液乙醇 乙酸溶液丁二酸酐1-甲基-2-吡咯烷酮硼酸钠仪器、耗材离心机96 孔热循环仪水浴锅微量滴定板清洗仪实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 将密
cDNA-扩增和影印实验
实验方法原理 实验材料 保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列 试剂、试剂盒
cDNA-扩增和影印实验
实验方法原理 实验材料 保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列试剂、试剂盒 LB 培养基超级肉汤培养基乙醇裂解液RNA 酶溶液缓冲液乙醇 乙酸溶液丁二酸酐1-甲基-2-吡咯烷酮硼酸钠仪器、耗材 离心机96 孔热循环仪水浴锅微量滴定板清洗仪实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具
cDNA文库组标准流程八:pBlueScript-cDNA库扩增
1.试剂及配方:2 x LB (1升): 20g 氯化钠 20g 蛋白提取物 10g 酵母提取物 加入蒸馏水至1升,用NaOH调pH值至7.0,高压灭菌2 x LB-甘油(12.5%)(200ml)175ml 2 x LB液体2
功能基因cDNA3#39;末端的克隆
一.原理(1) 以目的mRNA 为模板,使用Oligo dT-3sites Adaptor Primer 进行反转录反应,合成1st Strand cDNA。(2) 使用含有KpnI、XbaI、BamH I 酶切位点的上游特异性引物和3sites Adaptor Primer进行PCR反应。(3)
脊索瘤相关基因鉴定及筛查实验
实验方法原理 真核生物的mRNA 5′端有个帽子结构,3′端有长约200 bp 的poly(A)尾巴。据此特点,可设计一种与其互补的序列oligo dT,为了把它锚定在poly(A)尾的起始端,将其设计成T12MN(M=A/C/G;N=A/T/C/G),这样T12MN 就有12 种不同的
线形质粒DNA-5粘性末端去磷酸实验——抽提法
实验材料质粒试剂、试剂盒CIAPEDTABUFFER酚-氯仿乙醇TE仪器、耗材水浴锅抽干机实验步骤1、质粒DNA和CIAP以及BUFFER 37 ℃水浴30min 2、补充CIAP 再37 ℃水浴30min 3、加入50 mM EDTA至终浓度5 mM 75 ℃加热10min 失活CIAP 4、冷却
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验5
实验材料cDNA实验步骤1. 首先是对所得 cDNA 进行同源性的比较。通常是在 NCBl 的 GenBank 数据库中来完成,利用 Blast 程序,比较其与已知基因的同源性。2. 判断是否为完整的 cDNA 序列:如有无 polyA,有无起始和终止密码寻找开放性阅读框架(ORF,open rea
末端转移酶的应用介绍
末端转移酶在分子生物学中的应用。它可以被用来在cDNA末端的快速扩增(RACE)中来添加"核苷酸"(nucleotide),然后可以用来作为在后续PCR的"引物"(primer)的模板。它也可以用于添加标记放射性同位素的核苷酸,例如在TUNEL检测(末端脱氧核苷酸转移酶"dUTP缺口末端标记"(dU