寡核苷酸5末端磷酸化实验
试剂、试剂盒 T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液Tris-ClT4噬菌体多核苷酸激酶寡核苷酸[γ-32P]ATP仪器、耗材 微量离心管水浴箱实验步骤 材料缓冲液与溶液稀释贮存液至适当浓度10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液Tris-Cl(1mol/L,pH8.0)酶和缓冲液T4噬菌体多核苷酸激酶野生型T4噬菌体多核苷酸激酶是一种5‘磷酸转移酶和一种3'-磷酸酶(Depew and Cozarelli 1974;Sirotkin et al,1978)。而突变型酶(请见Cameron et al.1978)己失去磷酸酶活性而完全保留了磷酸转移酶活性,且可通过商品渠道获得(Behringer Mannheim公司)。因此,如可能,我们推荐使用突变型酶进行5'端标记。催化10~50pmol的5’端无磷酸末端的磷酸化需要10-20单位酶。重要:不同商家提供的多核苷酸激酶催化单链合成寡梭苷酸5‘端磷酸化的活性有很大的差......阅读全文
寡核苷酸5末端磷酸化实验
试剂、试剂盒 T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液Tris-ClT4噬菌体多核苷酸激酶寡核苷酸[γ-32P]ATP仪器、耗材 微量离心管水浴箱实验步骤 材料缓冲液与溶液稀释贮存液至适当浓度10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液Tris-Cl(1mol/L,pH8.0)酶和缓冲液T4噬菌体多核苷酸激酶野生型T4噬
寡核苷酸5末端磷酸化实验
以下介绍的是标记 10pmol 高比活度的寡核苷酸的反应,标记不同量的寡核苷酸可以通过增加或减少反应体积而保持各组分的相应浓度来实现。也可用类似的反应条件,将非放射性的磷酸加到用于定点突变的合成寡核苷酸 5'末端。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒T4噬菌
寡核苷酸5末端磷酸化实验
试剂、试剂盒 T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液 Tris-Cl T4噬菌体多核苷酸激酶 寡核苷酸 [γ-32P]ATP
用经典-RACE-扩增-cDNA-的5’末端实验
试剂、试剂盒 GSP-RT 引物 poly(A)+RNA 或总 RNA 反转录缓冲液 RNA 酶 H RNasin SuperScriptI
用经典-RACE-扩增-cDNA-的5’末端实验
试剂、试剂盒 GSP-RT 引物poly(A)+RNA 或总 RNA反转录缓冲液 RNA 酶 HRNasinSuperScriptII 逆转录酶dNTP 溶液DTTTECoCl2dATP 溶液脱氧核苷酸末端转移酶加尾缓冲液 HerculesHot-Start 聚合酶HerculesHot
用经典-RACE-扩增-cDNA-的5’末端实验
这一实验方案分为 3 个阶段。 第 1 阶段:反转录产生 cDNA 模板 ;第 2 阶段:在第一链 cDNA 产物末端加 poly(A) 尾 ;第 3 阶段:扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒GSP-RT 引物poly(A)+RNA 或总 RNA反转录缓
线形质粒DNA-5粘性末端去磷酸实验
实验材料 质粒试剂、试剂盒 CIAPEDTABUFFER酚-氯仿乙醇TE仪器、耗材 水浴锅抽干机实验步骤 1、质粒DNA和CIAP以及BUFFER 37 ℃水浴30min 2、补充CIAP 再37 ℃水浴30min 3、加入50 mM EDTA至终浓度5 mM 75 ℃加热10min 失活CIAP
cDNA-5’末端的快速扩增(5’RACE)
实验方法原理 在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条
cDNA-5’末端的快速扩增(5’RACE)
在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条链往往 5' 末端不完整。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂
cDNA-5’末端的快速扩增(5’RACE)
实验方法原理 在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条链往往 5' 末端不完整。实验材料 反转录酶末端脱氧核
关于同聚寡核苷酸末端连接的基本介绍
同聚寡核苷酸末端连接(也叫同聚物加尾连接、同聚末端连接),是在脱氧核苷酸转移酶(terminal transferase,也称DNA 转移酶、末端转移酶) 的作用下可以在DNA 的3'; 一羧基端合成低聚多核苷酸(添加同聚物造成延伸部分)。如果把所需要的DNA 片段接上低聚腺嘌呤核苷酸(d
线形质粒DNA-5粘性末端去磷酸实验——抽提法
实验材料质粒试剂、试剂盒CIAPEDTABUFFER酚-氯仿乙醇TE仪器、耗材水浴锅抽干机实验步骤1、质粒DNA和CIAP以及BUFFER 37 ℃水浴30min 2、补充CIAP 再37 ℃水浴30min 3、加入50 mM EDTA至终浓度5 mM 75 ℃加热10min 失活CIAP 4、冷却
功能基因cDNA-5’末端的克隆
一.原理⑴ 5’-RACE法① 以目的mRNA 为模板,使用5’末端P 标记的RT 引物进行反转录反应,合成1ststrand cDNA。② 使用RNase H 分解 Hybrid DNA-RNA中的RNA链。③ 使用T4 RNA Ligase 使单链cDNA进行环化或形成首尾连接物。④ 进行PCR
染色末端的清洁纯化实验
试剂、试剂盒 乙醇洗脱上样液仪器、耗材 磁性分离装置平板夹平板架测序反应纯化系统实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂用于测序的胶洗脱/上样液 (见表 9-4)90% 乙酵洗涤液2. 特殊设备MagnaBotⅡ磁性分离装置(Promega)平板夹 96(Promega)平板架(Promega)3
染色末端的清洁纯化实验
试剂、试剂盒 乙醇 洗脱上样液 仪器、耗材 磁性分离装置 平板夹 平板架
染色末端的清洁纯化实验
利用 ABIPRISMRigDye 末端化学法进行自动荧光测序是高效率 DN 八序列测定的方法之一。序列梯度是由标准的 Sanger 方法利用荧光标记链末端的核苷而产生的。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇洗脱上样液仪器、耗材磁性分离装置平板夹平板架测序反
简并寡核苷酸诱变实验
实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS无水乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机分光光度计实验步骤 1. 设计寡核苷酸,其3‘端含有由8个核苷酸组成的回文结构,且包含某一限制性内切酶的识别位点;如果可能的话,5’端也应有一含某个限制性内切酶位点的序列。中间区段则应含目
简并寡核苷酸诱变实验
本方法的一个重要特点就是将单链的简并寡核苷酸转变成同源双链分子后直接克隆进常规载体。由于不同的寡核苷酸可通过其3’末端的回文结构杂交,因此,寡核苷酸实际上起互为引物的作用,在大肠杆菌DNA聚合酶I klenow片段作用下延伸。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS
简并寡核苷酸诱变实验
小段DNA序列中产生大量突变 实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 仪器、耗材 特殊设备
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端
这一实验方案分为 6 个阶段。第 1 阶段:降解 RNA 的去磷酸化; 第 2 阶段:完整 RNA 去帽; 第 3 阶段:RNA 寡核苷酸的制备; 第 4 阶段:RNA 寡核苷酸与细胞 RNA 的连接; 第 5 阶段:反转录; 第 6 阶段:扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ-Klenow片段实验——修复突出的3’或5‘末端
Klenow酶是大肠杆菌八聚合酶I的羧基端片段,它具有DNA聚合酶和3’到5’方向的外切酶活性,不含5’到3”方向的外切酶活性。实验材料DNA试剂、试剂盒限制性内切酶EDTA仪器、耗材水浴锅实验步骤1. 在20 μl 反应体积中,用限制性内切酶消化0.1~4 μg DNA。2. 加入1 μl 0
在凸出末端上连接接头实验
在凸出末端上连接接头实验 实验材料 T4 噬菌体 DNA 连接酶 多聚核苷酸激酶 限制性内切核酸酶
在凸出末端上连接接头实验
实验材料 T4 噬菌体 DNA 连接酶多聚核苷酸激酶限制性内切核酸酶试剂、试剂盒 ATP乙醇接头激酶缓冲液苯酚氯仿乙酸钠TE仪器、耗材 层析设备水浴装置实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液ATP (10 mmol/L),乙醇,10x 接头激酶缓冲液,苯酚:氯仿(1:1, V/V),乙酸钠(3 mol
在凸出末端上连接接头实验
实验材料T4 噬菌体 DNA 连接酶多聚核苷酸激酶限制性内切核酸酶试剂、试剂盒ATP乙醇接头激酶缓冲液苯酚氯仿乙酸钠TE仪器、耗材层析设备水浴装置实验步骤一、材料1. 缓冲液和溶液ATP (10 mmol/L),乙醇,10x 接头激酶缓冲液,苯酚:氯仿(1:1, V/V),乙酸钠(3 mol/L,
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料测序级膜蛋白酶 试剂、试剂盒二硫苏糖醇 碘代乙酰
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤这里所述的方法概括为下列几个步骤:胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质(见 24. 3.1 );固相金属螯合亲和层析(IMAC) 富集磷酸肽(见 24. 3. 2 );用串联质谱对磷酸
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料 测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒 二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材 螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤 这里所述的方法概括为下列几个步骤:胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质(见 24. 3.1 );固相金属螯合亲和层析(IMAC) 富集磷酸肽(见 24. 3. 2 );用串
去磷酸化的平端或5凹端DNA分子的磷酸化
实验方法原理 在 T4 多核苷酸激酶的正向反应中,带有平端、5' 凹端或分子内切口的 DNA 底物比 5' 突出端的分子标记效率低。实验材料 T4 噬菌体多核苷酸激酶试剂、试剂盒 乙酸铵EDTA乙醇咪唑缓冲液聚乙二醇仪器、耗材 液体闪烁计数仪Sephadex G-50 离心柱Seph
去磷酸化的平端或5凹端DNA分子的磷酸化
实验方法原理 在 T4 多核苷酸激酶的正向反应中,带有平端、5' 凹端或分子内切口的 DNA 底物比 5' 突出端的分子标记效率低。 实验材料