用引物延伸法进行RNA的分析
实验方法原理 引物延伸法主要用于 mRNA5' 末端作图。poly (A) + RNA 先与过量 5' 末端标记的且与靶 RNA 互补的单链寡核苷酸引物杂交,然后用反转录酶延伸这个引物。产生的 cDNA 与 RNA 模板互补且长度与引物 5' 末端和 RNA 5' 末端之间的距离相等。实验材料 多核苷酸激酶RNA 酶蛋白质抑制剂反转录酶寡核苷酸引物ATP试剂、试剂盒 乙酸铵氯仿DTT乙醇甲酰胺加样缓冲液KCl酚引物延伸反应混合物乙酸钠TE三氯乙酸仪器、耗材 变性聚丙烯酰胺凝胶水浴Whatman 3 MM 滤纸实验步骤 一、材料1. 缓冲液与溶液乙酸铵(10 mol/L)氯仿DTT ( 1 mol/L)乙醇甲酰胺加样缓冲液(80% 去离子甲酰胺,10 mmol/L EDTA (pH 8.0),1 mg/ml 二甲苯腈蓝,1 mg/ml 溴酚蓝)KCl ......阅读全文
刚合成的引物用降落PCR的原因分析
因为理论计算的TM值用来确定退火的温度只是一个参考呀,最合适的退火温度会因为各种原因而有所差异,就连PCR仪都会有影响的,我们实验室就是,好多都是在一台能拉出条带,而在另一台上就拉不出条带,或者相反的。降落(TD)PCR代表了一种完全不同的PCR优化方法。由于开始时的退火温度选择高于估计的Tm值,随
随机引物法
此法系可用于从低熔点琼脂糖凝胶中回收 DNA 的放射性标记 ( Feinberg 和 Vogelstein 1983,1984)。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理此法系可用于从低熔点琼脂糖凝胶中回收 DNA 的放射性标记 ( Feinberg 和 Vogelstein 1
用缺失定位法进行基因定位
缺失定位法一个细胞中的两个同源染色体中的一个上有一个突变基因,另一染色体上有一小段已知范围的缺失,如果这一突变基因的位置在缺失范围内,便不可能通过重组而得到野生型重组体;如果突变基因不在缺失范围内,那么就可以得到野生型重组体。利用一系列已知缺失位置和范围的缺失突变型,便能测定突变型基因的位置。
如何寻找转录起始位点
一、引物延伸分析(primer extension analysis) 引物延伸分析用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域,随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,
如何寻找转录起始位点?
一、引物延伸分析(primer extension analysis)引物延伸分析用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域,随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,用变
用共转导法进行基因定位
共转导法公式2每一种转导噬菌体有一定的大小,只能携带一定长度的供体细菌的 DNA。例如大肠杆菌噬菌体PI的头部中只能包装大约分子量为5.8×10的DNA,大肠杆菌的染色体DNA的分子量是2.5×10,所以PI所能包装的 DNA至多相当于大肠杆菌的遗传学图上相距两分钟这样一段DNA分子。如果两个基因能
分子遗传学词汇引物RNA
中文名称:引物RNA外文名称:primer定义:引物RNA是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点,存在于自然中生物的DNA复制。
利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记
随机引物法:利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记1. 在一个0.5ml的微量离心管中加入溶于30μl水的模板DNA(25ng)及1μl随机脱氧核苷酸引物(约125ng)。盖紧微量离心管,置于沸水浴中2min。2. 将微量离心管移至冰上放置1min,4℃下离心10
PCR引物设计,如何进行编辑
PCR引物设计的11条黄金法则1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计。DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。2.引物长度一般在15~30碱基之间。引
DNA合成由RNA引物引发过程
DNA聚合酶不能发动新链的合成,只能催化已有链的延长;RNA聚合酶则不同,只要有模板存在,不需引物,就可以合成新RNA链。因此在体内先由RNA聚合酶合成RNA引物,DNA聚合酶再从RNA引物的3‘-OH端开始合成新的DNA链。催化RNA引物合成的酶称为引物合成酶。引物长度通常只有几个~10多个核苷酸
随机引物法标记-DNA
实验方法原理 利用寡核苷酸作引物,DNA 聚合酶可沿单链模板起始 DNA 的合成(Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一,它们就可在模板的多位点上与模板杂交。因此模板上每一核苷酸(5' 端的核苷酸除外)的互补物将以同样
随机引物法标记探针
实验概要本实验探针标记采用TAKARA公司的随机引物标记试剂盒Ver.2。实验步骤1.于1.5ml离心管中加入5μl H2O,2μl引物(N6),5μl DNA(0.1μg-1μg)。2.充分混匀,98°C 3分钟。3.离心1秒钟,将离心管盖上的汽化水甩下。4.加入2.5μl dNTPs(各2.5m
随机引物法标记-DNA
实验方法原理 利用寡核苷酸作引物,DNA 聚合酶可沿单链模板起始 DNA 的合成(Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一,它们就可在模板的多位点上与模板杂交。因此模板上每一核苷酸(5' 端的核苷酸除外)的互补物将以同样的频率掺入产物。实验材料 大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅰ Kl
随机引物法标记-DNA
利用寡核苷酸作引物,DNA 聚合酶可沿单链模板起始 DNA 的合成(Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一,它们就可在模板的多位点上与模板杂交。因此模板上每一核苷酸(5' 端的核苷酸除外)的互补物将以同样的频率掺入产物。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法
用什么溶解引物最合适?
常用的溶剂是水或者TE缓冲液(pH7.4——8.0),两者在实际实验中都是常用的。一般认为,TE缓冲液比较稳定,能提供稳定的pH环境,适合于保存引物(以及质粒或基因组DNA)。但也有人认为,TE中的EDTA分子会影响后续PCR的效率。如果您很注重PCR效率的话就要考虑到这一点。而双蒸水很易得,操作方
从RNA的提取到PCR——Realtime-PCR经验
一 引物的设计引物的设计对于这个实验至关重要,因为real time pcr的检测灵敏度比较高,所以相应的对引物设计的要求就很高。普通的要求规则大家都知道,还有几点必须注意:1,引物的错配率(引物错配形成引物二聚体,但是SYBR照样能嵌入进去,结果导致实验结果的误差很大,重复性也不好)。2,引物的特
逆转录PCR概念及方法介绍
逆转录 PCRRT-PCR(reverse transcriptase PCR,RT-PCR)是一种 RNA 逆转录和 PCR 结合起来建立的 RNA 的聚合酶链反应。RT-PCR 使 RNA 检测的敏感性提高了几个数量级[较 Northern 印迹杂交敏感(3~6)×103倍],也使一些极微量 R
用显微镜如何用割断法进行观察
如果显微镜样品以苯乙烯树脂做为包埋剂,再行割断法做扫描电镜观察是十分方便的。因为苯乙烯聚合后,氧化丙烯及醋酸异戊酸等很容易将其溶解,多次更换溶剂便可将苯乙烯清除干净.因此,在制做透射电镜标本时,多做出几个包埋胶囊样品,待聚合后,显微镜按上述方法割断,麦克奥迪显微镜将割断好的样品放在氧化丙烯中,约2小
PAT法分析mRNA-Poly(A)尾长度实验
PAT法 [ PCR poly(A) test ] 可以快速、灵敏地从总 RNA 中分析特异 mRNA,而且可以定量估算 RNA poly(A) 尾长度。这方法中,包括 cDNA 合成的整个操作过程都在一个反应管中完成,不仅操作更简便,也减少了可能存在的 RNase 污染。本实验来源「RNA 实验指
RNA分离与分析实验_用丙烯酰胺尿素凝胶纯化RNA
实验材料RNA试剂、试剂盒TBE 缓冲液丙烯酰铵溶液过硫酸铵水溶液RNA 染色液仪器、耗材玻璃板实验步骤1. 准备下列溶液:TBE 缓冲液:Tris 碱 54 g,硼酸 27.5 g,0.5 mol/L EDTA ( pH 8.0) 20 ml,溶解并加水至 1000 ml。当发现贮存液有白色沉淀
传代细胞-PCR常见问题及回答
1. cDNA产量的很低 可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl 2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅 *zui常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应
PCR常见问题及回答
PCR常见问题及回答 1. cDNA产量的很低 可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl 2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅 *zui常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系
PCR实验操作常见问题及解决方法(一)
cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*最常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*与反应起始
pcr如何设计引物如何进行扩增
引物长度和专一性常见的引物长度为18-30个碱基。 短的引物(≤15碱基)能非常高效地结合, 但是它们的专一性不够。较长的引物能提高专一性,然而退火效率低,从而导致PCR产量低下。同时应避免编码单一序列和重复序列的引物。平衡GC含量,避免GC-和AT-富集区域引物的GC含量应介于40%~60%之间。
通用引物进行pcr扩展什么意思
一般载体的生产厂家会在多克隆位点两端加上一对已知序列的引物,用来做PCR验证和测序。所以一般介绍了是什么载体,直接说通用引物对于业内人士来说,通用引物的名称和序列都是已知的了
PCR仪常见问题及回答
PCR仪常见问题及回答1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*zui常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是R
PCR仪常见问题及回答
1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*最常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*与反
PCR仪常见问题及回答
1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*zui常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*
PCR实验操作常见问题及解决方法
1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*最常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*与反
PCR仪常见问题及回答,值得一看!
一、遇到的问题 1. cDNA产量的很低 可能的原因: RNA模板质量低 对mRNA浓度估计过高 反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足 同位素磷32过期 反应体积过大,不应超过50μL 2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅 最常见的原因在于您的反应体系是PCR的