利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记

随机引物法:利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记1. 在一个0.5ml的微量离心管中加入溶于30μl水的模板DNA(25ng)及1μl随机脱氧核苷酸引物(约125ng)。盖紧微量离心管,置于沸水浴中2min。2. 将微量离心管移至冰上放置1min,4℃下离心10s使引物与模板的混合物沉降至管底,将微量离心管重新置于冰上。3. 在引物与模板的混合物中加入:5 mmol/L dNTP溶液 1μl5×随机引物缓冲液 &n......阅读全文

利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记

   随机引物法:利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记1.      在一个0.5ml的微量离心管中加入溶于30μl水的模板DNA(25ng)及1μl随机脱氧核苷酸引物(约125ng)。盖紧微量离心管,置于沸水浴中2min。2.      将微量离心管移至冰上放置1min,4℃下离心10

随机引物法(利用随机寡核苷酸延伸进行DNA的放射标记)

            实验方法原理 此法系可用于从低熔点琼脂糖凝胶中回收 DNA 的放射性标记 ( Feinberg 和 Vogelstein 1983,1984)。 实验材料

用随机寡核苷酸延伸法进行扣除cDNA探针的放射性标记

实验方法原理 此方案中 cDNA 的合成是在 4 种饱和浓度的 dNTP 及一种痕量的放射性标记的 dNTP 中进行的。扣除杂交后,在大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅰ的 Klenow 片段作用下,富集的单链 cDNA 通过随机寡核苷酸引物延伸的二次合成反应,标记成高比活性的探针。由 于第一轮反应中

用随机寡核苷酸延伸法进行扣除cDNA探针的放射性标记

            实验方法原理 此方案中 cDNA 的合成是在 4 种饱和浓度的 dNTP 及一种痕量的放射性标记的 dNTP 中进行的。扣除杂交后,在大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅰ的 Klenow 片段作用下,富集的单链 cDNA 通过随机寡核苷酸引物延伸的

用随机寡核苷酸延伸法进行扣除cDNA探针的放射性标记

此方案中 cDNA 的合成是在 4 种饱和浓度的 dNTP 及一种痕量的放射性标记的 dNTP 中进行的。扣除杂交后,在大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅰ的 Klenow 片段作用下,富集的单链 cDNA 通过随机寡核苷酸引物延伸的二次合成反应,标记成高比活性的探针。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培

微量柱法纯化DNA片段

实验概要目的DNA片段的回收技术是重组DNA中的关键技术,回收是指从电泳介质中纯化出目的片断。目前待回收的片断主要有酶切片断和各种PCR片断;回收的介质主要有琼脂糖和PAGE;回收的方法主要有树脂回收、微量柱回收、玻璃奶回收、液氮冻冻融回收及透析袋大量回收等,下面分别介绍树脂、微量柱及液氮冻冻融回收

乙醇沉淀法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

试剂、试剂盒 乙酸铵乙醇TE放射性标记的寡核苷酸纯化的原料实验步骤 材料溶液和缓冲液稀释贮存液至适当浓度。乙酸铵(1mol/L)乙醇TE(pH7.6)核酸和寡核苷酸放射性标记的寡核苷酸纯化的原料是方案 2(步驟 3 或步骤 5) 的反应混合液,T4 噬菌体多核苷酸激酶巳在 68°C 加热后灭活。方法

CPB沉淀法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

本方案介绍用阳离子去污剂——十六烧基溴化吡啶(cetylpyridinium bromide,CPB) 定量差异沉淀分离放射性标记的寡核苷酸与未掺入的放射性标记物。此方法最初是用于回收磷酸缓冲液从羟磷灰石柱洗脱的 DNA(Geek and Nasz 1983), 也可用于沉淀放射性标记核酸包括寡核苷

乙醇沉淀法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

            试剂、试剂盒 乙酸铵 乙醇 TE 放射性标记的寡核苷酸 纯化的原料 实验步骤

CPB沉淀法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

            试剂、试剂盒 十六烷基溴化吡啶 EDTA-Tris EDTA-Tris-DNA 溶液 乙醇-乙酸钠溶液 乙醇 乙酸钠 TE(

乙醇沉淀法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

如果放射性标记的寡核苷酸只是用作杂交探针的话,一般不必完全除去未掺入的放射性标记物。然而,为了使本底降至最低,应该将未掺入的大部分放射性标记物与放射性标记的寡核苷酸分离。如果寡核苷酸长度超过 18 个核苷酸(本方案),则绝大部分未反应的放射性前体物质可通过乙醇分级沉淀除去。本实验来源于分子克隆实验指

DNA片段回收与纯化

    质粒、噬菌体等经酶切,电泳;PCR产物经电泳后,常常需要对一些DNA电泳片段进行回收和纯化,用于亚克隆、探针标记等。DNA回收和纯化常用方法有压碎法、低融点琼脂糖法、冻融法等,也有现成的试剂盒供应。一、冻融法1.  紫外灯下仔细切下含待回收DNA的胶条,将切下的胶条(小于0.6g)捣碎,置于

DNA小片段的纯化回收

DNA 电泳小于100bp的片断通常在电泳时就比较难观察分辨,需要用分辨率很高的琼脂糖或者丙烯酰胺凝胶。比如Cambrex的NuSieve 3:1或者GTG,或者是大名鼎鼎的MetaPhor琼脂糖。所以实际上对于小片断,可以分为两种情况:一个是真的要回收电泳中特别小的片断,这种情况我们前面有提到,比

大小排阻层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

            试剂、试剂盒 氯仿 EDTA 乙醇 酚:氯仿 乙酸钠 TE Tris-Cl Tris-SDS

大小排阻层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

放射性标记的寡核苷酸用于酶促反应如引物延伸反应时,需要完全除去未掺入的放射性标记物。本方案介绍的是利用大小排阻层析时寡核苷酸与单核苷酸移动速率差异,分离放射性标记的寡核苷酸与未掺入的放射性标记物的方法。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒氯仿EDTA乙醇酚:氯仿乙酸

大小排阻层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

试剂、试剂盒 氯仿EDTA乙醇酚:氯仿乙酸钠TETris-ClTris-SDS 层析缓冲液放射性标记的寡核苷酸纯化的原料仪器、耗材 凝胶过滤树脂破璃棉巴斯德吸管实验步骤 材料溶液和缓冲液稀释贮存液至适当浓度。氯仿任选,见步驟 7。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇酚:氯仿任选,见步骤 7。

DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...4

序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA 化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的

关于Southern杂交的探针标记简介

  用于Southern印迹杂交的探针可以是纯化的DNA片段或寡核苷酸片段。探针可以用放射性物质标记或用地高辛标记,放射性标记灵敏度高,效果好;地高辛标记没有半衰期,安全性好。人工合成的短寡核苷酸可以用T4多聚核苷酸激酶进行末端标记。探针标记的方法有随机引物法、切口平移法和末端标记法。

用大肠杆菌-Klenow-片段标记合成的寡核苷酸实验

通常利用 T4 噬菌体多核苷酸激酶催化的磷酸化反应进行寡核苷酸的标记。但有时需要标记比活度更高的放射性标记的探针,最理想的情况下,磷酸化反应中每一个寡核苷酸分子上有一个 32P 原子掺人。而用大肠杆菌 DNA 聚合酶 IKlenow 片段合成与寡核苷酸互补的一条 DNA 链,可获得更高比活度的探针。

如何进行DNA纯化

检测:用足迹法,又称为足印法(footprinting)是一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法。用于检测与特定蛋白质结合 的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。其原理为:DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了

随机引物法(在融化琼脂糖存在下利用随机寡核苷酸延...

随机引物法(在融化琼脂糖存在下利用随机寡核苷酸延伸进行DNA的放射标记)实验方法原理 此法系可用于从低熔点琼脂糖凝胶中回收 DNA 的放射性标记 ( Feinberg 和 Vogelstein 1983,1984)。实验材料 大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅰ Klenow 片段模板 DNA试剂、试剂盒 醋

用引物延伸法进行-RNA-的分析

            实验方法原理 引物延伸法主要用于 mRNA5' 末端作图。poly (A) + RNA 先与过量 5' 末端标记的且与靶 RNA 互补的单链寡核苷酸引物杂交,然后用反转录酶延伸这个引物。产生的 cDNA 与 RNA 模板互补且

用引物延伸法进行-RNA-的分析

引物延伸法主要用于 mRNA5' 末端作图。poly (A) + RNA 先与过量 5' 末端标记的且与靶 RNA 互补的单链寡核苷酸引物杂交,然后用反转录酶延伸这个引物。产生的 cDNA 与 RNA 模板互补且长度与引物 5' 末端和 RNA 5' 末端之间的距离相

用引物延伸法进行-RNA-的分析

实验方法原理 引物延伸法主要用于 mRNA5' 末端作图。poly (A) + RNA 先与过量 5' 末端标记的且与靶 RNA 互补的单链寡核苷酸引物杂交,然后用反转录酶延伸这个引物。产生的 cDNA 与 RNA 模板互补且长度与引物 5' 末端和 RNA 5'

用SepPak-C18柱层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

试剂、试剂盒 乙腈碳酸氢铵TE 溶液放射性标记寡核苷酸仪器、耗材 离心干燥机微量离心管放于管架或收集器Sep-Pak 经典层析柱注射器实验步骤 材料溶液和缓冲液稀释贮存液至适当浓度。乙腈(5%、30% 和 100%)毎个 Sep-Pak C18 柱用 10 ml 髙效液相(HPLC) 级乙腈(100

用SepPak-C18柱层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

            试剂、试剂盒 乙腈 碳酸氢铵 TE 溶液 放射性标记寡核苷酸 仪器、耗材 离心干

用SepPak-C18柱层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

本方案介绍的是利用寡核苷酸对于硅胶反相亲和的特性,将放射性标记的寡核苷酸与未掺入的放射性标记物分离的方法,本方案的方法只可用于纯化 5'端放射性标记或非标记的含磷酸基团的寡核苷酸,而方案 1 所介绍的方法多用于 5'末端为游离羟基的寡核苷酸。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册

冻融法回收DNA片段

            实验方法原理 冻融法是指采用反复冷冻与融化时由于细胞中形成了冰晶及剩余液体中盐浓度的增高可以使细胞破裂。这种方法简单方便,但要注意那些对温度变化敏感的蛋白质不宜采用此法。  实验材料

冻融法回收DNA片段

冻融法回收DNA片段可用于:(1)获取纯化的DNA片段;(2)回收PCR产物。实验方法原理冻融法是指采用反复冷冻与融化时由于细胞中形成了冰晶及剩余液体中盐浓度的增高可以使细胞破裂。这种方法简单方便,但要注意那些对温度变化敏感的蛋白质不宜采用此法。 实验材料DNA胶条试剂、试剂盒Tris-HCl饱和酚

从M13噬菌体模板合成固定长度的单链DNA探针

实验材料大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性内切核酸酶模板 DNA寡核苷酸引物试剂、试剂盒乙酸铵DTTEDTA乙醇NaCl酚氯仿TBE 电泳缓冲液Tris-ClKlenow 基础缓冲液dNTP 溶液仪器、耗材变性聚丙烯酰胺凝胶或碱性琼脂糖凝胶黏性贴片或磷光黏性贴片Sephadex