基于PCR的DNA文库筛选实验方法

试剂、试剂盒 PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸 杂交寡核苷酸PCR 正对照PCR 主要混合物蒸馏水仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳设备实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水2. 酶和酶缓冲液PCR 混合物(可以放在一起冰冻),对于 lml 反应,包括:200nmol 的各种 dNTP;1XVent 溶液或等价物;2.5umol 的 MgCl2;2nmol 的各引物PCR 主要混合物(每个反应必须新鲜配置):lulVent DNA 聚合酶或等价物;99ul 上述 PCR 混合物3. 核酸和寡核苷酸2 个 PCR 引物寡核苷酸1 个杂交寡核苷酸PCR 正对照:10ng 全基因组 DNA 或能产生阳性 PCR 信号的起始文库组分(见第 5 步)4. 培养基LB,1L 水中加入:10 g 蛋白胨、5 g 酵母抽提物、10 gNaCl, 用 NaOH 调节 pH 至 7.5SM,1L 水中加入:5.8 gNaCl、2 gMgS04、......阅读全文

基于-PCR-的-DNA-文库筛选实验方法

            试剂、试剂盒 PCR 混合物 PCR 引物寡核苷酸 杂交寡核苷酸 PCR 正对照 PCR 主要混合物 蒸馏水

基于-PCR-的-DNA-文库筛选实验方法

试剂、试剂盒PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸杂交寡核苷酸PCR 正对照PCR 主要混合物蒸馏水仪器、耗材琼脂糖凝胶电泳设备实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水2. 酶和酶缓冲液PCR 混合物(可以放在一起冰冻),对于 lml 反应,包括:200nmol 的各种 dNTP;1XVent 溶

基于-PCR-的-DNA-文库筛选实验方法

试剂、试剂盒 PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸 杂交寡核苷酸PCR 正对照PCR 主要混合物蒸馏水仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳设备实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水2. 酶和酶缓冲液PCR 混合物(可以放在一起冰冻),对于 lml 反应,包括:200nmol 的各种 dNTP;1XVe

单链DNA文库的SELEX筛选实验

单链DNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料3

单链DNA文库的SELEX筛选实验

实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料 3' 引物链亲和素磁珠仪器、耗材 电泳仪PCR 仪离心机凝胶成像仪

单链DNA文库的SELEX筛选实验

            实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。

DNA文库的构建及其筛选

DNA文库的构建和筛选可以用于:(1)将某生物的全部基因组DNA用限制性内切酶或机械力量切割成一定长度的DNA片段,再与适合的载体在体外重组并转化相应的宿主细胞获得的所有阳性菌落。 (2)采用“化整为零”策略,将庞大的基因分解成一段段,每段包含一个或几个基因。实验方法原理高等植物基因组的一个显著特征

DNA文库的构建及其筛选

            实验方法原理 高等植物基因组的一个显著特征是其内含有大量的 DNA 重复序列, 重复序列常位于异染色质区, 因此可能与染色体的结构有关 . 季静等根据国际上 对基因组、染色体、结构蛋白的研究前沿, 提出染色体 DNA 平均每隔 30 kb

DNA文库的构建及其筛选

实验材料 DNA试剂、试剂盒 升汞MS培养基琼脂糖EcoR IHind IIIBamH IBg lII Pst I仪器、耗材 电泳仪尼龙膜实验步骤 1.水稻 DNA 的提取水稻 DNA 的提取参照 Dellaporta, Wood 和 Hicks (1983) 法分离总基因组DNA并略有修改。 通过

利用λ噬菌体文库筛选-DNA-结合蛋白实验

试剂、试剂盒 ATP结合缓冲液变性溶液二硫苏糖醇EDTA乙醇激酶 连接酶缓冲液酚氯仿筛选缓冲液SDS醋酸钠TET4 噬菌体 DNA 连接酶T4 噬菌体多核苷酸激酶合成的寡核苷酸[a-32P]ATP非变性聚丙烯酰胺凝胶仪器、耗材 烤盘结晶皿平头镊子装有防水黑墨水注射器硝酸纤维素滤膜Sephadex G

利用λ噬菌体文库筛选-DNA-结合蛋白实验

可利用合成双链寡核苷酸筛选构建于λ噬菌体的 cDNA 表达文库,以鉴定与特异 DNA 结合蛋白质相对应的克隆(Singhetal.1988,Vinsonetal.1988)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试剂、试剂盒ATP结合缓冲液变性溶

利用λ噬菌体文库筛选-DNA-结合蛋白实验

            试剂、试剂盒 ATP 结合缓冲液 变性溶液 二硫苏糖醇 EDTA 乙醇激酶 连接酶缓冲液 酚 氯

YAC实验——YAC文库筛选

实验步骤1.  YAC中心实验室用于筛选文库的方法进展很快。2.  将一块或多块微量滴定板微孔中的YAC克隆转印到尼龙膜上,用单拷贝探针进行杂交,就可以筛选YAC文库了。3.  然而,由 于杂交实验的信噪比较低以及制备所有的转印尼龙膜所需的花费巨大,绝大多数实验室已采用PCR方法来筛选文库。4.  

基于-PCR-的-DNA-斑点印迹实验

            实验方法原理 dNTP ,PCR 缓冲液,聚合酶混合液,嵌套引物,LB-氨苄液体培养基,溶液NaOH,SSC,Tris-HCl,PCR 产物微量滴定板,尼龙膜,紫外交联装置,96 孔或 384 孔复制器,热循环仪,PCR 管或反应板

基于-PCR-的-DNA-斑点印迹实验

对于高通量的筛选,推荐使用几个热循环仪厂家提供的 96 孔或 384 孔 PCR 板,或者使用单个的管子。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。实验方法原理dNTP ,PCR 缓冲液,聚合酶混合液,嵌套引物,LB-氨苄液体培养基,溶液NaOH,SSC,Tris-HCl,PCR

基于-PCR-的-DNA-斑点印迹实验

实验方法原理 dNTP ,PCR 缓冲液,聚合酶混合液,嵌套引物,LB-氨苄液体培养基,溶液NaOH,SSC,Tris-HCl,PCR 产物微量滴定板,尼龙膜,紫外交联装置,96 孔或 384 孔复制器,热循环仪,PCR 管或反应板试剂、试剂盒 dNTP PCR 缓冲液聚合酶混合液嵌套引物LB-氨苄

用-PCR-控制基因组-DNA-文库的质量实验

试剂、试剂盒 ddH20Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶 dNTP质粒 DNAPCR 引物仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳所需的试剂和设备热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂ddH202. 酶和酶缓冲液10X Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸dNTP,各

用-PCR-控制基因组-DNA-文库的质量实验

在该方案中,用限制性内切酶的混合物处理人类基因组 DNA(内切酶混合物的识别位点为 4bp),产生大概 50〜500bp 的片段。最终使用这一类型的表达文库,是通过利用表型的和生化的筛选方法,分离编码功能多肽或蛋白片段的基因片段。用KlenowDNA 聚合酶处理后,基因组 DNA 片段成为平末端,然

用-PCR-控制基因组-DNA-文库的质量实验

            试剂、试剂盒 ddH20 Vent 缓冲液 Vent DNA 聚合酶 dNTP 质粒 DNA PCR 引物

随机RNA文库的SELEX筛选实验

            实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形

随机RNA文库的SELEX筛选实验

实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形成发夹、假结、凸环、G-四聚体等多种空间结 构,它

随机RNA文库的SELEX筛选实验

随机RNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的

用杂交的方法筛选大片段插入的文库实验

由于原代的转化子只能产生数目有限的滤膜,因而随机铺板不适合滤膜的制备以及 YAC、BAC 和 PAC 文库的保存,而且由于克隆增殖率存在差别,因而无论是哪一种扩增形式都会将偏差带人文库中去。因此,原代的转化子应加入微孔板中,放置于-8℃ 保存。这使得制造分配用的文库拷贝变得简单易行,而且使组

用杂交的方法筛选大片段插入的文库实验

实验步骤由于原代的转化子只能产生数目有限的滤膜,因而随机铺板不适合滤膜的制备以及 YAC、BAC 和 PAC 文库的保存,而且由于克隆增殖率存在差别,因而无论是哪一种扩增形式都会将偏差带人文库中去。因此,原代的转化子应加入微孔板中,放置于-8℃ 保存。这使得制造分配用的文库拷贝变得简单易行,而且使组

Northwestern筛选蛋白表达文库实验

            实验方法原理 Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库(融合蛋白的 N 端由载体序列编码,C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码),进而诱导融合蛋白表达,并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤

Northwestern筛选蛋白表达文库实验

实验方法原理 Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库(融合蛋白的 N 端由载体序列编码,C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码),进而诱导融合蛋白表达,并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤膜上,以标记的 RNA 探针进行筛选,最终获取能与靶

Northwestern筛选蛋白表达文库实验

Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库(融合蛋白的 N 端由载体序列编码,C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码),进而诱导融合蛋白表达,并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤膜上,以标记的 RNA 探针进行筛选,最终获取能与靶 RNA 分子特异性结合

CDNA文库筛选

CDNA文库筛选(一)λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1.用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基(Y1088用于噬菌斑杂交,Y1090用于免疫筛选),于37℃振荡培养过夜。2.将过夜培养物以3000×g离心5min。3.分别用2ml λ-dil(10 mmol/L

CDNA文库筛选

(一)λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1.用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基(Y1088用于噬菌斑杂交,Y1090用于免疫筛选),于37℃振荡培养过夜。2.将过夜培养物以3000×g离心5min。3.分别用2ml λ-dil(10 mmol/L tris-Cl,

用-PCR-来制备编码随机肽的双链-DNA-文库实验

使用合成的寡核苷酸构建文库时,PCR 有两个重要的作用。第一,用与特定侧翼序列退火的引物来扩增文库,仅用少量的不同模板,就可以得到大量的 PCR 产物。第二,若要产生文库 DNA 的复杂互补链,PCR 合成法是有效的方法。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒限制