转录组的重编写:RNA编辑

前 言基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA的纠正,成为了科学界的新一大热点。特别是前2个月,北京大学和MIT分别在Nature Biotechnology与Science上发文,提出了名为“LEAPER”的A-to-I RNA编辑工具[1]和名为“RESCUE”的C-to-U RNA编辑器[2],被Nature Reviews Genetics和Nature Reviews Drug Discovery两篇杂志分别点评是“拓宽了RNA单碱基编辑器的选择”[3]和“拓展了RNA编辑的工具箱”[4],在业内引起了广泛的关注与讨论,进一步打开了我们深入认识RNA的大门。......阅读全文

RNA编辑主要类型

①简单编辑,单碱基转变的转录后调节;②插入编辑,插入单个核苷酸或少量核苷酸的丢失,其机制是转录链的跳格;③泛编辑,插入或缺失多个尿嘧啶核苷酸或转录后插入多个胞嘧啶,其机制是编辑序列由外源反义引导RNA( gRNA)提供,gRNA在编辑体(editosome)核蛋白颗粒中与前编辑mRNA配对,鉴别作为

什么是RNA编辑?

RNA编辑(RNA editing)是指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入、丢失或转换等现象。RNA编辑产生的“基因”可称为隐蔽基因( cryptogene),其产物的结构不能从基因组DNA序列中推导获得。早在1986年发现锥虫线粒体mRNA转录加工后,其mRNA的多个编码位置上加入或丢失尿苷酸。

概述RNA编辑的现象

  RNA编辑(RNA editing)是新发现的在mRNA水平上遗传信息改变的过程。由于RNA编辑使mRNA中的编码序列与它的基因中的编码序列不一致。研究证明,mRNA中个别碱基的取代和加减,造成mRNA的碱基序列与它的基因的碱基序列不一致,使其仍能参与翻译,所有这一系列的改变不是发生在基因水平上

RNA编辑领域前世今生

  提到基因编辑,我们可能首先想到的是著名学者张锋和Jennifer Doudna博士共同发现的CRISPR基因编辑系统。而提到单碱基编辑系统,我们可能首先会想到Broad研究所著名科学家David Liu和张锋博士等人共同创建的Beam Therapeutics公司,这家初创公司致力于使用基于CR

简述RNA编辑的机制

  编辑一般发生在mRNA的3’端而不在5’端,1988年Kenneth等首次报道了编辑在3'端的现象。他们合成了2种编辑引物和2种未编辑引物。完全编辑的成熟RNA仅能同编辑引物杂交,用PCR检测到了杂交带,它不能杂交到未编辑mRNA上。相反,未编辑RNA仅能同未编辑引物反应。如果编辑是从转

简述RNA编辑的意义

  RNA编辑的生物学意义主要有:  ①校正作用,因4个核苷酸的插入移码,使其肽链的序列和其他生物的相似;  ②调控翻译,通过编辑可以引入或去除起始密码子或终止密码子;  ③扩充遗传信息,经编辑后增加了肽链的编码信息量

关于RNA编辑的基本介绍

  RNA编辑(RNA editing)是指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入、丢失或转换等现象。RNA编辑产生的“基因”可称为隐蔽基因( cryptogene),其产物的结构不能从基因组DNA序列中推导获得。 早在1986年发现锥虫线粒体mRNA转录加工后,其mRNA的多个编码位置上加入或丢失尿

RNA编辑如何促进肿瘤生长?

  最近一项新的研究,对于RNA(核糖核酸)编辑在癌症中可能发挥的作用,提供了新的见解。这项研究结果发表在《Scientific Reports》杂志,可以让我们进一步了解参与肿瘤发生和发展的一种新机制,并因此可能在未来带来更好的治疗方案。  在每一个健康的人体细胞中,连接到DNA中的遗传信息,被转

CRISPR的新前沿:编辑RNA

  基因编辑工具CRISPR令科学家们修改DNA的能力发生了革命性的变化,如今,该工具的一种新的版本能对RNA进行靶向修改。编辑RNA而不是DNA有若干优点,例如,它能减轻与DNA相关的在伦理方面的顾虑,它能为科学家在活体生物中提供更为精确的编辑时间框架(如在关键性的发育期中)。在这里,David

关于RNA编辑的分类介绍

  RNA编辑主要类型有:  ①简单编辑,单碱基转变的转录后调节;  ②插入编辑,插入单个核苷酸或少量核苷酸的丢失,其机制是转录链的跳格;  ③泛编辑,插入或缺失多个尿嘧啶核苷酸或转录后插入多个胞嘧啶,其机制是编辑序列由外源反义引导RNA( gRNA)提供,gRNA在编辑体(editosome)核蛋

大脑RNA编辑位点“辞典”发布

美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目,在这些位点中,RNA在整个人类生命周期中被修饰,这个过程被称为腺苷到肌苷(A-to-I)编辑,其为理解大脑发育的细胞和分子机制以及它们如何影响健康和疾病提供了重要的新途径。在《细胞报告》上发表的论文中,研究团队描述了大脑中RNA编辑的速率如

转录组的重编写:RNA编辑

  前 言   基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA

转录组的重编写:RNA编辑

  基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA的纠正,成为了

RNA编辑技术治疗严重罕见病

  肌肉萎缩症目前还没有治愈的方法,患有这种疾病的儿童在早年失去了重要的肌肉力量。根据来自美国西北大学医学院和芝加哥大学的一项最新研究,一种被称为“外显子跳跃(exon skipping)”的RNA编辑技术,在治疗一种罕见而严重形式的肌肉萎缩症的过程中,已经取得初步成效。相关研究结果发表在十月十二日

转录组的重编写:RNA编辑

前 言基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA的纠

RNA编辑的生物学意义

RNA编辑的生物学意义主要有:①校正作用,因4个核苷酸的插入移码,使其肽链的序列和其他生物的相似;②调控翻译,通过编辑可以引入或去除起始密码子或终止密码子;③扩充遗传信息,经编辑后增加了肽链的编码信息量。

浙大:RNA编辑阻止RISC识别靶标mRNA

  MicroRNAs(miRNAs)结合Ago形成RNA诱导沉默复合体,通过沉默靶mRNA调控基因表达。miRNA的RNA编辑可能影响miRNA的加工,Ago复合物的组装,以及靶mRNA的结合。然而,组装进Ago复合物的被编辑的miRNA的功能,还没有被深入研究过。  浙江大学生命科学学院章晓波教

Cancer-Research:RNA编辑与食管癌

  科学家们首次在食管鳞状细胞癌中发现,负责编辑RNA的酶发生过表达,促进了癌症的发展。   食管鳞状细胞癌ESCC(Esophageal Squamous Cell Carcinoma)是食管癌的一种主要类型。新加坡国立大学NUS的科学家们发现,RNA 腺苷脱氨酶1(ADAR1)可以作为

张建之教授PNAS解析RNA编辑

  如果一些编码位点的RNA编辑受损,就会引起严重的疾病。因此,一些人认为编码性RNA编辑是对人体有利的。   近年来的基因组研究显示,人类基因组中有超过一千个编码位点受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)编辑。许多这样的RNA编辑事件属于非同义替换。   现在

新型腺嘌呤碱基编辑器可让细胞RNA编辑最小化

  在一项新的研究中,来自美国布罗德研究所和哈佛大学的研究人员发现有证据表明使用碱基编辑器会导致细胞中出现意想不到的RNA编辑。相关研究结果发表在2019年5月8日的Science Advances期刊上,论文标题为“Analysis and minimization of cellular RNA

基因编辑大牛张锋开发出RESCUE技术,可扩大RNA编辑能力

  基于CRISPR的工具彻底改变了我们靶向与疾病相关的基因突变的能力。CRISPR技术包括一系列不断增长的能够操纵基因及其表达的工具,包括利用酶Cas9和Cas12靶向DNA,利用酶Cas13靶向RNA。这一系列工具提供了处理突变的不同策略。鉴于RNA寿命相对较短,靶向RNA中与疾病相关的突变可避

Nature重大突破:CRISPR也可编辑RNA

  一种用来编辑基因组中DNA指令的强大科学工具现在也可以应用于RNA。来自加州大学伯克利分校和劳伦斯伯克利国家实验室的一个研究人员小组,证实借助于一种方法可以编程CRISPR/Cas9蛋白复合物在序列特异性的靶位点识别并切割RNA。这一研究发现有可能改变RNA功能研究的模式,为检测、分析和操控RN

中科院PLOS发表RNA编辑新成果

  7月28日,来自中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组、上海巴斯德研究所郝沛研究组以及密歇根州立大学王红兵教授,在国际著名遗传学期刊《PLOS Genetics》发表一项合作研究,题为“The Landscape of A-to-I RNA Editome Is Shaped by

科学首次揭示“RNA编辑”生物学功能

  栖息在南极冰冷海水中的章鱼并没有给自己的触手带上手套,但它却找到了另一种方式来抵御寒冷。   一项新的研究表明,这种海洋生物利用一种被称为核糖核酸(RNA)编辑的手段来定制在低温下工作的关键神经系统蛋白质。这篇论文同时也第一次揭示了RNA编辑——不仅仅是改变一个特定的基因——能够导致适应。

科学家提出“RNA编辑”新方式遭质疑

Vivian G. Cheung   美国宾州大学Vivian G. Cheung课题组今年五月份在《科学》发表文章指出,人类细胞中有超过10000个外显子位点存在转录RNA序列和模板DNA序列不匹配现象。此结论意味着可能存在“RNA编辑”新方式。然而,该结论遭到了其他科学家的

PNAS:利用RNA控制CRISPR/Cas9基因编辑

  在过去的几年里,研究人员找到了一种方法利用天然存在的细菌免疫系统CRISPR/Cas9来失活或纠正任何生物体内的特定基因。然而,CRISPR/Cas9持续地发挥基因编辑活性,带来了额外编辑不必要位点的风险。  现在,来自加州大学圣地亚哥医学院、Ludwig癌症研究所和艾希司制药公司(Isis P

中山大学等开发RNA编辑新工具

  CRISPR-Cas9系统使用一段引导RNA(其与Cas9蛋白结合起来才能发挥作用)来靶定一段DNA,并裂解双链DNA。这一现象提出了一个问题:由一个Dicer结合RNA元件和一段反义RNA组成的一种人造小RNA(asRNA,是否也能用来诱导Dicer处理和降解一段特定的RNA呢?  为此,5月

基因编辑鼠的构建-Guide-RNA设计和筛选

众所周知,CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”,它可以高效地实现靶基因的编辑,自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成,Cas9核酸酶会在向导RNA(Guide RNA, gRNA)的指引下,在完整基因组上的特定位点完成切割反应,同

梁晗:RNA编辑为精确癌症治疗带来新希望

  如果说所有癌症都有一个共同点的话,那就是无共同性。  因此这造成了癌症难以治疗的一个根本原因。近期来自德州大学MD安德森癌症中心的研究人员发现了为什么作为许多癌症的“孵化器”的蛋白质,会出现癌症类别的差异,甚至患者之间的差异。这一发现为科学家们提供了新思路,对于开发更有效的癌症精确治疗方法十分重

孟山都CTO谈基因编辑、RNA干扰与行业并购影响

  Fraley对两公司的合并持乐观态度,并认为这是一次积极健康的合并。通过合并,两者可扩大规模,同时得到更多研发资金,继续保持育种优势。  记者:关于基因编辑的问题。之前有报道说孟山都已经在谈基因编辑的专利问题,很多人猜测孟山都很可能已经有基因编辑的产品在研发,或者是将要推出来,能不能介绍一下基因