盘绕螺旋结构的设计和优化技巧实验(一)

本节讨论盘绕螺旋特异性设计所涉及的几个不同方面。我们的目标是在核心处和边沿位置选择氨基酸以得到期望的寡聚态( 见 3. 2.1)、特异性(见 3. 2. 2 ) 和螺旋取向 ( 见 3.2.3 )。这里,我们也把针对特定稳定性的不同设计方案联系起来。第 4 小节(见 3. 2.4 ) 涉及整体稳定性,集中在外部位点(b、c 和 f )。本章我们把所有内容分为小节逐一讨论。但是,正是由于所讨论的导致盘绕螺旋形成的相互影响的各因子的本性,本节的讨论会在几个地方互相交叉。因此,对于处理同一残基位置所起的不同作用的小节可以被认为是互相联系的片段。3. 2. 1 寡聚态为正常地发挥功能,任何蛋白质都必须折叠成合适的三维结构。类似地,盘绕螺旋结构必须采取正确的寡聚( 四级)结构。在下一小节,讨论实现正确结构的主要因素。3.2.1.1 核心残基图 3.1,我们称 a 和 d 残基为核心残基,因为它们绕着每一个螺旋形成疏水带。 ......阅读全文

α螺旋的基本结构

α螺旋是一种最常见的二级结构,最先由Linus Pauling和Robert Corey于1951年提出,其主要内容是: ①肽链骨架围绕一个轴以螺旋的方式伸展;②螺旋形成是自发的,肽链骨架上由n位氨基酸残基上的-C=O与n+4位残基上的-NH之间形成的氢键起着稳定的作用;被氢键封闭的环含有13个原子

α螺旋的结构特点

α-螺旋(α-helix)是蛋白质二级结构的主要形式之一。指多肽链主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升,每3.6 个氨基酸残基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距为0.54nm,两个氨基酸残基之间的距离为0.15nm。螺旋的方向为右手螺旋。氨基酸侧链R基团伸向螺旋外侧,每个肽键的肽键的羰基氧和第

正超螺旋的结构特点和形成原因

正超螺旋:由线性双螺旋分子两端连接起来或因与蛋白质结合而固定的环状DNA分子,进一步扭曲都可形成超螺旋·双螺旋DNA处于拧紧状态时所形成的超螺旋为正超螺旋(左手超螺旋)。

负超螺旋的结构特点和形成原因

负超螺旋(Negative Supercoiled):通过这种方式,调节了DNA双螺旋本身的结构,松解了扭曲压力,使每个碱基对的旋转减少,甚至可打乱碱基配对。生物体内绝大多数环状DNA是以负超螺旋的形式存在。

反应釜的设计技巧

1 根据工艺流程的特点确定反应釜操作方式,确定反应釜是连续的还是间歇的操作。2 计算反应釜体积 3 依据生产能力、反应时间、温度、装料系数、投料比、转化率、投料变化情况以及物料和反应产物的物性数据、化学性质等因素对设计基础数据工艺进行汇总。4 确定反应釜直径和筒体高度、封头5 确定反应釜设计(选用)

优化噪声监测的技术路线设计

  车水马龙被看成是城市繁华的标志。如今,不少人希望远离闹市,去安静的地方生活。究其原因,噪声污染是重要方面之一。可以说,噪声污染普遍存在,其危害不仅与声强有关,也取决于个体的敏感程度。例如,在寂静的乡村,一阵狗吠或鸡鸣,都有可能惊醒睡眠浅的人。在城市,人口居住密度高,个体反应差别更大,容易出现众说

寡核苷酸的优化设计

关键词:寡核苷酸;优化设计中图分类号:Q524     在核酸分子杂交、DNA序列测定和通过PCR放大DNA片段等实验中,都需要使用寡核苷酸作为探针或引物,而对这些反应的质量起最重要影响作用的,就是这些寡核苷酸探针或引物。用优化的寡核苷酸进行实验能够很快得到好的结果,而用不够合适的寡核苷酸时,常常得

全新M5000优化设计

 智能曲线   智能曲线功能,可满足对基体内所有材料的分析需求   智能链接最适当的曲线模型,获得更精准的分析结果   真正实现未知样品分析,无需纠结模型选择,使操作更加简便  质量判断   根据用户的测量标准,可自由设定元素成分质量控制的上下限   自动判断样品成

植物整体结构的研究和异常结构的观察实验(一)

实验方法原理 实验材料 玉米小麦水稻向日葵蚕豆大豆豌豆等若干种完整植株核桃杨树苹果等植物的二或三年生植株大豆黄瓜和曼陀罗的幼苗丁香大叶黄杨和苹果的顶芽或腋芽棉毛茛幻根-茎过渡区系列制片棉茎节部横切制片等试剂、试剂盒 碘液间苯三酚溶液 50%HCI仪器、耗材 显微镜解剖镜放大镜载玻片盖玻片刀片摄子吸水

一种螺旋加压式耳郭夹的设计与临床应用

耳郭是瘢痕疙瘩的好发部位,约占全身瘢痕疙 瘩发生部位的 1/3 以上。 对耳郭瘢痕疙瘩的治疗主 要采用手术切除的方法,但术后容易复发,尤其外 耳郭的独特位置使术后加压包扎很困难[1]。 手术切 除后还需配合放射治疗,但放射治疗后易再出现并 发症,而且反复放射治疗会造成较大的损伤[2]。 因其 位

如何利用CMR机制优化电路板设计及布局(一)

Allegro MicroSystems电流传感器IC可以分为三大类:需要外部磁芯的传感器、具有封装内置磁芯的传感器,以及具有集成载流环(但无磁芯)的传感器。最后一类就是具有共模场抑制(CMR)功能的传感器。本文将探讨CMR的机制,并重点介绍如何充分利用此机制来优化电路板设计和布局。背景

Western-Blot实验操作进阶技巧(一)

  除非是Western blot实验方面的高手,要不就像在我看来,Western blot发展至今好像与其1979年刚被发明出来的时候一样一样,同样也是根据蛋白不同的大小(或电荷)进行电泳分离,然后转膜,利用抗体筛选出目标蛋白。  多年来这种技术已经成为了蛋白研究方面的一种主要技术,研究人员可以利

药学实验室小技巧(一)

1、乙醇溶解主成分后,不能溶解辅料,需要过滤。采用离心方法使辅料沉淀,取上清夜。(注意,有很多离心管不具塞子,可用柔软的塑料薄膜袋扎橡皮筋做塞子。没有塞子离心,偏差可达5%),与薄膜过滤法比较,对测定结果没有影响。而且,如果过滤法操作不够快速,乙醇挥发,易影响测定结果。2、 检验吲哒帕胺片的含量测定

关于β螺旋的结构介绍

  第一个被发现的β螺旋结构是在酶的果胶酸裂解酶中,其中包含一七转螺旋,达到34Å(3.4 nm)长。P22噬菌体的tailspike蛋白,拥有一个13圈的螺旋,由其构成的同源三聚体达到了200Å(20 nm)的长度。它的内部密集,无中心孔,包含了疏水残基和通过盐桥中和的带电残基。  果胶裂解酶和P

超螺旋的结构特点

超螺旋是DNA三级结构的主要形式,由双螺旋DNA进一步扭曲盘绕而形成。超螺旋按其扭曲方向分两种类型:与DNA双螺旋的旋转方向相同的扭转称为正超螺旋;反之称为负超螺旋。研究发现,所有的DNA超螺旋都可由DNA拓扑异构酶消除。正超螺旋和负超螺旋两种。真核生物中,DNA与组蛋白八聚体形成核小体结构时,存在

超螺旋的结构特点

超螺旋,DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋,超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时,其超螺旋结构为正超螺旋,反之则为负超螺旋,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。

过柱的实验方法和技巧

   常说的过柱子应该叫柱层析分离,也叫柱色谱。我们常用的是以硅胶或氧化铝作固定相的吸附柱。由于柱分的经验成分太多,所以下面我就几年来过柱的体会写些心得,希望能有所帮助。    一:柱子可以分为:加压,常压,减压    1.压力可以增加淋洗剂的流动速度,减少产品收集的时间,但是会减低柱子的塔板

过柱的实验方法和技巧

常说的过柱子应该叫柱层析分离,也叫柱色谱。我们常用的是以硅胶或氧化铝作固定相的吸附柱。由于柱分的经验成分太多,所以下面我就几年来过柱的体会写些心得,希望能有所帮助。 一:柱子可以分为:加压,常压,减压1.压力可以增加淋洗剂的流动速度,减少产品收集的时间,但是会减低柱子的塔板数。所以其他条件相同的时候

一抗的选择要点和技巧

免疫组化实验是一种很严密的实验,对抗体的选择哪也有很高的要求,,免疫组化所有的抗体主要是一抗今天就让上海劲马与您一起分享如何选择免疫组化中的一抗,下面我们就从下面五点来论述一下这个问题。  1.单克隆和多克隆抗体的选择。由一种克隆产生的特异性抗体叫做单克隆抗体。单克隆抗体能目标明确地与单一的特异抗原

ESD设计分析技巧(二)

1、ESD测试能量释放于机壳,通过电子产品或设备和耦合板的耦合电容,会在机壳上建立电压V即产生电压降!电压的幅度与接地线阻抗、机壳与大地的电容、机壳与内部电路的电容有关。2、系统地与机壳地分离的电子产品,内部电路也不会设计成与机壳连通,所以干扰进入内部电路主要是耦合方式。通过耦合方式进入电子产品内部

ESD设计分析技巧(三)

5、空气放电主要是空间的辐射成分,没有明确的路径,对于容性耦合情况,受扰部位会有较大面积以及较近的距离,不太容易识别路径,所以从敏感部位入手比较容易。实际的ESD都是非常高电压的空气放电模式,空间放电于接缝、插座、按键等;相对接触放电,空气放电干扰情况要复杂很多。最常见的是金属壳与按键、显示

一些关于色谱实验室的技巧(一)

常说的过柱子应该叫柱层析分离,也叫柱色谱。我们常用的是以硅胶或氧化铝作固定相的吸附柱。由于柱分的经验成分太多,所以下面我就几年来过柱的体会写些心得,希望能有所帮助。柱子可以分为:加压,常压,减压。压力可以增加淋洗剂的流动速度,减少产品收集的时间,但是会减低柱子的塔板数。所以其他条件相同的时候,常压柱

螺旋袢螺旋结构域的基本信息

中文名称螺旋-袢-螺旋结构域英文名称helix-loophelix motif定  义存在于转录因子的DNA结合结构域中的一种蛋白质结构域。由两个α螺旋和中间的一个袢组成,识别并结合特异的DNA序列。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)

螺旋转角螺旋结构域的基本信息

中文名称螺旋-转角-螺旋结构域英文名称helix-turnhelix motif定  义由两个α螺旋间隔以一定角度的转角构成的结构域。其中一个α螺旋可插入DNA大沟中与专一DNA序列结合。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)

薄膜蒸发器的优化设计方案!

薄膜蒸发器作为一种新型高效的蒸发设备,其广泛应用为工业生产带来了巨大的经济效益,在真空薄膜蒸发器的设计中,传热部分的计算关系到整个蒸发器产出高质量产品的重要依据,杭州安研经过多年不断研发优化薄膜蒸发器设计,总结出以下优化设计方案。一、蒸发概述蒸发是重要的化工单元操作之一,蒸发操作是用加热的方法,在沸

磁性器件损耗的分析设计优化(二)

高频导体电路密度分布图如下:高频时的导体电流密度分布情形,大致如图所示,由表面向中心处的电流密度逐渐减小。由上图及上面公式可知,当频率愈高时,临界深度将会愈小,结果造成等效阻值上升;因此在高频时,电阻大小随着频率而变的情形,就必须要考虑了。在应用时,比如高频电路中可以采用空心导线代替实心导线。此外,

磁性器件损耗的分析设计优化(三)

C.导体的边缘效应Dowall提出了计算两绕组变压器绕组交流电阻的方法,此方法先将圆导体转化为方形,并作如下假设:①磁场被假定为一维变量,垂直于导体的分量被忽略,并且总磁场强度在每个导体层中为常量;②绕组被假定为无限长片状导体的一部分,电流密度沿每层导体截面是常数,导体边缘效应被忽略;③假定磁芯不存

磁性器件损耗的分析设计优化(六)

减小气隙边缘磁通的方法主要有以下几种:①通过使导体远离气隙,保持导体和气隙之间有一定的距离来减小气隙边缘磁通的影响,但是磁芯窗口宽度是很有限的,这样做会减小磁芯窗口的利用率。②将绕组导体放置在磁芯窗口中一个固定的区域中,而这个区域边缘磁通很小,这种方式同样可以减小气隙边缘磁通造成的导体涡流损耗,但是

磁性器件损耗的分析设计优化(五)

扩散磁通损耗在设计电感工作时输入的电流波形是一个直流分量叠加一个开关频率的纹波,因此在设计电感时为了在磁芯中瞬间存储能量,磁路中需要有一个较大的磁势,因此一般都需要添加气隙。在磁路设计时,因为磁芯(比如铁氧体)和磁绝缘物质(比如空气)之间的磁导率比例系数大约为10^3,因此磁通在磁路中并非完全限制在

磁性器件损耗的分析设计优化(四)

通过分析可以发现,电感中的磁通主要分为以下几个部分:①主磁路磁通。这部分磁通是流通在电感磁芯中的磁通,它不会在磁芯窗口中出现,因此它不会切割导体,也不会产生导体损耗。②气隙边缘磁通,即扩散磁通。这部分磁通是由于气隙磁势而产生,它在磁芯窗口中出现,在高频时会切割窗口中的导体造成涡流损耗。③旁路磁通。这