研究基于荧光的一种蛋白质RNA相互作用的小分子调节剂
国立首尔大学化学系CRI化学蛋白组学Wan Gi Byun团队在《Chembiochem》发表了他们最新的研究成果,基于荧光的紧密结合分析发现了一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂。 那为什么要研究RNA-蛋白之间的相互作用呢? RNA和蛋白是可以相互作用的生物分子,可以通过物理性相互作用,调节彼此的生命周期和功能。mRNA编码序列指导蛋白质和一些调节序列的合成,而mRNA的非翻译区域通过调控蛋白质的翻译、定位和与其他蛋白质的相互作用,影响编码蛋白的命运。另一方面,从RNA合成到降解的过程中,蛋白质反过来可以结合和调控RNA的表达和功能。RNA与蛋白质的相互作用对于维持细胞稳态是非常重要的,而干扰两者的相互作用会造成细胞功能失调和相关疾病的发生。 那如何来检测蛋白-RNA间的相互作用呢? 让我们一起来看看Wan Gi Byun团队是怎么做的: 蛋白质结合会引起微环境的变化,而这将会显著改变与......阅读全文
研究基于荧光的一种蛋白质RNA相互作用的小分子调节剂
国立首尔大学化学系CRI化学蛋白组学Wan Gi Byun团队在《Chembiochem》发表了他们最新的研究成果,基于荧光的紧密结合分析发现了一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂。 那为什么要研究RNA-蛋白之间的相互作用呢? RNA和蛋白是可以相互作用的生物分子,可以通过物理
通过Sapphire平台研究基于荧光的一种蛋白质RNA相互作用...
通过Sapphire平台研究基于荧光的一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂Azure Biosystems国立首尔大学化学系CRI化学蛋白组学Wan Gi Byun团队在《Chembiochem》发表了他们最新的研究成果,基于荧光的紧密结合分析发现了一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂。那为
小分子RNA
RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,
小分子RNA的简介
MicroRNA (miRNA) 是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA,其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某
小分子RNA的特征介绍
已经被鉴定的miRNAs据推测大都是由具有发夹结构,约70个碱基大小形成发夹结构的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成的,有5’端磷酸基和3’羟基,大小约21—25nt的小分子RNA片段,定位于RNA前体的3’端或者5’端。 3个研究小组分别从线虫、果蝇和Hela细胞中鉴定的100个新mi
小分子RNA的功能介绍
科学家开始认识到这些普遍存在的小分子在真核基因表达调控中有着广泛的作用。在线虫,果蝇,小鼠和人等物种中已经发现的数百个miRNAs中的多数具有和其他参与调控基因表达的分子一样的特征——在不同组织、不同发育阶段中miRNA的水平有显著差异,这种miRNAs表达模式具有分化的位相性和时序性(diff
方案12-通过阵列检测来研究蛋白质小分子相互作用
实验材料用于标记的小牛血清白蛋目标小分子载有蛋白质阵列的玻片试剂、试剂盒单功能活性染料Cy-3或Cy-5磷酸盐缓冲溶液含有 500mmol L甘氨酸的 PBS二琥珀酰亚胺戊二酸(DSG)NN’-二琥珀酰亚胺碳酸盐硫代琥珀酰亚胺酯含 0.01g ml小牛血清白蛋白(BSA)的 PBST仪器、耗材荧光玻
研究蛋白质RNA相互作用的新工具
近日,赛默飞世尔科技全新推出了一款Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit,让研究人员能够以末端标记的RNA作为诱饵,轻松富集蛋白质-RNA的相互作用。与抗体捕获相比,这种方法的优势在于脱硫生物素化的目标RNA能够直接富集RBP(或复合物)。 蛋白
什么是小分子RNA?
MicroRNA (miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为22 个核苷酸的非编码单链RNA分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控。在动植物以及病毒中已经发现有28645个miRNA 分子(Release 21: June 2014) 。大多数miRNA 基因以单拷贝、多拷贝或基因簇(c
小分子RNA(miRNA)简介
一、什么是小分子RNA( MicroRNA)? MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本(primary transcrip
Cell:小分子RNA的大作用
所有有性繁殖多细胞生物体都依赖于卵子来支持早期的生命。加州大学圣地亚哥医学院及Ludwig癌症研究所的研究人员利用微小线虫作为模型,更好地了解了卵子仅借助于已存在的物质实现胚胎发育的机制。发表在3月24日《细胞》(Cell)杂志上的这项研究,揭示出了小分子RNA(Small RNAs)和辅助蛋白
Science:小RNA分子的大作用
如果我们的神经系统发育被扰乱,我们便会有罹患上严重神经系统疾病,造成感觉系统、运动控制和认知功能受损的风险。从人类到线虫,对于所有具有发达神经系统的生物都是这种情况。 现在来自哥本哈根大学的一项新研究,揭示了线虫中一个叫做mir-79的小分子调控神经发育的机制。这一分子是发育过程中特异神经
小分子RNA——microRNA综述(1)
RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有
小分子RNA——microRNA综述(2)
未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted-disruption缺失miRNA序
基于化学小分子探针的信号转导研究项目指南发布
国家自然科学基金重大研究计划遵循“有限目标、稳定支持、集成升华、跨越发展”的总体思路,围绕国民经济、社会发展和科学前沿中的重大战略需求,重点支持我国具有基础和优势的优先发展领域。重大研究计划以专家顶层设计引导和科技人员自由选题申请相结合的方式,凝聚优势力量,形成具有相对统一目标或方向的
核仁小分子RNA的定义和分布
核仁小RNA与其它RNA的处理和修饰有关,如核糖体和剪接体核小RNA、gRNA等。核仁小RNA是一个与特性化的非编码RNA相关的大家族。核仁小分子RNA调节细胞死亡,即便是血糖得到合适地调控,糖尿病病人经常会遭受并发症带来的痛苦,如心力衰竭(heart failure)、肾功能不全和免疫系统中B细胞
关于核仁小分子RNA的基本介绍
核仁小RNA(small nucleolar RNA),是近来生物学研究的热点,由内含子编码,分布于真核生物细胞核仁的小分子非编码RNA,具有保守的结构元件。已证明有多种功能,主要参与rRNA的加工;反义snoRNA指导rRNA核糖甲基化。 核仁小RNA与其它RNA的处理和修饰有关,如核糖
关于小分子RNA的作用方式介绍
microRNA-RISC对靶基因mRNA的作用主要取决于它与靶基因转录体序列互补的程度,有三种方式。 第一种是切断靶基因的mRNA分子——miRNA与靶基因完全互补结合,作用方式和功能与siRNA非常相似,最后切割靶mRNA。在植物中,大部分miRNA都以这种方式,靶基因mRNA断裂后,无p
小分子RNA的识别方法的介绍
多个研究小组采用生物化学结合以及生物信息学的方法开展对miRNAs的研究工作。由于据推测都是由Dicer酶降解RNA得到的,21—23个碱基大小、有5’端磷酸基和3’羟基的RNA片段,有的实验室采用改良的定向克隆方法来筛选具有相同特征的小分子——筛选一定大小的RNA分子,连接到3’和5’的适配子
计算小RNA分子的单细胞测序新法
最近,卡罗林斯卡学院的研究人员开发出了一种单细胞程序,测量了单个胚胎干细胞中短的非编码RNA序列的绝对数量。这种新方法可以加深我们对于“基因是如何被调节、不同的细胞类型如何发展”的理解。相关研究结果发表在10月31日的《Nature Biotechnology》。当我们基因中的信息被使用时――例如构
细胞化学词汇核仁小分子RNA
中文名称:核仁小分子RNA外文名称:small nucleolar RNA定 义:核仁小RNA(small nucleolar RNA),是近来生物学研究的热点,由内含子编码,分布于真核生物细胞核仁的小分子非编码RNA,具有保守的结构元件。已证明有多种功能,主要参与rRNA的加工;反义s
研究发现评估IVF中精子质量的小RNA分子标志物
4月9日,国际学术期刊Cell Discovery 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚研究组、上海市计划生育科学研究所施惠娟实验室和复旦大学附属妇产科医院上海集爱遗传与不育诊疗中心陈国武实验室的合作研究成果“Identification of small noncoding R
RNA-蛋白质的相互作用2
叶绿体mRNA3’末端的体外加工l RNA加工反应1.在1.5ml微量离心管中加入下列反应液:缓冲液IVT(20×) 0.5μl叶绿体蛋白提取物(20μg) Lμl缓冲液E
RNA-蛋白质的相互作用1
叶绿体RNA的体外加工与紫外交联分析RNARNA的合成l DNA模板的线性化1.根据供应商的指导用合适的限制酶酶解含有DNA模板(如亚克隆在转录载体如pBluescript®(Stratagene)上的菠菜叶绿体psbA基因)的质粒(Schuster and Gruissem1991)。2
宋凤瑞:质谱研究生物分子与中药小分子的相互作用
分析测试百科网讯 2020年9月15日,2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020CMSS)进行到第二天,由北京生命科学研究所董梦秋研究员、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究员、同济大学田志新教授、中国医学科学院药物研究所张金兰研究员;吉林大学药物代谢研究中心顾景凯教授、军事医学科学院放射
Chemical-Society-Reviews:发表小分子荧光探针研究“指南综述”
近日,中国科学院上海药物研究所李佳团队联合华东理工大学贺晓鹏团队、英国巴斯大学Tony D. James团队,以及美国德克萨斯大学奥斯汀分校Jonathan L. Sessler团队,撰写“指南综述”(Tutorial Review)文章Small-molecule fluorescence-b
分子技巧使土壤细菌对抗生素特别耐药
一些土壤细菌特别耐受青霉素。为什么长久以来一直是个谜?现在研究人员已经开始研究这种特殊抗生素耐药性的神秘面纱。 许多土壤细菌本身对抗生素有抗药性。现在,波鸿鲁尔大学的生物学家发现了一种调节这种抗性的新机制。在最近的一份出版物中,由微生物生物学系的Jessica Borgmann领导的研究小组
Nat-Commun:基于RNA分子的新型疗法有望治疗肺癌
近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自瑞典的科学家们表示,通过降低特殊RNA分子的活性就能使得小鼠肺部肿瘤缩小40%至50%,这或许是研究中的冰山一角,此外研究人员还从14类不同癌症中鉴别出了633个新型的生物标志物。图片来源于网络 文章中,研究
单细胞测序,解密小RNA分子的未知功能
随着科研人员对各种遗传疾病和癌症的深入挖掘,单细胞基因组方法捕获的信息变得越来越重要。卡罗林斯卡学院( Karolinska Institute)的研究人员近日公布了一种新方法,这种方法可以读取个体胚胎干细胞中短的、非编码RNA序列,有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的发展。相关结
PNAS:小分子RNA引发肥胖代谢问题
科学家发现了机体生物事件链中的一种关键分子,这些事件会导致脂肪肝疾病,2型糖尿病和其他与肥胖有关的代谢异常疾病。通过阻挡这种分子,研究人员就能够扭转肥胖小鼠中其引发一些病理发展。这项研究结果刊登在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。MIR-34A是一种小分子RNA,在肥胖小鼠和患有脂肪肝的患者