Genomeresearch:不同RNAm5C甲基化修饰存在巨大差异

近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEARCH(IF=11.922)上发表一篇题为“Statistically robust methylation calling for whole-transcriptome bisulfite sequencing reveals distinct methylation patterns for mouse RNAs” 的文章。在本文中,他们运用了综合的甲基化分析方法检测了小鼠胚胎干细胞中tRNAs、rRNAs和mRNAs的m5C修饰。 文中指出,基于重亚硫酸盐转换的技术是检测m5C修饰的经典方法,而二代测序为此提供了检测转录组水平整......阅读全文

RNA甲基化测序

1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶,能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2(NSUN2-/-HEK293细胞)后进行

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...1

云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用导读RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。近日,Plant Physiology 

Genome-Research:常见病源自基因调控

  许多罕见疾病都是由基因突变引起的,例如镰状细胞贫血。然而,人们至今还未能确定引起复杂常见病(类风湿关节炎等)的基因突变。   Case Western Reserve大学医学院的研究人员对六种复杂的常见病进行研究,向人们展示这些疾病的病因在于基因以外的DNA改变,文章发表在Genome

我国研究院揭示m6A修饰对AtoI-类RNA编辑的调控作用

  A-to-I类型的RNA编辑是一种基本的生物学现象,广泛存在于哺乳动物中,目前被认为是一种能够产生分子多样性的转录后修饰机制,通过重新编码来调节蛋白质翻译,大大丰富了遗传信息。A-to-I类型的RNA编辑不仅对基因表达调控具有重要影响,而且还与很多疾病的发生发展过程密切相关。m6A 修饰对 A-

研究揭示RNA甲基化调控斑马鱼母源mRNA稳定性机制

  斑马鱼母源-合子转换 (maternal-to-zygotic transition, MZT)过程伴随着母源RNA和蛋白质的降解以及合子基因组的激活(maternal-to-zygotic transition, ZGA)。已有研究表明多种关键因素通过母源和合子途径促进母源mRNA降解,其中包

中国学者发表RNA甲基化重要成果

  基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。  西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普

中国学者发表RNA甲基化重要成果

  基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。  西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

拟南芥RNA核糖甲基化修饰研究方面获进展

  3月30日,中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组、北京大学现代农学院博士王玉秋和中科院遗传与发育研究所研究员李家洋课题组合作在Nucleic Acids Research上发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

杨运桂/杨莹开发新技术,首次获得m7G-mRNA高分辨率图谱

  在RNA分子中鉴定出超过150种RNA修饰。转录组分析是解码这些化学修饰的潜在功能的关键步骤之一。N7-甲基鸟苷(m7G)是tRNA,rRNA和mRNA 5'cap中存在的最丰富的修饰之一,并且在调节RNA加工,代谢和功能中具有关键作用。除了其在mRNA中的帽位置外,还在内部mRNA区域

最新进展:RNA的甲基化与去甲基化修饰

  德国慕尼黑的路德维希-马克西米利安大学(LMU)研究人员发现了细菌RNA中一种新型的化学修饰形式。显然,只有当细胞处于应激状态时,这种修饰才会附着在分子上,并且在恢复过程中会迅速去除。  核糖核酸(RNA)在化学形式上与DNA密切相关,而DNA是所有细胞中遗传信息的载体。实际上,RNA本身在将遗

研究发现不同组蛋白酰化修饰的功能差异

北京时间5月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所罗小舟课题组和北京大学刘涛课题组、刘小云课题组的合作成果发表于国际著名学术期刊《德国应用化学》,研究团队基于基因密码子扩展技术,创造了含共翻译修饰(Co-Translational modification, CTM)核小体的酿酒酵母菌

SMAD2/3与TGFβ影响转录因子发生m6ARNA甲基化调控干细胞发育

  文章导读:   胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天,分享一

Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰-m1A

  说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN

Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰-m1A

说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN

科学家发现线粒体中的RNA修饰可促进癌细胞转移

肿瘤细胞在转移过程中会消耗远超正常细胞需要的能量,德国癌症研究中心的研究团队发现了与能量代谢相关的新型癌细胞转移的促进因素,相关成果在《Nature》发表,论文的标题为:Mitochondrial RNA modifications shape metabolic plasticity in met

Nature:线粒体中的RNA修饰能促进癌症的扩散

肿瘤细胞在转移过程中会消耗远超正常细胞需要的能量,德国癌症研究中心的研究团队发现了与能量代谢相关的新型癌细胞转移的促进因素,相关成果在《Nature》发表,论文的标题为:Mitochondrial RNA modifications shape metabolic plasticity in met

Nature:线粒体中的RNA修饰能促进癌症的扩散

肿瘤细胞在转移过程中会消耗远超正常细胞需要的能量,德国癌症研究中心的研究团队发现了与能量代谢相关的新型癌细胞转移的促进因素,相关成果在《Nature》发表,论文的标题为:Mitochondrial RNA modifications shape metabolic plasticity in met

Nature:线粒体中的RNA修饰能促进癌症的扩散

肿瘤细胞在转移过程中会消耗远超正常细胞需要的能量,德国癌症研究中心的研究团队发现了与能量代谢相关的新型癌细胞转移的促进因素,相关成果在《Nature》发表,论文的标题为:Mitochondrial RNA modifications shape metabolic plasticity in met

2019年云序RNA甲基化修饰领域文章汇总

  感恩有你,一路同行!2019年末,云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候!光阴如梭,一年转瞬又将成为历史,新的一年意味着新的起点、新的机遇、新的挑战,决心再接再厉,更上一层楼。回首即将过去的2019,云序生物不断创新,硕果累累;展望2020,任重道远却信心倍

《Genome-Research》:根据基因组序列预测MRSA毒性

  微生物毒力一直是一个复杂的多因素表型,与病原体的进化轨迹有着复杂的关联。毒性,破坏宿主细胞膜和粘附的能力,粘附到人体组织的能力,是许多细菌病原体的主要毒力因子,包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。   金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌,自从上世纪40

科学家揭示RNA甲基化调控实体瘤膀胱癌发生机制

  m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一,但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。  中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究,发现m5C通过细胞

研究揭示RNA甲基化调控实体瘤膀胱癌发生机制

  m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一,但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。  中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究,发现m5C通过细胞

RNA研究热点技术介绍总汇

  头条消息:2019年8月16日,2019年国家自然科学基金评审结果发布,今年国自然重点资助项目743项,总金额达22.184亿,北京大学、浙江大学位居前两位,分别获得37项和34项,总计超过1亿元,而上海交通大学(30项)、复旦大学、清华大学、南京大学、中山大学、天津大学、华中科技大学、同济大学

RNA研究热点技术介绍总汇

  头条消息:2019年8月16日,2019年国家自然科学基金评审结果发布,今年国自然重点资助项目743项,总金额达22.184亿,北京大学、浙江大学位居前两位,分别获得37项和34项,总计超过1亿元,而上海交通大学(30项)、复旦大学、清华大学、南京大学、中山大学、天津大学、华中科技大学、同济大学

2019年,大牛们都在研究什么?—m6A文章盘点

  19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成

Oligopull-down结合质谱、蛋白解构技术等研究实体瘤膀胱癌

  m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一,但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究,发现m5C通过细胞质内

SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子机制

  RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:RNA甲基化研究深度剖析)。   近三个月高分文章部分列表:   2月28日