大样本量SNP鉴定神器MassARRAY之技术特点、实验流程
老美大当家的奥大叔似乎并不愿悄悄离去，在其任期最后一年又搞了个大动作。年初，奥叔在对国会发表的国情咨文中宣布将发起一项寻找癌症治愈疗法的“登月计划”，并任命二当家的拜登为该项目负责人。此外还有两项分别由个人（陈颂雄）和医院（美国MD安德森癌症中心）发起的癌症“登月计划”，可见老美此次是倾全国之力向癌症发起挑战。 所谓“登月”，肯定不是把患者拉到月亮上面让嫦娥姐姐给治治，而是指攻克癌症所面临的巨大挑战，这是一个将要经历重重困难，且需长期坚持的过程，一如当初人类排除万难成功登月，借此寓意我们最终将会打败癌症这个大魔头。如今，我们的长征七号火箭成功发射，五星红旗插上月球指日可待，中国的肿瘤研究登月征途时不我待！ 美帝癌症“登月计划”具体如何实施现在尚不明朗，小道消息称明年会有10亿刀（妈蛋！好多小钱钱）投入该项目，主要集中在免疫治疗，基因组学和联合治疗等几个方面。这下有人毛了，这不，来自Inova Schar癌症研究所......阅读全文
大样本量SNP鉴定神器MassARRAY之技术特点、实验流程
老美大当家的奥大叔似乎并不愿悄悄离去，在其任期最后一年又搞了个大动作。年初，奥叔在对国会发表的国情咨文中宣布将发起一项寻找癌症治愈疗法的“登月计划”，并任命二当家的拜登为该项目负责人。此外还有两项分别由个人（陈颂雄）和医院（美国MD安德森癌症中心）发起的癌症“登月计划”，可见老美此次是倾全国之力
MassARRAY核酸质谱技术特点
多重反应，检测成本低单个反应达10~60重检测，且只需简单的PCR及延伸试剂，无需荧光探针，无需高成本人员投入，检测成本极低高准确度和灵敏度分型准确性>99.7%,是SNP检测的金标准；灵敏度可达0.1%的低频等位基因或稀有突变进行检测；检测周期短检测流程和数据分析简单-从DNA到结果输出仅需8小时
MassARRAY系统高度自动化的实验流程
根据实验室对检测通量的不同需求，Agena Bioscience MassARRAY系统提供全自动与半自动两种操作流程。可在8个小时内完成高达3000份样本量，十几万个位点的检测，并提供高度准确和可重复的实验室结果。全自动操作流程MassARRAY CPM96，芯片采用96孔制式，点样系统与检测系统
浅谈核酸与飞行时间质谱的“完美邂逅”
先声诊断的实验室近期很是忙碌，除了最近火遍全球的第四代测序—牛津纳米孔测序平台和大家熟悉的高通量测序等在如火如荼的运转之外，据说他们又引进了一个新的技术平台——MassARRAY®核酸质谱分析系统。先声小编表示核酸？质谱？它俩居然能是一对儿？质谱在小编的印象里不是做蛋白和代谢的吗？它居然还能做核酸？
MALDITOFMS在突变检测中的应用
近年来随着精准医疗的需求，临床中提出了越来越多的检测需求。以非小细胞肺癌为例，EGFR、KRAS、BRAF、ALK、ROS1、RET、MET、HER-2已经成为临床中常用的检测需求。 目前检测中，常以荧光定量方法检测mutation，FISH方法检测fusion，或者采用NGS技术进行检测。E
SNP检测技术（测序、taqman探针和snp芯片）
snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点，如hla区域，但成本较高，工作量大，不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠，国外文章也大量应用，不过对于国内成本偏高，同类还有snpshot技术，abi和贝克曼
SNP检测技术对比
1. SNP检测方法分类1.1. 根据检测原理分类根据检测原理进行分类，目前来说，基于杂交原理的检测方法应用更为广泛。1.2. 根据检测通量分类根据检测通量进行分类，可以分为高通量、中通量和低通量方法。目前中通量方法和高通量总的基因芯片法（包括beadschip）应用更为广泛。除此之外，基于Ta
MassARRAY系统的检测原理
MassARRAY系统基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 技术（Matrix Assisted Laser Desorption /Ionization-Time of Flight， MALDI-TOF），该技术完美地整合了PCR技术的高灵敏度、芯片技术的高通量和质谱技术的高精确度，是目前唯一应
ELISA实验之细胞样本的处理方法
ELISA（酶联免疫吸附剂测定）是一种快速、灵敏、准确可靠的一种定量分析方法，样本的处理对于ELISA实验的成功有着举足轻重的作用。 利用ELISA进行检测的样本类型包括常见的血液（血清、血浆），组织匀浆、细胞裂解液、细胞培养上清以及不常见的皮肤组织、尿液、粪便、肺泡灌洗液、唾液、脑脊液、胸腹水、前
实验仪器非正常使用指南之“烘”趴神器
最近，各路大神们开始在X音上分享自己特殊的做菜方法，瞬时掀起一番“龙争虎斗”，引得一众粉丝竞相追捧。对此，号称实验室厨神的诸位表示十分不服！嚷嚷着要奉献出自己闯荡实验室多年的感悟——实验仪器小妙招之化身厨神篇！
蛋白质组学鉴定技术流程
蛋白质组（Proteome）的概念，蕞早由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams于1994年首先提出的，是指一个基因组（Genome），或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质组学（Proteomics）以细胞、组织或生物体全体蛋白质为研究对象，通过高通量的色谱质谱联用技术
微生物鉴定之生化实验大全
不同的细菌具有各自的独特的酶系统，因而对底物的分解能力各异，其代谢的产物也不相同。这些代谢产物又具有不同的生物化学特性，可利用生物化学的方法测定这些代谢产物以鉴定细菌。掌握各种生化反应的原理和应用是细菌鉴定的基础。生理生化特性的测定主要根据Shirling & Gottlieb《Internatio
蛋白鉴定方法之质谱相关技术
质谱已成为连接蛋白质与基因的重要技术，开启了大规模自动化的蛋白质鉴定之门。 用来分析蛋白质或多肽的质谱有两个主要的部分，1）样品入机的离子源，2）测量被介入离子的分子量的装置。 首先是基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱（MALDI-TOF）为一脉冲式的离子化技术。 它从固相标本中产生离子，并在飞
蛋白鉴定方法之图象分析技术
“满天星”式的2-DE图谱分析不能依靠本能的直觉，每一个图象上斑点的上调、下调及出现、消失，都可能在生理和病理状态下产生，必须依靠计算机为基础的数据处理，进行定量分析。 在一系列高质量的2-DE凝胶产生（低背景染色，高度的重复性）的前提下，图象分析包括斑点检测、背景消减、斑点配比和数据库构建。
SNP检测——HRM技术应用
单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs），指单个核苷酸碱基的改变，包括置换、颠换、缺失和插入，导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中，绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象，这就是SNP。SNP在人类
SNP检测——HRM技术应用
HRM技术服务之SNP检测（snp检测的最佳方案） 单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs），指单个核苷酸碱基的改变，包括置换、颠换、缺失和插入，导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中，绝大多数核苷酸序列一
MassARRAY®－分析软件
MassARRAY® 分析软件是一套模块化应用程序，用于基因分型、甲基化、基因表达、拷贝数变异等多种应用的数据分析。以MassARRAY® Typer4软件为例，该软件用于MassARRAY系统的iPLEX SNP基因分型。用户可利用它进行分析结果的评估和管理，通过表格和图形格式进行数据的可视化，
实验技术方法流程汇总
目前最好的实验方法站点之一: http://www.protocol-online.org 有近三百种经典实验方法的生物学网站: http://iprotocol.mit.edu/ 目前最完美的生物技术收集网站之一: http://www.bioprotocol.com:包括动植物、果蝇、分子生物、
Western－Blot技术实验流程
Western Blot又称为蛋白质印迹，是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的基于抗体抗原之间特异免疫反应的一种定量或定性检测蛋白的实验方法。 基本原理：聚丙烯酰胺凝胶电泳将不同分子量的蛋白质样品分离，分离后的蛋白被转移到固相支撑物（杂交膜）上，抗体特异性识别目标蛋白，通过酶促反应或
Western－Blot技术实验流程
Western Blot又称为蛋白质印迹，是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的基于抗体抗原之间特异免疫反应的一种定量或定性检测蛋白的实验方法。基本原理：聚丙烯酰胺凝胶电泳将不同分子量的蛋白质样品分离，分离后的蛋白被转移到固相支撑物（杂交膜）上，抗体特异性识别目标蛋白，通过酶促反应或者化学发光等
技术解析之不同类型的样本的处理方法
elisa试剂盒通常我们可用于ELISA检测的样本是有多种类型的，如血清、血浆、尿液、细胞培养上清或组织匀浆液等，不同类型的检测样本前期的处理方法是不一样的。正确的处理样本是保证ELISA检测的正确性和准确性的步。1、 血清血清是*常用于ELISA检测的一类样本，处理也比较简单。用无热原、无内毒素的
全面解读药物基因组学基因检测技术
全面解读药物基因组学基因检测技术FDA和CFDA分别于2010和2012年将CYP2C19基因检测的重要性说明纳入氯吡格雷的药物说明书。在国内，阜外医院已完成氯吡格雷用药基因检测超过20000例，居全国单中心检测量之首。以下列出了药物基因组学涉及的主要基因及对应的个体化用药：（4） 以下为上述三大
食品微生物鉴定之生化实验汇总（二）
（二）蛋白质和氨基酸的代谢实验明胶液化实验（1）原理：某些可以产生一种胞外蛋白水解酶(明胶酶)，能使明胶分解为氨基酸，使明胶失去凝固能力而液化，因而使半固体的明胶培养基成为流动的液体。（2）实验方法：取18～24h的斜面培养物穿刺接种，并有两支未接种的空白对照。（3）结果观察：于30℃培养20天后观
食品微生物鉴定之生化实验汇总（三）
（三）碳源和氮源的利用实验 唯一碳源利用实验（1）原理：在基础培养基只提供一种待检测碳源，若菌株生长则表明菌株能以此种碳源为唯一碳源，否则不能。（2）培养基：基本培养基：(NH4)2HPO41g；NaCl 1g；MgSO4•7H2O 0.2 g；KH2PO40.5 g；琼脂20g；蒸馏水1000mL
食品微生物鉴定之生化实验汇总（一）
不同的细菌具有各自的独特的酶系统，因而对底物的分解能力各异，其代谢的产物也不相同。这些代谢产物又具有不同的生物化学特性，可利用生物化学的方法测定这些代谢产物以鉴定细菌。掌握各种生化反应的原理和应用是细菌鉴定的基础。生理生化特性的测定主要根据Shirling & Gottlieb《Internatio
食品微生物鉴定之生化实验汇总（四）
（四）各种酶类实验 氧化酶试验（1）原理：氧化酶(即细胞色素氧化酶)，是细胞色素氧化酶系统中的最终呼吸酶。具有氧化酶的细菌，首先使细胞色素C氧化，再由氧化型细胞色素C再使对苯二胺氧化，生成有色的醌类化合物。因此，本试验结果与细胞色素C的存在有关。（2）实验方法：菌落法：直接滴加试剂于被检菌落上；滤纸
亲子鉴定的样本采集方法
亲子鉴定又称“亲生子鉴定”。所谓亲子鉴定，就是根据人类遗传学的理论和实践，从子代和亲代的形态构造或生理机能方面的相似特点，分析遗传特征，对可疑的父与子或母与子之间的亲生关系进行判断，并做出肯定或否定的结论。运用生物学、遗传学以及有关学科的理论和技术，根据子代与亲代之间，在形态结构或生理机能方面具有相
亲子鉴定及样本采集方法
亲子鉴定又称“亲生子鉴定”。所谓亲子鉴定，就是根据人类遗传学的理论和实践，从子代和亲代的形态构造或生理机能方面的相似特点，分析遗传特征，对可疑的父与子或母与子之间的亲生关系进行判断，并做出肯定或否定的结论。运用生物学、遗传学以及有关学科的理论和技术，根据子代与亲代之间，在形态结构或生理机能方面具有
亲子鉴定及样本采集方法
亲子鉴定又称“亲生子鉴定”。所谓亲子鉴定，就是根据人类遗传学的理论和实践，从子代和亲代的形态构造或生理机能方面的相似特点，分析遗传特征，对可疑的父与子或母与子之间的亲生关系进行判断，并做出肯定或否定的结论。运用生物学、遗传学以及有关学科的理论和技术，根据子代与亲代之间，在形态结构或生理机能方面具
血液样本研究“神器”Norgen－Biotek在液体活检的应用
液体活检是一种新兴、无创的基因检测方式，适用症状多样，应用范围广阔，是当前基因检测和肿瘤精准治疗的热门研究领域。液体活检是通过采集人体血液、积液、尿液、唾液等体液样本，并检测体液样本生物标志物，进行疾病分析的诊断技术。液体活检的工作流程包括采集样本（以血液为主，包括胸腔或腹腔积液、唾液、尿