Nature:遗传变异如何影响蛋白表达变化
蛋白质是生命活动的主要承担者,其表达调控对于正常发育和疾病的发生发展至关重要。根据中心法则,我们知道信息的传递过程:DNA→RNA→蛋白。然而研究表明mRNA水平和蛋白水平并不完全一致,表明其中存在某种未知机制,介导mRNA水平的遗传变异对蛋白水平的影响。来自哈佛医学院和Jackson实验室的研究人员解决了这一谜题,研究结果发布在《Nature》杂志上 (PMID: 27309819)。 应用RNA-Seq和LC-MS/MS分别分析组织表达谱和蛋白谱 研究人员从8个祖系小鼠繁殖广泛遗传变异的多样性远交系小鼠/DO小鼠(指来自随机交配亲本、个体间遗传背景各异的小鼠)。通过测序和质谱技术比较了192个多样性远交系繁殖小鼠肝脏的mRNA和蛋白水平。进一步结合基因分型,进行eQTL(表达数量性状位点,指控制mRNA表达水平的位点)和pQTL(蛋白数量性状位点,指影响蛋白丰度的位点)定位,以探讨mRNA和蛋白表达水平之间的......阅读全文
Nature:高盐通过影响tau蛋白导致痴呆
中国作为食盐大国一直都榜上有名,然而,近日发表在国际期刊《Nature》上的文章却给我们重重一击:文章指出,高盐饮食会导致大脑中tau蛋白的改变,进而对大脑认知功能产生负面影响,而维持低盐饮食则可延缓痴呆的发生。 去年发表在《Nature》子刊的某项研究表明:高盐饮食会显著减少小鼠脑部的血流
影响表达杆状病毒表达的因素
在杆状病毒系统中,要获得蛋白质的有效表达,首先要选择合适的转染载体。依据表达的蛋白质属融合型或非融合型,选择单启动子型或多启动子型。另外目的基因的选择要注意以下因素:①该目的基因应不含内含子;②去除其mRNA 5′端非编码区的异源序列;③翻译启始密码子AUG应处于适当的序列之间(如Kozak 序列)
Nature:重大进展!揭示RNA中调节蛋白表达的隐藏信号
科学家们早就知道RNA会编码表达蛋白的指令。组成RNA的构成单元(building block)---碱基A、U、C和G---形成了细胞中蛋白制造复合物(protein-making machinery)的蓝图。为了表达蛋白,这种复合物结合到RNA的一端上,然后沿着RNA扫描,直到它到达AUG密
可溶性表达的蛋白如何纯化?纯化后如何除咪唑?
1,破细胞,高速离心收上清收集上清(同时平衡好柱子);2,既然你是His-tag,用Ni-NTA之类的柱子,两次上柱,buffer平衡;3,低浓度咪唑(5mM)洗5-10柱体积,以洗去杂蛋白;4,过梯度咪唑(10-500MM),用紫外检测仪监测280nm,收下每个峰;5,用峰液跑SDS-PAGE,看
可溶性表达的蛋白如何纯化?纯化后如何除咪唑?
1,破细胞,高速离心收上清收集上清(同时平衡好柱子);2,既然你是His-tag,用Ni-NTA之类的柱子,两次上柱,buffer平衡;3,低浓度咪唑(5mM)洗5-10柱体积,以洗去杂蛋白;4,过梯度咪唑(10-500MM),用紫外检测仪监测280nm,收下每个峰;5,用峰液跑SDS-PAGE,看
基因表达量变化差值是什么
差值是△CT,即是相对于某个内参基因的相对表达量,而不是绝对表达量;在此基础上再进行比值,即△△CT,是(某两个处理之间的)差异表达倍数。
Nature揭开基因表达的秘密
你的DNA不止控制了你的眼睛是什么颜色,是否可以卷起你的舌头。你的基因中包含了生成所有蛋白质的指令,细胞时时需要蛋白质来维持你的生存。然而直到现在,这一过程在分子水平上运作的一些关键方面仍然是难解的谜。 利用低温电子显微镜(cryo-EM),劳伦斯伯克利国家实验室的科学家Eva Nogales
遗传变异从生命早期就开始影响血压
某些与高血压相关的基因从生命早期就会影响血压,并且随着年龄的增长,它们会增加患心血管疾病的风险。研究表明,高血压发生在所有年龄组,并且与遗传因素有关。“我们发现遗传因素从儿童时期的头几年到你的一生都会影响血压,”Øvretveit说。来自大型人群研究的遗传数据高血压是心脏病发作和中风的主要原因,心血
组蛋白的修饰是怎么样影响基因表达的
组蛋白甲基化诱导了DNA的甲基化:组蛋白甲基化是招募DNA甲基化酶DNMT的信号,在异染色质蛋白HP1的协助下,DNA发生甲基化。DNA的甲基化又诱导组蛋白的去乙酰化:甲基CpG结合蛋白MeCP2可以特定地结合到甲基化的DNA.上,在组蛋白去乙酰化酶的作用下,将组蛋白.上的乙酰基去掉。而组蛋白去乙酰
组蛋白的修饰是怎么样影响基因表达的
组蛋白甲基化诱导了DNA的甲基化:组蛋白甲基化是招募DNA甲基化酶DNMT的信号,在异染色质蛋白HP1的协助下,DNA发生甲基化。DNA的甲基化又诱导组蛋白的去乙酰化:甲基CpG结合蛋白MeCP2可以特定地结合到甲基化的DNA.上,在组蛋白去乙酰化酶的作用下,将组蛋白.上的乙酰基去掉。而组蛋白去乙酰
流式检测膜蛋白表达的变化用多克隆抗体出结果的机会...
流式检测膜蛋白表达的变化用多克隆抗体出结果的机会大吗?流式的抗体和WB的抗体是不同的(有部分可以通用),多抗一般是大的变性蛋白为抗原制备的,而WB的中被检测蛋白就是变性状态,所以很吻合,而流失中一般蛋白还是保持了天然构象,所以产生的多抗可能不太好,而需要用很小特定的决定簇为抗原制备单克隆抗体。
初学者如何做好蛋白表达?古朵技术@
重组蛋白表达技术可以用来分析基因调控以及研究蛋白质结构和功能。无论是体内功能研究还是用于结构研究的大规模生产,以及生物治疗领域的药物开发都需要用到蛋白表达技术。1、蛋白质通用合成路径DNA —>mRNA—> 蛋白实际操作流程为:1. 克隆或合成目的基因2. 载体构建3. 蛋白表达与纯化4. 蛋白的大
Nature子刊:哪些遗传变异令人逃过癌症的追击
由加州大学旧金山分校领导的一个国际研究小组在拉美裔女性中发现了一种遗传突变,能令她们逃过乳腺癌的追击。 文章的通讯作者,医学教授Elad Ziv表示,“这种效果十分显著。如果你的体内含有这种突变的一个拷贝,那么就能减少40%患上乳腺癌的几率;如果有两个拷贝,那么就能减少80%患上乳腺癌的几率。
Nature破解30年研究谜题:朊蛋白的影响
自从1985年发现朊蛋白(prion)基因以来,它对神经元的 作用及生物学影响一直是个谜。“最终,我们发现了朊蛋白的明确功能,揭示出与特异的受体结合,它们对神经的长期完整性负责,”苏黎世大学与苏黎世大学医院 神经病理学研究所Adriano Aguzzi教授说。因此,发表在《自然》(Nature)
Nature揭示生命早期的TLR5表达影响长期肠道菌群组成
虽然人们认为离婚、丧亲和失业是重大的生活事件,但是也许一个人的生活没有发生变化就像他们出生的那一刻一样充满戏剧化。当婴儿离开产道时,新生儿失去胎盘支持,呼吸系统和肠道必须开始发挥功能。此外,婴儿遇到的有益微生物和致病性微生物将竞争着在他们的体内定植。在一项新的研究中,Marcus Fulde等人
表达蛋白检测实验
实验方法原理 当重组病毒通过噬斑纯化和扩增后,免疫印迹可用于鉴定重组蛋白,并检测其是否有预期的大小以及是否从感染细胞中分泌。下面的步骤是介绍检测非分泌性(细胞内)蛋白的,如果重组蛋白是分泌到培养基中的,可按注解中的步骤操作。实验材料 生长至汇片的单层 BS-C-1 细胞重组痘苗病毒储液试剂、试剂盒
表达蛋白检测实验
免疫印迹法 免疫沉淀法 点印迹法 实验方法原理 当重组病毒通过噬斑纯化和扩增后,免疫印迹可用于鉴定重组蛋白,并检测其是否有预期的大小以及是
膜蛋白的表达
常用于重组膜蛋白的表达系统有真核表达系统、原核表达系统和近些年来发展的无细胞表达系统。其中以大肠杆菌(E.coli)为代表的原核表达系统因为操作简单、成本相对低廉、遗传背景清楚、方便同位素标记,以及有大量可利用的表达载体和宿主菌株等原因,是当下获取重组膜蛋白的最主要途径。对于一些膜蛋白而言,采用增加
气候变化如何影响中国?诺奖得主这样说
4月28日,世界著名环境能源专家、诺贝尔和平奖获得者、美国劳伦斯-伯克利国家实验室(LBNL)资深研究员马克·列文 (Mark D. Levine)在中国科学院深圳先进技术研究院分享了以《气候变化的影响与中国机遇》为题的学术报告。马克·列文分享主题报告 深圳先进院供图他首先回顾了2016年至2018
做免疫荧光如何看蛋白是在细胞核表达还是胞浆表达
复染细胞核,常规用过的是DAPI进行细胞核复染(蓝色)。目的是为了鉴别目的蛋白的位置是胞核表达,还是胞质表达或胞膜表达。一般来讲,如果是胞核表达,会和蓝色的细胞核颜色重叠;胞质或胞膜表达则不会重合,单独看目的蛋白的表达,会看到有个黑色的空洞的,尤其细胞图像更为明显。从楼主的图片看,貌似是在胞核表达(
Nature揭示多变的基因表达模式
脊椎动物早期胚胎发育受到一些基因以及它们的“语法”控制。解译这一语法或许有助于了解畸形或癌症的形成,并开发出一些新的治疗药物。第一次,一项研究发现在斑马鱼的不同发育阶段基因表达过程中存在各种将DNA转录为RNA的机制。研究人员将这项研究发表在《自然》(Nature)杂志上。 在对几个基因组进
Nature重要论文:大型基因表达图谱
来自艾伦脑科学研究所的科学家们在最新出版的《自然》(Nature)杂志上报告称证实人类大脑具有一致的遗传蓝图,且拥有巨大的生物化学复杂性。这些研究结果来自于对“艾伦人脑图谱库”(Allen Human Brain Atlas)公开提供的大量数据集的首次深入大规模分析。 这项研究的结果是基于对“艾
Cell:通过QTL分析发现基因调控变异
在高等生物中,许多重要生理性状及复杂疾病都是数量性状,如农作物的产量和人类的高血压、糖尿病等,这些复杂性状受到多个基因和环境因素的控制。为了有效地研究多基因控制的复杂性状,数量性状基因座(QTL)分析技术在20世纪90年代应运而生,有效地将控制数量性状的众多主效基因定位在相应的染色体上。 表达
关于蛋白表达系统—昆虫表达系统的介绍
昆虫表达系统是一类应用广泛的真核表达系统,它具有同大多数高等真核生物相似的翻译后修饰加工以及转移外源蛋白的能力。昆虫杆状病毒表达系统是国内外十分推崇的真核表达系统。利用杆状病毒结构基因中多角体蛋白的强启动子构建的表达载体,可使很多真核目的基因得到有效甚至高水平的表达。它具有真核表达系统的翻译后加
无细胞表达系统——难度蛋白表达的福音
1964年有两个人开创了体外蛋白表达的先河,这两个人的名字大家必定不会陌生—马太和尼伦伯格。因为他们的创新思维让人类破译了编码氨基酸的64种翻译密码子。从此,体外蛋白表达开始为科学界所关注,不过彼时这个系统蛋白表达量低、持续时间短、稳定性差,使其未能得到进一步发展。 到80年代中期Sp
关于蛋白表达系统—植物表达系统的介绍
植物能够表达来自动物、细菌、病毒以及植物本身的蛋白质易于大规模培养和生产,且在基因表达与修饰及安全性方面有特别的优势,因此利用植物生产外源蛋白质的研究展现了极其诱人的前景。多种抗体、酶、激紊、血浆蛋白和疫苗等都已通过基因工程的手段在植物的叶、茎、根、果实、种子以及植物细胞和器官中得到表达,然而提
无细胞表达系统——难度蛋白表达的福音
1964年有两个人开创了体外蛋白表达的先河,这两个人的名字大家必定不会陌生—马太和尼伦伯格。因为他们的创新思维让人类破译了编码氨基酸的64种翻译密码子。从此,体外蛋白表达开始为科学界所关注,不过彼时这个系统蛋白表达量低、持续时间短、稳定性差,使其未能得到进一步发展。到80年代中期Spirin等对其进
Nature子刊支招:禁止单一蛋白表达就能跟感冒彻底说再见
说起感冒,大家都不会陌生。当出现打喷嚏、鼻塞、咽喉疼痛、咳嗽、发热等症状时,就要意识到病毒已经入侵你的身体。生活中细菌病毒无处不在,稍不留神便中招感冒,那有什么办法能够保护自身免受病毒的侵害吗?图片来源:Pixabay 近日,美国斯坦福大学和加州大学旧金山分校的研究人员共同领导的一项研究发现:
Nature-Genetics:中国人群MHC遗传变异图谱完成
5月23日,国际著名杂志《Nature Genetics》(自然遗传)以论著的形式在线全文发表了安徽医科大学、复旦大学与华大基因共同完成的人类MHC(major histocompatibility complex)区域全覆盖深度测序的研究成果,该研究成功构建出迄今为止最完整的中国汉族
如何筛选和鉴定生物标本中差异表达的蛋白分子
目前筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法 (differentialdisplayRT PCR ,DDRT PCR)、消减杂交法 (subtractivehybridization ,SH )、基因芯片技术 (DNAchiptechnique)和基因表达的系统分析 (serialanaly